MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 1200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017516	AAAAT	2	10	823	832	80 %	20 %	0 %	0 %	385852233
2	NC_017516	CGCAA	2	10	1306	1315	40 %	0 %	20 %	40 %	385852234
3	NC_017516	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385852234
4	NC_017516	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385852234
5	NC_017516	AAGGC	2	10	6081	6090	40 %	0 %	40 %	20 %	385852240
6	NC_017516	GCTTT	2	10	6441	6450	0 %	60 %	20 %	20 %	385852241
7	NC_017516	TACCG	2	10	8623	8632	20 %	20 %	20 %	40 %	385852242
8	NC_017516	TCAAT	2	10	9690	9699	40 %	40 %	0 %	20 %	385852243
9	NC_017516	CGCGC	2	10	10703	10712	0 %	0 %	40 %	60 %	385852244
10	NC_017516	CCCGT	2	10	10724	10733	0 %	20 %	20 %	60 %	385852244
11	NC_017516	CGCGC	2	10	13247	13256	0 %	0 %	40 %	60 %	385852246
12	NC_017516	TGTCG	2	10	13329	13338	0 %	40 %	40 %	20 %	385852246
13	NC_017516	AGGGC	2	10	27652	27661	20 %	0 %	60 %	20 %	385852259
14	NC_017516	AAACC	2	10	28355	28364	60 %	0 %	0 %	40 %	385852260
15	NC_017516	TCCGC	2	10	31655	31664	0 %	20 %	20 %	60 %	385852262
16	NC_017516	CATTC	2	10	36238	36247	20 %	40 %	0 %	40 %	385852266
17	NC_017516	AGGTG	2	10	36684	36693	20 %	20 %	60 %	0 %	385852267
18	NC_017516	GGGCT	2	10	39348	39357	0 %	20 %	60 %	20 %	385852268
19	NC_017516	GGCGG	2	10	42846	42855	0 %	0 %	80 %	20 %	385852271
20	NC_017516	GCGGT	2	10	43322	43331	0 %	20 %	60 %	20 %	385852272
21	NC_017516	GCGCG	2	10	43719	43728	0 %	0 %	60 %	40 %	385852272
22	NC_017516	ACGGC	2	10	44264	44273	20 %	0 %	40 %	40 %	385852272
23	NC_017516	CGGCG	2	10	48379	48388	0 %	0 %	60 %	40 %	385852274
24	NC_017516	GAAAA	2	10	49258	49267	80 %	0 %	20 %	0 %	385852274
25	NC_017516	GAACG	2	10	49907	49916	40 %	0 %	40 %	20 %	385852274
26	NC_017516	TTTGA	2	10	50348	50357	20 %	60 %	20 %	0 %	385852274
27	NC_017516	GAAAA	2	10	51014	51023	80 %	0 %	20 %	0 %	385852274
28	NC_017516	GTTGG	2	10	53843	53852	0 %	40 %	60 %	0 %	385852275
29	NC_017516	AAACC	2	10	56233	56242	60 %	0 %	0 %	40 %	385852276
30	NC_017516	GTGCG	2	10	58584	58593	0 %	20 %	60 %	20 %	385852278
31	NC_017516	TGCCG	2	10	68940	68949	0 %	20 %	40 %	40 %	385852284
32	NC_017516	TGGCT	2	10	69269	69278	0 %	40 %	40 %	20 %	385852284
33	NC_017516	TGCCC	2	10	69876	69885	0 %	20 %	20 %	60 %	385852284
34	NC_017516	TCTTT	2	10	71769	71778	0 %	80 %	0 %	20 %	385852286
35	NC_017516	GCGTA	2	10	71995	72004	20 %	20 %	40 %	20 %	385852287
36	NC_017516	TGCTA	2	10	75161	75170	20 %	40 %	20 %	20 %	385852288
37	NC_017516	AGGCC	2	10	76372	76381	20 %	0 %	40 %	40 %	385852289
38	NC_017516	AAGCA	2	10	77947	77956	60 %	0 %	20 %	20 %	385852290
39	NC_017516	TTTAA	2	10	78197	78206	40 %	60 %	0 %	0 %	385852290
40	NC_017516	GATTT	2	10	80110	80119	20 %	60 %	20 %	0 %	385852292
41	NC_017516	TGTAT	2	10	81512	81521	20 %	60 %	20 %	0 %	385852293
42	NC_017516	AAAAG	2	10	81696	81705	80 %	0 %	20 %	0 %	385852294
43	NC_017516	TTTGA	2	10	82319	82328	20 %	60 %	20 %	0 %	385852294
44	NC_017516	TGGCT	2	10	83252	83261	0 %	40 %	40 %	20 %	385852295
45	NC_017516	GCAAG	2	10	84533	84542	40 %	0 %	40 %	20 %	385852297
46	NC_017516	GCGCG	2	10	85592	85601	0 %	0 %	60 %	40 %	385852297
47	NC_017516	CAACG	2	10	86514	86523	40 %	0 %	20 %	40 %	385852297
48	NC_017516	TACGC	2	10	89659	89668	20 %	20 %	20 %	40 %	385852298
49	NC_017516	CCCGT	2	10	92745	92754	0 %	20 %	20 %	60 %	385852301
50	NC_017516	CCGTA	2	10	92982	92991	20 %	20 %	20 %	40 %	385852301
51	NC_017516	ACATC	2	10	93883	93892	40 %	20 %	0 %	40 %	385852302
52	NC_017516	CGCAA	2	10	95592	95601	40 %	0 %	20 %	40 %	385852303
53	NC_017516	ACCGC	2	10	101887	101896	20 %	0 %	20 %	60 %	385852308
54	NC_017516	AAACC	2	10	102329	102338	60 %	0 %	0 %	40 %	385852308
55	NC_017516	CGTGC	2	10	110775	110784	0 %	20 %	40 %	40 %	385852312
56	NC_017516	AATTG	2	10	112729	112738	40 %	40 %	20 %	0 %	385852313
57	NC_017516	AAAAT	2	10	112990	112999	80 %	20 %	0 %	0 %	385852313
58	NC_017516	CGGCG	2	10	114833	114842	0 %	0 %	60 %	40 %	385852316
59	NC_017516	CAGGT	2	10	116299	116308	20 %	20 %	40 %	20 %	385852318
60	NC_017516	CGCCT	2	10	116985	116994	0 %	20 %	20 %	60 %	385852319
61	NC_017516	GGTAT	2	10	117225	117234	20 %	40 %	40 %	0 %	385852319
62	NC_017516	GGCGC	2	10	117476	117485	0 %	0 %	60 %	40 %	385852319
63	NC_017516	TGGCG	2	10	119021	119030	0 %	20 %	60 %	20 %	385852321
64	NC_017516	CAAAG	2	10	119231	119240	60 %	0 %	20 %	20 %	385852321
65	NC_017516	GCGCC	2	10	120438	120447	0 %	0 %	40 %	60 %	385852322
66	NC_017516	GGCGC	2	10	120667	120676	0 %	0 %	60 %	40 %	385852322
67	NC_017516	TGAGT	2	10	122281	122290	20 %	40 %	40 %	0 %	385852324
68	NC_017516	CGGCG	2	10	122785	122794	0 %	0 %	60 %	40 %	385852324
69	NC_017516	GGCAA	2	10	122858	122867	40 %	0 %	40 %	20 %	385852324
70	NC_017516	GTTTT	2	10	125298	125307	0 %	80 %	20 %	0 %	385852326
71	NC_017516	CGTGT	2	10	127068	127077	0 %	40 %	40 %	20 %	385852328
72	NC_017516	GAAAA	2	10	127482	127491	80 %	0 %	20 %	0 %	385852328
73	NC_017516	CAAAT	2	10	128517	128526	60 %	20 %	0 %	20 %	385852328
74	NC_017516	TAATA	2	10	130336	130345	60 %	40 %	0 %	0 %	385852330
75	NC_017516	GAAGG	2	10	133974	133983	40 %	0 %	60 %	0 %	385852335
76	NC_017516	TTGGG	2	10	140575	140584	0 %	40 %	60 %	0 %	385852341
77	NC_017516	CATAC	2	10	143051	143060	40 %	20 %	0 %	40 %	385852342
78	NC_017516	GTGAT	2	10	143930	143939	20 %	40 %	40 %	0 %	385852342
79	NC_017516	CCTGC	2	10	149281	149290	0 %	20 %	20 %	60 %	385852347
80	NC_017516	GAAAA	2	10	153529	153538	80 %	0 %	20 %	0 %	385852354
81	NC_017516	TGATT	2	10	154616	154625	20 %	60 %	20 %	0 %	385852356
82	NC_017516	AATGC	2	10	155310	155319	40 %	20 %	20 %	20 %	385852357
83	NC_017516	GTAAA	2	10	156261	156270	60 %	20 %	20 %	0 %	385852360
84	NC_017516	TCAAA	2	10	157333	157342	60 %	20 %	0 %	20 %	385852362
85	NC_017516	TTTGG	2	10	158144	158153	0 %	60 %	40 %	0 %	385852364
86	NC_017516	GAAAT	2	10	161990	161999	60 %	20 %	20 %	0 %	385852371
87	NC_017516	AAAAT	2	10	162252	162261	80 %	20 %	0 %	0 %	385852373
88	NC_017516	GGGTT	2	10	163739	163748	0 %	40 %	60 %	0 %	385852376
89	NC_017516	GTCAT	2	10	164261	164270	20 %	40 %	20 %	20 %	385852377
90	NC_017516	GCAAA	2	10	166633	166642	60 %	0 %	20 %	20 %	385852380
91	NC_017516	CGGTT	2	10	166663	166672	0 %	40 %	40 %	20 %	385852380
92	NC_017516	TGGTT	2	10	171150	171159	0 %	60 %	40 %	0 %	385852383
93	NC_017516	CGGCG	2	10	171703	171712	0 %	0 %	60 %	40 %	385852384
94	NC_017516	CCAAA	2	10	172092	172101	60 %	0 %	0 %	40 %	385852384
95	NC_017516	TGAAA	2	10	173004	173013	60 %	20 %	20 %	0 %	385852385
96	NC_017516	GCCGC	2	10	174095	174104	0 %	0 %	40 %	60 %	385852386
97	NC_017516	CGGCG	2	10	175559	175568	0 %	0 %	60 %	40 %	385852387
98	NC_017516	TCTGC	2	10	175646	175655	0 %	40 %	20 %	40 %	385852387
99	NC_017516	AACCC	2	10	179577	179586	40 %	0 %	0 %	60 %	385852391
100	NC_017516	CTCGG	2	10	180760	180769	0 %	20 %	40 %	40 %	385852391
101	NC_017516	GCCGT	2	10	183262	183271	0 %	20 %	40 %	40 %	385852393
102	NC_017516	ACCAA	2	10	184104	184113	60 %	0 %	0 %	40 %	385852394
103	NC_017516	TGCCG	2	10	186678	186687	0 %	20 %	40 %	40 %	385852397
104	NC_017516	GTTGC	2	10	186993	187002	0 %	40 %	40 %	20 %	385852397
105	NC_017516	CCTGC	2	10	195303	195312	0 %	20 %	20 %	60 %	385852403
106	NC_017516	CGGGG	2	10	198659	198668	0 %	0 %	80 %	20 %	385852404
107	NC_017516	GCGCC	2	10	199930	199939	0 %	0 %	40 %	60 %	385852404
108	NC_017516	TGCGT	2	10	200241	200250	0 %	40 %	40 %	20 %	385852404
109	NC_017516	GCGCC	2	10	201146	201155	0 %	0 %	40 %	60 %	385852405
110	NC_017516	AAATT	2	10	203399	203408	60 %	40 %	0 %	0 %	385852407
111	NC_017516	GCCGT	2	10	206348	206357	0 %	20 %	40 %	40 %	385852411
112	NC_017516	GCCGT	2	10	206477	206486	0 %	20 %	40 %	40 %	385852411
113	NC_017516	TGTCG	2	10	207044	207053	0 %	40 %	40 %	20 %	385852412
114	NC_017516	GGCAG	2	10	208577	208586	20 %	0 %	60 %	20 %	385852413
115	NC_017516	GTCAA	2	10	210153	210162	40 %	20 %	20 %	20 %	385852414
116	NC_017516	CCTTT	2	10	210757	210766	0 %	60 %	0 %	40 %	385852414
117	NC_017516	AAATG	2	10	210973	210982	60 %	20 %	20 %	0 %	385852414
118	NC_017516	CAGGG	2	10	214806	214815	20 %	0 %	60 %	20 %	385852416
119	NC_017516	TTTGG	2	10	215046	215055	0 %	60 %	40 %	0 %	385852416
120	NC_017516	CGCTT	2	10	217094	217103	0 %	40 %	20 %	40 %	385852417
121	NC_017516	ATCAA	2	10	217341	217350	60 %	20 %	0 %	20 %	385852418
122	NC_017516	GTCAA	2	10	221580	221589	40 %	20 %	20 %	20 %	385852420
123	NC_017516	ATAAA	2	10	224661	224670	80 %	20 %	0 %	0 %	385852422
124	NC_017516	CTGCC	2	10	224773	224782	0 %	20 %	20 %	60 %	385852422
125	NC_017516	CGTGC	2	10	226317	226326	0 %	20 %	40 %	40 %	385852423
126	NC_017516	TTGGG	2	10	229100	229109	0 %	40 %	60 %	0 %	385852426
127	NC_017516	GATTT	2	10	230491	230500	20 %	60 %	20 %	0 %	385852428
128	NC_017516	GGTGC	2	10	233861	233870	0 %	20 %	60 %	20 %	385852429
129	NC_017516	TCGTT	2	10	234781	234790	0 %	60 %	20 %	20 %	385852430
130	NC_017516	ACAAT	2	10	235545	235554	60 %	20 %	0 %	20 %	385852431
131	NC_017516	TGCCA	2	10	235772	235781	20 %	20 %	20 %	40 %	385852431
132	NC_017516	GCACG	2	10	237720	237729	20 %	0 %	40 %	40 %	385852433
133	NC_017516	GCGAA	2	10	238157	238166	40 %	0 %	40 %	20 %	385852434
134	NC_017516	CGGCA	2	10	238227	238236	20 %	0 %	40 %	40 %	385852434
135	NC_017516	CGCAT	2	10	239001	239010	20 %	20 %	20 %	40 %	385852435
136	NC_017516	CGCCA	2	10	240939	240948	20 %	0 %	20 %	60 %	385852435
137	NC_017516	ATTGA	2	10	241744	241753	40 %	40 %	20 %	0 %	385852436
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139	NC_017516	TTTGT	2	10	244689	244698	0 %	80 %	20 %	0 %	385852439
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142	NC_017516	CCTGC	2	10	249025	249034	0 %	20 %	20 %	60 %	385852444
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149	NC_017516	TTTTG	2	10	263092	263101	0 %	80 %	20 %	0 %	385852458
150	NC_017516	CGGTG	2	10	263269	263278	0 %	20 %	60 %	20 %	385852458
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152	NC_017516	GTTTG	2	10	265526	265535	0 %	60 %	40 %	0 %	385852461
153	NC_017516	AGGCG	2	10	265955	265964	20 %	0 %	60 %	20 %	385852462
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156	NC_017516	GCCGC	2	10	267223	267232	0 %	0 %	40 %	60 %	385852463
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166	NC_017516	GACCT	2	10	283733	283742	20 %	20 %	20 %	40 %	385852480
167	NC_017516	CGGCG	2	10	288941	288950	0 %	0 %	60 %	40 %	385852482
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174	NC_017516	GCGAG	2	10	299283	299292	20 %	0 %	60 %	20 %	385852489
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253	NC_017516	TGTTT	2	10	456255	456264	0 %	80 %	20 %	0 %	385852625
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260	NC_017516	ATCGT	2	10	465896	465905	20 %	40 %	20 %	20 %	385852632
261	NC_017516	CGCGG	2	10	466556	466565	0 %	0 %	60 %	40 %	385852633
262	NC_017516	TTTAC	2	10	468348	468357	20 %	60 %	0 %	20 %	385852636
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