MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 83966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018224	CGA	2	6	257942	257947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772050
6002	NC_018224	TCG	2	6	257958	257963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772050
6003	NC_018224	CGC	2	6	257971	257976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772050
6004	NC_018224	GTG	2	6	257999	258004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397772050
6005	NC_018224	CTC	2	6	258011	258016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772050
6006	NC_018224	GTC	2	6	258031	258036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6007	NC_018224	TCCCG	2	10	258037	258046	0 %	20 %	20 %	60 %	397772051
6008	NC_018224	GTCG	2	8	258052	258059	0 %	25 %	50 %	25 %	397772051
6009	NC_018224	TCG	3	9	258074	258082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6010	NC_018224	GGC	2	6	258111	258116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772051
6011	NC_018224	TGCC	2	8	258244	258251	0 %	25 %	25 %	50 %	397772051
6012	NC_018224	GCT	2	6	258288	258293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6013	NC_018224	TCG	2	6	258299	258304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6014	NC_018224	GCG	2	6	258330	258335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772051
6015	NC_018224	CTG	2	6	258370	258375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6016	NC_018224	TGC	2	6	258383	258388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6017	NC_018224	CTC	2	6	258400	258405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772051
6018	NC_018224	AGG	2	6	258446	258451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772051
6019	NC_018224	GTC	2	6	258452	258457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6020	NC_018224	CAT	2	6	258511	258516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397772051
6021	NC_018224	CGACGG	2	12	258597	258608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397772051
6022	NC_018224	TCG	2	6	258647	258652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6023	NC_018224	GTC	2	6	258712	258717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6024	NC_018224	TCGA	2	8	258749	258756	25 %	25 %	25 %	25 %	397772051
6025	NC_018224	CGC	3	9	258762	258770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772051
6026	NC_018224	GCC	2	6	258772	258777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772051
6027	NC_018224	CGG	2	6	258798	258803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772051
6028	NC_018224	TTGCCC	2	12	258905	258916	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397772051
6029	NC_018224	ACGGG	2	10	258983	258992	20 %	0 %	60 %	20 %	397772051
6030	NC_018224	CG	3	6	259073	259078	0 %	0 %	50 %	50 %	397772051
6031	NC_018224	CGA	2	6	259080	259085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6032	NC_018224	TTC	2	6	259117	259122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397772051
6033	NC_018224	TCG	2	6	259127	259132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6034	NC_018224	CTC	2	6	259135	259140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772051
6035	NC_018224	TTC	2	6	259192	259197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397772051
6036	NC_018224	AGC	2	6	259202	259207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6037	NC_018224	CGT	2	6	259219	259224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772051
6038	NC_018224	GTC	3	9	259606	259614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772052
6039	NC_018224	CCGA	2	8	259636	259643	25 %	0 %	25 %	50 %	397772052
6040	NC_018224	TCG	2	6	259661	259666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772052
6041	NC_018224	CGA	2	6	259683	259688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772052
6042	NC_018224	GTCCA	2	10	259709	259718	20 %	20 %	20 %	40 %	397772052
6043	NC_018224	GAC	2	6	259726	259731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772052
6044	NC_018224	CTG	2	6	259732	259737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772052
6045	NC_018224	CCG	2	6	259751	259756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772052
6046	NC_018224	CGG	2	6	259804	259809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772052
6047	NC_018224	CGG	2	6	259833	259838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772052
6048	NC_018224	GTCGG	2	10	259849	259858	0 %	20 %	60 %	20 %	397772052
6049	NC_018224	GCC	2	6	259883	259888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772052
6050	NC_018224	CGCGAG	2	12	259948	259959	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397772052
6051	NC_018224	CCG	2	6	259989	259994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772052
6052	NC_018224	CGTC	2	8	260007	260014	0 %	25 %	25 %	50 %	397772052
6053	NC_018224	TCG	3	9	260051	260059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772052
6054	NC_018224	CCGA	2	8	260084	260091	25 %	0 %	25 %	50 %	397772052
6055	NC_018224	CGG	2	6	260094	260099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772052
6056	NC_018224	GCG	2	6	260127	260132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772052
6057	NC_018224	CGT	2	6	260182	260187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772052
6058	NC_018224	AGCGC	2	10	260213	260222	20 %	0 %	40 %	40 %	397772052
6059	NC_018224	TCC	2	6	260294	260299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772052
6060	NC_018224	CGT	2	6	260308	260313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772052
6061	NC_018224	GTG	2	6	260318	260323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397772052
6062	NC_018224	CGGT	2	8	260351	260358	0 %	25 %	50 %	25 %	397772052
6063	NC_018224	TCG	2	6	260474	260479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772052
6064	NC_018224	TGA	2	6	260529	260534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772052
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6066	NC_018224	CCG	2	6	260634	260639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772052
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6068	NC_018224	ACC	2	6	260681	260686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397772052
6069	NC_018224	CA	4	8	260692	260699	50 %	0 %	0 %	50 %	397772052
6070	NC_018224	CG	3	6	260824	260829	0 %	0 %	50 %	50 %	397772053
6071	NC_018224	TCGAGA	2	12	260836	260847	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397772053
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6073	NC_018224	TGCTCG	2	12	260884	260895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772053
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6090	NC_018224	GTCG	2	8	261759	261766	0 %	25 %	50 %	25 %	397772055
6091	NC_018224	AGC	2	6	261767	261772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772055
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6103	NC_018224	CGGT	2	8	262103	262110	0 %	25 %	50 %	25 %	397772055
6104	NC_018224	CCGA	2	8	262111	262118	25 %	0 %	25 %	50 %	397772055
6105	NC_018224	GTCG	2	8	262122	262129	0 %	25 %	50 %	25 %	397772055
6106	NC_018224	TCGCC	2	10	262140	262149	0 %	20 %	20 %	60 %	397772055
6107	NC_018224	GAA	2	6	262159	262164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397772055
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6109	NC_018224	GAG	2	6	262250	262255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772055
6110	NC_018224	GCG	3	9	262260	262268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772055
6111	NC_018224	TCA	2	6	262386	262391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397772055
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6114	NC_018224	TCCG	2	8	262583	262590	0 %	25 %	25 %	50 %	397772055
6115	NC_018224	CCT	2	6	262617	262622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772055
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6118	NC_018224	TCG	3	9	262670	262678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772055
6119	NC_018224	CCCGA	2	10	262683	262692	20 %	0 %	20 %	60 %	397772055
6120	NC_018224	GGA	2	6	262701	262706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772055
6121	NC_018224	GTC	2	6	262720	262725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772055
6122	NC_018224	GTC	2	6	262732	262737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772055
6123	NC_018224	TCC	2	6	262754	262759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772055
6124	NC_018224	CCGAAG	2	12	262787	262798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772055
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6149	NC_018224	CGA	2	6	263520	263525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772055
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6238	NC_018224	CTG	2	6	267385	267390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772061
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6361	NC_018224	GCT	2	6	272486	272491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772067
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6479	NC_018224	AGC	2	6	277454	277459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772071
6480	NC_018224	CGAG	2	8	277494	277501	25 %	0 %	50 %	25 %	397772071
6481	NC_018224	GACGA	2	10	277531	277540	40 %	0 %	40 %	20 %	397772071
6482	NC_018224	ATCT	2	8	277747	277754	25 %	50 %	0 %	25 %	397772071
6483	NC_018224	CCG	2	6	277805	277810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772071
6484	NC_018224	TCG	2	6	277820	277825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772071
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6499	NC_018224	CGA	2	6	278137	278142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772072
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