MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 83966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018224	GTT	2	6	217061	217066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397772010
5002	NC_018224	GAG	2	6	217092	217097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772010
5003	NC_018224	ACG	2	6	217114	217119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5004	NC_018224	AGC	2	6	217124	217129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5005	NC_018224	GCG	2	6	217153	217158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772010
5006	NC_018224	ACG	2	6	217161	217166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5007	NC_018224	CGG	2	6	217189	217194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772010
5008	NC_018224	TCG	2	6	217204	217209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5009	NC_018224	CGT	2	6	217211	217216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5010	NC_018224	CACT	2	8	217233	217240	25 %	25 %	0 %	50 %	397772010
5011	NC_018224	CGG	2	6	217292	217297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772010
5012	NC_018224	CGC	2	6	217301	217306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772010
5013	NC_018224	TCGCCG	2	12	217348	217359	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397772010
5014	NC_018224	GTCGGC	2	12	217380	217391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397772010
5015	NC_018224	TCG	2	6	217405	217410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5016	NC_018224	TTC	2	6	217482	217487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397772010
5017	NC_018224	CGG	2	6	217514	217519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772010
5018	NC_018224	GCT	2	6	217535	217540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5019	NC_018224	CAG	2	6	217572	217577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5020	NC_018224	GCC	2	6	217578	217583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772010
5021	NC_018224	CAT	2	6	217640	217645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397772010
5022	NC_018224	CTT	2	6	217661	217666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397772010
5023	NC_018224	GCC	2	6	217677	217682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772010
5024	NC_018224	CAG	2	6	217695	217700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5025	NC_018224	GGC	2	6	217712	217717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772010
5026	NC_018224	CAT	2	6	217742	217747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397772010
5027	NC_018224	TCG	2	6	217771	217776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5028	NC_018224	GAC	2	6	217784	217789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5029	NC_018224	CGG	2	6	217806	217811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772010
5030	NC_018224	GTC	2	6	217842	217847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5031	NC_018224	GCGA	2	8	217867	217874	25 %	0 %	50 %	25 %	397772010
5032	NC_018224	TGA	2	6	217951	217956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772010
5033	NC_018224	CGAC	2	8	217957	217964	25 %	0 %	25 %	50 %	397772010
5034	NC_018224	CGATG	2	10	217988	217997	20 %	20 %	40 %	20 %	397772010
5035	NC_018224	GCC	2	6	218032	218037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772010
5036	NC_018224	GAC	3	9	218052	218060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5037	NC_018224	TGA	2	6	218089	218094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772010
5038	NC_018224	GCGGT	2	10	218119	218128	0 %	20 %	60 %	20 %	397772010
5039	NC_018224	GC	3	6	218294	218299	0 %	0 %	50 %	50 %	397772011
5040	NC_018224	TTC	2	6	218337	218342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397772011
5041	NC_018224	GAC	2	6	218372	218377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772011
5042	NC_018224	CGG	2	6	218414	218419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772011
5043	NC_018224	ACG	2	6	218440	218445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772011
5044	NC_018224	GAC	2	6	218451	218456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772011
5045	NC_018224	CAG	2	6	218460	218465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772011
5046	NC_018224	CGCGA	2	10	218469	218478	20 %	0 %	40 %	40 %	397772011
5047	NC_018224	GCC	2	6	218577	218582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772011
5048	NC_018224	CGA	2	6	218630	218635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772011
5049	NC_018224	CGG	2	6	218654	218659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772011
5050	NC_018224	GCC	2	6	218668	218673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772011
5051	NC_018224	TGC	2	6	218674	218679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772011
5052	NC_018224	CCG	2	6	218731	218736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772011
5053	NC_018224	GAC	2	6	218798	218803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772011
5054	NC_018224	CTG	2	6	218808	218813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772011
5055	NC_018224	GAG	2	6	218829	218834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772011
5056	NC_018224	GCCG	2	8	218954	218961	0 %	0 %	50 %	50 %	397772011
5057	NC_018224	ACG	2	6	218994	218999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772011
5058	NC_018224	CGA	2	6	219029	219034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772011
5059	NC_018224	GGT	2	6	219036	219041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397772011
5060	NC_018224	CCGCG	2	10	219046	219055	0 %	0 %	40 %	60 %	397772011
5061	NC_018224	CTC	2	6	219057	219062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772011
5062	NC_018224	CGA	2	6	219092	219097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772011
5063	NC_018224	GAG	2	6	219123	219128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772011
5064	NC_018224	CGG	2	6	219178	219183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772011
5065	NC_018224	CGA	2	6	219194	219199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772011
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5070	NC_018224	CGC	2	6	219287	219292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772012
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5079	NC_018224	TCG	3	9	219600	219608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772012
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5085	NC_018224	ATC	2	6	219719	219724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397772012
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5087	NC_018224	CGA	2	6	219748	219753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772012
5088	NC_018224	TGA	2	6	219762	219767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772012
5089	NC_018224	TCC	2	6	219777	219782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772012
5090	NC_018224	TCT	2	6	219792	219797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397772012
5091	NC_018224	TCT	2	6	219807	219812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397772012
5092	NC_018224	AGC	2	6	219831	219836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772012
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5094	NC_018224	GTTCG	2	10	219890	219899	0 %	40 %	40 %	20 %	397772012
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5101	NC_018224	CGGA	2	8	220270	220277	25 %	0 %	50 %	25 %	397772013
5102	NC_018224	CCG	2	6	220290	220295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772013
5103	NC_018224	ACG	2	6	220309	220314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772013
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5108	NC_018224	CTCGT	2	10	220456	220465	0 %	40 %	20 %	40 %	397772013
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5116	NC_018224	TCG	3	9	220861	220869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772014
5117	NC_018224	CGC	2	6	220889	220894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772014
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5119	NC_018224	GCGG	2	8	220998	221005	0 %	0 %	75 %	25 %	397772014
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5240	NC_018224	CG	3	6	225531	225536	0 %	0 %	50 %	50 %	397772017
5241	NC_018224	TCG	2	6	225592	225597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772017
5242	NC_018224	CGT	2	6	225647	225652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772017
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5348	NC_018224	G	6	6	229903	229908	0 %	0 %	100 %	0 %	397772024
5349	NC_018224	CGTTCG	2	12	229911	229922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772024
5350	NC_018224	GTC	2	6	229925	229930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772024
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5353	NC_018224	GAT	2	6	230039	230044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772024
5354	NC_018224	CGT	2	6	230050	230055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772024
5355	NC_018224	GAG	2	6	230105	230110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772024
5356	NC_018224	GC	3	6	230165	230170	0 %	0 %	50 %	50 %	397772024
5357	NC_018224	GCC	2	6	230267	230272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772024
5358	NC_018224	TCGCCG	2	12	230283	230294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397772024
5359	NC_018224	CGT	2	6	230296	230301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772024
5360	NC_018224	TTC	2	6	230306	230311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397772024
5361	NC_018224	TCG	2	6	230316	230321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772024
5362	NC_018224	CGG	2	6	230347	230352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772024
5363	NC_018224	CCG	2	6	230409	230414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772024
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5369	NC_018224	GAAC	2	8	230563	230570	50 %	0 %	25 %	25 %	397772025
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5477	NC_018224	TCG	2	6	235482	235487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772029
5478	NC_018224	CGA	3	9	235531	235539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772029
5479	NC_018224	CGGC	2	8	235587	235594	0 %	0 %	50 %	50 %	397772029
5480	NC_018224	GAC	2	6	235619	235624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772029
5481	NC_018224	CGGTCG	2	12	235639	235650	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397772029
5482	NC_018224	GTCG	2	8	235654	235661	0 %	25 %	50 %	25 %	397772029
5483	NC_018224	GGC	2	6	235678	235683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772029
5484	NC_018224	CGT	2	6	235684	235689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772029
5485	NC_018224	GTA	2	6	235748	235753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772029
5486	NC_018224	GTC	2	6	235814	235819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772029
5487	NC_018224	TGT	2	6	235902	235907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397772029
5488	NC_018224	CCG	2	6	235974	235979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772029
5489	NC_018224	GAC	2	6	236003	236008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772029
5490	NC_018224	GCG	2	6	236013	236018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772029
5491	NC_018224	CGA	2	6	236040	236045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772029
5492	NC_018224	CGC	2	6	236171	236176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772030
5493	NC_018224	CGA	2	6	236180	236185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772030
5494	NC_018224	CAT	2	6	236243	236248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397772030
5495	NC_018224	TGG	2	6	236251	236256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397772030
5496	NC_018224	CAG	2	6	236274	236279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772030
5497	NC_018224	TCG	4	12	236320	236331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772030
5498	NC_018224	CG	3	6	236355	236360	0 %	0 %	50 %	50 %	397772030
5499	NC_018224	CGGC	2	8	236383	236390	0 %	0 %	50 %	50 %	397772030
5500	NC_018224	CCCCG	2	10	236391	236400	0 %	0 %	20 %	80 %	397772030

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