MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natronobacterium gregoryi SP2 chromosome

Total Repeats: 80831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019792	GCCG	2	8	139424	139431	0 %	0 %	50 %	50 %	429190170
3002	NC_019792	CGTC	2	8	139455	139462	0 %	25 %	25 %	50 %	429190170
3003	NC_019792	CGT	2	6	139485	139490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190170
3004	NC_019792	CCCCG	2	10	139512	139521	0 %	0 %	20 %	80 %	429190170
3005	NC_019792	GAA	2	6	139697	139702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190171
3006	NC_019792	CGA	2	6	139753	139758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3007	NC_019792	GCC	2	6	139760	139765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190171
3008	NC_019792	TCG	2	6	139791	139796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3009	NC_019792	CCG	2	6	139818	139823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190171
3010	NC_019792	CGAC	2	8	139845	139852	25 %	0 %	25 %	50 %	429190171
3011	NC_019792	CGA	2	6	139879	139884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3012	NC_019792	TCG	2	6	139959	139964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3013	NC_019792	GCG	2	6	139965	139970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190171
3014	NC_019792	CGA	2	6	139978	139983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3015	NC_019792	CGA	2	6	140065	140070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3016	NC_019792	GAC	2	6	140072	140077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3017	NC_019792	CGGC	2	8	140107	140114	0 %	0 %	50 %	50 %	429190171
3018	NC_019792	TCG	2	6	140133	140138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3019	NC_019792	ACC	2	6	140163	140168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190171
3020	NC_019792	CGAGTA	2	12	140188	140199	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429190171
3021	NC_019792	CGT	2	6	140212	140217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3022	NC_019792	GAT	2	6	140254	140259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190171
3023	NC_019792	CGA	2	6	140293	140298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3024	NC_019792	GAA	2	6	140303	140308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190171
3025	NC_019792	GAAGAC	2	12	140339	140350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	429190171
3026	NC_019792	CCG	2	6	140358	140363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190171
3027	NC_019792	GTC	2	6	140384	140389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3028	NC_019792	CAG	2	6	140438	140443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3029	NC_019792	GAT	2	6	140446	140451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190171
3030	NC_019792	CAG	2	6	140459	140464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3031	NC_019792	GGCATG	2	12	140537	140548	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429190171
3032	NC_019792	ATG	2	6	140555	140560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190171
3033	NC_019792	GGT	2	6	140561	140566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429190171
3034	NC_019792	GCG	3	9	140574	140582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190171
3035	NC_019792	CGA	2	6	140620	140625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3036	NC_019792	TCG	2	6	140628	140633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3037	NC_019792	CGA	2	6	140647	140652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190171
3038	NC_019792	GCC	2	6	140865	140870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190172
3039	NC_019792	CAT	2	6	140906	140911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190172
3040	NC_019792	GTA	2	6	140948	140953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190172
3041	NC_019792	AGC	2	6	140954	140959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190172
3042	NC_019792	C	6	6	140997	141002	0 %	0 %	0 %	100 %	429190172
3043	NC_019792	GAA	2	6	141032	141037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190172
3044	NC_019792	CAG	2	6	141062	141067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190172
3045	NC_019792	CGA	2	6	141472	141477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3046	NC_019792	GAA	2	6	141494	141499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190173
3047	NC_019792	CCA	2	6	141641	141646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190173
3048	NC_019792	AGC	2	6	141738	141743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3049	NC_019792	AGC	2	6	141822	141827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3050	NC_019792	AGG	2	6	141835	141840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190173
3051	NC_019792	GAT	2	6	141902	141907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190173
3052	NC_019792	CGC	2	6	141970	141975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190173
3053	NC_019792	GTTCG	2	10	142094	142103	0 %	40 %	40 %	20 %	429190173
3054	NC_019792	GA	3	6	142170	142175	50 %	0 %	50 %	0 %	429190173
3055	NC_019792	GAA	2	6	142181	142186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190173
3056	NC_019792	CGC	2	6	142273	142278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190173
3057	NC_019792	GTC	2	6	142298	142303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3058	NC_019792	GGC	2	6	142362	142367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190173
3059	NC_019792	ACG	2	6	142471	142476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3060	NC_019792	ACCG	2	8	142493	142500	25 %	0 %	25 %	50 %	429190173
3061	NC_019792	GGCGT	2	10	142549	142558	0 %	20 %	60 %	20 %	429190173
3062	NC_019792	CAG	2	6	142586	142591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3063	NC_019792	CGA	2	6	142600	142605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3064	NC_019792	CCA	2	6	142667	142672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190173
3065	NC_019792	GTA	2	6	142673	142678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190173
3066	NC_019792	CCG	2	6	142683	142688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190173
3067	NC_019792	CGA	2	6	142732	142737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3068	NC_019792	ACG	2	6	142770	142775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3069	NC_019792	CGT	2	6	142847	142852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3070	NC_019792	GTC	2	6	142929	142934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3071	NC_019792	CAT	2	6	142937	142942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190173
3072	NC_019792	TCG	2	6	142966	142971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3073	NC_019792	CCA	2	6	143014	143019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190173
3074	NC_019792	GAT	2	6	143030	143035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190173
3075	NC_019792	CGAC	2	8	143046	143053	25 %	0 %	25 %	50 %	429190173
3076	NC_019792	GAA	2	6	143108	143113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190173
3077	NC_019792	GGTC	2	8	143179	143186	0 %	25 %	50 %	25 %	429190173
3078	NC_019792	ACAGC	2	10	143227	143236	40 %	0 %	20 %	40 %	429190173
3079	NC_019792	CAT	2	6	143264	143269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190173
3080	NC_019792	CAG	2	6	143279	143284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3081	NC_019792	TCG	2	6	143410	143415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3082	NC_019792	GTC	2	6	143427	143432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3083	NC_019792	GT	3	6	143446	143451	0 %	50 %	50 %	0 %	429190173
3084	NC_019792	CCAC	2	8	143483	143490	25 %	0 %	0 %	75 %	429190173
3085	NC_019792	GAA	2	6	143510	143515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190173
3086	NC_019792	GTC	2	6	143588	143593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3087	NC_019792	AGT	2	6	143617	143622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190173
3088	NC_019792	AAGC	2	8	143752	143759	50 %	0 %	25 %	25 %	429190173
3089	NC_019792	CAG	2	6	143777	143782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190173
3090	NC_019792	TCG	2	6	143882	143887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3091	NC_019792	GTCGT	2	10	143903	143912	0 %	40 %	40 %	20 %	429190174
3092	NC_019792	GTC	2	6	143920	143925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3093	NC_019792	TTC	3	9	143950	143958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429190174
3094	NC_019792	GTCTTC	3	18	143959	143976	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	429190174
3095	NC_019792	TCG	2	6	143981	143986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3096	NC_019792	TCG	2	6	143990	143995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3097	NC_019792	TCG	2	6	144026	144031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3098	NC_019792	CCGGT	2	10	144033	144042	0 %	20 %	40 %	40 %	429190174
3099	NC_019792	TCG	2	6	144074	144079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3100	NC_019792	ACC	2	6	144109	144114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190174
3101	NC_019792	GATC	2	8	144136	144143	25 %	25 %	25 %	25 %	429190174
3102	NC_019792	TCG	2	6	144155	144160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3103	NC_019792	TCG	3	9	144182	144190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3104	NC_019792	TCG	2	6	144194	144199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3105	NC_019792	CCGT	2	8	144230	144237	0 %	25 %	25 %	50 %	429190174
3106	NC_019792	ATCGTC	2	12	144269	144280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429190174
3107	NC_019792	TCG	2	6	144287	144292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3108	NC_019792	CGT	2	6	144300	144305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3109	NC_019792	CA	3	6	144360	144365	50 %	0 %	0 %	50 %	429190174
3110	NC_019792	CGA	2	6	144405	144410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3111	NC_019792	CGTC	2	8	144486	144493	0 %	25 %	25 %	50 %	429190174
3112	NC_019792	GT	3	6	144516	144521	0 %	50 %	50 %	0 %	429190174
3113	NC_019792	ACCG	2	8	144550	144557	25 %	0 %	25 %	50 %	429190174
3114	NC_019792	ACG	2	6	144558	144563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3115	NC_019792	GTA	3	9	144580	144588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190174
3116	NC_019792	TCGATT	2	12	144611	144622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429190174
3117	NC_019792	CGT	3	9	144630	144638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3118	NC_019792	GAC	2	6	144691	144696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3119	NC_019792	ATG	2	6	144710	144715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190174
3120	NC_019792	TTTC	2	8	144742	144749	0 %	75 %	0 %	25 %	429190174
3121	NC_019792	CGT	2	6	144801	144806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3122	NC_019792	CTC	2	6	144811	144816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190174
3123	NC_019792	GAC	2	6	144859	144864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190174
3124	NC_019792	CGA	2	6	144870	144875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190174
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3127	NC_019792	TCG	2	6	145304	145309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190175
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3156	NC_019792	CGA	2	6	146419	146424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190177
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3163	NC_019792	TTCT	2	8	146869	146876	0 %	75 %	0 %	25 %	429190177
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3226	NC_019792	CTC	2	6	149628	149633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190178
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3231	NC_019792	AGCGTG	2	12	149827	149838	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429190178
3232	NC_019792	GAC	2	6	149874	149879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190178
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3234	NC_019792	GTTC	2	8	149922	149929	0 %	50 %	25 %	25 %	429190178
3235	NC_019792	CGT	2	6	149939	149944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190178
3236	NC_019792	CTG	2	6	149960	149965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190178
3237	NC_019792	GACTTC	2	12	150012	150023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429190178
3238	NC_019792	GTC	2	6	150024	150029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190178
3239	NC_019792	CGT	2	6	150089	150094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190178
3240	NC_019792	AGT	2	6	150095	150100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190178
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3242	NC_019792	CGA	2	6	150200	150205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190178
3243	NC_019792	TCGA	2	8	150231	150238	25 %	25 %	25 %	25 %	429190178
3244	NC_019792	CGT	2	6	150240	150245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190178
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3249	NC_019792	GACC	2	8	150420	150427	25 %	0 %	25 %	50 %	429190178
3250	NC_019792	CGT	2	6	150455	150460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190178
3251	NC_019792	CGTCTG	2	12	150489	150500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190178
3252	NC_019792	GTC	3	9	150505	150513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190178
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3257	NC_019792	TCG	2	6	150685	150690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190178
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3266	NC_019792	CGA	2	6	151107	151112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190179
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3337	NC_019792	TCGA	2	8	154339	154346	25 %	25 %	25 %	25 %	429190182
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3352	NC_019792	GAC	2	6	154888	154893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190182
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3354	NC_019792	TC	3	6	154919	154924	0 %	50 %	0 %	50 %	429190182
3355	NC_019792	GTC	2	6	154954	154959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190182
3356	NC_019792	TCG	2	6	155048	155053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190182
3357	NC_019792	CGAC	2	8	156214	156221	25 %	0 %	25 %	50 %	429190183
3358	NC_019792	GAG	2	6	156243	156248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190183
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3360	NC_019792	GTC	2	6	156327	156332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190183
3361	NC_019792	GTC	2	6	156360	156365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190183
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3380	NC_019792	CGG	2	6	157504	157509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190185
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3467	NC_019792	CTT	2	6	161734	161739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429190188
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3470	NC_019792	TA	3	6	161837	161842	50 %	50 %	0 %	0 %	429190188
3471	NC_019792	CCAT	2	8	161960	161967	25 %	25 %	0 %	50 %	429190188
3472	NC_019792	TAA	2	6	162097	162102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429190188
3473	NC_019792	AC	3	6	162118	162123	50 %	0 %	0 %	50 %	429190188
3474	NC_019792	AG	3	6	162186	162191	50 %	0 %	50 %	0 %	429190188
3475	NC_019792	ATTT	2	8	162223	162230	25 %	75 %	0 %	0 %	429190188
3476	NC_019792	CAA	2	6	162283	162288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429190188
3477	NC_019792	C	6	6	162425	162430	0 %	0 %	0 %	100 %	429190188
3478	NC_019792	TCG	2	6	162435	162440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190188
3479	NC_019792	GAA	2	6	162473	162478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190188
3480	NC_019792	CCA	2	6	162486	162491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190188
3481	NC_019792	TCG	3	9	162549	162557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190188
3482	NC_019792	TCG	2	6	162672	162677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190188
3483	NC_019792	TCC	2	6	162684	162689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190188
3484	NC_019792	CTG	2	6	162791	162796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190188
3485	NC_019792	GCC	2	6	162809	162814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190188
3486	NC_019792	CGTC	2	8	162841	162848	0 %	25 %	25 %	50 %	429190188
3487	NC_019792	TCCGA	2	10	162852	162861	20 %	20 %	20 %	40 %	429190188
3488	NC_019792	GGT	2	6	162883	162888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429190188
3489	NC_019792	TCG	2	6	163007	163012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190188
3490	NC_019792	TCG	2	6	163023	163028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190188
3491	NC_019792	CCT	2	6	163039	163044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190188
3492	NC_019792	CTG	2	6	163070	163075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190188
3493	NC_019792	TCG	2	6	163224	163229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190188
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3495	NC_019792	TCG	2	6	163314	163319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190188
3496	NC_019792	TCG	2	6	163341	163346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190188
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3499	NC_019792	CAG	2	6	163457	163462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190188
3500	NC_019792	TCG	2	6	163530	163535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190188

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