MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624

Total Repeats: 86445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019962	CCGTCG	2	12	173236	173247	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433589530
4002	NC_019962	CG	3	6	173295	173300	0 %	0 %	50 %	50 %	433589530
4003	NC_019962	GAC	2	6	173346	173351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589530
4004	NC_019962	ATG	2	6	173352	173357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589530
4005	NC_019962	CGT	2	6	173366	173371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589530
4006	NC_019962	CGC	2	6	173381	173386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589530
4007	NC_019962	CAA	2	6	173393	173398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433589530
4008	NC_019962	AAG	2	6	173415	173420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433589530
4009	NC_019962	GGC	2	6	173439	173444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589530
4010	NC_019962	GGA	2	6	173462	173467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589530
4011	NC_019962	CGT	2	6	173483	173488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589530
4012	NC_019962	CAC	2	6	173521	173526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589530
4013	NC_019962	AGG	2	6	173527	173532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589530
4014	NC_019962	CTC	2	6	173562	173567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589530
4015	NC_019962	GC	3	6	173572	173577	0 %	0 %	50 %	50 %	433589530
4016	NC_019962	GAG	2	6	173604	173609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589530
4017	NC_019962	ACC	2	6	173644	173649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589530
4018	NC_019962	CGG	2	6	173657	173662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589530
4019	NC_019962	CAG	2	6	173962	173967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4020	NC_019962	GGA	2	6	173997	174002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589531
4021	NC_019962	CAGC	2	8	174003	174010	25 %	0 %	25 %	50 %	433589531
4022	NC_019962	GGA	2	6	174021	174026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589531
4023	NC_019962	GAC	2	6	174078	174083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4024	NC_019962	TCG	2	6	174113	174118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4025	NC_019962	CTC	2	6	174120	174125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589531
4026	NC_019962	ACG	2	6	174146	174151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589531
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4028	NC_019962	GGAGAT	2	12	174168	174179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	433589531
4029	NC_019962	ACC	2	6	174182	174187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589531
4030	NC_019962	TCG	2	6	174203	174208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4031	NC_019962	AGGAAG	2	12	174224	174235	50 %	0 %	50 %	0 %	433589531
4032	NC_019962	GTC	2	6	174259	174264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4033	NC_019962	CTC	2	6	174277	174282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589531
4034	NC_019962	CTG	2	6	174298	174303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4035	NC_019962	CCA	2	6	174320	174325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589531
4036	NC_019962	GCC	2	6	174349	174354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589531
4037	NC_019962	GAA	2	6	174376	174381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433589531
4038	NC_019962	TCGACG	2	12	174389	174400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4039	NC_019962	GAC	2	6	174403	174408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4040	NC_019962	CGC	2	6	174429	174434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589531
4041	NC_019962	TCG	3	9	174488	174496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4042	NC_019962	GC	3	6	174504	174509	0 %	0 %	50 %	50 %	433589531
4043	NC_019962	CGA	2	6	174519	174524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4044	NC_019962	ACA	2	6	174539	174544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433589531
4045	NC_019962	GTC	2	6	174559	174564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4046	NC_019962	GGC	2	6	174565	174570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589531
4047	NC_019962	TCG	2	6	174590	174595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4048	NC_019962	TCG	2	6	174605	174610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4049	NC_019962	ATC	2	6	174667	174672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589531
4050	NC_019962	CCGACC	2	12	174725	174736	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433589531
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4052	NC_019962	CAG	2	6	174766	174771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4053	NC_019962	CGT	2	6	174813	174818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4054	NC_019962	TCG	2	6	174821	174826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4055	NC_019962	CGG	2	6	174828	174833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589531
4056	NC_019962	CGA	2	6	174837	174842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4057	NC_019962	CAT	2	6	174873	174878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589531
4058	NC_019962	CG	3	6	174922	174927	0 %	0 %	50 %	50 %	433589531
4059	NC_019962	TGACC	2	10	174957	174966	20 %	20 %	20 %	40 %	433589531
4060	NC_019962	GAC	2	6	174970	174975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4061	NC_019962	TCG	2	6	175031	175036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4062	NC_019962	CGA	2	6	175044	175049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4063	NC_019962	TCC	2	6	175070	175075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589531
4064	NC_019962	CGA	2	6	175098	175103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589531
4065	NC_019962	CTCG	2	8	175125	175132	0 %	25 %	25 %	50 %	433589531
4066	NC_019962	GAC	2	6	175143	175148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589531
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4068	NC_019962	CTCG	2	8	175200	175207	0 %	25 %	25 %	50 %	433589531
4069	NC_019962	CGG	2	6	175233	175238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589531
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4092	NC_019962	CGA	2	6	176810	176815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589532
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4095	NC_019962	TCGAC	2	10	176959	176968	20 %	20 %	20 %	40 %	433589532
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4102	NC_019962	ACCG	2	8	177122	177129	25 %	0 %	25 %	50 %	433589533
4103	NC_019962	CCG	2	6	177135	177140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589533
4104	NC_019962	TCG	2	6	177166	177171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589533
4105	NC_019962	GTCGGC	2	12	177196	177207	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433589533
4106	NC_019962	CGG	2	6	177212	177217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589533
4107	NC_019962	AGC	2	6	177223	177228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589533
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4109	NC_019962	CGG	2	6	177365	177370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589533
4110	NC_019962	CCGG	2	8	177386	177393	0 %	0 %	50 %	50 %	433589533
4111	NC_019962	CGGG	2	8	177409	177416	0 %	0 %	75 %	25 %	433589533
4112	NC_019962	G	6	6	177414	177419	0 %	0 %	100 %	0 %	433589533
4113	NC_019962	CGCT	2	8	177442	177449	0 %	25 %	25 %	50 %	433589533
4114	NC_019962	GGTC	2	8	177470	177477	0 %	25 %	50 %	25 %	433589533
4115	NC_019962	GTC	2	6	177517	177522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589533
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4118	NC_019962	GCA	2	6	177638	177643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589533
4119	NC_019962	GAC	2	6	177810	177815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589533
4120	NC_019962	GTG	2	6	177818	177823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433589533
4121	NC_019962	GTT	2	6	177872	177877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433589533
4122	NC_019962	GTC	2	6	178192	178197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4123	NC_019962	GTC	2	6	178212	178217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4124	NC_019962	TCG	2	6	178244	178249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4125	NC_019962	GAC	2	6	178264	178269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4126	NC_019962	CGC	2	6	178306	178311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589534
4127	NC_019962	TCG	2	6	178334	178339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4128	NC_019962	CGT	2	6	178488	178493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4129	NC_019962	CGA	3	9	178509	178517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4130	NC_019962	CGA	2	6	178554	178559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4131	NC_019962	CGGTCG	2	12	178613	178624	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433589534
4132	NC_019962	CGG	2	6	178629	178634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589534
4133	NC_019962	CTCGGC	2	12	178642	178653	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433589534
4134	NC_019962	CGT	2	6	178662	178667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4135	NC_019962	TTC	2	6	178687	178692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589534
4136	NC_019962	GCAA	2	8	178715	178722	50 %	0 %	25 %	25 %	433589534
4137	NC_019962	TTG	2	6	178829	178834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433589534
4138	NC_019962	GTC	2	6	178843	178848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4139	NC_019962	TGGCGA	2	12	178860	178871	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433589534
4140	NC_019962	CGT	3	9	178911	178919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4141	NC_019962	TCG	2	6	178931	178936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4142	NC_019962	GGC	2	6	179032	179037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589534
4143	NC_019962	CAT	2	6	179041	179046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589534
4144	NC_019962	CG	3	6	179054	179059	0 %	0 %	50 %	50 %	433589534
4145	NC_019962	CTC	2	6	179074	179079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589534
4146	NC_019962	GAC	2	6	179098	179103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4147	NC_019962	CTTGGA	2	12	179110	179121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433589534
4148	NC_019962	TCT	2	6	179124	179129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589534
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4150	NC_019962	CAG	2	6	179233	179238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4151	NC_019962	GCC	2	6	179260	179265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589534
4152	NC_019962	GAG	2	6	179360	179365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589534
4153	NC_019962	CGA	2	6	179367	179372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4154	NC_019962	CGC	3	9	179406	179414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589534
4155	NC_019962	GTC	2	6	179426	179431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4156	NC_019962	CTC	2	6	179440	179445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589534
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4162	NC_019962	TCGC	2	8	179647	179654	0 %	25 %	25 %	50 %	433589534
4163	NC_019962	TCG	3	9	179753	179761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4164	NC_019962	TTC	2	6	179801	179806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589534
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4181	NC_019962	GTA	2	6	180439	180444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589534
4182	NC_019962	GGT	2	6	180457	180462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433589534
4183	NC_019962	GGTC	2	8	180507	180514	0 %	25 %	50 %	25 %	433589534
4184	NC_019962	CG	3	6	180543	180548	0 %	0 %	50 %	50 %	433589534
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4189	NC_019962	ACGT	2	8	180728	180735	25 %	25 %	25 %	25 %	433589534
4190	NC_019962	CGT	2	6	180747	180752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589534
4191	NC_019962	CGA	2	6	181632	181637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589535
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4200	NC_019962	CCGA	2	8	182014	182021	25 %	0 %	25 %	50 %	433589535
4201	NC_019962	GGA	2	6	182115	182120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589535
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4204	NC_019962	GAC	2	6	182217	182222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589535
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4207	NC_019962	GCCG	2	8	182247	182254	0 %	0 %	50 %	50 %	433589535
4208	NC_019962	CG	3	6	182260	182265	0 %	0 %	50 %	50 %	433589535
4209	NC_019962	TCA	2	6	182303	182308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589535
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4211	NC_019962	CGT	3	9	182334	182342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589535
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4215	NC_019962	GAT	2	6	182478	182483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589535
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4217	NC_019962	CGA	2	6	182568	182573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589535
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4219	NC_019962	CTTCGG	2	12	182646	182657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589535
4220	NC_019962	CCG	2	6	182711	182716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589535
4221	NC_019962	ATC	2	6	182719	182724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589535
4222	NC_019962	ACG	2	6	182795	182800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589535
4223	NC_019962	TCGG	2	8	182846	182853	0 %	25 %	50 %	25 %	433589535
4224	NC_019962	CTG	2	6	182854	182859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589535
4225	NC_019962	GCTCC	2	10	182887	182896	0 %	20 %	20 %	60 %	433589535
4226	NC_019962	TTC	2	6	182917	182922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589535
4227	NC_019962	GAG	3	9	182968	182976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589535
4228	NC_019962	TCC	2	6	182981	182986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589535
4229	NC_019962	GATCAG	2	12	183094	183105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433589535
4230	NC_019962	GGC	2	6	183162	183167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589535
4231	NC_019962	GAT	2	6	183175	183180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589535
4232	NC_019962	ACGG	2	8	183209	183216	25 %	0 %	50 %	25 %	433589535
4233	NC_019962	TCG	2	6	183284	183289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589535
4234	NC_019962	ACG	2	6	183344	183349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589535
4235	NC_019962	GTT	2	6	183351	183356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433589535
4236	NC_019962	GCG	2	6	183376	183381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589535
4237	NC_019962	CGA	2	6	183450	183455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589535
4238	NC_019962	CGGA	2	8	183464	183471	25 %	0 %	50 %	25 %	433589535
4239	NC_019962	TTCC	2	8	183486	183493	0 %	50 %	0 %	50 %	433589535
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4242	NC_019962	CGG	2	6	183596	183601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589535
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4357	NC_019962	CCT	2	6	190381	190386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589542
4358	NC_019962	TCG	2	6	190392	190397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589542
4359	NC_019962	TCGT	2	8	190412	190419	0 %	50 %	25 %	25 %	433589542
4360	NC_019962	CGA	2	6	190488	190493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589542
4361	NC_019962	ACT	2	6	190524	190529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589543
4362	NC_019962	CGA	2	6	190530	190535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589543
4363	NC_019962	ACCC	2	8	190568	190575	25 %	0 %	0 %	75 %	433589543
4364	NC_019962	CGC	2	6	190606	190611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589543
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4368	NC_019962	TCCTGA	2	12	190856	190867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433589543
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4384	NC_019962	ATC	2	6	191556	191561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589544
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4387	NC_019962	CCG	2	6	191655	191660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589544
4388	NC_019962	ACG	2	6	191661	191666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589544
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4391	NC_019962	ATC	2	6	191814	191819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589544
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4475	NC_019962	TCG	2	6	195515	195520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589547
4476	NC_019962	GTC	2	6	195529	195534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589547
4477	NC_019962	CG	3	6	195584	195589	0 %	0 %	50 %	50 %	433589547
4478	NC_019962	AGCG	2	8	195608	195615	25 %	0 %	50 %	25 %	433589547
4479	NC_019962	GTC	2	6	195721	195726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589547
4480	NC_019962	TTC	2	6	195733	195738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589547
4481	NC_019962	TCG	2	6	195776	195781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589547
4482	NC_019962	GCA	2	6	195827	195832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589548
4483	NC_019962	CA	3	6	195842	195847	50 %	0 %	0 %	50 %	433589548
4484	NC_019962	AGCC	2	8	195909	195916	25 %	0 %	25 %	50 %	433589548
4485	NC_019962	GTC	2	6	196006	196011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589548
4486	NC_019962	GGGT	2	8	196012	196019	0 %	25 %	75 %	0 %	433589548
4487	NC_019962	CTC	2	6	196104	196109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589548
4488	NC_019962	GAA	2	6	196170	196175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433589548
4489	NC_019962	GAG	2	6	196179	196184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589548
4490	NC_019962	GGGTC	2	10	196187	196196	0 %	20 %	60 %	20 %	433589548
4491	NC_019962	GGT	2	6	196296	196301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433589548
4492	NC_019962	GC	3	6	196319	196324	0 %	0 %	50 %	50 %	433589548
4493	NC_019962	CCTT	2	8	196378	196385	0 %	50 %	0 %	50 %	433589548
4494	NC_019962	GC	3	6	196390	196395	0 %	0 %	50 %	50 %	433589548
4495	NC_019962	CGA	2	6	196406	196411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589548
4496	NC_019962	G	6	6	196417	196422	0 %	0 %	100 %	0 %	433589548
4497	NC_019962	GTC	2	6	196425	196430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589548
4498	NC_019962	GGT	2	6	196481	196486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433589548
4499	NC_019962	CGA	2	6	196565	196570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589548
4500	NC_019962	CGG	2	6	196589	196594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589548

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