MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 4650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019967	ACGT	2	8	278024	278031	25 %	25 %	25 %	25 %	433593576
4502	NC_019967	GAT	2	6	278195	278200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593576
4503	NC_019967	CAG	2	6	278246	278251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593576
4504	NC_019967	GA	3	6	278276	278281	50 %	0 %	50 %	0 %	433593576
4505	NC_019967	CGA	2	6	278419	278424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593576
4506	NC_019967	GAG	2	6	278435	278440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593576
4507	NC_019967	GCTC	2	8	278443	278450	0 %	25 %	25 %	50 %	433593576
4508	NC_019967	TC	3	6	278449	278454	0 %	50 %	0 %	50 %	433593576
4509	NC_019967	ACG	2	6	278457	278462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593576
4510	NC_019967	CGA	2	6	278488	278493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593576
4511	NC_019967	GGA	2	6	278560	278565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593576
4512	NC_019967	G	6	6	278593	278598	0 %	0 %	100 %	0 %	433593576
4513	NC_019967	CCG	2	6	278720	278725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593576
4514	NC_019967	GAG	2	6	278786	278791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593576
4515	NC_019967	CGA	2	6	278824	278829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593576
4516	NC_019967	GAG	2	6	278849	278854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593576
4517	NC_019967	CCGG	2	8	278947	278954	0 %	0 %	50 %	50 %	433593576
4518	NC_019967	CAG	2	6	278998	279003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593576
4519	NC_019967	AGC	2	6	279044	279049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593576
4520	NC_019967	TCG	2	6	279084	279089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593576
4521	NC_019967	GAG	2	6	279146	279151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593576
4522	NC_019967	GAG	2	6	279167	279172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593576
4523	NC_019967	ACG	2	6	279255	279260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593576
4524	NC_019967	GCCATC	2	12	279263	279274	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433593576
4525	NC_019967	GTC	2	6	279311	279316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593576
4526	NC_019967	GGA	2	6	279328	279333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593576
4527	NC_019967	GCCGA	2	10	279371	279380	20 %	0 %	40 %	40 %	433593576
4528	NC_019967	GAG	2	6	279386	279391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593576
4529	NC_019967	GGA	2	6	279541	279546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593576
4530	NC_019967	GAG	2	6	279554	279559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593576
4531	NC_019967	TCG	2	6	279655	279660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593577
4532	NC_019967	TCG	2	6	279701	279706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593577
4533	NC_019967	TG	3	6	279727	279732	0 %	50 %	50 %	0 %	433593577
4534	NC_019967	GAGT	2	8	279755	279762	25 %	25 %	50 %	0 %	433593577
4535	NC_019967	GAC	2	6	279806	279811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593577
4536	NC_019967	GT	3	6	279837	279842	0 %	50 %	50 %	0 %	433593577
4537	NC_019967	CGA	2	6	279908	279913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593577
4538	NC_019967	GAG	2	6	279969	279974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593577
4539	NC_019967	TCG	2	6	279985	279990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593577
4540	NC_019967	GAC	2	6	280001	280006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593577
4541	NC_019967	CAC	2	6	280040	280045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593577
4542	NC_019967	CGA	2	6	280139	280144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593577
4543	NC_019967	ACT	3	9	280255	280263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593577
4544	NC_019967	AGG	2	6	280273	280278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593577
4545	NC_019967	GCT	2	6	280344	280349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593577
4546	NC_019967	CGG	2	6	280671	280676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593578
4547	NC_019967	CGA	2	6	280699	280704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593578
4548	NC_019967	TACT	2	8	280731	280738	25 %	50 %	0 %	25 %	433593578
4549	NC_019967	G	6	6	280800	280805	0 %	0 %	100 %	0 %	433593578
4550	NC_019967	CCT	2	6	280888	280893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593578
4551	NC_019967	GCT	2	6	280908	280913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593578
4552	NC_019967	CTC	2	6	281061	281066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593579
4553	NC_019967	GCA	2	6	281067	281072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593579
4554	NC_019967	CCT	2	6	281117	281122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593579
4555	NC_019967	CT	3	6	281121	281126	0 %	50 %	0 %	50 %	433593579
4556	NC_019967	TGC	2	6	281129	281134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593579
4557	NC_019967	CGA	2	6	281174	281179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593579
4558	NC_019967	ACA	2	6	281233	281238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593579
4559	NC_019967	GCC	2	6	281305	281310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593579
4560	NC_019967	ACC	2	6	282079	282084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593580
4561	NC_019967	CGA	3	9	282096	282104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593580
4562	NC_019967	GAC	2	6	282141	282146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593581
4563	NC_019967	CAC	2	6	282170	282175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593581
4564	NC_019967	AC	3	6	282188	282193	50 %	0 %	0 %	50 %	433593581
4565	NC_019967	CTT	2	6	282201	282206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593581
4566	NC_019967	CGA	2	6	282209	282214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593581
4567	NC_019967	CCTACA	2	12	282265	282276	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	433593581
4568	NC_019967	ACG	2	6	282292	282297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593581
4569	NC_019967	GT	3	6	282341	282346	0 %	50 %	50 %	0 %	433593581
4570	NC_019967	CACG	2	8	282359	282366	25 %	0 %	25 %	50 %	433593581
4571	NC_019967	CAAC	2	8	282464	282471	50 %	0 %	0 %	50 %	433593581
4572	NC_019967	CA	3	6	282483	282488	50 %	0 %	0 %	50 %	433593581
4573	NC_019967	AAC	2	6	282526	282531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593581
4574	NC_019967	CGAC	2	8	282545	282552	25 %	0 %	25 %	50 %	433593581
4575	NC_019967	GTG	2	6	282684	282689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593581
4576	NC_019967	GGTTGG	2	12	282779	282790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593581
4577	NC_019967	TGA	2	6	282941	282946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593581
4578	NC_019967	AC	3	6	282960	282965	50 %	0 %	0 %	50 %	433593581
4579	NC_019967	GCG	2	6	283067	283072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593581
4580	NC_019967	TGAG	2	8	283111	283118	25 %	25 %	50 %	0 %	433593581
4581	NC_019967	CAG	2	6	283122	283127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593581
4582	NC_019967	AGAA	2	8	283135	283142	75 %	0 %	25 %	0 %	433593581
4583	NC_019967	GGC	2	6	283196	283201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593581
4584	NC_019967	TAG	2	6	283286	283291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593581
4585	NC_019967	GC	3	6	283296	283301	0 %	0 %	50 %	50 %	433593581
4586	NC_019967	ACT	2	6	283307	283312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593581
4587	NC_019967	GGA	2	6	283455	283460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593581
4588	NC_019967	TG	3	6	283475	283480	0 %	50 %	50 %	0 %	433593581
4589	NC_019967	CA	3	6	283609	283614	50 %	0 %	0 %	50 %	433593581
4590	NC_019967	GT	3	6	283638	283643	0 %	50 %	50 %	0 %	433593581
4591	NC_019967	TTC	2	6	283649	283654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593581
4592	NC_019967	CGT	2	6	283759	283764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593581
4593	NC_019967	TAC	2	6	283769	283774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593581
4594	NC_019967	GTGA	2	8	284041	284048	25 %	25 %	50 %	0 %	433593582
4595	NC_019967	ACG	2	6	284077	284082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4596	NC_019967	GTT	2	6	284094	284099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593582
4597	NC_019967	TGCG	2	8	284105	284112	0 %	25 %	50 %	25 %	433593582
4598	NC_019967	GA	3	6	284147	284152	50 %	0 %	50 %	0 %	433593582
4599	NC_019967	CTCG	2	8	284156	284163	0 %	25 %	25 %	50 %	433593582
4600	NC_019967	CGT	2	6	284285	284290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4601	NC_019967	AAC	2	6	284323	284328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593582
4602	NC_019967	CGT	2	6	284368	284373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4603	NC_019967	CAG	2	6	284388	284393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4604	NC_019967	TGC	2	6	284460	284465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4605	NC_019967	TCG	2	6	284473	284478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4606	NC_019967	CTC	2	6	284499	284504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593582
4607	NC_019967	CGC	2	6	284520	284525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593582
4608	NC_019967	CTG	2	6	284536	284541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4609	NC_019967	ACG	2	6	284587	284592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4610	NC_019967	CGT	2	6	284657	284662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4611	NC_019967	TCT	2	6	284668	284673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593582
4612	NC_019967	GT	3	6	284675	284680	0 %	50 %	50 %	0 %	433593582
4613	NC_019967	GGC	2	6	284688	284693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593582
4614	NC_019967	ACG	2	6	284713	284718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4615	NC_019967	CGTGAT	2	12	284729	284740	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433593582
4616	NC_019967	CA	3	6	284756	284761	50 %	0 %	0 %	50 %	433593582
4617	NC_019967	GTC	2	6	284799	284804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4618	NC_019967	CGTCC	2	10	284823	284832	0 %	20 %	20 %	60 %	433593582
4619	NC_019967	GGA	2	6	284930	284935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593582
4620	NC_019967	GCG	2	6	284941	284946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593582
4621	NC_019967	CGGG	2	8	284954	284961	0 %	0 %	75 %	25 %	433593582
4622	NC_019967	GA	3	6	284989	284994	50 %	0 %	50 %	0 %	433593582
4623	NC_019967	TCG	2	6	285010	285015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4624	NC_019967	TCG	2	6	285034	285039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4625	NC_019967	GTCG	2	8	285057	285064	0 %	25 %	50 %	25 %	433593582
4626	NC_019967	CGT	2	6	285129	285134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593582
4627	NC_019967	AGC	2	6	285194	285199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593582
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4629	NC_019967	CGGA	2	8	285224	285231	25 %	0 %	50 %	25 %	433593582
4630	NC_019967	TCT	2	6	285283	285288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593582
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4634	NC_019967	GGCT	2	8	285893	285900	0 %	25 %	50 %	25 %	433593583
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4646	NC_019967	TTC	2	6	287392	287397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593584
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4649	NC_019967	CGT	2	6	287505	287510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593584
4650	NC_019967	GGT	2	6	287561	287566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593584

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