MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 1188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017518	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385856167
2	NC_017518	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385856168
3	NC_017518	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385856168
4	NC_017518	GACAT	2	10	3506	3515	40 %	20 %	20 %	20 %	385856170
5	NC_017518	AAGGC	2	10	6082	6091	40 %	0 %	40 %	20 %	385856174
6	NC_017518	TGCTT	2	10	6441	6450	0 %	60 %	20 %	20 %	385856175
7	NC_017518	GGTGC	2	10	8363	8372	0 %	20 %	60 %	20 %	385856176
8	NC_017518	TACCG	2	10	9641	9650	20 %	20 %	20 %	40 %	385856177
9	NC_017518	TCAAT	2	10	10707	10716	40 %	40 %	0 %	20 %	385856178
10	NC_017518	CGCGC	2	10	11720	11729	0 %	0 %	40 %	60 %	385856179
11	NC_017518	CACGC	2	10	12036	12045	20 %	0 %	20 %	60 %	385856180
12	NC_017518	TCCCG	2	10	12890	12899	0 %	20 %	20 %	60 %	385856180
13	NC_017518	TGTCG	2	10	14346	14355	0 %	40 %	40 %	20 %	385856181
14	NC_017518	ATTTC	2	10	23605	23614	20 %	60 %	0 %	20 %	385856191
15	NC_017518	AGGCG	2	10	26481	26490	20 %	0 %	60 %	20 %	385856194
16	NC_017518	AGGGC	2	10	28603	28612	20 %	0 %	60 %	20 %	385856195
17	NC_017518	AAACC	2	10	29306	29315	60 %	0 %	0 %	40 %	385856196
18	NC_017518	TCCGC	2	10	32606	32615	0 %	20 %	20 %	60 %	385856198
19	NC_017518	GGGCT	2	10	40303	40312	0 %	20 %	60 %	20 %	385856203
20	NC_017518	TGCGG	2	10	42842	42851	0 %	20 %	60 %	20 %	385856206
21	NC_017518	GGCGG	2	10	43801	43810	0 %	0 %	80 %	20 %	385856206
22	NC_017518	GCGGT	2	10	44277	44286	0 %	20 %	60 %	20 %	385856207
23	NC_017518	GCGCG	2	10	44674	44683	0 %	0 %	60 %	40 %	385856207
24	NC_017518	ACGGC	2	10	45219	45228	20 %	0 %	40 %	40 %	385856207
25	NC_017518	GTTGG	2	10	50194	50203	0 %	40 %	60 %	0 %	385856208
26	NC_017518	AAACC	2	10	52584	52593	60 %	0 %	0 %	40 %	385856209
27	NC_017518	GTGCG	2	10	54935	54944	0 %	20 %	60 %	20 %	385856211
28	NC_017518	ACGGC	2	10	63774	63783	20 %	0 %	40 %	40 %	385856215
29	NC_017518	TGCCG	2	10	66256	66265	0 %	20 %	40 %	40 %	385856217
30	NC_017518	TGGCT	2	10	66585	66594	0 %	40 %	40 %	20 %	385856217
31	NC_017518	TGCCC	2	10	67192	67201	0 %	20 %	20 %	60 %	385856217
32	NC_017518	TCTTT	2	10	69085	69094	0 %	80 %	0 %	20 %	385856219
33	NC_017518	GCGTA	2	10	69311	69320	20 %	20 %	40 %	20 %	385856220
34	NC_017518	AATGG	2	10	70491	70500	40 %	20 %	40 %	0 %	385856221
35	NC_017518	GGGTA	2	10	70675	70684	20 %	20 %	60 %	0 %	385856221
36	NC_017518	TCGGC	2	10	71068	71077	0 %	20 %	40 %	40 %	385856221
37	NC_017518	TGCTA	2	10	72477	72486	20 %	40 %	20 %	20 %	385856222
38	NC_017518	GTTTG	2	10	73342	73351	0 %	60 %	40 %	0 %	385856223
39	NC_017518	AGGCC	2	10	74912	74921	20 %	0 %	40 %	40 %	385856224
40	NC_017518	AAGCA	2	10	76487	76496	60 %	0 %	20 %	20 %	385856225
41	NC_017518	TTTAA	2	10	76737	76746	40 %	60 %	0 %	0 %	385856225
42	NC_017518	GATTT	2	10	78650	78659	20 %	60 %	20 %	0 %	385856227
43	NC_017518	TGTAT	2	10	80052	80061	20 %	60 %	20 %	0 %	385856228
44	NC_017518	AAAAG	2	10	80236	80245	80 %	0 %	20 %	0 %	385856229
45	NC_017518	TTTGA	2	10	80859	80868	20 %	60 %	20 %	0 %	385856229
46	NC_017518	TGGCT	2	10	81792	81801	0 %	40 %	40 %	20 %	385856230
47	NC_017518	GCAAG	2	10	83074	83083	40 %	0 %	40 %	20 %	385856232
48	NC_017518	GCGCG	2	10	84133	84142	0 %	0 %	60 %	40 %	385856232
49	NC_017518	CAACG	2	10	85055	85064	40 %	0 %	20 %	40 %	385856232
50	NC_017518	GCACG	2	10	87625	87634	20 %	0 %	40 %	40 %	385856234
51	NC_017518	GTTGG	2	10	88135	88144	0 %	40 %	60 %	0 %	385856234
52	NC_017518	TTGAT	2	10	90472	90481	20 %	60 %	20 %	0 %	385856237
53	NC_017518	GTTTG	2	10	90869	90878	0 %	60 %	40 %	0 %	385856237
54	NC_017518	CCCGT	2	10	91409	91418	0 %	20 %	20 %	60 %	385856237
55	NC_017518	CCGTA	2	10	91646	91655	20 %	20 %	20 %	40 %	385856237
56	NC_017518	ACATC	2	10	92547	92556	40 %	20 %	0 %	40 %	385856238
57	NC_017518	CGCAA	2	10	94256	94265	40 %	0 %	20 %	40 %	385856239
58	NC_017518	CAAGC	2	10	94621	94630	40 %	0 %	20 %	40 %	385856239
59	NC_017518	AAAAC	2	10	98862	98871	80 %	0 %	0 %	20 %	385856243
60	NC_017518	TTTGA	2	10	101188	101197	20 %	60 %	20 %	0 %	385856244
61	NC_017518	AAACC	2	10	102912	102921	60 %	0 %	0 %	40 %	385856245
62	NC_017518	CAGGT	2	10	107107	107116	20 %	20 %	40 %	20 %	385856247
63	NC_017518	TTTGA	2	10	107817	107826	20 %	60 %	20 %	0 %	385856247
64	NC_017518	AATGA	2	10	108524	108533	60 %	20 %	20 %	0 %	385856248
65	NC_017518	GAACA	2	10	110409	110418	60 %	0 %	20 %	20 %	385856248
66	NC_017518	CGTGC	2	10	111715	111724	0 %	20 %	40 %	40 %	385856251
67	NC_017518	AATTG	2	10	113657	113666	40 %	40 %	20 %	0 %	385856252
68	NC_017518	AAAAT	2	10	113918	113927	80 %	20 %	0 %	0 %	385856252
69	NC_017518	CGGCG	2	10	115758	115767	0 %	0 %	60 %	40 %	385856255
70	NC_017518	CGCCT	2	10	117910	117919	0 %	20 %	20 %	60 %	385856257
71	NC_017518	GGTAT	2	10	118150	118159	20 %	40 %	40 %	0 %	385856257
72	NC_017518	GGCGC	2	10	118401	118410	0 %	0 %	60 %	40 %	385856257
73	NC_017518	CCGCC	2	10	119734	119743	0 %	0 %	20 %	80 %	385856259
74	NC_017518	TGGCG	2	10	119946	119955	0 %	20 %	60 %	20 %	385856259
75	NC_017518	CAAAG	2	10	120156	120165	60 %	0 %	20 %	20 %	385856259
76	NC_017518	GCGCC	2	10	121363	121372	0 %	0 %	40 %	60 %	385856260
77	NC_017518	GGCGC	2	10	121592	121601	0 %	0 %	60 %	40 %	385856260
78	NC_017518	TGAGT	2	10	123209	123218	20 %	40 %	40 %	0 %	385856262
79	NC_017518	GGCAA	2	10	123786	123795	40 %	0 %	40 %	20 %	385856262
80	NC_017518	GTTTT	2	10	126226	126235	0 %	80 %	20 %	0 %	385856264
81	NC_017518	CGTGT	2	10	127990	127999	0 %	40 %	40 %	20 %	385856266
82	NC_017518	GAAAA	2	10	128404	128413	80 %	0 %	20 %	0 %	385856266
83	NC_017518	AGGGC	2	10	128541	128550	20 %	0 %	60 %	20 %	385856266
84	NC_017518	TGATT	2	10	131448	131457	20 %	60 %	20 %	0 %	385856268
85	NC_017518	AATTC	2	10	131523	131532	40 %	40 %	0 %	20 %	385856268
86	NC_017518	GTACC	2	10	136877	136886	20 %	20 %	20 %	40 %	385856275
87	NC_017518	TTGGG	2	10	141907	141916	0 %	40 %	60 %	0 %	385856278
88	NC_017518	CATAC	2	10	144383	144392	40 %	20 %	0 %	40 %	385856279
89	NC_017518	GTGAT	2	10	145262	145271	20 %	40 %	40 %	0 %	385856279
90	NC_017518	CCTGC	2	10	150613	150622	0 %	20 %	20 %	60 %	385856285
91	NC_017518	GAAAA	2	10	154877	154886	80 %	0 %	20 %	0 %	385856292
92	NC_017518	TGATT	2	10	155964	155973	20 %	60 %	20 %	0 %	385856294
93	NC_017518	AATGC	2	10	156658	156667	40 %	20 %	20 %	20 %	385856295
94	NC_017518	GTAAA	2	10	157609	157618	60 %	20 %	20 %	0 %	385856298
95	NC_017518	AATTT	2	10	157833	157842	40 %	60 %	0 %	0 %	385856299
96	NC_017518	TCAAA	2	10	158682	158691	60 %	20 %	0 %	20 %	385856301
97	NC_017518	TTTGG	2	10	159493	159502	0 %	60 %	40 %	0 %	385856303
98	NC_017518	GAAAT	2	10	163339	163348	60 %	20 %	20 %	0 %	385856310
99	NC_017518	AAAAT	2	10	163601	163610	80 %	20 %	0 %	0 %	385856312
100	NC_017518	GGGTT	2	10	165088	165097	0 %	40 %	60 %	0 %	385856315
101	NC_017518	GTCAT	2	10	165610	165619	20 %	40 %	20 %	20 %	385856316
102	NC_017518	GCAAA	2	10	167983	167992	60 %	0 %	20 %	20 %	385856319
103	NC_017518	CGGTT	2	10	168013	168022	0 %	40 %	40 %	20 %	385856319
104	NC_017518	TGGTT	2	10	172501	172510	0 %	60 %	40 %	0 %	385856322
105	NC_017518	CGGCG	2	10	173054	173063	0 %	0 %	60 %	40 %	385856323
106	NC_017518	CCAAA	2	10	173443	173452	60 %	0 %	0 %	40 %	385856323
107	NC_017518	TGGTT	2	10	174346	174355	0 %	60 %	40 %	0 %	385856324
108	NC_017518	GCCGC	2	10	175446	175455	0 %	0 %	40 %	60 %	385856325
109	NC_017518	CGGCG	2	10	177063	177072	0 %	0 %	60 %	40 %	385856326
110	NC_017518	CTCGG	2	10	182264	182273	0 %	20 %	40 %	40 %	385856330
111	NC_017518	GCCGT	2	10	184766	184775	0 %	20 %	40 %	40 %	385856332
112	NC_017518	CAGAC	2	10	185421	185430	40 %	0 %	20 %	40 %	385856333
113	NC_017518	ACCAA	2	10	185608	185617	60 %	0 %	0 %	40 %	385856333
114	NC_017518	TGCCG	2	10	188183	188192	0 %	20 %	40 %	40 %	385856336
115	NC_017518	GTTGC	2	10	188498	188507	0 %	40 %	40 %	20 %	385856336
116	NC_017518	CCTGC	2	10	196535	196544	0 %	20 %	20 %	60 %	385856343
117	NC_017518	CGGGG	2	10	199711	199720	0 %	0 %	80 %	20 %	385856344
118	NC_017518	TGCGT	2	10	201293	201302	0 %	40 %	40 %	20 %	385856344
119	NC_017518	GCGCC	2	10	202197	202206	0 %	0 %	40 %	60 %	385856345
120	NC_017518	AAATT	2	10	204451	204460	60 %	40 %	0 %	0 %	385856347
121	NC_017518	GCCGT	2	10	207273	207282	0 %	20 %	40 %	40 %	385856351
122	NC_017518	GCCGT	2	10	207402	207411	0 %	20 %	40 %	40 %	385856351
123	NC_017518	TGTCG	2	10	207976	207985	0 %	40 %	40 %	20 %	385856352
124	NC_017518	GGCAG	2	10	209511	209520	20 %	0 %	60 %	20 %	385856353
125	NC_017518	GTCAA	2	10	211087	211096	40 %	20 %	20 %	20 %	385856354
126	NC_017518	CCTTT	2	10	211691	211700	0 %	60 %	0 %	40 %	385856354
127	NC_017518	AAATG	2	10	211907	211916	60 %	20 %	20 %	0 %	385856354
128	NC_017518	GGCGC	2	10	214657	214666	0 %	0 %	60 %	40 %	385856357
129	NC_017518	GCATG	2	10	215172	215181	20 %	20 %	40 %	20 %	385856357
130	NC_017518	TTTGG	2	10	215983	215992	0 %	60 %	40 %	0 %	385856357
131	NC_017518	ATCAA	2	10	218278	218287	60 %	20 %	0 %	20 %	385856359
132	NC_017518	CGCCC	2	10	219566	219575	0 %	0 %	20 %	80 %	385856359
133	NC_017518	GTCAA	2	10	223478	223487	40 %	20 %	20 %	20 %	385856361
134	NC_017518	CGTGC	2	10	228213	228222	0 %	20 %	40 %	40 %	385856363
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