MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 plasmid pNOS7524.01

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019677	GAAC	2	8	3578	3585	50 %	0 %	25 %	25 %	427726396
2	NC_019677	TAAC	2	8	3633	3640	50 %	25 %	0 %	25 %	427726396
3	NC_019677	GGTA	2	8	3677	3684	25 %	25 %	50 %	0 %	427726396
4	NC_019677	TTGG	2	8	4428	4435	0 %	50 %	50 %	0 %	427726397
5	NC_019677	ATTG	2	8	5684	5691	25 %	50 %	25 %	0 %	427726398
6	NC_019677	TTTG	2	8	5942	5949	0 %	75 %	25 %	0 %	427726398
7	NC_019677	CTAT	2	8	5953	5960	25 %	50 %	0 %	25 %	427726398
8	NC_019677	TTTG	2	8	6487	6494	0 %	75 %	25 %	0 %	427726398
9	NC_019677	AAAG	2	8	6872	6879	75 %	0 %	25 %	0 %	427726399
10	NC_019677	TCCT	2	8	7750	7757	0 %	50 %	0 %	50 %	427726400
11	NC_019677	TTGG	2	8	8477	8484	0 %	50 %	50 %	0 %	427726401
12	NC_019677	AACA	2	8	8661	8668	75 %	0 %	0 %	25 %	427726401
13	NC_019677	CATC	2	8	8741	8748	25 %	25 %	0 %	50 %	427726402
14	NC_019677	GTTA	2	8	8896	8903	25 %	50 %	25 %	0 %	427726402
15	NC_019677	TATT	2	8	9370	9377	25 %	75 %	0 %	0 %	427726403
16	NC_019677	AAAT	2	8	9467	9474	75 %	25 %	0 %	0 %	427726403
17	NC_019677	CAAT	2	8	14796	14803	50 %	25 %	0 %	25 %	427726409
18	NC_019677	ATGA	2	8	15407	15414	50 %	25 %	25 %	0 %	427726411
19	NC_019677	GAAA	2	8	15645	15652	75 %	0 %	25 %	0 %	427726412
20	NC_019677	TGAA	2	8	15828	15835	50 %	25 %	25 %	0 %	427726412
21	NC_019677	AACT	2	8	16056	16063	50 %	25 %	0 %	25 %	427726413
22	NC_019677	AATC	2	8	16582	16589	50 %	25 %	0 %	25 %	427726414
23	NC_019677	CAAA	2	8	16921	16928	75 %	0 %	0 %	25 %	427726414
24	NC_019677	CTGC	2	8	17288	17295	0 %	25 %	25 %	50 %	427726414
25	NC_019677	TACA	2	8	17765	17772	50 %	25 %	0 %	25 %	427726415
26	NC_019677	TTTG	2	8	17989	17996	0 %	75 %	25 %	0 %	427726415
27	NC_019677	TGGG	2	8	18721	18728	0 %	25 %	75 %	0 %	427726416
28	NC_019677	GTCA	2	8	18737	18744	25 %	25 %	25 %	25 %	427726416
29	NC_019677	GATA	2	8	19541	19548	50 %	25 %	25 %	0 %	427726417
30	NC_019677	AGAA	2	8	19753	19760	75 %	0 %	25 %	0 %	427726418
31	NC_019677	CACT	2	8	19902	19909	25 %	25 %	0 %	50 %	427726418
32	NC_019677	TCTA	2	8	19921	19928	25 %	50 %	0 %	25 %	427726418
33	NC_019677	AGGT	2	8	21256	21263	25 %	25 %	50 %	0 %	427726419
34	NC_019677	GAAT	2	8	21593	21600	50 %	25 %	25 %	0 %	427726419
35	NC_019677	TAAA	2	8	21728	21735	75 %	25 %	0 %	0 %	427726420
36	NC_019677	ATCA	2	8	22404	22411	50 %	25 %	0 %	25 %	427726421
37	NC_019677	ACCT	2	8	23738	23745	25 %	25 %	0 %	50 %	427726423
38	NC_019677	ATCA	2	8	23802	23809	50 %	25 %	0 %	25 %	427726423
39	NC_019677	TCTT	2	8	23817	23824	0 %	75 %	0 %	25 %	427726423
40	NC_019677	TTCA	2	8	24086	24093	25 %	50 %	0 %	25 %	427726424
41	NC_019677	CCAA	2	8	24316	24323	50 %	0 %	0 %	50 %	427726424
42	NC_019677	GAAT	2	8	24796	24803	50 %	25 %	25 %	0 %	427726425
43	NC_019677	TAAT	2	8	25209	25216	50 %	50 %	0 %	0 %	427726425
44	NC_019677	AGAA	2	8	26382	26389	75 %	0 %	25 %	0 %	427726427
45	NC_019677	TTAT	2	8	26527	26534	25 %	75 %	0 %	0 %	427726427
46	NC_019677	AAAG	2	8	26701	26708	75 %	0 %	25 %	0 %	427726427
47	NC_019677	TAGC	2	8	26751	26758	25 %	25 %	25 %	25 %	427726427
48	NC_019677	TTAA	2	8	27086	27093	50 %	50 %	0 %	0 %	427726427
49	NC_019677	GAAA	2	8	27165	27172	75 %	0 %	25 %	0 %	427726427
50	NC_019677	TGTA	2	8	27341	27348	25 %	50 %	25 %	0 %	427726428
51	NC_019677	AATT	2	8	33055	33062	50 %	50 %	0 %	0 %	427726429
52	NC_019677	AATT	2	8	33424	33431	50 %	50 %	0 %	0 %	427726429
53	NC_019677	TATC	2	8	33483	33490	25 %	50 %	0 %	25 %	427726429
54	NC_019677	GGTT	2	8	33828	33835	0 %	50 %	50 %	0 %	427726429
55	NC_019677	AGAA	2	8	33997	34004	75 %	0 %	25 %	0 %	427726429
56	NC_019677	GATA	2	8	34544	34551	50 %	25 %	25 %	0 %	427726429
57	NC_019677	GTTG	2	8	34593	34600	0 %	50 %	50 %	0 %	427726429
58	NC_019677	ATTA	2	8	34652	34659	50 %	50 %	0 %	0 %	427726429
59	NC_019677	AACT	2	8	34855	34862	50 %	25 %	0 %	25 %	427726429
60	NC_019677	CTCA	2	8	34938	34945	25 %	25 %	0 %	50 %	427726429
61	NC_019677	ACAT	2	8	35258	35265	50 %	25 %	0 %	25 %	427726429
62	NC_019677	TTAA	2	8	35665	35672	50 %	50 %	0 %	0 %	427726429
63	NC_019677	AGGA	2	8	36204	36211	50 %	0 %	50 %	0 %	427726430
64	NC_019677	TACA	2	8	36825	36832	50 %	25 %	0 %	25 %	427726431
65	NC_019677	TTCC	2	8	36900	36907	0 %	50 %	0 %	50 %	427726431
66	NC_019677	ATCT	2	8	37841	37848	25 %	50 %	0 %	25 %	427726432
67	NC_019677	TAAT	2	8	38071	38078	50 %	50 %	0 %	0 %	427726433
68	NC_019677	AATT	2	8	38935	38942	50 %	50 %	0 %	0 %	427726433
69	NC_019677	GTCC	2	8	39057	39064	0 %	25 %	25 %	50 %	427726433
70	NC_019677	ATTA	2	8	39335	39342	50 %	50 %	0 %	0 %	427726433
71	NC_019677	TAGT	2	8	39604	39611	25 %	50 %	25 %	0 %	427726433
72	NC_019677	GTAG	2	8	39762	39769	25 %	25 %	50 %	0 %	427726433
73	NC_019677	ACCA	2	8	40257	40264	50 %	0 %	0 %	50 %	427726434
74	NC_019677	ACAA	2	8	40489	40496	75 %	0 %	0 %	25 %	427726434
75	NC_019677	CAAT	2	8	41057	41064	50 %	25 %	0 %	25 %	427726434
76	NC_019677	TCAA	2	8	41160	41167	50 %	25 %	0 %	25 %	427726434
77	NC_019677	ATAG	2	8	42243	42250	50 %	25 %	25 %	0 %	427726435
78	NC_019677	TTAA	2	8	43086	43093	50 %	50 %	0 %	0 %	427726435
79	NC_019677	ATCC	2	8	44407	44414	25 %	25 %	0 %	50 %	427726438
80	NC_019677	AGCC	2	8	44804	44811	25 %	0 %	25 %	50 %	427726439
81	NC_019677	AGAA	2	8	45239	45246	75 %	0 %	25 %	0 %	427726440
82	NC_019677	TTTA	2	8	45438	45445	25 %	75 %	0 %	0 %	427726440
83	NC_019677	TACT	2	8	45564	45571	25 %	50 %	0 %	25 %	427726440
84	NC_019677	AATT	2	8	45591	45598	50 %	50 %	0 %	0 %	427726440
85	NC_019677	ACCG	2	8	45624	45631	25 %	0 %	25 %	50 %	427726440
86	NC_019677	AATC	2	8	45704	45711	50 %	25 %	0 %	25 %	427726440
87	NC_019677	GAAA	2	8	46174	46181	75 %	0 %	25 %	0 %	427726442
88	NC_019677	TTAC	2	8	46949	46956	25 %	50 %	0 %	25 %	427726443
89	NC_019677	TATC	2	8	46994	47001	25 %	50 %	0 %	25 %	427726443
90	NC_019677	GAAA	2	8	47480	47487	75 %	0 %	25 %	0 %	427726444
91	NC_019677	CAAA	2	8	48604	48611	75 %	0 %	0 %	25 %	427726444
92	NC_019677	ATTG	2	8	48672	48679	25 %	50 %	25 %	0 %	427726444
93	NC_019677	TTTC	2	8	49570	49577	0 %	75 %	0 %	25 %	427726446
94	NC_019677	TCTG	2	8	50085	50092	0 %	50 %	25 %	25 %	427726447
95	NC_019677	ATTT	2	8	50172	50179	25 %	75 %	0 %	0 %	427726448
96	NC_019677	ATTG	2	8	50241	50248	25 %	50 %	25 %	0 %	427726448
97	NC_019677	TCCA	2	8	50518	50525	25 %	25 %	0 %	50 %	427726448
98	NC_019677	TCAT	2	8	51750	51757	25 %	50 %	0 %	25 %	427726449
99	NC_019677	TGAT	2	8	52226	52233	25 %	50 %	25 %	0 %	427726449
100	NC_019677	TCGC	2	8	52926	52933	0 %	25 %	25 %	50 %	427726450
101	NC_019677	TCGG	2	8	53042	53049	0 %	25 %	50 %	25 %	427726450
102	NC_019677	TGGG	2	8	53123	53130	0 %	25 %	75 %	0 %	427726450
103	NC_019677	TTGC	2	8	53949	53956	0 %	50 %	25 %	25 %	427726451
104	NC_019677	AGAA	2	8	54313	54320	75 %	0 %	25 %	0 %	427726452
105	NC_019677	TCTG	2	8	54840	54847	0 %	50 %	25 %	25 %	427726453
106	NC_019677	TATT	2	8	54953	54960	25 %	75 %	0 %	0 %	427726454
107	NC_019677	TTGC	2	8	55024	55031	0 %	50 %	25 %	25 %	427726454
108	NC_019677	CAGT	2	8	56454	56461	25 %	25 %	25 %	25 %	427726455
109	NC_019677	GCTA	2	8	57376	57383	25 %	25 %	25 %	25 %	427726455
110	NC_019677	TAAA	2	8	57460	57467	75 %	25 %	0 %	0 %	427726455
111	NC_019677	GGTA	2	8	57697	57704	25 %	25 %	50 %	0 %	427726455
112	NC_019677	GTTT	2	8	58162	58169	0 %	75 %	25 %	0 %	427726456
113	NC_019677	AGTT	2	8	58425	58432	25 %	50 %	25 %	0 %	427726456
114	NC_019677	TCCC	2	8	58521	58528	0 %	25 %	0 %	75 %	427726457
115	NC_019677	GGCT	2	8	59410	59417	0 %	25 %	50 %	25 %	427726458
116	NC_019677	GGTT	2	8	59447	59454	0 %	50 %	50 %	0 %	427726459
117	NC_019677	TGAT	2	8	59948	59955	25 %	50 %	25 %	0 %	427726460
118	NC_019677	TAAT	2	8	60061	60068	50 %	50 %	0 %	0 %	427726460
119	NC_019677	GCTT	2	8	60623	60630	0 %	50 %	25 %	25 %	427726462
120	NC_019677	ATTG	2	8	61067	61074	25 %	50 %	25 %	0 %	427726462
121	NC_019677	AAGC	2	8	61371	61378	50 %	0 %	25 %	25 %	427726463
122	NC_019677	TTGG	2	8	61537	61544	0 %	50 %	50 %	0 %	427726463
123	NC_019677	GATT	2	8	62447	62454	25 %	50 %	25 %	0 %	427726465
124	NC_019677	GCTG	2	8	62878	62885	0 %	25 %	50 %	25 %	427726465
125	NC_019677	AATT	2	8	63125	63132	50 %	50 %	0 %	0 %	427726466
126	NC_019677	ACTC	2	8	63184	63191	25 %	25 %	0 %	50 %	427726466
127	NC_019677	AATT	2	8	63375	63382	50 %	50 %	0 %	0 %	427726467
128	NC_019677	AGAT	2	8	63524	63531	50 %	25 %	25 %	0 %	427726467
129	NC_019677	CCCT	2	8	63542	63549	0 %	25 %	0 %	75 %	427726467
130	NC_019677	GAAG	2	8	63723	63730	50 %	0 %	50 %	0 %	427726467
131	NC_019677	GAAT	2	8	63816	63823	50 %	25 %	25 %	0 %	427726467
132	NC_019677	ACAA	2	8	63895	63902	75 %	0 %	0 %	25 %	427726467
133	NC_019677	CTGT	2	8	64623	64630	0 %	50 %	25 %	25 %	427726468
134	NC_019677	TAAT	2	8	65670	65677	50 %	50 %	0 %	0 %	427726470
135	NC_019677	AGAT	2	8	65991	65998	50 %	25 %	25 %	0 %	427726470
136	NC_019677	ACCA	2	8	66063	66070	50 %	0 %	0 %	50 %	427726470
137	NC_019677	TTTG	2	8	66436	66443	0 %	75 %	25 %	0 %	427726470
138	NC_019677	TTTG	2	8	66603	66610	0 %	75 %	25 %	0 %	427726470
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.