MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 39105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017518	GGT	2	6	177493	177498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856326
3002	NC_017518	GTTGCC	2	12	177514	177525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856326
3003	NC_017518	TCG	2	6	177545	177550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856326
3004	NC_017518	T	6	6	177556	177561	0 %	100 %	0 %	0 %	385856326
3005	NC_017518	GTT	2	6	177604	177609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856326
3006	NC_017518	TGA	2	6	177633	177638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856326
3007	NC_017518	CGG	2	6	177747	177752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856326
3008	NC_017518	CA	3	6	177875	177880	50 %	0 %	0 %	50 %	385856327
3009	NC_017518	TGA	2	6	177881	177886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856327
3010	NC_017518	CAG	2	6	177957	177962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856327
3011	NC_017518	GAA	4	12	178032	178043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856327
3012	NC_017518	GAT	2	6	178110	178115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856327
3013	NC_017518	TGTC	2	8	178307	178314	0 %	50 %	25 %	25 %	385856327
3014	NC_017518	GCT	3	9	178370	178378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856328
3015	NC_017518	GC	3	6	178434	178439	0 %	0 %	50 %	50 %	385856328
3016	NC_017518	GACG	2	8	178509	178516	25 %	0 %	50 %	25 %	385856328
3017	NC_017518	GCC	3	9	178518	178526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856328
3018	NC_017518	TGG	2	6	178529	178534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856328
3019	NC_017518	CGC	3	9	178571	178579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856328
3020	NC_017518	GAT	2	6	178581	178586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856328
3021	NC_017518	GGC	2	6	178629	178634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856328
3022	NC_017518	GGT	2	6	178710	178715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856328
3023	NC_017518	CGC	2	6	178727	178732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856328
3024	NC_017518	CGT	2	6	178763	178768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856328
3025	NC_017518	CGC	2	6	178856	178861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856328
3026	NC_017518	TAA	2	6	178897	178902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856328
3027	NC_017518	ACG	2	6	178903	178908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856328
3028	NC_017518	GAC	2	6	178923	178928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856328
3029	NC_017518	TCG	2	6	178930	178935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856328
3030	NC_017518	GAC	2	6	178956	178961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856328
3031	NC_017518	CGA	2	6	179063	179068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856328
3032	NC_017518	CGG	2	6	179069	179074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856328
3033	NC_017518	GGAT	2	8	179077	179084	25 %	25 %	50 %	0 %	385856328
3034	NC_017518	GCC	2	6	179085	179090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856328
3035	NC_017518	GC	3	6	179091	179096	0 %	0 %	50 %	50 %	385856328
3036	NC_017518	GAC	2	6	179100	179105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856328
3037	NC_017518	GGCG	2	8	179117	179124	0 %	0 %	75 %	25 %	385856328
3038	NC_017518	GTC	2	6	179148	179153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856328
3039	NC_017518	CCGCGC	2	12	179210	179221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856328
3040	NC_017518	CGG	2	6	179303	179308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856328
3041	NC_017518	CGC	2	6	179324	179329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856328
3042	NC_017518	CGC	2	6	179336	179341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856328
3043	NC_017518	CG	3	6	179347	179352	0 %	0 %	50 %	50 %	385856328
3044	NC_017518	CGT	2	6	179458	179463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856329
3045	NC_017518	GGAG	2	8	179554	179561	25 %	0 %	75 %	0 %	385856329
3046	NC_017518	GCG	2	6	179576	179581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856329
3047	NC_017518	TCT	2	6	179592	179597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856329
3048	NC_017518	T	6	6	179612	179617	0 %	100 %	0 %	0 %	385856329
3049	NC_017518	TTC	2	6	179648	179653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856329
3050	NC_017518	T	6	6	179664	179669	0 %	100 %	0 %	0 %	385856329
3051	NC_017518	T	6	6	179773	179778	0 %	100 %	0 %	0 %	385856329
3052	NC_017518	GC	3	6	179786	179791	0 %	0 %	50 %	50 %	385856329
3053	NC_017518	T	6	6	179836	179841	0 %	100 %	0 %	0 %	385856329
3054	NC_017518	GC	3	6	179857	179862	0 %	0 %	50 %	50 %	385856329
3055	NC_017518	GCA	2	6	179870	179875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856329
3056	NC_017518	CG	3	6	179900	179905	0 %	0 %	50 %	50 %	385856329
3057	NC_017518	CGT	2	6	179992	179997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856330
3058	NC_017518	TTGGAA	2	12	180004	180015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856330
3059	NC_017518	T	6	6	180037	180042	0 %	100 %	0 %	0 %	385856330
3060	NC_017518	CGC	2	6	180102	180107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856330
3061	NC_017518	CGG	2	6	180108	180113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856330
3062	NC_017518	GCC	2	6	180181	180186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856330
3063	NC_017518	CTG	2	6	180197	180202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856330
3064	NC_017518	GTC	2	6	180205	180210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856330
3065	NC_017518	CTGC	2	8	180233	180240	0 %	25 %	25 %	50 %	385856330
3066	NC_017518	GC	3	6	180268	180273	0 %	0 %	50 %	50 %	385856330
3067	NC_017518	AGC	2	6	180299	180304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856330
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3069	NC_017518	T	6	6	180322	180327	0 %	100 %	0 %	0 %	385856330
3070	NC_017518	GCC	2	6	180331	180336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856330
3071	NC_017518	T	6	6	180345	180350	0 %	100 %	0 %	0 %	385856330
3072	NC_017518	GCC	3	9	180415	180423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856330
3073	NC_017518	AAG	2	6	180437	180442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856330
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3078	NC_017518	TGC	2	6	180567	180572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856330
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3080	NC_017518	TTG	2	6	180641	180646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856330
3081	NC_017518	CAGC	2	8	180673	180680	25 %	0 %	25 %	50 %	385856330
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3087	NC_017518	GGC	2	6	181009	181014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856330
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3089	NC_017518	TCG	2	6	181292	181297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856330
3090	NC_017518	TGT	2	6	181305	181310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856330
3091	NC_017518	CGG	2	6	181470	181475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856330
3092	NC_017518	CTG	2	6	181480	181485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856330
3093	NC_017518	CAG	2	6	181516	181521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856330
3094	NC_017518	GTT	2	6	181684	181689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856330
3095	NC_017518	GCC	2	6	181774	181779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856330
3096	NC_017518	GATGTC	2	12	181882	181893	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385856330
3097	NC_017518	TTC	2	6	181963	181968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856330
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3099	NC_017518	GCA	2	6	182067	182072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856330
3100	NC_017518	GAGC	2	8	182092	182099	25 %	0 %	50 %	25 %	385856330
3101	NC_017518	TGG	2	6	182103	182108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856330
3102	NC_017518	CAG	2	6	182125	182130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856330
3103	NC_017518	CGT	2	6	182160	182165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856330
3104	NC_017518	TGA	2	6	182193	182198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856330
3105	NC_017518	GT	4	8	182209	182216	0 %	50 %	50 %	0 %	385856330
3106	NC_017518	CTCGG	2	10	182264	182273	0 %	20 %	40 %	40 %	385856330
3107	NC_017518	GTTTCA	2	12	182367	182378	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385856330
3108	NC_017518	AGC	2	6	182443	182448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856331
3109	NC_017518	CGT	2	6	182456	182461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856331
3110	NC_017518	GAA	2	6	182463	182468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856331
3111	NC_017518	CAT	2	6	182478	182483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856331
3112	NC_017518	CAT	2	6	182487	182492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856331
3113	NC_017518	GCC	2	6	182583	182588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856331
3114	NC_017518	CGG	2	6	182678	182683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856331
3115	NC_017518	T	6	6	182795	182800	0 %	100 %	0 %	0 %	385856331
3116	NC_017518	ACA	2	6	182824	182829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856331
3117	NC_017518	GACG	2	8	182830	182837	25 %	0 %	50 %	25 %	385856331
3118	NC_017518	GCG	2	6	182844	182849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856331
3119	NC_017518	CGGA	2	8	182880	182887	25 %	0 %	50 %	25 %	385856331
3120	NC_017518	CGG	2	6	182945	182950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856331
3121	NC_017518	T	7	7	182987	182993	0 %	100 %	0 %	0 %	385856331
3122	NC_017518	CGG	2	6	183053	183058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856331
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3129	NC_017518	CGG	2	6	183482	183487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856331
3130	NC_017518	CGA	2	6	183488	183493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856331
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3225	NC_017518	CG	3	6	187903	187908	0 %	0 %	50 %	50 %	385856336
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3229	NC_017518	GC	3	6	188058	188063	0 %	0 %	50 %	50 %	385856336
3230	NC_017518	CCG	2	6	188158	188163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856336
3231	NC_017518	TGCCG	2	10	188183	188192	0 %	20 %	40 %	40 %	385856336
3232	NC_017518	AGA	2	6	188203	188208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856336
3233	NC_017518	AAT	2	6	188224	188229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856336
3234	NC_017518	GAC	2	6	188339	188344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856336
3235	NC_017518	AGC	2	6	188385	188390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856336
3236	NC_017518	CCG	2	6	188421	188426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856336
3237	NC_017518	GGC	2	6	188446	188451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856336
3238	NC_017518	GGTAGC	2	12	188452	188463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385856336
3239	NC_017518	GTTGC	2	10	188498	188507	0 %	40 %	40 %	20 %	385856336
3240	NC_017518	ATG	2	6	189011	189016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856337
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3242	NC_017518	GCT	2	6	189045	189050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856337
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3362	NC_017518	A	6	6	195548	195553	100 %	0 %	0 %	0 %	385856342
3363	NC_017518	ATC	2	6	195574	195579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856342
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3482	NC_017518	CGA	2	6	201264	201269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856344
3483	NC_017518	TGCGT	2	10	201293	201302	0 %	40 %	40 %	20 %	385856344
3484	NC_017518	GCC	2	6	202072	202077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856345
3485	NC_017518	GCGT	2	8	202086	202093	0 %	25 %	50 %	25 %	385856345
3486	NC_017518	GTT	2	6	202099	202104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856345
3487	NC_017518	CGG	2	6	202158	202163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856345
3488	NC_017518	GCG	2	6	202166	202171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856345
3489	NC_017518	GCGCC	2	10	202197	202206	0 %	0 %	40 %	60 %	385856345
3490	NC_017518	TTG	2	6	202264	202269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856345
3491	NC_017518	TGG	2	6	202271	202276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856345
3492	NC_017518	GAA	2	6	202278	202283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856345
3493	NC_017518	GC	3	6	202289	202294	0 %	0 %	50 %	50 %	385856345
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3495	NC_017518	A	7	7	202333	202339	100 %	0 %	0 %	0 %	385856345
3496	NC_017518	GAC	2	6	202372	202377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856345
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3498	NC_017518	GCAC	2	8	202565	202572	25 %	0 %	25 %	50 %	385856345
3499	NC_017518	CGA	2	6	202617	202622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856345
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