MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 2

Total Repeats: 298

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019976	TG	3	6	1893	1898	0 %	50 %	50 %	0 %	435849398
2	NC_019976	AG	3	6	3343	3348	50 %	0 %	50 %	0 %	435849399
3	NC_019976	GA	3	6	3599	3604	50 %	0 %	50 %	0 %	435849399
4	NC_019976	AG	3	6	3745	3750	50 %	0 %	50 %	0 %	435849399
5	NC_019976	GA	3	6	4973	4978	50 %	0 %	50 %	0 %	435849400
6	NC_019976	GA	3	6	5588	5593	50 %	0 %	50 %	0 %	435849400
7	NC_019976	CG	3	6	5668	5673	0 %	0 %	50 %	50 %	435849400
8	NC_019976	TC	3	6	5988	5993	0 %	50 %	0 %	50 %	435849400
9	NC_019976	GA	3	6	6040	6045	50 %	0 %	50 %	0 %	435849400
10	NC_019976	GA	3	6	9347	9352	50 %	0 %	50 %	0 %	435849401
11	NC_019976	AG	4	8	9412	9419	50 %	0 %	50 %	0 %	435849401
12	NC_019976	GC	3	6	10860	10865	0 %	0 %	50 %	50 %	435849402
13	NC_019976	CG	3	6	10987	10992	0 %	0 %	50 %	50 %	435849402
14	NC_019976	GC	3	6	11630	11635	0 %	0 %	50 %	50 %	435849402
15	NC_019976	GC	3	6	12005	12010	0 %	0 %	50 %	50 %	435849402
16	NC_019976	AG	3	6	12690	12695	50 %	0 %	50 %	0 %	435849403
17	NC_019976	AT	3	6	12855	12860	50 %	50 %	0 %	0 %	435849403
18	NC_019976	AG	3	6	13386	13391	50 %	0 %	50 %	0 %	435849404
19	NC_019976	AT	3	6	15739	15744	50 %	50 %	0 %	0 %	435849406
20	NC_019976	CT	3	6	16504	16509	0 %	50 %	0 %	50 %	435849407
21	NC_019976	AC	3	6	16861	16866	50 %	0 %	0 %	50 %	435849407
22	NC_019976	GA	3	6	17178	17183	50 %	0 %	50 %	0 %	435849407
23	NC_019976	GA	3	6	19077	19082	50 %	0 %	50 %	0 %	435849408
24	NC_019976	GT	3	6	20216	20221	0 %	50 %	50 %	0 %	435849410
25	NC_019976	TC	3	6	21653	21658	0 %	50 %	0 %	50 %	435849411
26	NC_019976	TC	3	6	24560	24565	0 %	50 %	0 %	50 %	435849413
27	NC_019976	TC	3	6	24780	24785	0 %	50 %	0 %	50 %	435849413
28	NC_019976	CT	3	6	24809	24814	0 %	50 %	0 %	50 %	435849413
29	NC_019976	CA	3	6	25190	25195	50 %	0 %	0 %	50 %	435849413
30	NC_019976	TC	3	6	25991	25996	0 %	50 %	0 %	50 %	435849414
31	NC_019976	GT	3	6	29270	29275	0 %	50 %	50 %	0 %	435849417
32	NC_019976	CT	4	8	29872	29879	0 %	50 %	0 %	50 %	435849418
33	NC_019976	GA	3	6	30176	30181	50 %	0 %	50 %	0 %	435849418
34	NC_019976	GA	3	6	32522	32527	50 %	0 %	50 %	0 %	435849421
35	NC_019976	TG	3	6	32557	32562	0 %	50 %	50 %	0 %	435849421
36	NC_019976	TC	3	6	36598	36603	0 %	50 %	0 %	50 %	435849426
37	NC_019976	GA	3	6	37220	37225	50 %	0 %	50 %	0 %	435849427
38	NC_019976	GC	3	6	38414	38419	0 %	0 %	50 %	50 %	435849428
39	NC_019976	TA	3	6	38465	38470	50 %	50 %	0 %	0 %	435849428
40	NC_019976	GA	3	6	39618	39623	50 %	0 %	50 %	0 %	435849429
41	NC_019976	TC	3	6	39898	39903	0 %	50 %	0 %	50 %	435849429
42	NC_019976	GA	3	6	42285	42290	50 %	0 %	50 %	0 %	435849432
43	NC_019976	CA	3	6	42306	42311	50 %	0 %	0 %	50 %	435849432
44	NC_019976	AC	3	6	43449	43454	50 %	0 %	0 %	50 %	435849434
45	NC_019976	GA	3	6	46190	46195	50 %	0 %	50 %	0 %	435849438
46	NC_019976	GT	3	6	48588	48593	0 %	50 %	50 %	0 %	435849440
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48	NC_019976	TC	3	6	50444	50449	0 %	50 %	0 %	50 %	435849441
49	NC_019976	GC	3	6	50536	50541	0 %	0 %	50 %	50 %	435849441
50	NC_019976	GA	3	6	52619	52624	50 %	0 %	50 %	0 %	435849443
51	NC_019976	CA	3	6	53174	53179	50 %	0 %	0 %	50 %	435849443
52	NC_019976	CG	3	6	53623	53628	0 %	0 %	50 %	50 %	435849444
53	NC_019976	GT	3	6	55341	55346	0 %	50 %	50 %	0 %	435849447
54	NC_019976	CA	3	6	55618	55623	50 %	0 %	0 %	50 %	435849448
55	NC_019976	TG	4	8	56290	56297	0 %	50 %	50 %	0 %	435849449
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57	NC_019976	GT	3	6	56617	56622	0 %	50 %	50 %	0 %	435849449
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59	NC_019976	GA	3	6	62117	62122	50 %	0 %	50 %	0 %	435849454
60	NC_019976	GC	3	6	63483	63488	0 %	0 %	50 %	50 %	435849456
61	NC_019976	CG	3	6	64720	64725	0 %	0 %	50 %	50 %	435849457
62	NC_019976	CG	3	6	65183	65188	0 %	0 %	50 %	50 %	435849457
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65	NC_019976	AC	4	8	66529	66536	50 %	0 %	0 %	50 %	435849458
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68	NC_019976	GA	3	6	70043	70048	50 %	0 %	50 %	0 %	435849461
69	NC_019976	CT	3	6	70440	70445	0 %	50 %	0 %	50 %	435849461
70	NC_019976	CG	3	6	70539	70544	0 %	0 %	50 %	50 %	435849461
71	NC_019976	CA	3	6	71796	71801	50 %	0 %	0 %	50 %	435849462
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73	NC_019976	AC	3	6	72986	72991	50 %	0 %	0 %	50 %	435849462
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83	NC_019976	AT	3	6	83334	83339	50 %	50 %	0 %	0 %	435849471
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107	NC_019976	CG	3	6	106337	106342	0 %	0 %	50 %	50 %	435849494
108	NC_019976	TC	3	6	106470	106475	0 %	50 %	0 %	50 %	435849494
109	NC_019976	GA	3	6	107043	107048	50 %	0 %	50 %	0 %	435849495
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111	NC_019976	TC	3	6	111398	111403	0 %	50 %	0 %	50 %	435849497
112	NC_019976	CT	3	6	112993	112998	0 %	50 %	0 %	50 %	435849498
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.