MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Natronobacterium gregoryi SP2 chromosome

Total Repeats: 61380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019792	ACG	2	6	380	385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
2	NC_019792	ACG	2	6	407	412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
3	NC_019792	CGA	2	6	426	431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
4	NC_019792	TCG	2	6	473	478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190046
5	NC_019792	ACC	2	6	545	550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190046
6	NC_019792	ACG	2	6	632	637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
7	NC_019792	ATC	2	6	694	699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190046
8	NC_019792	GCG	2	6	737	742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190046
9	NC_019792	ACT	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190046
10	NC_019792	CGA	2	6	837	842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
11	NC_019792	GAC	2	6	859	864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
12	NC_019792	ACC	2	6	962	967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190046
13	NC_019792	ACG	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
14	NC_019792	CGC	2	6	1057	1062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190046
15	NC_019792	GAC	2	6	1090	1095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
16	NC_019792	CGG	2	6	1109	1114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190046
17	NC_019792	TCC	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190046
18	NC_019792	AAG	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190046
19	NC_019792	ACG	3	9	1196	1204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
20	NC_019792	CAG	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
21	NC_019792	CGA	2	6	1352	1357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
22	NC_019792	ATC	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190046
23	NC_019792	ACT	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190046
24	NC_019792	AAG	2	6	1546	1551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190046
25	NC_019792	GAG	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190046
26	NC_019792	TCG	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190047
27	NC_019792	GTC	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190047
28	NC_019792	TCG	2	6	1916	1921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
29	NC_019792	ACG	2	6	1970	1975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
30	NC_019792	GAC	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
31	NC_019792	TCG	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
32	NC_019792	CGA	2	6	2094	2099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
33	NC_019792	CCG	2	6	2105	2110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
34	NC_019792	TGA	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190048
35	NC_019792	TCG	2	6	2307	2312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
36	NC_019792	GAG	2	6	2335	2340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190048
37	NC_019792	CGC	2	6	2352	2357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
38	NC_019792	GAT	2	6	2383	2388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190048
39	NC_019792	GAA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190048
40	NC_019792	CCG	2	6	2444	2449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
41	NC_019792	CGG	2	6	2526	2531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190048
42	NC_019792	GAC	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
43	NC_019792	CGC	2	6	2560	2565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
44	NC_019792	CGA	2	6	2598	2603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
45	NC_019792	CGA	2	6	2622	2627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
46	NC_019792	CGG	2	6	2688	2693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190048
47	NC_019792	TGC	2	6	2754	2759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
48	NC_019792	CGA	2	6	2763	2768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
49	NC_019792	GCG	2	6	2792	2797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190048
50	NC_019792	ACG	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
51	NC_019792	TCG	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
52	NC_019792	GCA	2	6	2924	2929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
53	NC_019792	CTG	2	6	2964	2969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
54	NC_019792	AGC	2	6	3029	3034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
55	NC_019792	CGA	2	6	3111	3116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
56	NC_019792	GCC	2	6	3118	3123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
57	NC_019792	CGA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
58	NC_019792	GAA	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190048
59	NC_019792	CGA	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
60	NC_019792	ATA	2	6	3338	3343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429190048
61	NC_019792	CCG	2	6	3377	3382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
62	NC_019792	GTC	2	6	3409	3414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
63	NC_019792	TCG	2	6	3434	3439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
64	NC_019792	GAG	2	6	3910	3915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190049
65	NC_019792	ACG	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
66	NC_019792	CGA	2	6	3969	3974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
67	NC_019792	TCG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190049
68	NC_019792	CGA	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
69	NC_019792	GAG	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190049
70	NC_019792	ACG	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
71	NC_019792	CCG	2	6	4267	4272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190049
72	NC_019792	ACG	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
73	NC_019792	TCG	2	6	4406	4411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190049
74	NC_019792	CGG	2	6	4422	4427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190049
75	NC_019792	GAC	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
76	NC_019792	GAA	2	6	4527	4532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190049
77	NC_019792	GGC	2	6	4587	4592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190049
78	NC_019792	CGT	2	6	4623	4628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190049
79	NC_019792	CGC	2	6	4659	4664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190049
80	NC_019792	ACT	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190049
81	NC_019792	GAA	2	6	4768	4773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190049
82	NC_019792	GCC	3	9	4867	4875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190049
83	NC_019792	GAA	2	6	4999	5004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190049
84	NC_019792	TAC	2	6	5015	5020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190049
85	NC_019792	CGA	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190050
86	NC_019792	TCG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190050
87	NC_019792	CGT	3	9	5377	5385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190050
88	NC_019792	ACG	2	6	5490	5495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190050
89	NC_019792	GTC	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190050
90	NC_019792	CGA	2	6	5635	5640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190050
91	NC_019792	TCC	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190050
92	NC_019792	GGC	2	6	5716	5721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190050
93	NC_019792	ATC	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190050
94	NC_019792	TCG	2	6	5760	5765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190050
95	NC_019792	CGA	2	6	5776	5781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190050
96	NC_019792	GAG	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190050
97	NC_019792	CGA	2	6	5953	5958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190051
98	NC_019792	CGT	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190051
99	NC_019792	CTC	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190051
100	NC_019792	GTC	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190051
101	NC_019792	CGT	2	6	6043	6048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190051
102	NC_019792	TCG	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190051
103	NC_019792	TCG	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
104	NC_019792	GGT	2	6	6417	6422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429190052
105	NC_019792	GTC	2	6	6450	6455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
106	NC_019792	TTC	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429190052
107	NC_019792	TCG	2	6	6538	6543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
108	NC_019792	CGC	2	6	6572	6577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190052
109	NC_019792	GCG	2	6	6589	6594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190052
110	NC_019792	CTT	3	9	6605	6613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429190052
111	NC_019792	GTA	2	6	6642	6647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190052
112	NC_019792	CGT	2	6	6752	6757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
113	NC_019792	TCG	2	6	6786	6791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
114	NC_019792	CTC	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190052
115	NC_019792	GAT	2	6	6831	6836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190052
116	NC_019792	GCG	2	6	6895	6900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190052
117	NC_019792	TGG	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429190052
118	NC_019792	CGT	2	6	6968	6973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
119	NC_019792	GAT	2	6	7005	7010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190052
120	NC_019792	CCG	2	6	7029	7034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190052
121	NC_019792	CAG	2	6	7152	7157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190052
122	NC_019792	TTC	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429190052
123	NC_019792	CGA	2	6	7316	7321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190052
124	NC_019792	TGC	2	6	7341	7346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
125	NC_019792	CCA	2	6	7494	7499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190053
126	NC_019792	ACG	2	6	7510	7515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190053
127	NC_019792	CGG	2	6	7549	7554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190053
128	NC_019792	CCT	2	6	7576	7581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190053
129	NC_019792	TCG	2	6	7641	7646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190053
130	NC_019792	CGC	2	6	7666	7671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190053
131	NC_019792	ACC	2	6	7764	7769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190053
132	NC_019792	TCG	2	6	7866	7871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190053
133	NC_019792	TCG	2	6	7881	7886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190053
134	NC_019792	ACG	2	6	7891	7896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190053
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137	NC_019792	TCG	2	6	7942	7947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190053
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148	NC_019792	GCC	2	6	8198	8203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190053
149	NC_019792	GGA	2	6	8218	8223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190053
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151	NC_019792	CGA	2	6	8317	8322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190053
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153	NC_019792	CGT	2	6	8504	8509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190053
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156	NC_019792	TCG	2	6	8577	8582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190053
157	NC_019792	CGA	2	6	8999	9004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190054
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159	NC_019792	TGG	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429190054
160	NC_019792	CGC	3	9	9150	9158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190054
161	NC_019792	CAT	2	6	9162	9167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190054
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163	NC_019792	TCC	2	6	9281	9286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190054
164	NC_019792	CGA	2	6	9393	9398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190054
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239	NC_019792	GAA	3	9	14140	14148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190058
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241	NC_019792	CGA	2	6	14256	14261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190058
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245	NC_019792	ACC	2	6	14355	14360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190058
246	NC_019792	TTC	2	6	14533	14538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429190058
247	NC_019792	CGC	2	6	14541	14546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190058
248	NC_019792	ATC	2	6	14626	14631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190058
249	NC_019792	CTA	2	6	14679	14684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190058
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251	NC_019792	CGG	2	6	14868	14873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190058
252	NC_019792	CAG	2	6	14899	14904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190058
253	NC_019792	CGC	2	6	15078	15083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190058
254	NC_019792	CGT	2	6	15084	15089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190058
255	NC_019792	CTA	2	6	15138	15143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190058
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373	NC_019792	GGC	2	6	25470	25475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190066
374	NC_019792	GAA	2	6	25564	25569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190066
375	NC_019792	TAC	2	6	25571	25576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190066
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499	NC_019792	GAA	2	6	34182	34187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190076
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