MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 83966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018224	GCG	2	6	172351	172356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771959
4002	NC_018224	GCG	2	6	172401	172406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771959
4003	NC_018224	CGATC	2	10	172576	172585	20 %	20 %	20 %	40 %	397771960
4004	NC_018224	TGCGCA	2	12	172670	172681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397771961
4005	NC_018224	CGG	2	6	172736	172741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771961
4006	NC_018224	CTA	2	6	172746	172751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771961
4007	NC_018224	GCCG	2	8	172756	172763	0 %	0 %	50 %	50 %	397771961
4008	NC_018224	GCC	2	6	172776	172781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771961
4009	NC_018224	GCG	2	6	172792	172797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771961
4010	NC_018224	GCT	2	6	172815	172820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771961
4011	NC_018224	CTT	2	6	172824	172829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771961
4012	NC_018224	CGA	2	6	172920	172925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771961
4013	NC_018224	GAC	2	6	172948	172953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771961
4014	NC_018224	CGCT	2	8	172957	172964	0 %	25 %	25 %	50 %	397771961
4015	NC_018224	GGA	2	6	172968	172973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771961
4016	NC_018224	CGA	2	6	172974	172979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771961
4017	NC_018224	CGG	2	6	172983	172988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771961
4018	NC_018224	CCGTCG	2	12	173124	173135	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771962
4019	NC_018224	CGC	2	6	173143	173148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771962
4020	NC_018224	GCT	2	6	173205	173210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771962
4021	NC_018224	CG	3	6	173220	173225	0 %	0 %	50 %	50 %	397771962
4022	NC_018224	GTG	2	6	173234	173239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771962
4023	NC_018224	GGC	2	6	173302	173307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771962
4024	NC_018224	GCC	2	6	173318	173323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771962
4025	NC_018224	GAG	2	6	173448	173453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771963
4026	NC_018224	CCG	2	6	173455	173460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771963
4027	NC_018224	GCG	2	6	173503	173508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771963
4028	NC_018224	ACG	2	6	173509	173514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771963
4029	NC_018224	ACC	2	6	173530	173535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771963
4030	NC_018224	ATCG	2	8	173556	173563	25 %	25 %	25 %	25 %	397771963
4031	NC_018224	CGTG	2	8	173578	173585	0 %	25 %	50 %	25 %	397771963
4032	NC_018224	CA	3	6	173595	173600	50 %	0 %	0 %	50 %	397771963
4033	NC_018224	GGT	2	6	173629	173634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771963
4034	NC_018224	GAACG	2	10	173668	173677	40 %	0 %	40 %	20 %	397771963
4035	NC_018224	CTC	2	6	173746	173751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771964
4036	NC_018224	CGCGA	2	10	173781	173790	20 %	0 %	40 %	40 %	397771964
4037	NC_018224	TC	3	6	173817	173822	0 %	50 %	0 %	50 %	397771964
4038	NC_018224	TCG	2	6	173843	173848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771964
4039	NC_018224	GCC	2	6	173870	173875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771964
4040	NC_018224	TCG	2	6	173879	173884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771964
4041	NC_018224	CGC	2	6	173997	174002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771964
4042	NC_018224	TCG	2	6	174011	174016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771964
4043	NC_018224	CGG	2	6	174020	174025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771964
4044	NC_018224	TCG	2	6	174026	174031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771964
4045	NC_018224	TCT	2	6	174035	174040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771964
4046	NC_018224	CGA	2	6	174062	174067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771964
4047	NC_018224	CGT	2	6	174069	174074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771964
4048	NC_018224	CTCGCG	2	12	174079	174090	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771964
4049	NC_018224	TCG	2	6	174107	174112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771964
4050	NC_018224	TCC	2	6	174175	174180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771965
4051	NC_018224	CGC	2	6	174191	174196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771965
4052	NC_018224	CGA	2	6	174290	174295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771965
4053	NC_018224	GTC	2	6	174346	174351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4054	NC_018224	GTGAT	2	10	174412	174421	20 %	40 %	40 %	0 %	397771966
4055	NC_018224	CGC	2	6	174422	174427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4056	NC_018224	CTCG	2	8	174456	174463	0 %	25 %	25 %	50 %	397771966
4057	NC_018224	CGC	2	6	174509	174514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4058	NC_018224	CGA	2	6	174521	174526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4059	NC_018224	CGA	2	6	174536	174541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4060	NC_018224	CCT	2	6	174545	174550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771966
4061	NC_018224	GATCTC	2	12	174555	174566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397771966
4062	NC_018224	GCC	2	6	174658	174663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4063	NC_018224	CTC	2	6	174684	174689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771966
4064	NC_018224	CGT	2	6	174782	174787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4065	NC_018224	CGA	2	6	174803	174808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4066	NC_018224	CGT	2	6	174884	174889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4067	NC_018224	GTC	2	6	174915	174920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4068	NC_018224	CG	3	6	174944	174949	0 %	0 %	50 %	50 %	397771966
4069	NC_018224	AGCG	2	8	174967	174974	25 %	0 %	50 %	25 %	397771966
4070	NC_018224	GCC	3	9	174984	174992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4071	NC_018224	GAT	2	6	174993	174998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771966
4072	NC_018224	GCC	2	6	175050	175055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4073	NC_018224	GAC	2	6	175062	175067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4074	NC_018224	GAG	2	6	175101	175106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771966
4075	NC_018224	TCG	2	6	175124	175129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4076	NC_018224	GCC	2	6	175137	175142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4077	NC_018224	CGAC	2	8	175184	175191	25 %	0 %	25 %	50 %	397771966
4078	NC_018224	GAT	2	6	175197	175202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771966
4079	NC_018224	CGA	2	6	175214	175219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4080	NC_018224	GTC	2	6	175264	175269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4081	NC_018224	ACG	3	9	175309	175317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4082	NC_018224	CGC	2	6	175322	175327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4083	NC_018224	AAC	2	6	175342	175347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771966
4084	NC_018224	TGA	2	6	175376	175381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771966
4085	NC_018224	TCC	2	6	175432	175437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771966
4086	NC_018224	GGCCGC	2	12	175479	175490	0 %	0 %	50 %	50 %	397771966
4087	NC_018224	CGCC	2	8	175493	175500	0 %	0 %	25 %	75 %	397771966
4088	NC_018224	CGA	2	6	175532	175537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4089	NC_018224	GA	3	6	175588	175593	50 %	0 %	50 %	0 %	397771966
4090	NC_018224	GAC	2	6	175617	175622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4091	NC_018224	CGA	2	6	175628	175633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4092	NC_018224	CGA	2	6	175640	175645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4093	NC_018224	AAC	2	6	175672	175677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771966
4094	NC_018224	GGT	2	6	175692	175697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771966
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4097	NC_018224	ACGG	2	8	175806	175813	25 %	0 %	50 %	25 %	397771966
4098	NC_018224	GAC	2	6	175815	175820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4099	NC_018224	TGA	2	6	175835	175840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771966
4100	NC_018224	GC	3	6	175865	175870	0 %	0 %	50 %	50 %	397771966
4101	NC_018224	GAA	2	6	175905	175910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771966
4102	NC_018224	CGG	3	9	175919	175927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771966
4103	NC_018224	CGC	2	6	175944	175949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4104	NC_018224	TCG	2	6	175955	175960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4105	NC_018224	GAT	2	6	176031	176036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771966
4106	NC_018224	TCG	2	6	176057	176062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4107	NC_018224	GAG	2	6	176175	176180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771966
4108	NC_018224	AGA	2	6	176186	176191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771966
4109	NC_018224	CGA	2	6	176201	176206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4110	NC_018224	GTC	2	6	176446	176451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4111	NC_018224	TCT	2	6	176505	176510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771967
4112	NC_018224	TCG	2	6	176514	176519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4113	NC_018224	CCT	2	6	176616	176621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771967
4114	NC_018224	GTC	3	9	176644	176652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4115	NC_018224	G	6	6	176664	176669	0 %	0 %	100 %	0 %	397771967
4116	NC_018224	GATC	2	8	176679	176686	25 %	25 %	25 %	25 %	397771967
4117	NC_018224	CCG	2	6	176688	176693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771967
4118	NC_018224	GAG	2	6	176731	176736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771967
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4120	NC_018224	CGA	2	6	176781	176786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771967
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4239	NC_018224	ACG	2	6	181830	181835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771971
4240	NC_018224	CGCC	2	8	181853	181860	0 %	0 %	25 %	75 %	397771971
4241	NC_018224	CCG	2	6	181863	181868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771971
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4243	NC_018224	CCG	2	6	182026	182031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771972
4244	NC_018224	CGT	2	6	182074	182079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771972
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4251	NC_018224	TCGGC	2	10	182476	182485	0 %	20 %	40 %	40 %	397771973
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4270	NC_018224	GC	3	6	183279	183284	0 %	0 %	50 %	50 %	397771975
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4354	NC_018224	CGA	2	6	186398	186403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771978
4355	NC_018224	GCA	2	6	186421	186426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771978
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4357	NC_018224	GAC	3	9	186444	186452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771978
4358	NC_018224	TCC	2	6	186508	186513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771978
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4362	NC_018224	TCG	2	6	186643	186648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771978
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4434	NC_018224	GTC	2	6	190337	190342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771982
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4462	NC_018224	GC	3	6	191643	191648	0 %	0 %	50 %	50 %	397771982
4463	NC_018224	TCGC	2	8	191650	191657	0 %	25 %	25 %	50 %	397771982
4464	NC_018224	TGA	2	6	191704	191709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771982
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4471	NC_018224	GTC	2	6	191924	191929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771982
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4473	NC_018224	TCG	2	6	192016	192021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771983
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4475	NC_018224	TCG	2	6	192032	192037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771983
4476	NC_018224	TGAG	2	8	192071	192078	25 %	25 %	50 %	0 %	397771983
4477	NC_018224	CCGGAC	2	12	192126	192137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397771983
4478	NC_018224	CGA	2	6	192156	192161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771983
4479	NC_018224	CAC	2	6	192165	192170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771983
4480	NC_018224	CGTC	2	8	192331	192338	0 %	25 %	25 %	50 %	397771984
4481	NC_018224	CGA	2	6	192352	192357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771984
4482	NC_018224	GCC	2	6	192368	192373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771984
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4488	NC_018224	CGA	2	6	192607	192612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771984
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4490	NC_018224	CTG	2	6	192644	192649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771984
4491	NC_018224	TCCT	2	8	192650	192657	0 %	50 %	0 %	50 %	397771984
4492	NC_018224	CGG	3	9	192672	192680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771984
4493	NC_018224	CCCG	2	8	192705	192712	0 %	0 %	25 %	75 %	397771984
4494	NC_018224	CGG	2	6	192753	192758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771984
4495	NC_018224	TCGCGC	2	12	192771	192782	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771984
4496	NC_018224	TCG	2	6	192801	192806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771984
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4499	NC_018224	TCG	2	6	192939	192944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771984
4500	NC_018224	ACGCG	2	10	192945	192954	20 %	0 %	40 %	40 %	397771984

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