MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 4650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019967	GTC	2	6	88828	88833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593403
1502	NC_019967	TCC	2	6	88917	88922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593403
1503	NC_019967	GAA	2	6	88946	88951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593403
1504	NC_019967	ATC	2	6	89003	89008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593403
1505	NC_019967	CGG	2	6	89123	89128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593403
1506	NC_019967	GCT	2	6	89139	89144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593403
1507	NC_019967	CAT	3	9	89200	89208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593403
1508	NC_019967	ACG	2	6	89211	89216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593403
1509	NC_019967	CCT	2	6	89224	89229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593403
1510	NC_019967	ACG	2	6	89241	89246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593403
1511	NC_019967	TCG	2	6	89268	89273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593403
1512	NC_019967	CG	3	6	89280	89285	0 %	0 %	50 %	50 %	433593403
1513	NC_019967	GAG	2	6	89318	89323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593403
1514	NC_019967	TC	3	6	89605	89610	0 %	50 %	0 %	50 %	433593404
1515	NC_019967	GTC	2	6	89630	89635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1516	NC_019967	CAC	2	6	89671	89676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593404
1517	NC_019967	AAC	2	6	89685	89690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593404
1518	NC_019967	TTC	2	6	89750	89755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593404
1519	NC_019967	GC	3	6	89767	89772	0 %	0 %	50 %	50 %	433593404
1520	NC_019967	CGA	2	6	89839	89844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1521	NC_019967	ACC	2	6	89866	89871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593404
1522	NC_019967	AAC	2	6	90054	90059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593404
1523	NC_019967	GAG	2	6	90065	90070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593404
1524	NC_019967	ACCG	2	8	90076	90083	25 %	0 %	25 %	50 %	433593404
1525	NC_019967	GTC	2	6	90213	90218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1526	NC_019967	GTCA	2	8	90263	90270	25 %	25 %	25 %	25 %	433593404
1527	NC_019967	GTA	2	6	90380	90385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593404
1528	NC_019967	CCG	2	6	90393	90398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593404
1529	NC_019967	TTC	2	6	90422	90427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593404
1530	NC_019967	GGA	2	6	90445	90450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593404
1531	NC_019967	GCG	2	6	90459	90464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593404
1532	NC_019967	GAG	2	6	90527	90532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593404
1533	NC_019967	AGC	2	6	90533	90538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1534	NC_019967	CTC	2	6	90539	90544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593404
1535	NC_019967	CAT	2	6	90545	90550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593404
1536	NC_019967	CGA	2	6	90565	90570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1537	NC_019967	CTG	2	6	90590	90595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1538	NC_019967	GGAA	2	8	90626	90633	50 %	0 %	50 %	0 %	433593404
1539	NC_019967	GAC	3	9	90674	90682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1540	NC_019967	GAG	2	6	90707	90712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593404
1541	NC_019967	CGG	2	6	90757	90762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593404
1542	NC_019967	CGA	2	6	90769	90774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1543	NC_019967	TCG	2	6	90777	90782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1544	NC_019967	GTC	3	9	90795	90803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1545	NC_019967	GAC	2	6	90818	90823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1546	NC_019967	CGT	2	6	90826	90831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593404
1547	NC_019967	AGTG	2	8	90843	90850	25 %	25 %	50 %	0 %	433593404
1548	NC_019967	C	6	6	90904	90909	0 %	0 %	0 %	100 %	433593404
1549	NC_019967	TCC	2	6	91279	91284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593405
1550	NC_019967	CGA	2	6	91415	91420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1551	NC_019967	GTC	3	9	91467	91475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1552	NC_019967	CGA	2	6	91577	91582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1553	NC_019967	GCT	2	6	91589	91594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1554	NC_019967	TCGCC	2	10	91607	91616	0 %	20 %	20 %	60 %	433593405
1555	NC_019967	GTC	2	6	91662	91667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1556	NC_019967	CGA	2	6	91688	91693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1557	NC_019967	CTC	2	6	91806	91811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593405
1558	NC_019967	GCG	2	6	91814	91819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593405
1559	NC_019967	TCG	2	6	91822	91827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1560	NC_019967	AGTCAC	2	12	91829	91840	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433593405
1561	NC_019967	TGA	2	6	91889	91894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593405
1562	NC_019967	CCAGAT	2	12	91902	91913	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433593405
1563	NC_019967	CTC	2	6	91947	91952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593405
1564	NC_019967	TGA	2	6	92003	92008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593405
1565	NC_019967	AGT	2	6	92027	92032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593405
1566	NC_019967	CGT	2	6	92087	92092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1567	NC_019967	CGA	2	6	92102	92107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1568	NC_019967	GTC	2	6	92109	92114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1569	NC_019967	TCG	2	6	92143	92148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1570	NC_019967	CGA	2	6	92178	92183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593405
1571	NC_019967	TCG	2	6	92348	92353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593406
1572	NC_019967	C	6	6	92432	92437	0 %	0 %	0 %	100 %	433593406
1573	NC_019967	ACC	2	6	92451	92456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593406
1574	NC_019967	CGG	2	6	92491	92496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593406
1575	NC_019967	TCGAT	2	10	92523	92532	20 %	40 %	20 %	20 %	433593406
1576	NC_019967	TG	3	6	92570	92575	0 %	50 %	50 %	0 %	433593406
1577	NC_019967	GTC	2	6	92596	92601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593406
1578	NC_019967	TGT	2	6	92624	92629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593406
1579	NC_019967	ATA	2	6	92636	92641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433593406
1580	NC_019967	AT	3	6	93995	94000	50 %	50 %	0 %	0 %	433593407
1581	NC_019967	CTT	2	6	94006	94011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593407
1582	NC_019967	GGA	2	6	94014	94019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593407
1583	NC_019967	ATC	2	6	94030	94035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593407
1584	NC_019967	CGA	2	6	94113	94118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593407
1585	NC_019967	TCC	2	6	94136	94141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593407
1586	NC_019967	CAG	2	6	94150	94155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593407
1587	NC_019967	CAG	2	6	94215	94220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593407
1588	NC_019967	CTC	2	6	94228	94233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593407
1589	NC_019967	GCT	2	6	94328	94333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593407
1590	NC_019967	CAC	2	6	94391	94396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593407
1591	NC_019967	CGG	2	6	94452	94457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593407
1592	NC_019967	GCG	2	6	94476	94481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593407
1593	NC_019967	TCGGA	2	10	94506	94515	20 %	20 %	40 %	20 %	433593407
1594	NC_019967	GCG	2	6	94542	94547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593407
1595	NC_019967	AC	3	6	94630	94635	50 %	0 %	0 %	50 %	433593407
1596	NC_019967	AGT	2	6	94655	94660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593407
1597	NC_019967	TCG	2	6	94793	94798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593407
1598	NC_019967	TCC	2	6	94847	94852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593407
1599	NC_019967	ATC	2	6	94910	94915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593407
1600	NC_019967	GAC	2	6	94965	94970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593408
1601	NC_019967	TCG	2	6	95047	95052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593408
1602	NC_019967	TCG	2	6	95116	95121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593408
1603	NC_019967	CGA	2	6	95144	95149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593408
1604	NC_019967	CTC	2	6	95160	95165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593408
1605	NC_019967	CAG	2	6	95208	95213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593408
1606	NC_019967	GAG	2	6	95253	95258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593408
1607	NC_019967	GCTG	2	8	95263	95270	0 %	25 %	50 %	25 %	433593408
1608	NC_019967	TTG	2	6	95329	95334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593408
1609	NC_019967	AGC	2	6	95392	95397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593408
1610	NC_019967	GGA	2	6	95420	95425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593408
1611	NC_019967	GCC	2	6	95478	95483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593408
1612	NC_019967	TCC	2	6	95654	95659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593409
1613	NC_019967	CGT	2	6	95661	95666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593409
1614	NC_019967	CAC	2	6	95673	95678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593409
1615	NC_019967	TCC	2	6	95696	95701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593409
1616	NC_019967	CCA	2	6	95716	95721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593409
1617	NC_019967	TCG	2	6	95798	95803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593409
1618	NC_019967	AAGC	2	8	95834	95841	50 %	0 %	25 %	25 %	433593409
1619	NC_019967	TC	3	6	95868	95873	0 %	50 %	0 %	50 %	433593409
1620	NC_019967	GTCG	2	8	95997	96004	0 %	25 %	50 %	25 %	433593409
1621	NC_019967	TC	3	6	96394	96399	0 %	50 %	0 %	50 %	433593410
1622	NC_019967	CGA	2	6	96499	96504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593410
1623	NC_019967	CGA	2	6	96625	96630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593410
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1985	NC_019967	GAC	2	6	123199	123204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593430
1986	NC_019967	GCA	2	6	123286	123291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593430
1987	NC_019967	GACTGC	2	12	123349	123360	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433593430
1988	NC_019967	ATG	2	6	123454	123459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593430
1989	NC_019967	GTA	2	6	123498	123503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593430
1990	NC_019967	GAACT	2	10	123694	123703	40 %	20 %	20 %	20 %	433593430
1991	NC_019967	GTCG	2	8	123711	123718	0 %	25 %	50 %	25 %	433593430
1992	NC_019967	CAT	3	9	123770	123778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593430
1993	NC_019967	GTC	2	6	123787	123792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593430
1994	NC_019967	CAA	2	6	123831	123836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593430
1995	NC_019967	GCT	2	6	123878	123883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593430
1996	NC_019967	CCG	2	6	123912	123917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593430
1997	NC_019967	GAC	2	6	124073	124078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593431
1998	NC_019967	GAA	2	6	124111	124116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593431
1999	NC_019967	TCGC	2	8	124214	124221	0 %	25 %	25 %	50 %	433593431
2000	NC_019967	CGC	3	9	124219	124227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593431

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