MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 39105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017518	CCTG	2	8	284843	284850	0 %	25 %	25 %	50 %	385856420
5002	NC_017518	GA	3	6	284878	284883	50 %	0 %	50 %	0 %	385856420
5003	NC_017518	GCC	2	6	284890	284895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856420
5004	NC_017518	GCG	2	6	284906	284911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856420
5005	NC_017518	CATC	2	8	284915	284922	25 %	25 %	0 %	50 %	385856420
5006	NC_017518	TTG	2	6	284942	284947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856420
5007	NC_017518	GCAGGT	2	12	284970	284981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385856420
5008	NC_017518	CGT	3	9	284997	285005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856420
5009	NC_017518	GAC	2	6	285018	285023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856420
5010	NC_017518	AGC	2	6	285143	285148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856420
5011	NC_017518	CGG	2	6	285196	285201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856420
5012	NC_017518	CCG	2	6	285221	285226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856420
5013	NC_017518	CCG	2	6	285281	285286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856420
5014	NC_017518	CGC	2	6	285360	285365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856420
5015	NC_017518	CGG	2	6	285375	285380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856420
5016	NC_017518	CCG	2	6	285461	285466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856420
5017	NC_017518	TAT	2	6	285496	285501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385856420
5018	NC_017518	CGCGG	2	10	285556	285565	0 %	0 %	60 %	40 %	385856420
5019	NC_017518	GACCT	2	10	285616	285625	20 %	20 %	20 %	40 %	385856420
5020	NC_017518	A	7	7	285640	285646	100 %	0 %	0 %	0 %	385856420
5021	NC_017518	GCA	2	6	285678	285683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856420
5022	NC_017518	CTA	2	6	285747	285752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856420
5023	NC_017518	CAA	2	6	285768	285773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856420
5024	NC_017518	TCAACC	2	12	285791	285802	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385856420
5025	NC_017518	GGC	2	6	285823	285828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856420
5026	NC_017518	GCG	2	6	285832	285837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856420
5027	NC_017518	GGC	2	6	285838	285843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856420
5028	NC_017518	CCG	2	6	285938	285943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856420
5029	NC_017518	GCC	2	6	286013	286018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856420
5030	NC_017518	GCC	2	6	286028	286033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856420
5031	NC_017518	TCG	2	6	286034	286039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856420
5032	NC_017518	CGTC	2	8	286083	286090	0 %	25 %	25 %	50 %	385856420
5033	NC_017518	AAG	2	6	286142	286147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856420
5034	NC_017518	GCG	2	6	286190	286195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856420
5035	NC_017518	CGG	3	9	286224	286232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856420
5036	NC_017518	TCG	2	6	286312	286317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856420
5037	NC_017518	AGC	2	6	286321	286326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856420
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5039	NC_017518	GAT	2	6	286486	286491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856420
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5041	NC_017518	GCA	2	6	286562	286567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856420
5042	NC_017518	CAG	2	6	286590	286595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856420
5043	NC_017518	A	6	6	286706	286711	100 %	0 %	0 %	0 %	385856420
5044	NC_017518	CAGC	2	8	286752	286759	25 %	0 %	25 %	50 %	385856420
5045	NC_017518	CGT	2	6	286803	286808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856420
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5047	NC_017518	GCT	2	6	286883	286888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856420
5048	NC_017518	CAG	2	6	286977	286982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856420
5049	NC_017518	GGAT	2	8	287006	287013	25 %	25 %	50 %	0 %	385856420
5050	NC_017518	CT	3	6	287043	287048	0 %	50 %	0 %	50 %	385856420
5051	NC_017518	CCG	2	6	287051	287056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856420
5052	NC_017518	CAA	2	6	287061	287066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856420
5053	NC_017518	ATG	2	6	287178	287183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856421
5054	NC_017518	TGA	2	6	287197	287202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856421
5055	NC_017518	GCC	2	6	287205	287210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856421
5056	NC_017518	GCA	2	6	287220	287225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856421
5057	NC_017518	CGC	2	6	287237	287242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856421
5058	NC_017518	GCC	2	6	287331	287336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856421
5059	NC_017518	CCGCAC	2	12	287353	287364	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385856421
5060	NC_017518	CAG	2	6	287367	287372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856421
5061	NC_017518	GCC	2	6	287400	287405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856421
5062	NC_017518	TCA	2	6	287422	287427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856421
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5067	NC_017518	CGT	2	6	287603	287608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856421
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5069	NC_017518	CGC	2	6	287649	287654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856421
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5080	NC_017518	CG	4	8	290084	290091	0 %	0 %	50 %	50 %	385856422
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5088	NC_017518	TGC	2	6	290379	290384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856422
5089	NC_017518	ATC	3	9	290508	290516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856422
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5092	NC_017518	TCT	2	6	290574	290579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856422
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5094	NC_017518	CG	3	6	290635	290640	0 %	0 %	50 %	50 %	385856422
5095	NC_017518	TGG	2	6	290688	290693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856422
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5098	NC_017518	AAAT	2	8	290838	290845	75 %	25 %	0 %	0 %	385856422
5099	NC_017518	GCA	2	6	290905	290910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856422
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5102	NC_017518	T	7	7	290961	290967	0 %	100 %	0 %	0 %	385856422
5103	NC_017518	CGGCG	2	10	290999	291008	0 %	0 %	60 %	40 %	385856422
5104	NC_017518	GGT	2	6	291074	291079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856422
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5108	NC_017518	T	7	7	291232	291238	0 %	100 %	0 %	0 %	385856422
5109	NC_017518	CGG	2	6	291271	291276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856422
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5117	NC_017518	CGGCG	2	10	291503	291512	0 %	0 %	60 %	40 %	385856422
5118	NC_017518	GCC	2	6	291531	291536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856422
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5121	NC_017518	CGC	2	6	291604	291609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856422
5122	NC_017518	CCG	2	6	291640	291645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856422
5123	NC_017518	CGC	2	6	291671	291676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856422
5124	NC_017518	GTT	2	6	291704	291709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856422
5125	NC_017518	T	7	7	291765	291771	0 %	100 %	0 %	0 %	385856422
5126	NC_017518	GAT	2	6	291773	291778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856422
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5129	NC_017518	ATG	2	6	292169	292174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856423
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5132	NC_017518	CAGT	2	8	292220	292227	25 %	25 %	25 %	25 %	385856423
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5134	NC_017518	CGC	2	6	292247	292252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856423
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5141	NC_017518	TTTG	2	8	292692	292699	0 %	75 %	25 %	0 %	385856423
5142	NC_017518	T	6	6	292909	292914	0 %	100 %	0 %	0 %	385856424
5143	NC_017518	TGA	2	6	292927	292932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856424
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5155	NC_017518	TGC	2	6	293260	293265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856424
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5163	NC_017518	TTC	2	6	293717	293722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856424
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5223	NC_017518	TCAAAG	2	12	297497	297508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385856426
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5228	NC_017518	GTC	2	6	297700	297705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856426
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5230	NC_017518	GAG	2	6	297835	297840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385856426
5231	NC_017518	GC	3	6	297865	297870	0 %	0 %	50 %	50 %	385856426
5232	NC_017518	GC	3	6	297916	297921	0 %	0 %	50 %	50 %	385856426
5233	NC_017518	GGT	2	6	297943	297948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856426
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5235	NC_017518	TCG	2	6	298103	298108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856426
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5237	NC_017518	T	6	6	298231	298236	0 %	100 %	0 %	0 %	385856426
5238	NC_017518	GGT	2	6	298242	298247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856426
5239	NC_017518	GCAG	2	8	298283	298290	25 %	0 %	50 %	25 %	385856426
5240	NC_017518	CGC	3	9	298296	298304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856426
5241	NC_017518	AGA	2	6	298325	298330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856426
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5366	NC_017518	CAG	2	6	306311	306316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856433
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5488	NC_017518	ATTG	2	8	320796	320803	25 %	50 %	25 %	0 %	385856442
5489	NC_017518	CATC	2	8	320804	320811	25 %	25 %	0 %	50 %	385856442
5490	NC_017518	CAC	2	6	320817	320822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856442
5491	NC_017518	TGG	2	6	320876	320881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856442
5492	NC_017518	TTA	2	6	320998	321003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385856442
5493	NC_017518	A	6	6	321094	321099	100 %	0 %	0 %	0 %	385856443
5494	NC_017518	AAC	2	6	321117	321122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856443
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5499	NC_017518	CGGG	2	8	321309	321316	0 %	0 %	75 %	25 %	385856443
5500	NC_017518	TGC	2	6	321319	321324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856443

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