MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624

Total Repeats: 86445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019962	GAC	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
2	NC_019962	CGAGGT	2	12	1178	1189	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433589360
3	NC_019962	CGA	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
4	NC_019962	GAT	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589360
5	NC_019962	GCG	2	6	1279	1284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589360
6	NC_019962	AGG	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589360
7	NC_019962	GATCA	2	10	1353	1362	40 %	20 %	20 %	20 %	433589360
8	NC_019962	CGA	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
9	NC_019962	CGC	2	6	1385	1390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
10	NC_019962	CGA	2	6	1610	1615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
11	NC_019962	CGA	2	6	1622	1627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
12	NC_019962	CTG	2	6	1638	1643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
13	NC_019962	CGA	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
14	NC_019962	G	6	6	1821	1826	0 %	0 %	100 %	0 %	433589360
15	NC_019962	CGG	2	6	1864	1869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589360
16	NC_019962	GCC	2	6	1914	1919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
17	NC_019962	CGA	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
18	NC_019962	CGAGA	2	10	1965	1974	40 %	0 %	40 %	20 %	433589360
19	NC_019962	GAC	2	6	2001	2006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
20	NC_019962	CCGA	2	8	2043	2050	25 %	0 %	25 %	50 %	433589360
21	NC_019962	TCT	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589360
22	NC_019962	ACG	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
23	NC_019962	GTC	3	9	2097	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
24	NC_019962	TCG	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
25	NC_019962	GAC	2	6	2148	2153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
26	NC_019962	TC	3	6	2165	2170	0 %	50 %	0 %	50 %	433589360
27	NC_019962	ATC	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589360
28	NC_019962	ACG	2	6	2302	2307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
29	NC_019962	G	6	6	2357	2362	0 %	0 %	100 %	0 %	433589360
30	NC_019962	TG	3	6	2389	2394	0 %	50 %	50 %	0 %	433589360
31	NC_019962	CGC	2	6	2402	2407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
32	NC_019962	CTG	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
33	NC_019962	CCG	2	6	2452	2457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
34	NC_019962	TCG	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
35	NC_019962	GTC	2	6	2541	2546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
36	NC_019962	GTC	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
37	NC_019962	ATC	2	6	2595	2600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589360
38	NC_019962	GAG	2	6	2670	2675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589360
39	NC_019962	TCA	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589360
40	NC_019962	CGT	3	9	2753	2761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
41	NC_019962	GAG	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589360
42	NC_019962	TCC	2	6	2830	2835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589360
43	NC_019962	CGA	2	6	2861	2866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
44	NC_019962	CCG	2	6	3025	3030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589361
45	NC_019962	GAC	2	6	3150	3155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
46	NC_019962	GCC	2	6	3159	3164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589361
47	NC_019962	CAGT	2	8	3179	3186	25 %	25 %	25 %	25 %	433589361
48	NC_019962	GAC	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
49	NC_019962	GTTC	2	8	3252	3259	0 %	50 %	25 %	25 %	433589361
50	NC_019962	GTT	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433589361
51	NC_019962	CGT	2	6	3320	3325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
52	NC_019962	AGCG	2	8	3326	3333	25 %	0 %	50 %	25 %	433589361
53	NC_019962	CGA	2	6	3368	3373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
54	NC_019962	CTC	2	6	3375	3380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589361
55	NC_019962	TTC	2	6	3409	3414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589361
56	NC_019962	GATG	2	8	3434	3441	25 %	25 %	50 %	0 %	433589361
57	NC_019962	CGT	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
58	NC_019962	TCGG	2	8	3467	3474	0 %	25 %	50 %	25 %	433589361
59	NC_019962	TTC	2	6	3519	3524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589361
60	NC_019962	CGA	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
61	NC_019962	GCG	2	6	3656	3661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589361
62	NC_019962	AAC	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433589361
63	NC_019962	AGG	2	6	3688	3693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589361
64	NC_019962	CGA	2	6	3695	3700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
65	NC_019962	CGA	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
66	NC_019962	GCT	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
67	NC_019962	TCG	3	9	3751	3759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
68	NC_019962	GAC	2	6	3777	3782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
69	NC_019962	CGT	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
70	NC_019962	CGT	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
71	NC_019962	GCT	2	6	3836	3841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
72	NC_019962	CGC	2	6	3885	3890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589361
73	NC_019962	TCGCCG	2	12	3904	3915	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433589361
74	NC_019962	G	6	6	3924	3929	0 %	0 %	100 %	0 %	433589361
75	NC_019962	CGA	2	6	4102	4107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
76	NC_019962	CGCC	2	8	4114	4121	0 %	0 %	25 %	75 %	433589362
77	NC_019962	CAG	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
78	NC_019962	GAC	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
79	NC_019962	TGA	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589362
80	NC_019962	CGT	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
81	NC_019962	AGCG	2	8	4303	4310	25 %	0 %	50 %	25 %	433589362
82	NC_019962	TCG	2	6	4417	4422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
83	NC_019962	ACG	3	9	4455	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
84	NC_019962	CG	3	6	4510	4515	0 %	0 %	50 %	50 %	433589362
85	NC_019962	TCG	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
86	NC_019962	TGC	2	6	4609	4614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
87	NC_019962	CCA	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589362
88	NC_019962	GCG	2	6	4633	4638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589362
89	NC_019962	CAG	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
90	NC_019962	CGA	2	6	4672	4677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
91	NC_019962	CGA	2	6	4681	4686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
92	NC_019962	CGC	2	6	4697	4702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589362
93	NC_019962	CCG	2	6	4720	4725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589362
94	NC_019962	GTC	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
95	NC_019962	CGT	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
96	NC_019962	CGGG	2	8	4787	4794	0 %	0 %	75 %	25 %	433589362
97	NC_019962	GTCG	2	8	4807	4814	0 %	25 %	50 %	25 %	433589362
98	NC_019962	GCC	2	6	4833	4838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589362
99	NC_019962	CGG	2	6	4852	4857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589362
100	NC_019962	CGG	2	6	4859	4864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589362
101	NC_019962	TCG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
102	NC_019962	CG	3	6	5117	5122	0 %	0 %	50 %	50 %	433589363
103	NC_019962	TCG	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
104	NC_019962	GTC	2	6	5250	5255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
105	NC_019962	GGC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
106	NC_019962	CGG	2	6	5284	5289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
107	NC_019962	CGC	2	6	5297	5302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
108	NC_019962	CCG	2	6	5314	5319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
109	NC_019962	GCC	2	6	5325	5330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
110	NC_019962	AACC	2	8	5369	5376	50 %	0 %	0 %	50 %	433589363
111	NC_019962	CGA	2	6	5387	5392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
112	NC_019962	CCGG	2	8	5394	5401	0 %	0 %	50 %	50 %	433589363
113	NC_019962	G	7	7	5420	5426	0 %	0 %	100 %	0 %	433589363
114	NC_019962	CGCC	2	8	5431	5438	0 %	0 %	25 %	75 %	433589363
115	NC_019962	TCG	2	6	5476	5481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
116	NC_019962	CGAC	2	8	5543	5550	25 %	0 %	25 %	50 %	433589363
117	NC_019962	GGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
118	NC_019962	ACC	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589363
119	NC_019962	GGC	2	6	5622	5627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
120	NC_019962	CTGG	2	8	5723	5730	0 %	25 %	50 %	25 %	433589363
121	NC_019962	TGA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589363
122	NC_019962	CGA	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
123	NC_019962	GAC	2	6	5811	5816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
124	NC_019962	TCG	2	6	5830	5835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
125	NC_019962	GGC	2	6	5900	5905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
126	NC_019962	CTG	3	9	6009	6017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
127	NC_019962	GGCGTC	2	12	6036	6047	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433589363
128	NC_019962	TCG	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
129	NC_019962	AAG	2	6	6120	6125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433589363
130	NC_019962	ACG	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
131	NC_019962	CGA	2	6	6203	6208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
132	NC_019962	ACG	2	6	6355	6360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
133	NC_019962	CCT	2	6	6383	6388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589363
134	NC_019962	AAG	2	6	6390	6395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433589363
135	NC_019962	CGC	2	6	6406	6411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
136	NC_019962	AGG	2	6	6445	6450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589363
137	NC_019962	CGA	2	6	6464	6469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
138	NC_019962	ACG	2	6	6526	6531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
139	NC_019962	GCT	2	6	6550	6555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
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141	NC_019962	TCG	2	6	6619	6624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
142	NC_019962	CGG	3	9	6979	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589364
143	NC_019962	GATCG	2	10	6992	7001	20 %	20 %	40 %	20 %	433589364
144	NC_019962	GGC	2	6	7010	7015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589364
145	NC_019962	ACCGG	2	10	7051	7060	20 %	0 %	40 %	40 %	433589364
146	NC_019962	CAG	2	6	7067	7072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589364
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148	NC_019962	CG	4	8	7126	7133	0 %	0 %	50 %	50 %	433589364
149	NC_019962	TCC	2	6	7158	7163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589364
150	NC_019962	CGT	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589364
151	NC_019962	GTCG	2	8	7268	7275	0 %	25 %	50 %	25 %	433589364
152	NC_019962	GCGTCG	2	12	7299	7310	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433589364
153	NC_019962	CGT	2	6	7548	7553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589365
154	NC_019962	CGG	2	6	7563	7568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589365
155	NC_019962	GCG	2	6	7583	7588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589365
156	NC_019962	CCGCG	2	10	7599	7608	0 %	0 %	40 %	60 %	433589365
157	NC_019962	CGC	3	9	7617	7625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589365
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160	NC_019962	GAG	2	6	7693	7698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589365
161	NC_019962	CGA	2	6	7713	7718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589365
162	NC_019962	CACT	2	8	7781	7788	25 %	25 %	0 %	50 %	433589365
163	NC_019962	CGT	2	6	7839	7844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589365
164	NC_019962	CGA	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589365
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168	NC_019962	ACC	2	6	7999	8004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589365
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182	NC_019962	CGA	2	6	8499	8504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589365
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235	NC_019962	CGGCG	2	10	10680	10689	0 %	0 %	60 %	40 %	433589367
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237	NC_019962	GACC	2	8	10801	10808	25 %	0 %	25 %	50 %	433589367
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239	NC_019962	CCG	2	6	10877	10882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589367
240	NC_019962	CGT	2	6	10985	10990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589367
241	NC_019962	AGC	2	6	11383	11388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589368
242	NC_019962	TCG	2	6	11467	11472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589369
243	NC_019962	CGC	2	6	11489	11494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589369
244	NC_019962	GTC	2	6	11505	11510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589369
245	NC_019962	CGT	2	6	11558	11563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589369
246	NC_019962	GCGCTC	2	12	11583	11594	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433589369
247	NC_019962	CGAT	2	8	11602	11609	25 %	25 %	25 %	25 %	433589369
248	NC_019962	GGC	3	9	11639	11647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589369
249	NC_019962	CGACG	2	10	11658	11667	20 %	0 %	40 %	40 %	433589369
250	NC_019962	GAC	2	6	11700	11705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589369
251	NC_019962	CGGT	2	8	11719	11726	0 %	25 %	50 %	25 %	433589369
252	NC_019962	CGCC	2	8	11762	11769	0 %	0 %	25 %	75 %	433589369
253	NC_019962	GGC	2	6	11823	11828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589369
254	NC_019962	CCG	2	6	11838	11843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589369
255	NC_019962	TCG	2	6	11857	11862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589369
256	NC_019962	GACG	2	8	11873	11880	25 %	0 %	50 %	25 %	433589369
257	NC_019962	GCC	2	6	11895	11900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589370
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377	NC_019962	GTCG	2	8	16227	16234	0 %	25 %	50 %	25 %	433589373
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379	NC_019962	ACG	2	6	16256	16261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589373
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