MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 39105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017518	AGG	2	6	321441	321446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385856443
5502	NC_017518	GGC	2	6	321491	321496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5503	NC_017518	CTT	2	6	321526	321531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856443
5504	NC_017518	CGG	2	6	321535	321540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5505	NC_017518	GGC	2	6	321544	321549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5506	NC_017518	GTC	2	6	321644	321649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5507	NC_017518	AGC	2	6	321678	321683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5508	NC_017518	GGC	2	6	321686	321691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5509	NC_017518	TCA	2	6	321751	321756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856443
5510	NC_017518	CGG	2	6	321787	321792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5511	NC_017518	GGT	2	6	321797	321802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856443
5512	NC_017518	TCTTTT	2	12	321831	321842	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385856443
5513	NC_017518	TGT	2	6	321867	321872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856443
5514	NC_017518	CGG	3	9	321970	321978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5515	NC_017518	TGT	2	6	321990	321995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856443
5516	NC_017518	GCC	2	6	322016	322021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856443
5517	NC_017518	CCG	2	6	322035	322040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856443
5518	NC_017518	TCG	2	6	322041	322046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5519	NC_017518	GCC	2	6	322089	322094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856443
5520	NC_017518	ATG	2	6	322170	322175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856443
5521	NC_017518	TGA	2	6	322213	322218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856443
5522	NC_017518	CA	3	6	322232	322237	50 %	0 %	0 %	50 %	385856443
5523	NC_017518	GCG	2	6	322241	322246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5524	NC_017518	CAG	2	6	322271	322276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5525	NC_017518	T	6	6	322282	322287	0 %	100 %	0 %	0 %	385856443
5526	NC_017518	TTC	2	6	322451	322456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856443
5527	NC_017518	TG	3	6	322462	322467	0 %	50 %	50 %	0 %	385856443
5528	NC_017518	CGG	2	6	322468	322473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5529	NC_017518	TCG	2	6	322488	322493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5530	NC_017518	CAG	2	6	322505	322510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5531	NC_017518	CGG	2	6	322528	322533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5532	NC_017518	AGGGGT	2	12	322569	322580	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385856443
5533	NC_017518	GCT	2	6	322606	322611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5534	NC_017518	GTC	2	6	322625	322630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5535	NC_017518	CT	3	6	322680	322685	0 %	50 %	0 %	50 %	385856443
5536	NC_017518	TGC	2	6	322719	322724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5537	NC_017518	GTC	2	6	322742	322747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5538	NC_017518	TGC	2	6	322799	322804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5539	NC_017518	CCCT	2	8	322854	322861	0 %	25 %	0 %	75 %	385856443
5540	NC_017518	GGGT	2	8	322873	322880	0 %	25 %	75 %	0 %	385856443
5541	NC_017518	GGTTG	2	10	322895	322904	0 %	40 %	60 %	0 %	385856443
5542	NC_017518	CAACC	2	10	322948	322957	40 %	0 %	0 %	60 %	385856443
5543	NC_017518	GAC	2	6	323034	323039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856443
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5545	NC_017518	TCGT	2	8	323129	323136	0 %	50 %	25 %	25 %	385856443
5546	NC_017518	CTTG	2	8	323176	323183	0 %	50 %	25 %	25 %	385856443
5547	NC_017518	TGT	2	6	323227	323232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856443
5548	NC_017518	A	6	6	323237	323242	100 %	0 %	0 %	0 %	385856443
5549	NC_017518	CCA	2	6	323269	323274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856443
5550	NC_017518	CG	3	6	323296	323301	0 %	0 %	50 %	50 %	385856443
5551	NC_017518	CTT	2	6	323302	323307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856443
5552	NC_017518	GCG	2	6	323336	323341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5553	NC_017518	CGC	2	6	323392	323397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856443
5554	NC_017518	GCG	2	6	323443	323448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5555	NC_017518	GGC	2	6	323477	323482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856443
5556	NC_017518	GCC	2	6	323523	323528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856443
5557	NC_017518	CG	3	6	323590	323595	0 %	0 %	50 %	50 %	385856443
5558	NC_017518	CTT	2	6	323686	323691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856443
5559	NC_017518	GTT	2	6	323716	323721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856443
5560	NC_017518	GTT	2	6	323731	323736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856443
5561	NC_017518	TTTG	2	8	323737	323744	0 %	75 %	25 %	0 %	385856443
5562	NC_017518	GAC	2	6	323781	323786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856443
5563	NC_017518	CTT	2	6	323824	323829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856443
5564	NC_017518	TGG	2	6	323830	323835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856443
5565	NC_017518	TGG	2	6	323868	323873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856443
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5570	NC_017518	CG	3	6	324076	324081	0 %	0 %	50 %	50 %	385856443
5571	NC_017518	CGC	2	6	324143	324148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856443
5572	NC_017518	GC	3	6	324158	324163	0 %	0 %	50 %	50 %	385856443
5573	NC_017518	GC	3	6	324185	324190	0 %	0 %	50 %	50 %	385856443
5574	NC_017518	CTGC	2	8	324446	324453	0 %	25 %	25 %	50 %	385856444
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5578	NC_017518	GCT	2	6	324747	324752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856444
5579	NC_017518	CAA	2	6	324847	324852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856444
5580	NC_017518	TGCC	2	8	324899	324906	0 %	25 %	25 %	50 %	385856444
5581	NC_017518	CTG	2	6	324907	324912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856444
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5583	NC_017518	CGC	3	9	325116	325124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856444
5584	NC_017518	CGCTTT	2	12	325302	325313	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385856444
5585	NC_017518	AAC	2	6	325403	325408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856444
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5587	NC_017518	CGAA	2	8	325512	325519	50 %	0 %	25 %	25 %	385856444
5588	NC_017518	ATC	2	6	325529	325534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856444
5589	NC_017518	AT	3	6	325554	325559	50 %	50 %	0 %	0 %	385856444
5590	NC_017518	GCAG	2	8	325634	325641	25 %	0 %	50 %	25 %	385856444
5591	NC_017518	TTG	2	6	325754	325759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856444
5592	NC_017518	AAT	2	6	325762	325767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856444
5593	NC_017518	CAG	2	6	325792	325797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856444
5594	NC_017518	GCA	2	6	325832	325837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856444
5595	NC_017518	AGAGAA	2	12	325944	325955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856444
5596	NC_017518	T	6	6	325966	325971	0 %	100 %	0 %	0 %	385856444
5597	NC_017518	TGT	2	6	326212	326217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856445
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5599	NC_017518	T	6	6	326325	326330	0 %	100 %	0 %	0 %	385856445
5600	NC_017518	TCA	2	6	326341	326346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856445
5601	NC_017518	T	7	7	326360	326366	0 %	100 %	0 %	0 %	385856445
5602	NC_017518	GCT	2	6	326369	326374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856445
5603	NC_017518	AAGTG	2	10	326500	326509	40 %	20 %	40 %	0 %	385856445
5604	NC_017518	ACG	2	6	326527	326532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856445
5605	NC_017518	TCA	2	6	326635	326640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856445
5606	NC_017518	TGA	2	6	326645	326650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856445
5607	NC_017518	TTC	2	6	326700	326705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856445
5608	NC_017518	T	6	6	326711	326716	0 %	100 %	0 %	0 %	385856445
5609	NC_017518	GGC	2	6	326771	326776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856445
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5611	NC_017518	GCT	2	6	326815	326820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856445
5612	NC_017518	GGT	2	6	326856	326861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856445
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5614	NC_017518	CGG	2	6	326895	326900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856445
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5619	NC_017518	T	6	6	327104	327109	0 %	100 %	0 %	0 %	385856445
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5621	NC_017518	GGC	2	6	327385	327390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856446
5622	NC_017518	CAT	2	6	327426	327431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856446
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5743	NC_017518	CGTGCG	2	12	332325	332336	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385856449
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5747	NC_017518	TCG	2	6	332505	332510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856450
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5986	NC_017518	CGC	2	6	344193	344198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856457
5987	NC_017518	CGC	2	6	344345	344350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856457
5988	NC_017518	CAT	2	6	344367	344372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856457
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5991	NC_017518	GGC	2	6	344511	344516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856457
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