MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE02

Total Repeats: 5200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019963	AAC	2	6	65	70	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593058
2	NC_019963	CA	3	6	76	81	50 %	0 %	0 %	50 %	433593058
3	NC_019963	ACC	2	6	83	88	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593058
4	NC_019963	CGA	2	6	91	96	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593058
5	NC_019963	CGA	2	6	109	114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593058
6	NC_019963	GACGA	2	10	201	210	40 %	0 %	40 %	20 %	433593058
7	NC_019963	AGC	2	6	340	345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593058
8	NC_019963	GTT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593058
9	NC_019963	GTC	2	6	554	559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593058
10	NC_019963	GAC	2	6	632	637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593058
11	NC_019963	CCAG	2	8	721	728	25 %	0 %	25 %	50 %	433593058
12	NC_019963	GAA	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593058
13	NC_019963	GAA	2	6	854	859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593058
14	NC_019963	CGA	2	6	872	877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593058
15	NC_019963	CGA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593058
16	NC_019963	GAT	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593058
17	NC_019963	TCG	2	6	969	974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593058
18	NC_019963	GAC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593058
19	NC_019963	TCGAA	2	10	1197	1206	40 %	20 %	20 %	20 %	433593058
20	NC_019963	AGG	2	6	1212	1217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593058
21	NC_019963	G	6	6	1216	1221	0 %	0 %	100 %	0 %	433593058
22	NC_019963	GATGG	2	10	1315	1324	20 %	20 %	60 %	0 %	433593058
23	NC_019963	CCCT	2	8	1605	1612	0 %	25 %	0 %	75 %	433593059
24	NC_019963	CTG	2	6	1628	1633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593059
25	NC_019963	CTT	2	6	1641	1646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593059
26	NC_019963	GTG	2	6	1663	1668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593059
27	NC_019963	TCT	2	6	1730	1735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593059
28	NC_019963	AG	3	6	1755	1760	50 %	0 %	50 %	0 %	433593059
29	NC_019963	TCG	2	6	1891	1896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593060
30	NC_019963	AGT	3	9	1952	1960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593060
31	NC_019963	TGATCG	2	12	1982	1993	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433593060
32	NC_019963	CGT	2	6	2009	2014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593060
33	NC_019963	CTC	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593060
34	NC_019963	CTT	2	6	2045	2050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593060
35	NC_019963	CTC	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593060
36	NC_019963	GCT	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593060
37	NC_019963	CGA	2	6	2416	2421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593061
38	NC_019963	CT	3	6	2445	2450	0 %	50 %	0 %	50 %	433593061
39	NC_019963	TCG	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593061
40	NC_019963	GCG	2	6	2504	2509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593061
41	NC_019963	GCT	2	6	2594	2599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593061
42	NC_019963	TAC	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593061
43	NC_019963	TCG	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593061
44	NC_019963	ACG	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593061
45	NC_019963	CTCG	2	8	2931	2938	0 %	25 %	25 %	50 %	433593061
46	NC_019963	CTA	2	6	2981	2986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593061
47	NC_019963	CGG	2	6	3019	3024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593061
48	NC_019963	CA	3	6	3036	3041	50 %	0 %	0 %	50 %	433593061
49	NC_019963	CGA	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593061
50	NC_019963	GCC	2	6	3061	3066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593061
51	NC_019963	TCC	2	6	3082	3087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593061
52	NC_019963	ACGTCG	2	12	3097	3108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433593061
53	NC_019963	GGC	2	6	3131	3136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593061
54	NC_019963	CGA	3	9	3200	3208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593061
55	NC_019963	GGC	2	6	3242	3247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593061
56	NC_019963	GGT	2	6	3362	3367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593062
57	NC_019963	CGA	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593062
58	NC_019963	GTC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593062
59	NC_019963	CGA	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593062
60	NC_019963	ACG	3	9	3540	3548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593062
61	NC_019963	CAG	2	6	3572	3577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593062
62	NC_019963	CAGCG	2	10	3614	3623	20 %	0 %	40 %	40 %	433593062
63	NC_019963	GAC	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593062
64	NC_019963	ACG	2	6	3756	3761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593062
65	NC_019963	GAG	2	6	3848	3853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593062
66	NC_019963	TAC	2	6	3908	3913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593062
67	NC_019963	TCC	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593062
68	NC_019963	CGA	2	6	3958	3963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593062
69	NC_019963	GAG	2	6	3992	3997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593062
70	NC_019963	TC	3	6	4018	4023	0 %	50 %	0 %	50 %	433593062
71	NC_019963	GTCC	2	8	4058	4065	0 %	25 %	25 %	50 %	433593062
72	NC_019963	AGT	2	6	4071	4076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593062
73	NC_019963	GGC	2	6	4101	4106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593063
74	NC_019963	GCC	2	6	4168	4173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593063
75	NC_019963	TGC	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593063
76	NC_019963	TCG	2	6	4214	4219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593063
77	NC_019963	GAG	2	6	4282	4287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593063
78	NC_019963	TCC	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593063
79	NC_019963	TCG	2	6	4358	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593063
80	NC_019963	GTCG	2	8	4371	4378	0 %	25 %	50 %	25 %	433593063
81	NC_019963	TCC	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593063
82	NC_019963	CGA	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593063
83	NC_019963	TGG	2	6	4598	4603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593063
84	NC_019963	GAA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593063
85	NC_019963	CTT	2	6	4638	4643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593063
86	NC_019963	GCG	2	6	4644	4649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593063
87	NC_019963	CCA	2	6	4660	4665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593063
88	NC_019963	CTG	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593063
89	NC_019963	GGT	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593063
90	NC_019963	GAA	2	6	4782	4787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593063
91	NC_019963	TGTC	2	8	4818	4825	0 %	50 %	25 %	25 %	433593063
92	NC_019963	TGC	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593063
93	NC_019963	CGT	2	6	4879	4884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593063
94	NC_019963	TCA	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593063
95	NC_019963	CTG	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593064
96	NC_019963	TCCG	2	8	5057	5064	0 %	25 %	25 %	50 %	433593064
97	NC_019963	CGA	2	6	5153	5158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593064
98	NC_019963	GTC	3	9	5205	5213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593064
99	NC_019963	CG	3	6	5260	5265	0 %	0 %	50 %	50 %	433593064
100	NC_019963	CGA	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593064
101	NC_019963	CGA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593064
102	NC_019963	GCT	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593064
103	NC_019963	TCGCC	2	10	5345	5354	0 %	20 %	20 %	60 %	433593064
104	NC_019963	CTC	2	6	5364	5369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593064
105	NC_019963	GTC	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593064
106	NC_019963	GCG	2	6	5407	5412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593064
107	NC_019963	CGA	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593064
108	NC_019963	GCC	2	6	5433	5438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593064
109	NC_019963	CTC	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593064
110	NC_019963	GAT	2	6	5628	5633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593064
111	NC_019963	CCAGAT	2	12	5640	5651	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433593064
112	NC_019963	CTC	2	6	5685	5690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593064
113	NC_019963	TGA	2	6	5741	5746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593064
114	NC_019963	AGT	2	6	5765	5770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593064
115	NC_019963	CGT	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593064
116	NC_019963	CGA	2	6	5840	5845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593064
117	NC_019963	TCG	2	6	5848	5853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593064
118	NC_019963	CGA	2	6	5916	5921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593064
119	NC_019963	CT	3	6	6168	6173	0 %	50 %	0 %	50 %	433593065
120	NC_019963	CGCCGT	2	12	6234	6245	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433593065
121	NC_019963	TCGGGC	2	12	6263	6274	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433593065
122	NC_019963	TCA	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593065
123	NC_019963	TGT	2	6	6329	6334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593065
124	NC_019963	GGC	2	6	6399	6404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593065
125	NC_019963	GTC	2	6	6436	6441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593065
126	NC_019963	TTCC	2	8	6460	6467	0 %	50 %	0 %	50 %	433593065
127	NC_019963	TCG	2	6	6485	6490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593065
128	NC_019963	GTT	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593065
129	NC_019963	TCA	2	6	6530	6535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593065
130	NC_019963	TGT	2	6	6608	6613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593065
131	NC_019963	CAG	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593065
132	NC_019963	TCG	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593065
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164	NC_019963	CGAG	2	8	7932	7939	25 %	0 %	50 %	25 %	433593067
165	NC_019963	GTC	2	6	7991	7996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593067
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246	NC_019963	AT	3	6	12296	12301	50 %	50 %	0 %	0 %	433593073
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248	NC_019963	GAC	2	6	12346	12351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593073
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255	NC_019963	CGA	2	6	12594	12599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593073
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257	NC_019963	CTG	2	6	12661	12666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593073
258	NC_019963	CAC	2	6	12678	12683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593073
259	NC_019963	CTG	2	6	12706	12711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593073
260	NC_019963	ACG	2	6	12728	12733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593073
261	NC_019963	CTC	2	6	12742	12747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593073
262	NC_019963	GGA	2	6	12846	12851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593073
263	NC_019963	CTC	2	6	12916	12921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593073
264	NC_019963	GTA	2	6	12940	12945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593073
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266	NC_019963	CGA	2	6	12999	13004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593073
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283	NC_019963	CGC	2	6	14046	14051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593075
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361	NC_019963	GT	3	6	18463	18468	0 %	50 %	50 %	0 %	433593083
362	NC_019963	GT	4	8	18481	18488	0 %	50 %	50 %	0 %	433593083
363	NC_019963	TCG	2	6	18612	18617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593084
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369	NC_019963	TG	3	6	18852	18857	0 %	50 %	50 %	0 %	433593084
370	NC_019963	AC	3	6	18874	18879	50 %	0 %	0 %	50 %	433593084
371	NC_019963	ATCA	2	8	19052	19059	50 %	25 %	0 %	25 %	433593085
372	NC_019963	CGA	2	6	19284	19289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593085
373	NC_019963	ACGCC	2	10	19295	19304	20 %	0 %	20 %	60 %	433593085
374	NC_019963	CGG	2	6	19440	19445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593086
375	NC_019963	CTC	2	6	19459	19464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593086
376	NC_019963	CTC	2	6	19468	19473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593086
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379	NC_019963	TGG	2	6	19562	19567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593086
380	NC_019963	CGAG	2	8	19577	19584	25 %	0 %	50 %	25 %	433593086
381	NC_019963	TCG	2	6	19589	19594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593086
382	NC_019963	TCG	2	6	19607	19612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593086
383	NC_019963	TCG	2	6	19619	19624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593086
384	NC_019963	CTC	2	6	19660	19665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593086
385	NC_019963	TCG	2	6	19668	19673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593086
386	NC_019963	TCC	2	6	19772	19777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593086
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497	NC_019963	AGT	2	6	24737	24742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593091
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499	NC_019963	TCGGG	2	10	24877	24886	0 %	20 %	60 %	20 %	433593092
500	NC_019963	GGA	2	6	24904	24909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593092

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