MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 83966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018224	AC	3	6	2104	2109	50 %	0 %	0 %	50 %	397771791
2	NC_018224	CA	3	6	2111	2116	50 %	0 %	0 %	50 %	397771791
3	NC_018224	TCG	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771791
4	NC_018224	CGG	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771791
5	NC_018224	CCG	2	6	2311	2316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771791
6	NC_018224	CGT	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771791
7	NC_018224	TCTGC	2	10	2991	3000	0 %	40 %	20 %	40 %	397771792
8	NC_018224	ATC	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771792
9	NC_018224	GAG	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771792
10	NC_018224	GCT	2	6	3133	3138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771792
11	NC_018224	GAG	2	6	3140	3145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771792
12	NC_018224	CCA	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771792
13	NC_018224	CGA	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771792
14	NC_018224	GAG	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771792
15	NC_018224	CGGC	2	8	3254	3261	0 %	0 %	50 %	50 %	397771792
16	NC_018224	CGG	2	6	3267	3272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771792
17	NC_018224	CCG	2	6	3329	3334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771793
18	NC_018224	CGT	2	6	3363	3368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771793
19	NC_018224	CAT	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771793
20	NC_018224	TCG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771793
21	NC_018224	TGT	2	6	3506	3511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771793
22	NC_018224	CGG	2	6	3796	3801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
23	NC_018224	CGA	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
24	NC_018224	CGT	2	6	3955	3960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
25	NC_018224	CGA	2	6	3964	3969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
26	NC_018224	GGT	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771794
27	NC_018224	CCTCGG	2	12	4060	4071	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771794
28	NC_018224	TGG	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771794
29	NC_018224	TGC	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
30	NC_018224	GAGC	2	8	4201	4208	25 %	0 %	50 %	25 %	397771794
31	NC_018224	CGTG	2	8	4256	4263	0 %	25 %	50 %	25 %	397771794
32	NC_018224	CG	3	6	4264	4269	0 %	0 %	50 %	50 %	397771794
33	NC_018224	TCG	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
34	NC_018224	GGC	2	6	4345	4350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
35	NC_018224	CGA	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
36	NC_018224	CGG	2	6	4423	4428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
37	NC_018224	TCG	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
38	NC_018224	CCG	2	6	4464	4469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771794
39	NC_018224	GTT	2	6	4537	4542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771794
40	NC_018224	TCG	3	9	4560	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
41	NC_018224	TCGAG	2	10	4582	4591	20 %	20 %	40 %	20 %	397771794
42	NC_018224	CGA	3	9	4666	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
43	NC_018224	CGAGCG	2	12	4696	4707	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397771794
44	NC_018224	TCG	3	9	4731	4739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
45	NC_018224	CGA	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
46	NC_018224	GCCCT	2	10	4814	4823	0 %	20 %	20 %	60 %	397771794
47	NC_018224	CGC	2	6	4918	4923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771794
48	NC_018224	CGA	2	6	4936	4941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
49	NC_018224	CAT	2	6	4958	4963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771794
50	NC_018224	CGG	2	6	5008	5013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
51	NC_018224	GGC	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
52	NC_018224	CAGG	2	8	5078	5085	25 %	0 %	50 %	25 %	397771794
53	NC_018224	CGA	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
54	NC_018224	GTG	2	6	5199	5204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771794
55	NC_018224	CGT	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
56	NC_018224	TCGA	2	8	5305	5312	25 %	25 %	25 %	25 %	397771795
57	NC_018224	CGT	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
58	NC_018224	TCG	3	9	5414	5422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
59	NC_018224	CGA	2	6	5427	5432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771795
60	NC_018224	GGA	2	6	5461	5466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771795
61	NC_018224	TCG	3	9	5492	5500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
62	NC_018224	GGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
63	NC_018224	GTC	4	12	5596	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
64	NC_018224	GAA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771795
65	NC_018224	CGC	2	6	5655	5660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
66	NC_018224	GCCGTC	2	12	5666	5677	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771795
67	NC_018224	GGT	2	6	5678	5683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771795
68	NC_018224	TCG	3	9	5717	5725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
69	NC_018224	GCC	2	6	5728	5733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
70	NC_018224	CGT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
71	NC_018224	GA	3	6	5856	5861	50 %	0 %	50 %	0 %	397771795
72	NC_018224	CCG	2	6	5869	5874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
73	NC_018224	TCG	2	6	5894	5899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
74	NC_018224	CTCG	2	8	5938	5945	0 %	25 %	25 %	50 %	397771795
75	NC_018224	GTC	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
76	NC_018224	GCG	2	6	6132	6137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
77	NC_018224	CGA	2	6	6168	6173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771795
78	NC_018224	CGAC	2	8	6182	6189	25 %	0 %	25 %	50 %	397771795
79	NC_018224	AAG	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771795
80	NC_018224	CGT	2	6	6207	6212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
81	NC_018224	GTC	2	6	6233	6238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
82	NC_018224	GCC	2	6	6257	6262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
83	NC_018224	CGGTCG	2	12	6335	6346	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397771795
84	NC_018224	TCG	2	6	6459	6464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
85	NC_018224	TCGGAC	2	12	6472	6483	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397771795
86	NC_018224	GTC	2	6	6538	6543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
87	NC_018224	CGC	2	6	6590	6595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
88	NC_018224	GC	3	6	6601	6606	0 %	0 %	50 %	50 %	397771795
89	NC_018224	GTC	2	6	6676	6681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
90	NC_018224	CGGT	2	8	6687	6694	0 %	25 %	50 %	25 %	397771795
91	NC_018224	GCG	2	6	6698	6703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
92	NC_018224	CGGC	2	8	6797	6804	0 %	0 %	50 %	50 %	397771795
93	NC_018224	GTC	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
94	NC_018224	ACC	2	6	6824	6829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771795
95	NC_018224	CGC	2	6	6859	6864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
96	NC_018224	GTC	2	6	6895	6900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
97	NC_018224	CGT	2	6	6903	6908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
98	NC_018224	CGT	2	6	6939	6944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
99	NC_018224	GGTC	2	8	6987	6994	0 %	25 %	50 %	25 %	397771795
100	NC_018224	CCA	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771795
101	NC_018224	CGAC	2	8	7058	7065	25 %	0 %	25 %	50 %	397771795
102	NC_018224	GAG	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771795
103	NC_018224	GGC	2	6	7083	7088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
104	NC_018224	GTCG	2	8	7114	7121	0 %	25 %	50 %	25 %	397771795
105	NC_018224	GCG	2	6	7158	7163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
106	NC_018224	TCCG	2	8	7189	7196	0 %	25 %	25 %	50 %	397771795
107	NC_018224	GTC	2	6	7213	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
108	NC_018224	TCG	2	6	7238	7243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
109	NC_018224	CGG	2	6	7251	7256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
110	NC_018224	TG	3	6	7274	7279	0 %	50 %	50 %	0 %	397771795
111	NC_018224	TGTC	2	8	7281	7288	0 %	50 %	25 %	25 %	397771795
112	NC_018224	CGA	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771795
113	NC_018224	CGT	2	6	7371	7376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
114	NC_018224	CGT	2	6	7402	7407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
115	NC_018224	CTC	2	6	7423	7428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771795
116	NC_018224	TCG	4	12	7476	7487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
117	NC_018224	GTCG	2	8	7519	7526	0 %	25 %	50 %	25 %	397771796
118	NC_018224	GA	3	6	7541	7546	50 %	0 %	50 %	0 %	397771796
119	NC_018224	CGT	2	6	7549	7554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
120	NC_018224	GTC	2	6	7582	7587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
121	NC_018224	CGT	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
122	NC_018224	GCC	2	6	7618	7623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771796
123	NC_018224	CGA	2	6	7629	7634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771796
124	NC_018224	CGATC	2	10	7674	7683	20 %	20 %	20 %	40 %	397771796
125	NC_018224	CAT	2	6	7731	7736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771796
126	NC_018224	GATG	2	8	7749	7756	25 %	25 %	50 %	0 %	397771796
127	NC_018224	CTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771796
128	NC_018224	CCG	2	6	7796	7801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771796
129	NC_018224	CAG	2	6	7882	7887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771796
130	NC_018224	TGC	2	6	7904	7909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
131	NC_018224	GC	3	6	7916	7921	0 %	0 %	50 %	50 %	397771796
132	NC_018224	CTCG	2	8	7930	7937	0 %	25 %	25 %	50 %	397771796
133	NC_018224	GCG	2	6	7959	7964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771796
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243	NC_018224	CAG	2	6	12151	12156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771797
244	NC_018224	TG	3	6	12162	12167	0 %	50 %	50 %	0 %	397771797
245	NC_018224	CGA	2	6	12249	12254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771797
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248	NC_018224	CGAT	2	8	12404	12411	25 %	25 %	25 %	25 %	397771797
249	NC_018224	GGC	2	6	12455	12460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771797
250	NC_018224	GCC	2	6	12522	12527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771797
251	NC_018224	GTC	2	6	12580	12585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771797
252	NC_018224	TCC	2	6	12647	12652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771797
253	NC_018224	GTC	2	6	12661	12666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771797
254	NC_018224	GAC	2	6	12667	12672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771797
255	NC_018224	TCGATG	2	12	12757	12768	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397771798
256	NC_018224	GCT	2	6	12858	12863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771798
257	NC_018224	CAT	2	6	12939	12944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771798
258	NC_018224	GTC	2	6	12993	12998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771798
259	NC_018224	TCG	2	6	13072	13077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771798
260	NC_018224	GAT	2	6	13143	13148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771799
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262	NC_018224	TTG	2	6	13177	13182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771799
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380	NC_018224	CGA	2	6	17934	17939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771803
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382	NC_018224	CTCCG	2	10	18072	18081	0 %	20 %	20 %	60 %	397771803
383	NC_018224	GAT	2	6	18159	18164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771803
384	NC_018224	CGTC	2	8	18167	18174	0 %	25 %	25 %	50 %	397771803
385	NC_018224	GT	3	6	18179	18184	0 %	50 %	50 %	0 %	397771803
386	NC_018224	CGT	2	6	18186	18191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771803
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388	NC_018224	TCGCG	2	10	18418	18427	0 %	20 %	40 %	40 %	397771803
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488	NC_018224	ATA	2	6	22925	22930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397771804
489	NC_018224	GCTC	2	8	23032	23039	0 %	25 %	25 %	50 %	397771804
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491	NC_018224	CGG	2	6	23093	23098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771804
492	NC_018224	GTA	2	6	23129	23134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771804
493	NC_018224	GAT	2	6	23194	23199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771804
494	NC_018224	ATCT	2	8	23206	23213	25 %	50 %	0 %	25 %	397771804
495	NC_018224	TGA	2	6	23214	23219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771804
496	NC_018224	CT	5	10	23237	23246	0 %	50 %	0 %	50 %	397771804
497	NC_018224	ACA	2	6	23280	23285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771804
498	NC_018224	ATC	2	6	23303	23308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771804
499	NC_018224	CGCTT	2	10	23456	23465	0 %	40 %	20 %	40 %	397771805
500	NC_018224	CGA	2	6	23491	23496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771806

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