MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 39105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017518	GCC	2	6	202752	202757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856345
3502	NC_017518	A	7	7	202881	202887	100 %	0 %	0 %	0 %	385856346
3503	NC_017518	CGG	2	6	202994	202999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
3504	NC_017518	TGA	2	6	203005	203010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856346
3505	NC_017518	GGC	2	6	203080	203085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
3506	NC_017518	ACGG	2	8	203204	203211	25 %	0 %	50 %	25 %	385856346
3507	NC_017518	GGC	2	6	203254	203259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
3508	NC_017518	GCGG	2	8	203340	203347	0 %	0 %	75 %	25 %	385856346
3509	NC_017518	GAC	2	6	203397	203402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856346
3510	NC_017518	CTG	2	6	203457	203462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856346
3511	NC_017518	T	6	6	203505	203510	0 %	100 %	0 %	0 %	385856346
3512	NC_017518	ATT	2	6	203519	203524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385856346
3513	NC_017518	GTT	2	6	203525	203530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856346
3514	NC_017518	CTG	2	6	203556	203561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856346
3515	NC_017518	CGG	2	6	203572	203577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
3516	NC_017518	CGA	2	6	203578	203583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856346
3517	NC_017518	GCG	2	6	203585	203590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
3518	NC_017518	GACA	2	8	203646	203653	50 %	0 %	25 %	25 %	385856346
3519	NC_017518	GCG	2	6	203673	203678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
3520	NC_017518	TCA	2	6	203743	203748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856346
3521	NC_017518	CGC	2	6	203761	203766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856346
3522	NC_017518	CTTATG	2	12	203770	203781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385856346
3523	NC_017518	AGG	2	6	203836	203841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385856346
3524	NC_017518	GCT	2	6	203852	203857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856346
3525	NC_017518	ATG	2	6	203863	203868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856346
3526	NC_017518	GGC	3	9	203885	203893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
3527	NC_017518	CTG	2	6	203961	203966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856346
3528	NC_017518	A	6	6	203970	203975	100 %	0 %	0 %	0 %	385856346
3529	NC_017518	CGG	2	6	203980	203985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
3530	NC_017518	CG	5	10	203993	204002	0 %	0 %	50 %	50 %	385856346
3531	NC_017518	ATA	2	6	204277	204282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856347
3532	NC_017518	A	7	7	204302	204308	100 %	0 %	0 %	0 %	385856347
3533	NC_017518	TA	4	8	204324	204331	50 %	50 %	0 %	0 %	385856347
3534	NC_017518	ATC	2	6	204378	204383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856347
3535	NC_017518	AAATT	2	10	204451	204460	60 %	40 %	0 %	0 %	385856347
3536	NC_017518	ATA	2	6	204526	204531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856347
3537	NC_017518	GAT	2	6	204558	204563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856347
3538	NC_017518	GGTA	2	8	204603	204610	25 %	25 %	50 %	0 %	385856347
3539	NC_017518	GATA	2	8	204632	204639	50 %	25 %	25 %	0 %	385856347
3540	NC_017518	AGG	2	6	204676	204681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385856347
3541	NC_017518	GTT	2	6	204812	204817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856348
3542	NC_017518	GCG	2	6	204873	204878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856348
3543	NC_017518	CGG	2	6	204889	204894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856348
3544	NC_017518	GCT	2	6	204908	204913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856348
3545	NC_017518	CGA	2	6	204973	204978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856348
3546	NC_017518	CG	3	6	205021	205026	0 %	0 %	50 %	50 %	385856348
3547	NC_017518	GC	3	6	205081	205086	0 %	0 %	50 %	50 %	385856348
3548	NC_017518	GGT	2	6	205144	205149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856348
3549	NC_017518	GGC	2	6	205244	205249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856348
3550	NC_017518	TGTT	2	8	205262	205269	0 %	75 %	25 %	0 %	385856348
3551	NC_017518	CGG	2	6	205270	205275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856348
3552	NC_017518	TCG	2	6	205302	205307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856348
3553	NC_017518	TGT	2	6	205313	205318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856348
3554	NC_017518	GAT	3	9	205322	205330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856348
3555	NC_017518	CGT	2	6	205429	205434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856348
3556	NC_017518	GC	3	6	205513	205518	0 %	0 %	50 %	50 %	385856348
3557	NC_017518	GTT	2	6	205541	205546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856348
3558	NC_017518	TG	3	6	205615	205620	0 %	50 %	50 %	0 %	385856348
3559	NC_017518	TGC	2	6	205732	205737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856349
3560	NC_017518	TGA	2	6	205744	205749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856349
3561	NC_017518	CGGT	2	8	205785	205792	0 %	25 %	50 %	25 %	385856349
3562	NC_017518	GCA	2	6	205807	205812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856349
3563	NC_017518	GAGCAG	2	12	205823	205834	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385856349
3564	NC_017518	GGC	2	6	205865	205870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856349
3565	NC_017518	TTG	2	6	206361	206366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856350
3566	NC_017518	CGA	2	6	206392	206397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856350
3567	NC_017518	CCA	2	6	206444	206449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856350
3568	NC_017518	ACC	2	6	206491	206496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856350
3569	NC_017518	TG	3	6	206511	206516	0 %	50 %	50 %	0 %	385856350
3570	NC_017518	GCG	2	6	206521	206526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856350
3571	NC_017518	TCG	2	6	206599	206604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856350
3572	NC_017518	GCT	2	6	206744	206749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856351
3573	NC_017518	GCT	2	6	206843	206848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856351
3574	NC_017518	GGTT	2	8	206892	206899	0 %	50 %	50 %	0 %	385856351
3575	NC_017518	T	7	7	206898	206904	0 %	100 %	0 %	0 %	385856351
3576	NC_017518	CGCT	2	8	206958	206965	0 %	25 %	25 %	50 %	385856351
3577	NC_017518	GGCG	2	8	207176	207183	0 %	0 %	75 %	25 %	385856351
3578	NC_017518	GCCGT	2	10	207273	207282	0 %	20 %	40 %	40 %	385856351
3579	NC_017518	CAG	2	6	207318	207323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856351
3580	NC_017518	GCT	2	6	207356	207361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856351
3581	NC_017518	GCCGT	2	10	207402	207411	0 %	20 %	40 %	40 %	385856351
3582	NC_017518	GCG	2	6	207428	207433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856351
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3584	NC_017518	GGT	2	6	207865	207870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856352
3585	NC_017518	GC	3	6	207927	207932	0 %	0 %	50 %	50 %	385856352
3586	NC_017518	GGC	2	6	207943	207948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856352
3587	NC_017518	TCA	2	6	207951	207956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856352
3588	NC_017518	TTC	2	6	207967	207972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856352
3589	NC_017518	TGTCG	2	10	207976	207985	0 %	40 %	40 %	20 %	385856352
3590	NC_017518	CG	4	8	207984	207991	0 %	0 %	50 %	50 %	385856352
3591	NC_017518	CGC	2	6	208131	208136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856352
3592	NC_017518	GCG	2	6	208144	208149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856352
3593	NC_017518	TGG	2	6	208203	208208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856352
3594	NC_017518	TGG	2	6	208272	208277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856352
3595	NC_017518	ACG	2	6	208295	208300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856352
3596	NC_017518	CGG	2	6	208308	208313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856352
3597	NC_017518	ACG	2	6	208340	208345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856352
3598	NC_017518	TCG	2	6	208358	208363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856352
3599	NC_017518	T	6	6	208387	208392	0 %	100 %	0 %	0 %	385856352
3600	NC_017518	CGC	2	6	208395	208400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856352
3601	NC_017518	GAA	2	6	208510	208515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856352
3602	NC_017518	GCC	2	6	208546	208551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856352
3603	NC_017518	CGA	2	6	208644	208649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856352
3604	NC_017518	GC	3	6	208685	208690	0 %	0 %	50 %	50 %	385856352
3605	NC_017518	GGC	2	6	208698	208703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856352
3606	NC_017518	AGG	2	6	208946	208951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385856353
3607	NC_017518	GCG	2	6	209005	209010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856353
3608	NC_017518	TCGCTG	2	12	209017	209028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856353
3609	NC_017518	GCG	2	6	209052	209057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856353
3610	NC_017518	CGG	3	9	209117	209125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856353
3611	NC_017518	TTG	2	6	209136	209141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856353
3612	NC_017518	T	6	6	209196	209201	0 %	100 %	0 %	0 %	385856353
3613	NC_017518	GT	3	6	209204	209209	0 %	50 %	50 %	0 %	385856353
3614	NC_017518	CG	3	6	209224	209229	0 %	0 %	50 %	50 %	385856353
3615	NC_017518	CGG	2	6	209237	209242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856353
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3617	NC_017518	CGTT	2	8	209293	209300	0 %	50 %	25 %	25 %	385856353
3618	NC_017518	GC	3	6	209313	209318	0 %	0 %	50 %	50 %	385856353
3619	NC_017518	CG	3	6	209320	209325	0 %	0 %	50 %	50 %	385856353
3620	NC_017518	CGG	3	9	209330	209338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856353
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3622	NC_017518	GCG	2	6	209367	209372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856353
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3989	NC_017518	GAA	2	6	232171	232176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856369
3990	NC_017518	GCC	2	6	232200	232205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856369
3991	NC_017518	GAA	2	6	232240	232245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856369
3992	NC_017518	AAC	2	6	232285	232290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856369
3993	NC_017518	A	6	6	232557	232562	100 %	0 %	0 %	0 %	385856370
3994	NC_017518	GAT	2	6	232591	232596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856370
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