MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE02

Total Repeats: 5200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019963	TCTG	2	8	187080	187087	0 %	50 %	25 %	25 %	433593240
3502	NC_019963	GTC	2	6	187105	187110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593240
3503	NC_019963	CGT	2	6	187200	187205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593240
3504	NC_019963	CGC	2	6	187263	187268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593240
3505	NC_019963	CAG	2	6	187282	187287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593240
3506	NC_019963	CAG	2	6	187329	187334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593240
3507	NC_019963	TCCTCG	2	12	187400	187411	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	433593240
3508	NC_019963	TCAACA	2	12	187415	187426	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	433593240
3509	NC_019963	CTG	2	6	187431	187436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593240
3510	NC_019963	GTCA	2	8	187456	187463	25 %	25 %	25 %	25 %	433593240
3511	NC_019963	CAC	2	6	187464	187469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593240
3512	NC_019963	CGA	2	6	187547	187552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593240
3513	NC_019963	CTC	2	6	187570	187575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593240
3514	NC_019963	TCCG	3	12	187641	187652	0 %	25 %	25 %	50 %	433593240
3515	NC_019963	GTC	2	6	187744	187749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593240
3516	NC_019963	ATC	2	6	187804	187809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593240
3517	NC_019963	TCGA	2	8	187871	187878	25 %	25 %	25 %	25 %	433593240
3518	NC_019963	GAG	2	6	187901	187906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593240
3519	NC_019963	CAC	2	6	187914	187919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593240
3520	NC_019963	TTG	2	6	187941	187946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593240
3521	NC_019963	TTC	2	6	187963	187968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593240
3522	NC_019963	CAG	2	6	187973	187978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593240
3523	NC_019963	ACC	2	6	188077	188082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593241
3524	NC_019963	CGA	2	6	188175	188180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593241
3525	NC_019963	GA	3	6	188338	188343	50 %	0 %	50 %	0 %	433593241
3526	NC_019963	AGT	2	6	188349	188354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593241
3527	NC_019963	TC	3	6	188391	188396	0 %	50 %	0 %	50 %	433593242
3528	NC_019963	CGA	2	6	188490	188495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3529	NC_019963	CCGA	2	8	188509	188516	25 %	0 %	25 %	50 %	433593242
3530	NC_019963	GGTC	2	8	188550	188557	0 %	25 %	50 %	25 %	433593242
3531	NC_019963	TGC	2	6	188581	188586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3532	NC_019963	CT	3	6	188611	188616	0 %	50 %	0 %	50 %	433593242
3533	NC_019963	GCCGTC	2	12	188644	188655	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433593242
3534	NC_019963	CTG	2	6	188682	188687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3535	NC_019963	CTG	2	6	188800	188805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3536	NC_019963	TCG	2	6	188825	188830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3537	NC_019963	AAT	2	6	188862	188867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433593242
3538	NC_019963	CAG	2	6	188886	188891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3539	NC_019963	CT	3	6	188935	188940	0 %	50 %	0 %	50 %	433593242
3540	NC_019963	TAG	2	6	189008	189013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593242
3541	NC_019963	TC	3	6	189099	189104	0 %	50 %	0 %	50 %	433593242
3542	NC_019963	CAC	3	9	189174	189182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593242
3543	NC_019963	TCG	2	6	189197	189202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3544	NC_019963	GGT	2	6	189245	189250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593242
3545	NC_019963	ATA	2	6	189254	189259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433593242
3546	NC_019963	ACG	2	6	189305	189310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3547	NC_019963	CGT	2	6	189379	189384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3548	NC_019963	GAG	2	6	189514	189519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593242
3549	NC_019963	GT	3	6	189529	189534	0 %	50 %	50 %	0 %	433593242
3550	NC_019963	CGT	2	6	189588	189593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3551	NC_019963	GTC	2	6	189613	189618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3552	NC_019963	TCG	2	6	189728	189733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3553	NC_019963	GCT	2	6	189839	189844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3554	NC_019963	TGA	2	6	189927	189932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593242
3555	NC_019963	TCGA	2	8	189934	189941	25 %	25 %	25 %	25 %	433593242
3556	NC_019963	GGGT	2	8	189961	189968	0 %	25 %	75 %	0 %	433593242
3557	NC_019963	GGTC	2	8	190047	190054	0 %	25 %	50 %	25 %	433593242
3558	NC_019963	TGA	2	6	190056	190061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593242
3559	NC_019963	TCA	2	6	190092	190097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593242
3560	NC_019963	GTT	2	6	190150	190155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593242
3561	NC_019963	TCG	2	6	190178	190183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3562	NC_019963	TCGC	2	8	190268	190275	0 %	25 %	25 %	50 %	433593242
3563	NC_019963	TCG	2	6	190280	190285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3564	NC_019963	TCA	2	6	190289	190294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593242
3565	NC_019963	TCT	2	6	190389	190394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593242
3566	NC_019963	AACGAT	2	12	190423	190434	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	433593242
3567	NC_019963	GAT	2	6	190447	190452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593242
3568	NC_019963	GCT	2	6	190677	190682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3569	NC_019963	TCA	2	6	190689	190694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593242
3570	NC_019963	AGT	2	6	190740	190745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593242
3571	NC_019963	GTC	2	6	190811	190816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3572	NC_019963	GTGG	2	8	190861	190868	0 %	25 %	75 %	0 %	433593242
3573	NC_019963	GGA	2	6	190923	190928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593242
3574	NC_019963	CAT	2	6	190996	191001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593242
3575	NC_019963	GTC	2	6	191015	191020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3576	NC_019963	GTC	2	6	191033	191038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3577	NC_019963	CGGAG	2	10	191075	191084	20 %	0 %	60 %	20 %	433593242
3578	NC_019963	TCC	2	6	191108	191113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593242
3579	NC_019963	CGT	2	6	191142	191147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3580	NC_019963	CGAA	2	8	191171	191178	50 %	0 %	25 %	25 %	433593242
3581	NC_019963	TCG	2	6	191198	191203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3582	NC_019963	CGA	2	6	191253	191258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593242
3583	NC_019963	ATTG	2	8	191279	191286	25 %	50 %	25 %	0 %	433593242
3584	NC_019963	GAC	2	6	191297	191302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593242
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3586	NC_019963	CTG	2	6	191446	191451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593243
3587	NC_019963	TCG	2	6	191454	191459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593243
3588	NC_019963	TGTC	2	8	191471	191478	0 %	50 %	25 %	25 %	433593243
3589	NC_019963	CTC	2	6	191492	191497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593243
3590	NC_019963	CAC	2	6	191533	191538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593243
3591	NC_019963	TCG	2	6	191610	191615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593243
3592	NC_019963	CGAT	2	8	191634	191641	25 %	25 %	25 %	25 %	433593243
3593	NC_019963	GA	3	6	191662	191667	50 %	0 %	50 %	0 %	433593243
3594	NC_019963	ATC	2	6	191723	191728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593243
3595	NC_019963	GTA	2	6	191753	191758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593243
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3597	NC_019963	TGA	2	6	191813	191818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593243
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3599	NC_019963	TG	3	6	192039	192044	0 %	50 %	50 %	0 %	433593243
3600	NC_019963	TCG	2	6	192057	192062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593243
3601	NC_019963	TGT	2	6	192118	192123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593243
3602	NC_019963	GTT	2	6	192248	192253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593243
3603	NC_019963	AGC	2	6	192293	192298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593243
3604	NC_019963	CGAA	2	8	192340	192347	50 %	0 %	25 %	25 %	433593243
3605	NC_019963	TTC	2	6	192363	192368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593243
3606	NC_019963	TCG	2	6	192379	192384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593243
3607	NC_019963	CGT	2	6	192388	192393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593243
3608	NC_019963	TGCT	2	8	192479	192486	0 %	50 %	25 %	25 %	433593243
3609	NC_019963	ACGA	2	8	192492	192499	50 %	0 %	25 %	25 %	433593243
3610	NC_019963	TC	3	6	192505	192510	0 %	50 %	0 %	50 %	433593243
3611	NC_019963	CGA	2	6	192542	192547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593243
3612	NC_019963	CGT	2	6	192575	192580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593243
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3616	NC_019963	CAG	2	6	192758	192763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593244
3617	NC_019963	TGT	2	6	192793	192798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593244
3618	NC_019963	CGA	2	6	192809	192814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593244
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3620	NC_019963	CTG	2	6	192858	192863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593244
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3974	NC_019963	GCG	2	6	212036	212041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593259
3975	NC_019963	ATC	2	6	212092	212097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593259
3976	NC_019963	GTC	2	6	212167	212172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3977	NC_019963	ATCTCG	2	12	212185	212196	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433593259
3978	NC_019963	TCG	2	6	212203	212208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3979	NC_019963	CGT	2	6	212216	212221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3980	NC_019963	AGT	2	6	212236	212241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593259
3981	NC_019963	GGTTC	2	10	212282	212291	0 %	40 %	40 %	20 %	433593259
3982	NC_019963	CTG	2	6	212394	212399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3983	NC_019963	GAC	2	6	212400	212405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3984	NC_019963	TCG	2	6	212458	212463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3985	NC_019963	CGA	2	6	212564	212569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3986	NC_019963	CGA	2	6	212576	212581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593259
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3988	NC_019963	CGA	2	6	212669	212674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3989	NC_019963	TGGC	2	8	212697	212704	0 %	25 %	50 %	25 %	433593259
3990	NC_019963	GCTTCG	2	12	212716	212727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3991	NC_019963	GCC	2	6	212730	212735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593259
3992	NC_019963	CGA	2	6	212747	212752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3993	NC_019963	GCC	2	6	212760	212765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593259
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3996	NC_019963	CGA	2	6	212792	212797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3997	NC_019963	GAC	2	6	212844	212849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593259
3998	NC_019963	CGG	2	6	212895	212900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593259
3999	NC_019963	GAC	2	6	212901	212906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593259
4000	NC_019963	AGT	2	6	213014	213019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593259

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