MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natronomonas moolapensis 8.8.11 complete genome

Total Repeats: 66591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020388	CGA	2	6	50479	50484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1003	NC_020388	CGT	2	6	50497	50502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1004	NC_020388	GAC	2	6	50504	50509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1005	NC_020388	GCC	2	6	50514	50519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205907
1006	NC_020388	GTC	2	6	50556	50561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1007	NC_020388	CGT	2	6	50608	50613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1008	NC_020388	CG	3	6	50683	50688	0 %	0 %	50 %	50 %	452205907
1009	NC_020388	CGA	2	6	50713	50718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1010	NC_020388	TGG	2	6	50754	50759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452205907
1011	NC_020388	CCGTC	2	10	50846	50855	0 %	20 %	20 %	60 %	452205907
1012	NC_020388	GCA	2	6	50857	50862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1013	NC_020388	CGG	2	6	50900	50905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205907
1014	NC_020388	CCG	2	6	50929	50934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205907
1015	NC_020388	G	6	6	50968	50973	0 %	0 %	100 %	0 %	452205907
1016	NC_020388	CCT	2	6	50977	50982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452205907
1017	NC_020388	GCC	2	6	51000	51005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205907
1018	NC_020388	GTC	2	6	51011	51016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1019	NC_020388	C	6	6	51024	51029	0 %	0 %	0 %	100 %	452205907
1020	NC_020388	TCG	2	6	51079	51084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1021	NC_020388	TCG	2	6	51087	51092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1022	NC_020388	TCG	2	6	51180	51185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1023	NC_020388	TCG	2	6	51216	51221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1024	NC_020388	CGAC	2	8	51274	51281	25 %	0 %	25 %	50 %	452205907
1025	NC_020388	CGA	2	6	51337	51342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1026	NC_020388	TCC	2	6	51351	51356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452205907
1027	NC_020388	GTC	2	6	51396	51401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1028	NC_020388	CGTC	2	8	51406	51413	0 %	25 %	25 %	50 %	452205907
1029	NC_020388	TCG	2	6	51441	51446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1030	NC_020388	CGT	2	6	51454	51459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1031	NC_020388	CGT	2	6	51485	51490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1032	NC_020388	TCG	2	6	51525	51530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1033	NC_020388	TCG	2	6	51570	51575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1034	NC_020388	GGA	2	6	51586	51591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452205907
1035	NC_020388	TCC	2	6	51648	51653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452205907
1036	NC_020388	GTC	2	6	51665	51670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1037	NC_020388	CGG	2	6	51692	51697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205907
1038	NC_020388	CGA	2	6	51709	51714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1039	NC_020388	CGG	2	6	51715	51720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205907
1040	NC_020388	GTT	2	6	51758	51763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452205907
1041	NC_020388	GC	3	6	51811	51816	0 %	0 %	50 %	50 %	452205907
1042	NC_020388	CGTG	2	8	51865	51872	0 %	25 %	50 %	25 %	452205907
1043	NC_020388	GAC	2	6	51881	51886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1044	NC_020388	CGG	2	6	51892	51897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205907
1045	NC_020388	CTC	2	6	51902	51907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452205907
1046	NC_020388	GTA	2	6	51929	51934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452205907
1047	NC_020388	GGC	2	6	51942	51947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205907
1048	NC_020388	ATCC	2	8	51980	51987	25 %	25 %	0 %	50 %	452205907
1049	NC_020388	GGC	2	6	51999	52004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205907
1050	NC_020388	CGC	2	6	52031	52036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205907
1051	NC_020388	G	7	7	52061	52067	0 %	0 %	100 %	0 %	452205907
1052	NC_020388	CTC	2	6	52076	52081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452205907
1053	NC_020388	CCA	2	6	52118	52123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452205907
1054	NC_020388	ACG	2	6	52146	52151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1055	NC_020388	GTC	2	6	52193	52198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1056	NC_020388	ACCG	2	8	52252	52259	25 %	0 %	25 %	50 %	452205907
1057	NC_020388	CAG	2	6	52292	52297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1058	NC_020388	CGT	2	6	52345	52350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1059	NC_020388	CGG	2	6	52355	52360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205907
1060	NC_020388	GCA	2	6	52369	52374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1061	NC_020388	TTC	2	6	52386	52391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452205907
1062	NC_020388	TCG	2	6	52392	52397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1063	NC_020388	GGC	2	6	52439	52444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205907
1064	NC_020388	TCG	3	9	52503	52511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1065	NC_020388	TGA	2	6	52540	52545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452205907
1066	NC_020388	CGT	2	6	52615	52620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1067	NC_020388	ACCGCG	2	12	52621	52632	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	452205907
1068	NC_020388	CGC	2	6	52699	52704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205907
1069	NC_020388	TCG	2	6	52707	52712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1070	NC_020388	TCGCG	2	10	52714	52723	0 %	20 %	40 %	40 %	452205907
1071	NC_020388	ACG	2	6	52756	52761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1072	NC_020388	CGA	2	6	52774	52779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1073	NC_020388	CGCC	2	8	52786	52793	0 %	0 %	25 %	75 %	452205907
1074	NC_020388	TCGT	2	8	52794	52801	0 %	50 %	25 %	25 %	452205907
1075	NC_020388	CGA	2	6	52813	52818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
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1078	NC_020388	CGT	2	6	52984	52989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1079	NC_020388	GACG	2	8	53012	53019	25 %	0 %	50 %	25 %	452205907
1080	NC_020388	GAT	2	6	53026	53031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452205907
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1082	NC_020388	CGGT	2	8	53100	53107	0 %	25 %	50 %	25 %	452205907
1083	NC_020388	GCC	2	6	53141	53146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205907
1084	NC_020388	GAC	3	9	53231	53239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
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1086	NC_020388	GC	3	6	53269	53274	0 %	0 %	50 %	50 %	452205907
1087	NC_020388	GAC	3	9	53318	53326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
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1089	NC_020388	CGA	2	6	53398	53403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205907
1090	NC_020388	CGG	2	6	53422	53427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205907
1091	NC_020388	GC	3	6	53437	53442	0 %	0 %	50 %	50 %	452205907
1092	NC_020388	CGA	2	6	53534	53539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
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1094	NC_020388	TG	3	6	53602	53607	0 %	50 %	50 %	0 %	452205908
1095	NC_020388	CCG	2	6	53611	53616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205908
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1100	NC_020388	GCT	2	6	53912	53917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1101	NC_020388	CTG	2	6	53937	53942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1102	NC_020388	CGA	2	6	53948	53953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
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1104	NC_020388	CGA	2	6	53966	53971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1105	NC_020388	TCG	2	6	53977	53982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1106	NC_020388	GCC	2	6	54000	54005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205908
1107	NC_020388	CCG	2	6	54052	54057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205908
1108	NC_020388	TCG	2	6	54067	54072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1109	NC_020388	GAG	2	6	54087	54092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452205908
1110	NC_020388	CT	3	6	54129	54134	0 %	50 %	0 %	50 %	452205908
1111	NC_020388	GTCGAG	2	12	54135	54146	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452205908
1112	NC_020388	CAT	2	6	54176	54181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452205908
1113	NC_020388	CGA	3	9	54182	54190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
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1115	NC_020388	GAG	2	6	54210	54215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452205908
1116	NC_020388	CGA	3	9	54218	54226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1117	NC_020388	CCG	2	6	54239	54244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205908
1118	NC_020388	GCG	2	6	54251	54256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205908
1119	NC_020388	GTCG	2	8	54275	54282	0 %	25 %	50 %	25 %	452205908
1120	NC_020388	GACG	2	8	54287	54294	25 %	0 %	50 %	25 %	452205908
1121	NC_020388	CG	3	6	54374	54379	0 %	0 %	50 %	50 %	452205908
1122	NC_020388	CGC	2	6	54386	54391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205908
1123	NC_020388	GAC	2	6	54420	54425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1124	NC_020388	CGG	2	6	54433	54438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205908
1125	NC_020388	CGT	2	6	54439	54444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1126	NC_020388	CGA	2	6	54497	54502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1127	NC_020388	CGA	2	6	54509	54514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1128	NC_020388	AGG	2	6	54544	54549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452205908
1129	NC_020388	GCG	2	6	54550	54555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205908
1130	NC_020388	GTC	2	6	54563	54568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1131	NC_020388	CGGAGG	2	12	54592	54603	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	452205908
1132	NC_020388	CGG	3	9	54644	54652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205908
1133	NC_020388	GAC	2	6	54654	54659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
1134	NC_020388	CGA	2	6	54671	54676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
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1137	NC_020388	GAC	2	6	54801	54806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
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1144	NC_020388	CGGA	2	8	55005	55012	25 %	0 %	50 %	25 %	452205908
1145	NC_020388	CGG	3	9	55025	55033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205908
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1152	NC_020388	CCGA	2	8	55293	55300	25 %	0 %	25 %	50 %	452205908
1153	NC_020388	GCCG	2	8	55361	55368	0 %	0 %	50 %	50 %	452205908
1154	NC_020388	GAC	2	6	55376	55381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205908
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1230	NC_020388	ACG	3	9	57948	57956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205913
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1232	NC_020388	GC	3	6	57988	57993	0 %	0 %	50 %	50 %	452205913
1233	NC_020388	CGA	2	6	58015	58020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205913
1234	NC_020388	CGCGG	2	10	58027	58036	0 %	0 %	60 %	40 %	452205913
1235	NC_020388	GTAC	2	8	58083	58090	25 %	25 %	25 %	25 %	452205913
1236	NC_020388	TCA	2	6	58146	58151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452205913
1237	NC_020388	CGG	3	9	58168	58176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205913
1238	NC_020388	TCG	2	6	58185	58190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205913
1239	NC_020388	TCG	2	6	58227	58232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205913
1240	NC_020388	GGGCC	2	10	58282	58291	0 %	0 %	60 %	40 %	452205913
1241	NC_020388	CGG	2	6	58405	58410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205913
1242	NC_020388	A	6	6	58432	58437	100 %	0 %	0 %	0 %	452205913
1243	NC_020388	GGC	2	6	58447	58452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205913
1244	NC_020388	CGA	2	6	58525	58530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205913
1245	NC_020388	CTA	2	6	58564	58569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452205913
1246	NC_020388	CAG	2	6	58589	58594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205913
1247	NC_020388	GGCGA	2	10	58622	58631	20 %	0 %	60 %	20 %	452205913
1248	NC_020388	GTC	3	9	58748	58756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205913
1249	NC_020388	ATC	2	6	58781	58786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452205913
1250	NC_020388	CGGGG	2	10	58791	58800	0 %	0 %	80 %	20 %	452205913
1251	NC_020388	ACG	2	6	58803	58808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205913
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1253	NC_020388	C	6	6	58824	58829	0 %	0 %	0 %	100 %	452205913
1254	NC_020388	GCCG	2	8	58835	58842	0 %	0 %	50 %	50 %	452205913
1255	NC_020388	GTCG	2	8	58921	58928	0 %	25 %	50 %	25 %	452205913
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1262	NC_020388	ACG	2	6	59145	59150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205914
1263	NC_020388	TCG	2	6	59198	59203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205914
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1282	NC_020388	G	6	6	59799	59804	0 %	0 %	100 %	0 %	452205914
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1287	NC_020388	GCCGT	2	10	59921	59930	0 %	20 %	40 %	40 %	452205914
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1370	NC_020388	TTCG	2	8	63139	63146	0 %	50 %	25 %	25 %	452205919
1371	NC_020388	GAAC	2	8	63215	63222	50 %	0 %	25 %	25 %	452205919
1372	NC_020388	CTC	2	6	63272	63277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452205919
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1379	NC_020388	ATCCGG	2	12	63458	63469	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452205919
1380	NC_020388	TCGGG	2	10	63514	63523	0 %	20 %	60 %	20 %	452205919
1381	NC_020388	GAC	2	6	63531	63536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205919
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1384	NC_020388	TCCC	2	8	63598	63605	0 %	25 %	0 %	75 %	452205919
1385	NC_020388	CCG	2	6	63628	63633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205919
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1392	NC_020388	GCGCTC	2	12	63878	63889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	452205919
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1480	NC_020388	GTGGAG	2	12	67226	67237	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	452205924
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1482	NC_020388	CGA	2	6	67261	67266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205924
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1492	NC_020388	CGA	2	6	67654	67659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205924
1493	NC_020388	CTCG	2	8	67673	67680	0 %	25 %	25 %	50 %	452205924
1494	NC_020388	TCG	2	6	67705	67710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205924
1495	NC_020388	CCG	2	6	67718	67723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452205924
1496	NC_020388	GATC	2	8	67724	67731	25 %	25 %	25 %	25 %	452205924
1497	NC_020388	CGG	3	9	67741	67749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452205924
1498	NC_020388	CGA	2	6	67777	67782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452205924
1499	NC_020388	GGGC	2	8	67797	67804	0 %	0 %	75 %	25 %	452205924
1500	NC_020388	GTC	2	6	67872	67877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452205924

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