MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 83966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_018224	CCGCG	2	10	192976	192985	0 %	0 %	40 %	60 %	397771984
4503	NC_018224	GA	3	6	192990	192995	50 %	0 %	50 %	0 %	397771984
4504	NC_018224	GCGG	2	8	193013	193020	0 %	0 %	75 %	25 %	397771985
4505	NC_018224	GT	3	6	193030	193035	0 %	50 %	50 %	0 %	397771985
4506	NC_018224	GAGC	2	8	193086	193093	25 %	0 %	50 %	25 %	397771985
4507	NC_018224	GA	3	6	193098	193103	50 %	0 %	50 %	0 %	397771985
4508	NC_018224	GAC	2	6	193111	193116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771985
4509	NC_018224	GCGG	2	8	193247	193254	0 %	0 %	75 %	25 %	397771986
4510	NC_018224	TCT	2	6	193275	193280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771986
4511	NC_018224	CCT	2	6	193345	193350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771986
4512	NC_018224	GTG	2	6	193359	193364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771986
4513	NC_018224	CCG	2	6	193464	193469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771986
4514	NC_018224	GAT	2	6	193559	193564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771986
4515	NC_018224	TCT	2	6	193594	193599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771986
4516	NC_018224	TGA	2	6	193639	193644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771986
4517	NC_018224	CGA	2	6	193651	193656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771986
4518	NC_018224	CTT	2	6	193670	193675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771986
4519	NC_018224	CCGG	2	8	193812	193819	0 %	0 %	50 %	50 %	397771986
4520	NC_018224	TCT	2	6	193839	193844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771986
4521	NC_018224	GCC	2	6	193845	193850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771986
4522	NC_018224	TCG	2	6	193994	193999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771987
4523	NC_018224	TCG	2	6	194003	194008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771987
4524	NC_018224	GCGCG	2	10	194198	194207	0 %	0 %	60 %	40 %	397771987
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4527	NC_018224	GC	3	6	194257	194262	0 %	0 %	50 %	50 %	397771987
4528	NC_018224	GAC	2	6	194521	194526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771988
4529	NC_018224	CGA	3	9	194557	194565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771988
4530	NC_018224	TGA	2	6	194578	194583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771988
4531	NC_018224	GCTC	2	8	194619	194626	0 %	25 %	25 %	50 %	397771988
4532	NC_018224	CGC	2	6	194668	194673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771988
4533	NC_018224	TCG	2	6	194687	194692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771988
4534	NC_018224	CAA	2	6	194713	194718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771988
4535	NC_018224	CGA	2	6	194752	194757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771988
4536	NC_018224	TGT	2	6	194787	194792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771988
4537	NC_018224	CGA	2	6	194803	194808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771988
4538	NC_018224	CCG	2	6	194867	194872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771988
4539	NC_018224	GC	3	6	194892	194897	0 %	0 %	50 %	50 %	397771988
4540	NC_018224	TCGA	2	8	194903	194910	25 %	25 %	25 %	25 %	397771988
4541	NC_018224	ACC	2	6	194928	194933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771988
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4545	NC_018224	CGT	2	6	195251	195256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771989
4546	NC_018224	TCG	2	6	195276	195281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771989
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4548	NC_018224	TCG	2	6	195333	195338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771989
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4551	NC_018224	ACA	2	6	195556	195561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771989
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4553	NC_018224	CGA	2	6	195643	195648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771989
4554	NC_018224	TGA	2	6	195670	195675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771989
4555	NC_018224	CG	3	6	195700	195705	0 %	0 %	50 %	50 %	397771989
4556	NC_018224	TCG	2	6	195756	195761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771989
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4561	NC_018224	CGCCC	2	10	195946	195955	0 %	0 %	20 %	80 %	397771989
4562	NC_018224	GAG	2	6	195963	195968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771989
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4565	NC_018224	GCCC	2	8	196099	196106	0 %	0 %	25 %	75 %	397771989
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4570	NC_018224	GAG	2	6	196244	196249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771989
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4622	NC_018224	GCC	2	6	198600	198605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771992
4623	NC_018224	CGA	2	6	198624	198629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771992
4624	NC_018224	GTC	3	9	198640	198648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771992
4625	NC_018224	GTCA	2	8	198664	198671	25 %	25 %	25 %	25 %	397771992
4626	NC_018224	GTCG	2	8	198700	198707	0 %	25 %	50 %	25 %	397771993
4627	NC_018224	TCC	2	6	198765	198770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771993
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4860	NC_018224	CCG	2	6	209914	209919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772001
4861	NC_018224	CGA	2	6	209933	209938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772001
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4965	NC_018224	ACA	2	6	214621	214626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397772006
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4968	NC_018224	TCG	2	6	214795	214800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772007
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4970	NC_018224	GGT	2	6	214831	214836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397772007
4971	NC_018224	CGAC	2	8	214885	214892	25 %	0 %	25 %	50 %	397772007
4972	NC_018224	CCGCG	2	10	214939	214948	0 %	0 %	40 %	60 %	397772007
4973	NC_018224	ACCCCC	2	12	215172	215183	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	397772007
4974	NC_018224	CGT	2	6	215186	215191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772007
4975	NC_018224	ACG	2	6	215208	215213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772007
4976	NC_018224	GGC	2	6	215214	215219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772007
4977	NC_018224	GACC	2	8	215276	215283	25 %	0 %	25 %	50 %	397772007
4978	NC_018224	CCGC	2	8	215299	215306	0 %	0 %	25 %	75 %	397772007
4979	NC_018224	CGT	2	6	215437	215442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772007
4980	NC_018224	TCG	2	6	215445	215450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772007
4981	NC_018224	CGG	2	6	215459	215464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772007
4982	NC_018224	GATC	2	8	215578	215585	25 %	25 %	25 %	25 %	397772007
4983	NC_018224	CGC	2	6	215886	215891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772008
4984	NC_018224	CGA	3	9	215895	215903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772008
4985	NC_018224	CGG	2	6	215911	215916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772008
4986	NC_018224	TTG	2	6	215924	215929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397772008
4987	NC_018224	CGT	2	6	215964	215969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772008
4988	NC_018224	GC	3	6	216013	216018	0 %	0 %	50 %	50 %	397772008
4989	NC_018224	CGA	2	6	216027	216032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772008
4990	NC_018224	GTG	2	6	216112	216117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397772008
4991	NC_018224	GTT	2	6	216145	216150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397772008
4992	NC_018224	TCC	2	6	216230	216235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772008
4993	NC_018224	TGA	2	6	216237	216242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772008
4994	NC_018224	TGTGC	2	10	216294	216303	0 %	40 %	40 %	20 %	397772008
4995	NC_018224	GAG	2	6	216558	216563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772009
4996	NC_018224	TCGG	2	8	216681	216688	0 %	25 %	50 %	25 %	397772009
4997	NC_018224	TCGAT	2	10	216696	216705	20 %	40 %	20 %	20 %	397772009
4998	NC_018224	GAG	2	6	216989	216994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772010
4999	NC_018224	CGGAT	2	10	216999	217008	20 %	20 %	40 %	20 %	397772010
5000	NC_018224	CTG	2	6	217047	217052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772010

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