MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE02

Total Repeats: 5200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019963	CCA	2	6	158637	158642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593212
3002	NC_019963	CGA	2	6	158650	158655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593212
3003	NC_019963	TCG	2	6	158658	158663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593212
3004	NC_019963	GA	3	6	158679	158684	50 %	0 %	50 %	0 %	433593212
3005	NC_019963	CCG	2	6	158692	158697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593212
3006	NC_019963	CGC	2	6	158803	158808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593212
3007	NC_019963	GAA	2	6	158815	158820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593212
3008	NC_019963	TCG	2	6	159431	159436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3009	NC_019963	CGA	2	6	159438	159443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3010	NC_019963	CGA	2	6	159447	159452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3011	NC_019963	CGA	3	9	159456	159464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3012	NC_019963	CG	3	6	159524	159529	0 %	0 %	50 %	50 %	433593213
3013	NC_019963	TCGCG	2	10	159584	159593	0 %	20 %	40 %	40 %	433593213
3014	NC_019963	GAC	2	6	159628	159633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3015	NC_019963	GAG	3	9	159643	159651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593213
3016	NC_019963	CGA	2	6	159660	159665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3017	NC_019963	GTG	2	6	159711	159716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593213
3018	NC_019963	GCG	2	6	159734	159739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593213
3019	NC_019963	CGA	2	6	159762	159767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3020	NC_019963	TCG	2	6	159809	159814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3021	NC_019963	CCGA	2	8	159829	159836	25 %	0 %	25 %	50 %	433593213
3022	NC_019963	GAG	2	6	159865	159870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593213
3023	NC_019963	GGC	2	6	159871	159876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593213
3024	NC_019963	GAC	2	6	159936	159941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3025	NC_019963	TCG	3	9	159950	159958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3026	NC_019963	GGC	2	6	159980	159985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593213
3027	NC_019963	CGA	2	6	159987	159992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3028	NC_019963	CTC	2	6	160008	160013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593213
3029	NC_019963	CGA	2	6	160104	160109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3030	NC_019963	CGA	2	6	160113	160118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3031	NC_019963	TCG	3	9	160124	160132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3032	NC_019963	GACG	2	8	160166	160173	25 %	0 %	50 %	25 %	433593213
3033	NC_019963	GCT	2	6	160193	160198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3034	NC_019963	CGA	2	6	160253	160258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3035	NC_019963	CCGA	2	8	160270	160277	25 %	0 %	25 %	50 %	433593213
3036	NC_019963	GAC	2	6	160294	160299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3037	NC_019963	TCGC	2	8	160346	160353	0 %	25 %	25 %	50 %	433593213
3038	NC_019963	GC	3	6	160358	160363	0 %	0 %	50 %	50 %	433593213
3039	NC_019963	GAC	3	9	160375	160383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3040	NC_019963	TCG	2	6	160424	160429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3041	NC_019963	CGA	2	6	160440	160445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3042	NC_019963	CG	3	6	160457	160462	0 %	0 %	50 %	50 %	433593213
3043	NC_019963	CGG	2	6	160512	160517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593213
3044	NC_019963	CGA	2	6	160578	160583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3045	NC_019963	GAG	3	9	160597	160605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593213
3046	NC_019963	GCT	2	6	160623	160628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3047	NC_019963	GCC	2	6	160725	160730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593213
3048	NC_019963	GAT	2	6	160804	160809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593213
3049	NC_019963	CG	3	6	160886	160891	0 %	0 %	50 %	50 %	433593213
3050	NC_019963	CTC	2	6	160912	160917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593213
3051	NC_019963	CGG	2	6	160926	160931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593213
3052	NC_019963	CCG	2	6	160948	160953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593213
3053	NC_019963	AGC	2	6	160964	160969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593213
3054	NC_019963	A	6	6	160984	160989	100 %	0 %	0 %	0 %	433593213
3055	NC_019963	CG	3	6	161001	161006	0 %	0 %	50 %	50 %	433593213
3056	NC_019963	ACTG	3	12	161076	161087	25 %	25 %	25 %	25 %	433593213
3057	NC_019963	CGG	2	6	161092	161097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593213
3058	NC_019963	AC	3	6	161133	161138	50 %	0 %	0 %	50 %	433593213
3059	NC_019963	CCG	2	6	161273	161278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593214
3060	NC_019963	CGC	2	6	161280	161285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593214
3061	NC_019963	TCC	3	9	161290	161298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593214
3062	NC_019963	TCGA	2	8	161401	161408	25 %	25 %	25 %	25 %	433593214
3063	NC_019963	GTA	2	6	161431	161436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593214
3064	NC_019963	GTT	2	6	161821	161826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593215
3065	NC_019963	ACG	2	6	161850	161855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3066	NC_019963	TCC	2	6	161871	161876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593215
3067	NC_019963	CGA	2	6	161890	161895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3068	NC_019963	GTA	2	6	161924	161929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593215
3069	NC_019963	GCT	2	6	162046	162051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3070	NC_019963	TCG	3	9	162078	162086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3071	NC_019963	CCG	2	6	162087	162092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593215
3072	NC_019963	TGT	2	6	162157	162162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593215
3073	NC_019963	CAGCG	2	10	162167	162176	20 %	0 %	40 %	40 %	433593215
3074	NC_019963	GTC	2	6	162179	162184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3075	NC_019963	GAG	2	6	162191	162196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593215
3076	NC_019963	ACG	2	6	162246	162251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3077	NC_019963	CGG	2	6	162268	162273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593215
3078	NC_019963	CGT	2	6	162283	162288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3079	NC_019963	GTC	2	6	162315	162320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3080	NC_019963	CGG	2	6	162358	162363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593215
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3082	NC_019963	TCG	2	6	162480	162485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3083	NC_019963	CGA	2	6	162520	162525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593215
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3085	NC_019963	CGC	2	6	162697	162702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593215
3086	NC_019963	CGA	2	6	162730	162735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3087	NC_019963	GAC	2	6	162779	162784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3088	NC_019963	CA	3	6	162827	162832	50 %	0 %	0 %	50 %	433593215
3089	NC_019963	CTGTC	2	10	162873	162882	0 %	40 %	20 %	40 %	433593215
3090	NC_019963	GCC	2	6	162914	162919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593215
3091	NC_019963	CGC	2	6	162931	162936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593215
3092	NC_019963	GCC	2	6	162947	162952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593215
3093	NC_019963	GTC	2	6	163025	163030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3094	NC_019963	CGGG	2	8	163132	163139	0 %	0 %	75 %	25 %	433593215
3095	NC_019963	AGG	2	6	163156	163161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593215
3096	NC_019963	TGTCC	2	10	163165	163174	0 %	40 %	20 %	40 %	433593215
3097	NC_019963	CGA	2	6	163198	163203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3098	NC_019963	GAT	2	6	163229	163234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593215
3099	NC_019963	GCAC	2	8	163276	163283	25 %	0 %	25 %	50 %	433593215
3100	NC_019963	CTCG	2	8	163298	163305	0 %	25 %	25 %	50 %	433593215
3101	NC_019963	CCG	2	6	163330	163335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593215
3102	NC_019963	CTC	2	6	163415	163420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593215
3103	NC_019963	CTC	2	6	163436	163441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593215
3104	NC_019963	CGA	2	6	163504	163509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3105	NC_019963	TG	3	6	163510	163515	0 %	50 %	50 %	0 %	433593215
3106	NC_019963	TCG	2	6	163524	163529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3107	NC_019963	GGTC	2	8	163555	163562	0 %	25 %	50 %	25 %	433593215
3108	NC_019963	CGC	2	6	163576	163581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593215
3109	NC_019963	TCGACT	2	12	163624	163635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433593215
3110	NC_019963	ACG	2	6	163638	163643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3111	NC_019963	CGG	2	6	163684	163689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593215
3112	NC_019963	CGT	2	6	163690	163695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3113	NC_019963	GCC	2	6	163712	163717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593215
3114	NC_019963	TCC	2	6	163776	163781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593215
3115	NC_019963	TCC	2	6	163818	163823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593215
3116	NC_019963	CGT	2	6	163849	163854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593215
3117	NC_019963	GAG	2	6	163898	163903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593215
3118	NC_019963	ATCT	2	8	163947	163954	25 %	50 %	0 %	25 %	433593215
3119	NC_019963	TCC	2	6	163956	163961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593216
3120	NC_019963	GC	3	6	164008	164013	0 %	0 %	50 %	50 %	433593216
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3232	NC_019963	GTC	2	6	170766	170771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593225
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3234	NC_019963	TCG	2	6	170896	170901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593225
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3236	NC_019963	CAG	2	6	170946	170951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593225
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3238	NC_019963	CGT	2	6	171011	171016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593225
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3240	NC_019963	CGTCG	2	10	171117	171126	0 %	20 %	40 %	40 %	433593225
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3343	NC_019963	TTGA	2	8	176229	176236	25 %	50 %	25 %	0 %	433593229
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3361	NC_019963	AAC	2	6	177337	177342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593230
3362	NC_019963	TAC	2	6	177410	177415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593230
3363	NC_019963	ATC	2	6	177432	177437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593230
3364	NC_019963	CTA	2	6	177459	177464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593230
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3369	NC_019963	TGA	2	6	177800	177805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593230
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3475	NC_019963	GTTC	2	8	185245	185252	0 %	50 %	25 %	25 %	433593236
3476	NC_019963	CGA	2	6	185289	185294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593236
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3479	NC_019963	TAG	2	6	185738	185743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593237
3480	NC_019963	CTC	2	6	185751	185756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593237
3481	NC_019963	ATCA	2	8	186037	186044	50 %	25 %	0 %	25 %	433593238
3482	NC_019963	TTC	2	6	186098	186103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593238
3483	NC_019963	CTT	2	6	186146	186151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593238
3484	NC_019963	CAT	2	6	186214	186219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593238
3485	NC_019963	TGA	2	6	186229	186234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593238
3486	NC_019963	TCG	2	6	186306	186311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593238
3487	NC_019963	TCG	3	9	186316	186324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593238
3488	NC_019963	TGC	2	6	186333	186338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593239
3489	NC_019963	CTCG	2	8	186348	186355	0 %	25 %	25 %	50 %	433593239
3490	NC_019963	TCA	2	6	186370	186375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593239
3491	NC_019963	GAT	2	6	186425	186430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593239
3492	NC_019963	TCA	2	6	186499	186504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593239
3493	NC_019963	TTG	2	6	186565	186570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593239
3494	NC_019963	CATC	2	8	186849	186856	25 %	25 %	0 %	50 %	433593240
3495	NC_019963	ACG	2	6	186877	186882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593240
3496	NC_019963	GTT	2	6	186909	186914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593240
3497	NC_019963	CGTT	2	8	186953	186960	0 %	50 %	25 %	25 %	433593240
3498	NC_019963	GTC	2	6	186985	186990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593240
3499	NC_019963	GTCA	2	8	186997	187004	25 %	25 %	25 %	25 %	433593240
3500	NC_019963	TTC	2	6	187013	187018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593240

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