MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 4650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019967	CGA	2	6	54928	54933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1002	NC_019967	CCG	2	6	55022	55027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593370
1003	NC_019967	TCG	2	6	55032	55037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1004	NC_019967	GA	3	6	55038	55043	50 %	0 %	50 %	0 %	433593370
1005	NC_019967	TCC	2	6	55083	55088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593370
1006	NC_019967	TCC	2	6	55116	55121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593370
1007	NC_019967	TCG	2	6	55122	55127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1008	NC_019967	CTC	2	6	55154	55159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593370
1009	NC_019967	CG	3	6	55171	55176	0 %	0 %	50 %	50 %	433593370
1010	NC_019967	CTTC	2	8	55213	55220	0 %	50 %	0 %	50 %	433593370
1011	NC_019967	ACGC	2	8	55234	55241	25 %	0 %	25 %	50 %	433593370
1012	NC_019967	CTT	2	6	55310	55315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593370
1013	NC_019967	CGC	3	9	55316	55324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593370
1014	NC_019967	CCG	2	6	55325	55330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593370
1015	NC_019967	CAT	2	6	55337	55342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593370
1016	NC_019967	TCGG	2	8	55358	55365	0 %	25 %	50 %	25 %	433593370
1017	NC_019967	CCT	2	6	55366	55371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593370
1018	NC_019967	ATCGA	2	10	55403	55412	40 %	20 %	20 %	20 %	433593370
1019	NC_019967	CCGT	2	8	55469	55476	0 %	25 %	25 %	50 %	433593370
1020	NC_019967	C	6	6	55488	55493	0 %	0 %	0 %	100 %	433593370
1021	NC_019967	CAG	2	6	55496	55501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1022	NC_019967	CGT	2	6	55570	55575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1023	NC_019967	ACA	2	6	55587	55592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593370
1024	NC_019967	TCG	2	6	55614	55619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1025	NC_019967	ATGC	2	8	55620	55627	25 %	25 %	25 %	25 %	433593370
1026	NC_019967	CGC	2	6	55630	55635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593370
1027	NC_019967	GTC	2	6	55688	55693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1028	NC_019967	CCG	3	9	55699	55707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593370
1029	NC_019967	CGC	2	6	55718	55723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593370
1030	NC_019967	GAAG	2	8	55780	55787	50 %	0 %	50 %	0 %	433593370
1031	NC_019967	AGG	2	6	55818	55823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593370
1032	NC_019967	ACC	2	6	55858	55863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593370
1033	NC_019967	CAG	2	6	55937	55942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1034	NC_019967	CGG	2	6	55966	55971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593370
1035	NC_019967	CTCTC	2	10	56025	56034	0 %	40 %	0 %	60 %	433593370
1036	NC_019967	GAC	2	6	56036	56041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1037	NC_019967	TGCC	2	8	56042	56049	0 %	25 %	25 %	50 %	433593370
1038	NC_019967	GGT	2	6	56057	56062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593370
1039	NC_019967	CG	3	6	56071	56076	0 %	0 %	50 %	50 %	433593370
1040	NC_019967	CTC	2	6	56093	56098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593370
1041	NC_019967	ATG	2	6	56151	56156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593370
1042	NC_019967	CAC	2	6	56191	56196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593370
1043	NC_019967	GCT	2	6	56215	56220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1044	NC_019967	TGG	2	6	56235	56240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593370
1045	NC_019967	CGA	2	6	56258	56263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1046	NC_019967	CGA	2	6	56383	56388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1047	NC_019967	CAG	2	6	56435	56440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1048	NC_019967	TC	3	6	56587	56592	0 %	50 %	0 %	50 %	433593370
1049	NC_019967	GTC	2	6	56609	56614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593370
1050	NC_019967	CAT	2	6	56641	56646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593370
1051	NC_019967	GAGC	2	8	56689	56696	25 %	0 %	50 %	25 %	433593370
1052	NC_019967	TCC	2	6	56706	56711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593370
1053	NC_019967	GTA	2	6	56714	56719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593370
1054	NC_019967	GGA	2	6	56725	56730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593370
1055	NC_019967	TCC	2	6	57002	57007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593371
1056	NC_019967	CGA	2	6	57017	57022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593371
1057	NC_019967	CGT	2	6	57101	57106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593371
1058	NC_019967	GTG	2	6	57122	57127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593371
1059	NC_019967	GTC	2	6	57138	57143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593371
1060	NC_019967	CGT	2	6	57150	57155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593371
1061	NC_019967	GCC	2	6	57181	57186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593371
1062	NC_019967	GCC	2	6	57247	57252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593371
1063	NC_019967	TTC	2	6	57253	57258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593371
1064	NC_019967	ACG	2	6	57279	57284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593371
1065	NC_019967	TCG	2	6	57301	57306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593371
1066	NC_019967	CGA	2	6	57314	57319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593371
1067	NC_019967	CAG	2	6	57324	57329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593371
1068	NC_019967	CG	3	6	57337	57342	0 %	0 %	50 %	50 %	433593371
1069	NC_019967	CGT	2	6	57413	57418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593371
1070	NC_019967	GA	3	6	57450	57455	50 %	0 %	50 %	0 %	433593371
1071	NC_019967	GCCGC	2	10	57482	57491	0 %	0 %	40 %	60 %	433593371
1072	NC_019967	CTG	3	9	57552	57560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593371
1073	NC_019967	GCT	2	6	57561	57566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593371
1074	NC_019967	ACCA	2	8	57570	57577	50 %	0 %	0 %	50 %	433593371
1075	NC_019967	CGC	2	6	58003	58008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593372
1076	NC_019967	AAC	2	6	58077	58082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593372
1077	NC_019967	ACG	2	6	58115	58120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593372
1078	NC_019967	TCG	2	6	58191	58196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593372
1079	NC_019967	CGA	2	6	58237	58242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593372
1080	NC_019967	GATCG	2	10	58343	58352	20 %	20 %	40 %	20 %	433593372
1081	NC_019967	TTC	2	6	58397	58402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593372
1082	NC_019967	CTC	2	6	58469	58474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593372
1083	NC_019967	GAC	2	6	58489	58494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593372
1084	NC_019967	AGAT	2	8	58537	58544	50 %	25 %	25 %	0 %	433593372
1085	NC_019967	GAG	2	6	58559	58564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593372
1086	NC_019967	CGG	2	6	58838	58843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593373
1087	NC_019967	AATC	2	8	58844	58851	50 %	25 %	0 %	25 %	433593373
1088	NC_019967	AAG	2	6	58856	58861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593373
1089	NC_019967	TAC	2	6	58879	58884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593373
1090	NC_019967	TGA	2	6	58913	58918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593373
1091	NC_019967	AGCG	2	8	59000	59007	25 %	0 %	50 %	25 %	433593373
1092	NC_019967	ACG	2	6	59009	59014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593373
1093	NC_019967	CGAGT	2	10	59074	59083	20 %	20 %	40 %	20 %	433593373
1094	NC_019967	AACC	2	8	59618	59625	50 %	0 %	0 %	50 %	433593374
1095	NC_019967	GGAA	2	8	59626	59633	50 %	0 %	50 %	0 %	433593374
1096	NC_019967	TTCT	2	8	59769	59776	0 %	75 %	0 %	25 %	433593374
1097	NC_019967	CT	3	6	59803	59808	0 %	50 %	0 %	50 %	433593374
1098	NC_019967	CAC	2	6	59940	59945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593374
1099	NC_019967	TCG	2	6	59992	59997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593374
1100	NC_019967	TCG	2	6	60001	60006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593374
1101	NC_019967	TTA	2	6	60019	60024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433593374
1102	NC_019967	TCG	2	6	60046	60051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593374
1103	NC_019967	TCG	2	6	60070	60075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593374
1104	NC_019967	GAT	2	6	60173	60178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593374
1105	NC_019967	CTC	2	6	60192	60197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593374
1106	NC_019967	T	6	6	60222	60227	0 %	100 %	0 %	0 %	433593374
1107	NC_019967	TCGA	2	8	60249	60256	25 %	25 %	25 %	25 %	433593374
1108	NC_019967	TTG	2	6	60267	60272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593374
1109	NC_019967	TCG	2	6	60277	60282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593374
1110	NC_019967	GAGT	2	8	60314	60321	25 %	25 %	50 %	0 %	433593374
1111	NC_019967	CCT	2	6	60331	60336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593374
1112	NC_019967	CGT	2	6	60386	60391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593374
1113	NC_019967	CGG	2	6	60392	60397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593374
1114	NC_019967	CTTC	2	8	60398	60405	0 %	50 %	0 %	50 %	433593374
1115	NC_019967	TGA	2	6	60431	60436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593374
1116	NC_019967	TCT	2	6	60493	60498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593374
1117	NC_019967	TCT	2	6	60521	60526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593374
1118	NC_019967	CACTA	2	10	60537	60546	40 %	20 %	0 %	40 %	433593374
1119	NC_019967	CGC	2	6	61931	61936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593375
1120	NC_019967	GTCA	2	8	61943	61950	25 %	25 %	25 %	25 %	433593375
1121	NC_019967	GAC	2	6	61959	61964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593375
1122	NC_019967	ACC	2	6	62004	62009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593375
1123	NC_019967	GGC	2	6	62015	62020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593375
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1125	NC_019967	CTG	2	6	62091	62096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593375
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1246	NC_019967	CGG	2	6	66947	66952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593382
1247	NC_019967	CA	3	6	67157	67162	50 %	0 %	0 %	50 %	433593383
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1497	NC_019967	TGA	2	6	88154	88159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593402
1498	NC_019967	GTT	2	6	88184	88189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593402
1499	NC_019967	GCTT	2	8	88199	88206	0 %	50 %	25 %	25 %	433593402
1500	NC_019967	GTA	2	6	88781	88786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593403

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