MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 3378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019967	CAA	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
2	NC_019967	GAG	2	6	533	538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
3	NC_019967	GAG	2	6	545	550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
4	NC_019967	GAG	2	6	554	559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
5	NC_019967	CGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
6	NC_019967	AAC	2	6	602	607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
7	NC_019967	CCG	2	6	642	647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593319
8	NC_019967	CTG	2	6	786	791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
9	NC_019967	CAA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
10	NC_019967	AAC	3	9	953	961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
11	NC_019967	ATG	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593319
12	NC_019967	GCT	2	6	1178	1183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
13	NC_019967	CCT	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593319
14	NC_019967	GCA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593319
15	NC_019967	GGA	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
16	NC_019967	GAC	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593319
17	NC_019967	GCC	2	6	1382	1387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593319
18	NC_019967	ATC	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593319
19	NC_019967	ACT	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593319
20	NC_019967	AAC	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
21	NC_019967	CTG	2	6	2226	2231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
22	NC_019967	CTC	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593320
23	NC_019967	TCG	2	6	2260	2265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
24	NC_019967	AGC	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593320
25	NC_019967	CTG	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
26	NC_019967	ACG	2	6	2592	2597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593320
27	NC_019967	GTT	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593320
28	NC_019967	GGA	2	6	2864	2869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593320
29	NC_019967	CAC	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593320
30	NC_019967	TCG	2	6	3079	3084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
31	NC_019967	CGT	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
32	NC_019967	CAC	2	6	3157	3162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593320
33	NC_019967	TGA	2	6	3245	3250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593320
34	NC_019967	CGG	2	6	3251	3256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593320
35	NC_019967	CGG	2	6	3259	3264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593320
36	NC_019967	TCG	2	6	3479	3484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
37	NC_019967	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
38	NC_019967	CGT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
39	NC_019967	TCC	3	9	3614	3622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593321
40	NC_019967	CCT	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593321
41	NC_019967	CGT	2	6	3726	3731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
42	NC_019967	ATC	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593321
43	NC_019967	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593321
44	NC_019967	CAG	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593321
45	NC_019967	TCG	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
46	NC_019967	GAT	3	9	4243	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593321
47	NC_019967	CTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593321
48	NC_019967	TCG	2	6	4699	4704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
49	NC_019967	GCG	2	6	4810	4815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593322
50	NC_019967	TCG	3	9	4831	4839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
51	NC_019967	GTC	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
52	NC_019967	GGC	2	6	4971	4976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593322
53	NC_019967	GTC	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
54	NC_019967	CTT	2	6	5645	5650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593323
55	NC_019967	GCG	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593323
56	NC_019967	TCG	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
57	NC_019967	GTG	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593323
58	NC_019967	GCT	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
59	NC_019967	CGT	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
60	NC_019967	CCT	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593323
61	NC_019967	GCC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593323
62	NC_019967	AAC	2	6	6180	6185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593323
63	NC_019967	CTT	2	6	6262	6267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593323
64	NC_019967	TTC	3	9	6455	6463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593324
65	NC_019967	GTC	2	6	6479	6484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593324
66	NC_019967	CGA	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
67	NC_019967	CGC	3	9	6569	6577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
68	NC_019967	AGC	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
69	NC_019967	CCG	2	6	6622	6627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
70	NC_019967	CGC	2	6	6641	6646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
71	NC_019967	CGT	2	6	6751	6756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593324
72	NC_019967	CGA	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
73	NC_019967	TCA	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593324
74	NC_019967	TGA	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593324
75	NC_019967	CGC	2	6	6839	6844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
76	NC_019967	AGG	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593324
77	NC_019967	GCC	2	6	6944	6949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
78	NC_019967	GGA	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593324
79	NC_019967	GCC	2	6	7017	7022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
80	NC_019967	GAC	2	6	7028	7033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
81	NC_019967	GCC	2	6	7055	7060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
82	NC_019967	ATC	2	6	7062	7067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593324
83	NC_019967	TCG	2	6	7326	7331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593324
84	NC_019967	CGA	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
85	NC_019967	TTC	2	6	7454	7459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593324
86	NC_019967	GGT	2	6	7460	7465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593324
87	NC_019967	GTT	2	6	7502	7507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593324
88	NC_019967	AAG	2	6	8302	8307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593325
89	NC_019967	TGC	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
90	NC_019967	GCT	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
91	NC_019967	GCT	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
92	NC_019967	TCG	2	6	8435	8440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
93	NC_019967	CAG	2	6	8462	8467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593325
94	NC_019967	CAA	2	6	8527	8532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593325
95	NC_019967	CGA	2	6	8621	8626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593325
96	NC_019967	GAG	2	6	8644	8649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593325
97	NC_019967	TCG	2	6	8690	8695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
98	NC_019967	GCG	2	6	8696	8701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593325
99	NC_019967	CGA	2	6	8724	8729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593325
100	NC_019967	TCT	2	6	8735	8740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593325
101	NC_019967	CGA	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593325
102	NC_019967	TCG	2	6	8792	8797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
103	NC_019967	CGA	2	6	8805	8810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593325
104	NC_019967	CCT	2	6	8841	8846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593325
105	NC_019967	ACC	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593326
106	NC_019967	CGG	2	6	8974	8979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593326
107	NC_019967	GCC	2	6	9017	9022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593326
108	NC_019967	CAG	2	6	9179	9184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593326
109	NC_019967	CGA	2	6	9211	9216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593326
110	NC_019967	GCG	2	6	9221	9226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593326
111	NC_019967	ACA	2	6	9284	9289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593326
112	NC_019967	CTC	2	6	9434	9439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593326
113	NC_019967	TGA	2	6	9444	9449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593326
114	NC_019967	CTC	2	6	9518	9523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593326
115	NC_019967	CGA	2	6	9577	9582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593326
116	NC_019967	CGA	2	6	9613	9618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593326
117	NC_019967	GTT	2	6	9685	9690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593326
118	NC_019967	TCG	2	6	9748	9753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593327
119	NC_019967	CTG	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593327
120	NC_019967	GCC	2	6	9796	9801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593327
121	NC_019967	CGA	2	6	9812	9817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593327
122	NC_019967	TCG	2	6	9847	9852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593327
123	NC_019967	GGC	2	6	9858	9863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593327
124	NC_019967	CGT	3	9	9884	9892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593327
125	NC_019967	GCG	2	6	9895	9900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593327
126	NC_019967	CTT	2	6	10017	10022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593327
127	NC_019967	CGT	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593328
128	NC_019967	TCG	2	6	10459	10464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593328
129	NC_019967	CGG	2	6	10475	10480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593328
130	NC_019967	GCC	2	6	10495	10500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593328
131	NC_019967	CGT	2	6	10511	10516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593328
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133	NC_019967	CGT	2	6	10542	10547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593328
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238	NC_019967	TGA	2	6	19466	19471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593337
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243	NC_019967	GTC	2	6	19590	19595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593337
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245	NC_019967	CCT	2	6	19703	19708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593337
246	NC_019967	GAT	2	6	19832	19837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593337
247	NC_019967	CGA	2	6	19898	19903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593337
248	NC_019967	CCG	2	6	19925	19930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593337
249	NC_019967	ACT	2	6	19969	19974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593337
250	NC_019967	GGC	2	6	20306	20311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593338
251	NC_019967	GCG	2	6	20470	20475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593338
252	NC_019967	TGG	2	6	20542	20547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593338
253	NC_019967	GTC	2	6	20573	20578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593338
254	NC_019967	ACT	2	6	20664	20669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593338
255	NC_019967	GTC	2	6	20701	20706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593338
256	NC_019967	GAT	2	6	20710	20715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593338
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259	NC_019967	TCG	2	6	20999	21004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593339
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270	NC_019967	CGA	2	6	21576	21581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593340
271	NC_019967	TGA	2	6	21582	21587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593340
272	NC_019967	CGG	2	6	21594	21599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593340
273	NC_019967	GCT	2	6	21603	21608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593340
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281	NC_019967	GTC	2	6	22353	22358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593342
282	NC_019967	GGC	2	6	22371	22376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593342
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493	NC_019967	ACC	2	6	36629	36634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593354
494	NC_019967	AGT	2	6	36661	36666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593354
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496	NC_019967	AAG	2	6	36879	36884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593354
497	NC_019967	CCA	2	6	36889	36894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593354
498	NC_019967	CCA	2	6	37124	37129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593355
499	NC_019967	TCC	2	6	37247	37252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593355
500	NC_019967	TCG	2	6	37298	37303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593355

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