MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 plasmid pJ7-1

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018225	CT	3	6	1604	1609	0 %	50 %	0 %	50 %	397771727
2	NC_018225	TG	3	6	1667	1672	0 %	50 %	50 %	0 %	397771727
3	NC_018225	GA	3	6	2687	2692	50 %	0 %	50 %	0 %	397771727
4	NC_018225	GA	3	6	3437	3442	50 %	0 %	50 %	0 %	397771727
5	NC_018225	TG	3	6	5021	5026	0 %	50 %	50 %	0 %	397771729
6	NC_018225	CA	3	6	6970	6975	50 %	0 %	0 %	50 %	397771730
7	NC_018225	CA	3	6	7153	7158	50 %	0 %	0 %	50 %	397771730
8	NC_018225	AC	3	6	8979	8984	50 %	0 %	0 %	50 %	397771731
9	NC_018225	CG	3	6	10040	10045	0 %	0 %	50 %	50 %	397771733
10	NC_018225	GA	3	6	12195	12200	50 %	0 %	50 %	0 %	397771736
11	NC_018225	TC	3	6	12477	12482	0 %	50 %	0 %	50 %	397771736
12	NC_018225	CG	3	6	15244	15249	0 %	0 %	50 %	50 %	397771737
13	NC_018225	GC	3	6	16377	16382	0 %	0 %	50 %	50 %	397771738
14	NC_018225	GT	3	6	16794	16799	0 %	50 %	50 %	0 %	397771738
15	NC_018225	GA	4	8	17062	17069	50 %	0 %	50 %	0 %	397771739
16	NC_018225	GA	3	6	17081	17086	50 %	0 %	50 %	0 %	397771739
17	NC_018225	GC	3	6	18120	18125	0 %	0 %	50 %	50 %	397771741
18	NC_018225	GC	3	6	18524	18529	0 %	0 %	50 %	50 %	397771742
19	NC_018225	CT	4	8	19408	19415	0 %	50 %	0 %	50 %	397771742
20	NC_018225	AG	3	6	19697	19702	50 %	0 %	50 %	0 %	397771742
21	NC_018225	AG	3	6	20170	20175	50 %	0 %	50 %	0 %	397771742
22	NC_018225	GA	3	6	22432	22437	50 %	0 %	50 %	0 %	397771742
23	NC_018225	TG	3	6	23114	23119	0 %	50 %	50 %	0 %	397771742
24	NC_018225	AC	4	8	23638	23645	50 %	0 %	0 %	50 %	397771743
25	NC_018225	CG	3	6	24434	24439	0 %	0 %	50 %	50 %	397771744
26	NC_018225	TA	4	8	27355	27362	50 %	50 %	0 %	0 %	397771747
27	NC_018225	AG	3	6	27417	27422	50 %	0 %	50 %	0 %	397771747
28	NC_018225	GA	3	6	29572	29577	50 %	0 %	50 %	0 %	397771749
29	NC_018225	AT	3	6	29722	29727	50 %	50 %	0 %	0 %	397771750
30	NC_018225	TC	3	6	30169	30174	0 %	50 %	0 %	50 %	397771750
31	NC_018225	GC	3	6	30197	30202	0 %	0 %	50 %	50 %	397771750
32	NC_018225	AG	3	6	30356	30361	50 %	0 %	50 %	0 %	397771750
33	NC_018225	TC	3	6	34401	34406	0 %	50 %	0 %	50 %	397771753
34	NC_018225	GA	3	6	34751	34756	50 %	0 %	50 %	0 %	397771753
35	NC_018225	CT	3	6	35751	35756	0 %	50 %	0 %	50 %	397771753
36	NC_018225	CT	4	8	36049	36056	0 %	50 %	0 %	50 %	397771753
37	NC_018225	AT	3	6	36059	36064	50 %	50 %	0 %	0 %	397771753
38	NC_018225	GA	4	8	36315	36322	50 %	0 %	50 %	0 %	397771753
39	NC_018225	AT	3	6	36377	36382	50 %	50 %	0 %	0 %	397771753
40	NC_018225	AG	3	6	36727	36732	50 %	0 %	50 %	0 %	397771754
41	NC_018225	TG	3	6	37166	37171	0 %	50 %	50 %	0 %	397771754
42	NC_018225	AG	3	6	37446	37451	50 %	0 %	50 %	0 %	397771754
43	NC_018225	GT	3	6	38235	38240	0 %	50 %	50 %	0 %	397771755
44	NC_018225	TC	3	6	38495	38500	0 %	50 %	0 %	50 %	397771756
45	NC_018225	TC	3	6	39972	39977	0 %	50 %	0 %	50 %	397771758
46	NC_018225	GT	3	6	42427	42432	0 %	50 %	50 %	0 %	397771760
47	NC_018225	GA	4	8	43018	43025	50 %	0 %	50 %	0 %	397771760
48	NC_018225	GA	3	6	43952	43957	50 %	0 %	50 %	0 %	397771762
49	NC_018225	GA	3	6	44178	44183	50 %	0 %	50 %	0 %	397771762
50	NC_018225	AT	3	6	44392	44397	50 %	50 %	0 %	0 %	397771762
51	NC_018225	CG	3	6	44569	44574	0 %	0 %	50 %	50 %	397771762
52	NC_018225	GC	3	6	44590	44595	0 %	0 %	50 %	50 %	397771762
53	NC_018225	AC	3	6	44620	44625	50 %	0 %	0 %	50 %	397771762
54	NC_018225	GT	3	6	47785	47790	0 %	50 %	50 %	0 %	397771763
55	NC_018225	GC	3	6	48031	48036	0 %	0 %	50 %	50 %	397771763
56	NC_018225	TC	4	8	49853	49860	0 %	50 %	0 %	50 %	397771765
57	NC_018225	CT	3	6	50841	50846	0 %	50 %	0 %	50 %	397771765
58	NC_018225	TC	3	6	51034	51039	0 %	50 %	0 %	50 %	397771765
59	NC_018225	AC	3	6	51346	51351	50 %	0 %	0 %	50 %	397771765
60	NC_018225	TG	3	6	52076	52081	0 %	50 %	50 %	0 %	397771766
61	NC_018225	AC	3	6	52157	52162	50 %	0 %	0 %	50 %	397771766
62	NC_018225	AG	3	6	55147	55152	50 %	0 %	50 %	0 %	397771767
63	NC_018225	CT	3	6	55303	55308	0 %	50 %	0 %	50 %	397771767
64	NC_018225	CG	3	6	55553	55558	0 %	0 %	50 %	50 %	397771767
65	NC_018225	AG	3	6	56046	56051	50 %	0 %	50 %	0 %	397771767
66	NC_018225	TG	3	6	56621	56626	0 %	50 %	50 %	0 %	397771767
67	NC_018225	GC	3	6	56889	56894	0 %	0 %	50 %	50 %	397771767
68	NC_018225	TC	3	6	60696	60701	0 %	50 %	0 %	50 %	397771768
69	NC_018225	AG	4	8	60714	60721	50 %	0 %	50 %	0 %	397771768
70	NC_018225	CG	3	6	60850	60855	0 %	0 %	50 %	50 %	397771768
71	NC_018225	AG	3	6	60970	60975	50 %	0 %	50 %	0 %	397771768
72	NC_018225	GA	3	6	62929	62934	50 %	0 %	50 %	0 %	397771768
73	NC_018225	GA	4	8	63696	63703	50 %	0 %	50 %	0 %	397771768
74	NC_018225	CT	3	6	63981	63986	0 %	50 %	0 %	50 %	397771769
75	NC_018225	TC	3	6	64097	64102	0 %	50 %	0 %	50 %	397771769
76	NC_018225	AG	3	6	64814	64819	50 %	0 %	50 %	0 %	397771770
77	NC_018225	CA	3	6	64927	64932	50 %	0 %	0 %	50 %	397771770
78	NC_018225	GC	3	6	66075	66080	0 %	0 %	50 %	50 %	397771770
79	NC_018225	CT	3	6	68154	68159	0 %	50 %	0 %	50 %	397771770
80	NC_018225	AG	3	6	69070	69075	50 %	0 %	50 %	0 %	397771772
81	NC_018225	GA	3	6	70310	70315	50 %	0 %	50 %	0 %	397771772
82	NC_018225	TC	3	6	72930	72935	0 %	50 %	0 %	50 %	397771773
83	NC_018225	GA	3	6	73391	73396	50 %	0 %	50 %	0 %	397771773
84	NC_018225	CT	3	6	73818	73823	0 %	50 %	0 %	50 %	397771774
85	NC_018225	GA	3	6	74106	74111	50 %	0 %	50 %	0 %	397771774
86	NC_018225	CT	4	8	74151	74158	0 %	50 %	0 %	50 %	397771774
87	NC_018225	GA	3	6	74342	74347	50 %	0 %	50 %	0 %	397771774
88	NC_018225	GC	3	6	78123	78128	0 %	0 %	50 %	50 %	397771775
89	NC_018225	GC	3	6	78454	78459	0 %	0 %	50 %	50 %	397771775
90	NC_018225	GC	3	6	78626	78631	0 %	0 %	50 %	50 %	397771775
91	NC_018225	CA	3	6	79490	79495	50 %	0 %	0 %	50 %	397771775
92	NC_018225	TC	3	6	80180	80185	0 %	50 %	0 %	50 %	397771775
93	NC_018225	CT	3	6	81174	81179	0 %	50 %	0 %	50 %	397771776
94	NC_018225	GA	3	6	81194	81199	50 %	0 %	50 %	0 %	397771776
95	NC_018225	CT	3	6	81282	81287	0 %	50 %	0 %	50 %	397771776
96	NC_018225	CT	3	6	81813	81818	0 %	50 %	0 %	50 %	397771777
97	NC_018225	CA	3	6	84413	84418	50 %	0 %	0 %	50 %	397771780
98	NC_018225	AC	3	6	87636	87641	50 %	0 %	0 %	50 %	397771782
99	NC_018225	GC	3	6	90653	90658	0 %	0 %	50 %	50 %	397771786
100	NC_018225	AC	3	6	91895	91900	50 %	0 %	0 %	50 %	397771788
101	NC_018225	CT	3	6	92253	92258	0 %	50 %	0 %	50 %	397771788
102	NC_018225	GC	3	6	93140	93145	0 %	0 %	50 %	50 %	397771789

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.