MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardiopsis alba ATCC BAA-2165 chromosome

Total Repeats: 134423

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018524	GAT	2	6	170466	170471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403507673
4002	NC_018524	ACA	2	6	170477	170482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403507673
4003	NC_018524	TGA	2	6	170489	170494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403507673
4004	NC_018524	CCG	2	6	170497	170502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507673
4005	NC_018524	GAC	2	6	170532	170537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507673
4006	NC_018524	CGAGGA	2	12	170558	170569	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	403507673
4007	NC_018524	GAA	2	6	170601	170606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403507673
4008	NC_018524	GGCC	2	8	170630	170637	0 %	0 %	50 %	50 %	403507673
4009	NC_018524	CCG	2	6	170671	170676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507673
4010	NC_018524	TCA	2	6	170750	170755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403507673
4011	NC_018524	CGA	2	6	170765	170770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507673
4012	NC_018524	CGCC	2	8	170826	170833	0 %	0 %	25 %	75 %	403507673
4013	NC_018524	CTC	2	6	170868	170873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507673
4014	NC_018524	CCGGC	2	10	170884	170893	0 %	0 %	40 %	60 %	403507673
4015	NC_018524	CAG	2	6	170916	170921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507673
4016	NC_018524	CCG	2	6	170924	170929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507673
4017	NC_018524	GC	3	6	170981	170986	0 %	0 %	50 %	50 %	403507673
4018	NC_018524	ACC	2	6	170998	171003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507673
4019	NC_018524	CGG	2	6	171008	171013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507673
4020	NC_018524	GA	3	6	171034	171039	50 %	0 %	50 %	0 %	403507673
4021	NC_018524	CGG	2	6	171086	171091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507673
4022	NC_018524	CGA	2	6	171098	171103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507673
4023	NC_018524	CGC	2	6	171123	171128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507673
4024	NC_018524	ACGAGC	2	12	171163	171174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507673
4025	NC_018524	AGG	2	6	171190	171195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507673
4026	NC_018524	CGG	2	6	171197	171202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507673
4027	NC_018524	AGC	2	6	171208	171213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507673
4028	NC_018524	CGG	2	6	171218	171223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507673
4029	NC_018524	GCG	2	6	171229	171234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507673
4030	NC_018524	GAG	2	6	171240	171245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507673
4031	NC_018524	CGA	2	6	171296	171301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507673
4032	NC_018524	GGT	2	6	171369	171374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507673
4033	NC_018524	ATC	2	6	171400	171405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403507673
4034	NC_018524	G	6	6	171488	171493	0 %	0 %	100 %	0 %	403507674
4035	NC_018524	CGGT	2	8	171519	171526	0 %	25 %	50 %	25 %	403507674
4036	NC_018524	GGGGAA	2	12	171530	171541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507674
4037	NC_018524	GGC	2	6	171542	171547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507674
4038	NC_018524	CG	3	6	171563	171568	0 %	0 %	50 %	50 %	403507674
4039	NC_018524	GCC	2	6	171726	171731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507674
4040	NC_018524	GCGG	2	8	171746	171753	0 %	0 %	75 %	25 %	403507674
4041	NC_018524	GGA	2	6	171829	171834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507674
4042	NC_018524	CCA	2	6	171839	171844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507674
4043	NC_018524	TCC	2	6	171873	171878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507674
4044	NC_018524	GGT	2	6	171910	171915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507674
4045	NC_018524	GGCCGA	2	12	171920	171931	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	403507674
4046	NC_018524	CGG	2	6	171946	171951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507674
4047	NC_018524	CTT	2	6	171956	171961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403507674
4048	NC_018524	GCC	2	6	171975	171980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507674
4049	NC_018524	GGGGT	2	10	172077	172086	0 %	20 %	80 %	0 %	403507674
4050	NC_018524	GGC	2	6	172431	172436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507675
4051	NC_018524	TCGGC	2	10	172457	172466	0 %	20 %	40 %	40 %	403507675
4052	NC_018524	CCG	3	9	172511	172519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507675
4053	NC_018524	ACC	2	6	172526	172531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507675
4054	NC_018524	GACG	2	8	172537	172544	25 %	0 %	50 %	25 %	403507675
4055	NC_018524	CG	3	6	172543	172548	0 %	0 %	50 %	50 %	403507675
4056	NC_018524	CTC	2	6	172549	172554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507675
4057	NC_018524	GCC	2	6	172649	172654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507675
4058	NC_018524	ACG	2	6	172685	172690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507675
4059	NC_018524	GCCG	2	8	172713	172720	0 %	0 %	50 %	50 %	403507675
4060	NC_018524	ATC	2	6	172753	172758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403507675
4061	NC_018524	ACC	2	6	172760	172765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507675
4062	NC_018524	CTCG	2	8	172797	172804	0 %	25 %	25 %	50 %	403507675
4063	NC_018524	GAA	2	6	172809	172814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403507675
4064	NC_018524	GGCT	2	8	172843	172850	0 %	25 %	50 %	25 %	403507675
4065	NC_018524	GT	3	6	172883	172888	0 %	50 %	50 %	0 %	403507675
4066	NC_018524	CCCT	2	8	172927	172934	0 %	25 %	0 %	75 %	403507675
4067	NC_018524	CCG	2	6	172952	172957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507675
4068	NC_018524	TCT	2	6	172962	172967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403507675
4069	NC_018524	GGCGAG	2	12	172975	172986	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	403507675
4070	NC_018524	CCCG	2	8	173012	173019	0 %	0 %	25 %	75 %	403507675
4071	NC_018524	ATC	2	6	173020	173025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403507675
4072	NC_018524	GGC	2	6	173038	173043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507675
4073	NC_018524	ACA	2	6	173069	173074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403507675
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4077	NC_018524	AGA	2	6	173111	173116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403507675
4078	NC_018524	GGCC	2	8	173133	173140	0 %	0 %	50 %	50 %	403507675
4079	NC_018524	GCC	3	9	173152	173160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507675
4080	NC_018524	TACG	2	8	173212	173219	25 %	25 %	25 %	25 %	403507675
4081	NC_018524	CGC	2	6	173241	173246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507675
4082	NC_018524	CGA	2	6	173280	173285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507675
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4087	NC_018524	CAC	2	6	173530	173535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507676
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4092	NC_018524	GCG	2	6	173678	173683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507676
4093	NC_018524	CTT	2	6	173716	173721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403507676
4094	NC_018524	ACG	2	6	173750	173755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507676
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4104	NC_018524	GCC	2	6	174205	174210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507677
4105	NC_018524	TCG	2	6	174274	174279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507677
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4109	NC_018524	GGCC	2	8	174603	174610	0 %	0 %	50 %	50 %	403507678
4110	NC_018524	ACC	2	6	174664	174669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507678
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4113	NC_018524	CGA	2	6	174798	174803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507678
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4237	NC_018524	CACC	2	8	179690	179697	25 %	0 %	0 %	75 %	403507683
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4240	NC_018524	CCG	2	6	179760	179765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507683
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4242	NC_018524	CGG	2	6	179884	179889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507683
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4244	NC_018524	TGG	2	6	180108	180113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507684
4245	NC_018524	CG	3	6	180118	180123	0 %	0 %	50 %	50 %	403507684
4246	NC_018524	GGC	2	6	180164	180169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507684
4247	NC_018524	CTT	2	6	180187	180192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403507684
4248	NC_018524	CGC	2	6	180208	180213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507684
4249	NC_018524	GAC	2	6	180233	180238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507684
4250	NC_018524	CGA	2	6	180253	180258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507684
4251	NC_018524	CGT	2	6	180539	180544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507685
4252	NC_018524	GGA	2	6	180584	180589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507685
4253	NC_018524	GACCGA	2	12	180626	180637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507685
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4256	NC_018524	TCG	2	6	180715	180720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507685
4257	NC_018524	CGG	2	6	180767	180772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507685
4258	NC_018524	CGA	2	6	180794	180799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507685
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4260	NC_018524	GTT	2	6	180847	180852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403507685
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4263	NC_018524	CGA	2	6	180950	180955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507685
4264	NC_018524	GGC	2	6	180956	180961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507685
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4268	NC_018524	CGA	2	6	181088	181093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507685
4269	NC_018524	CGGCG	2	10	181097	181106	0 %	0 %	60 %	40 %	403507685
4270	NC_018524	GGCC	2	8	181142	181149	0 %	0 %	50 %	50 %	403507685
4271	NC_018524	CGGC	2	8	181166	181173	0 %	0 %	50 %	50 %	403507685
4272	NC_018524	CTT	2	6	181280	181285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403507685
4273	NC_018524	CGG	2	6	181328	181333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507685
4274	NC_018524	CCA	2	6	181345	181350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507685
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4276	NC_018524	CGC	2	6	181389	181394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507685
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4323	NC_018524	CTC	2	6	183188	183193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507687
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4349	NC_018524	CTG	2	6	184373	184378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507688
4350	NC_018524	CTGTC	2	10	184403	184412	0 %	40 %	20 %	40 %	403507688
4351	NC_018524	CGC	2	6	184513	184518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507688
4352	NC_018524	GTG	2	6	184520	184525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507688
4353	NC_018524	GCT	2	6	184576	184581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507688
4354	NC_018524	ACCCG	2	10	184618	184627	20 %	0 %	20 %	60 %	403507688
4355	NC_018524	CGGCC	2	10	184641	184650	0 %	0 %	40 %	60 %	403507688
4356	NC_018524	CGC	2	6	184686	184691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507688
4357	NC_018524	CTG	2	6	184769	184774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507688
4358	NC_018524	TCC	2	6	184779	184784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507688
4359	NC_018524	GAG	2	6	184802	184807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507688
4360	NC_018524	TCC	2	6	184820	184825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507688
4361	NC_018524	GCC	2	6	184826	184831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507688
4362	NC_018524	CCT	2	6	184837	184842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507688
4363	NC_018524	CGG	3	9	184863	184871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507688
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4365	NC_018524	GTG	2	6	184886	184891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507688
4366	NC_018524	TGG	2	6	184974	184979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507688
4367	NC_018524	GGT	2	6	185017	185022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507688
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4485	NC_018524	CGA	2	6	189795	189800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507691
4486	NC_018524	CG	3	6	189865	189870	0 %	0 %	50 %	50 %	403507691
4487	NC_018524	CGGGAA	2	12	189930	189941	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	403507691
4488	NC_018524	CGG	2	6	189948	189953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507691
4489	NC_018524	GCG	2	6	189972	189977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507691
4490	NC_018524	TCC	2	6	189980	189985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507691
4491	NC_018524	GGA	2	6	190009	190014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507691
4492	NC_018524	CGG	2	6	190046	190051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507691
4493	NC_018524	TC	3	6	190056	190061	0 %	50 %	0 %	50 %	403507691
4494	NC_018524	CCA	2	6	190071	190076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507691
4495	NC_018524	GTC	2	6	190102	190107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507691
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4497	NC_018524	CGT	3	9	190237	190245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507692
4498	NC_018524	CCA	2	6	190297	190302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507692
4499	NC_018524	GTC	3	9	190325	190333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507692
4500	NC_018524	CTT	2	6	190346	190351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403507692

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