MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 27107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017516	ACC	2	6	74	79	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852232
2	NC_017516	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385852232
3	NC_017516	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852232
4	NC_017516	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852232
5	NC_017516	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385852232
6	NC_017516	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852232
7	NC_017516	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852233
8	NC_017516	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852233
9	NC_017516	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852234
10	NC_017516	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852234
11	NC_017516	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852234
12	NC_017516	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852234
13	NC_017516	TCG	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852234
14	NC_017516	GAA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852234
15	NC_017516	TCG	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852234
16	NC_017516	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852234
17	NC_017516	ATC	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852234
18	NC_017516	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852234
19	NC_017516	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852234
20	NC_017516	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852234
21	NC_017516	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852234
22	NC_017516	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852234
23	NC_017516	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852234
24	NC_017516	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852234
25	NC_017516	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852234
26	NC_017516	ACG	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852234
27	NC_017516	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852234
28	NC_017516	CGG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852234
29	NC_017516	ATG	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852234
30	NC_017516	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852234
31	NC_017516	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852234
32	NC_017516	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852235
33	NC_017516	TCC	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385852235
34	NC_017516	CCG	2	6	2672	2677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852235
35	NC_017516	CAC	2	6	2709	2714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852235
36	NC_017516	TGT	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852235
37	NC_017516	CCG	2	6	2832	2837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852235
38	NC_017516	CGG	2	6	2978	2983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852235
39	NC_017516	CGG	2	6	3018	3023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852235
40	NC_017516	GCC	2	6	3198	3203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852236
41	NC_017516	GAT	2	6	3244	3249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852236
42	NC_017516	GCA	2	6	3262	3267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852236
43	NC_017516	ATC	2	6	3317	3322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852236
44	NC_017516	CAT	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852236
45	NC_017516	TTG	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852236
46	NC_017516	GCG	2	6	3397	3402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852236
47	NC_017516	GCA	2	6	3426	3431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852236
48	NC_017516	TTC	2	6	3440	3445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852236
49	NC_017516	GGC	2	6	3458	3463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852236
50	NC_017516	TGC	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852236
51	NC_017516	GCC	2	6	3668	3673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852237
52	NC_017516	ACA	2	6	3723	3728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852237
53	NC_017516	CGT	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852237
54	NC_017516	CGG	2	6	4346	4351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852238
55	NC_017516	CAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852238
56	NC_017516	CCA	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852238
57	NC_017516	CCG	2	6	4638	4643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852238
58	NC_017516	CGG	2	6	4727	4732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852238
59	NC_017516	AAC	3	9	4735	4743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852238
60	NC_017516	CGT	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852238
61	NC_017516	CTG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852238
62	NC_017516	CGA	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852238
63	NC_017516	GAC	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852238
64	NC_017516	CAT	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852239
65	NC_017516	AGC	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852239
66	NC_017516	ATG	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852239
67	NC_017516	CGC	2	6	5142	5147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852239
68	NC_017516	CCG	2	6	5172	5177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852239
69	NC_017516	CTG	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852239
70	NC_017516	ACA	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852239
71	NC_017516	AGA	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852239
72	NC_017516	GAA	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852239
73	NC_017516	AGA	2	6	5569	5574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852239
74	NC_017516	CGT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852239
75	NC_017516	CCG	2	6	5617	5622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852239
76	NC_017516	CCG	3	9	5661	5669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852239
77	NC_017516	GCT	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852239
78	NC_017516	TTC	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852239
79	NC_017516	CCA	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852239
80	NC_017516	TCA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852240
81	NC_017516	GCC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852240
82	NC_017516	CGG	2	6	6186	6191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852240
83	NC_017516	AAT	2	6	6210	6215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385852240
84	NC_017516	CGC	2	6	6286	6291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852241
85	NC_017516	CGC	3	9	6349	6357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852241
86	NC_017516	CGC	2	6	6404	6409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852241
87	NC_017516	CGC	3	9	6418	6426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852241
88	NC_017516	CGG	2	6	6538	6543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852241
89	NC_017516	ATC	2	6	6594	6599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852241
90	NC_017516	CAC	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852241
91	NC_017516	CGG	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852241
92	NC_017516	CAC	2	6	6662	6667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852241
93	NC_017516	CGG	2	6	6679	6684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852241
94	NC_017516	CAC	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852241
95	NC_017516	CGG	2	6	6712	6717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852241
96	NC_017516	ACG	2	6	6732	6737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852241
97	NC_017516	GCC	2	6	6771	6776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852241
98	NC_017516	TTC	2	6	6800	6805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852241
99	NC_017516	CCG	3	9	6876	6884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852241
100	NC_017516	TGG	2	6	6934	6939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852241
101	NC_017516	TGC	2	6	6946	6951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852241
102	NC_017516	AAG	2	6	7129	7134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852241
103	NC_017516	TCT	2	6	7165	7170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852241
104	NC_017516	TTG	2	6	7176	7181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852241
105	NC_017516	GCA	2	6	7195	7200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852241
106	NC_017516	GAC	2	6	7202	7207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852241
107	NC_017516	TCA	2	6	7354	7359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852241
108	NC_017516	GTC	2	6	7424	7429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852241
109	NC_017516	CGC	2	6	7714	7719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852242
110	NC_017516	GAC	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852242
111	NC_017516	CCA	2	6	7890	7895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852242
112	NC_017516	GAC	2	6	7969	7974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852242
113	NC_017516	TCG	2	6	8027	8032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852242
114	NC_017516	ACC	2	6	8111	8116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852242
115	NC_017516	GAC	2	6	8173	8178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852242
116	NC_017516	CGT	2	6	8320	8325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852242
117	NC_017516	CGC	2	6	8341	8346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852242
118	NC_017516	CAG	2	6	8350	8355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852242
119	NC_017516	GCC	2	6	8365	8370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852242
120	NC_017516	GCC	2	6	8512	8517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852242
121	NC_017516	AGC	2	6	8690	8695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852242
122	NC_017516	AAG	2	6	9408	9413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852243
123	NC_017516	CAG	2	6	9568	9573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852243
124	NC_017516	GGT	2	6	9637	9642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852243
125	NC_017516	CGG	2	6	9654	9659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852243
126	NC_017516	GCG	2	6	9720	9725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852243
127	NC_017516	CAG	2	6	9811	9816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852243
128	NC_017516	CTG	2	6	9818	9823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852243
129	NC_017516	TCA	2	6	9858	9863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852243
130	NC_017516	CTG	2	6	9919	9924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852243
131	NC_017516	CGA	2	6	9939	9944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852243
132	NC_017516	CAG	2	6	9988	9993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852243
133	NC_017516	ATC	2	6	10037	10042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852243
134	NC_017516	CTT	2	6	10221	10226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852243
135	NC_017516	TTC	2	6	10253	10258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852243
136	NC_017516	AAC	2	6	10316	10321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852243
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163	NC_017516	GCG	2	6	11907	11912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852245
164	NC_017516	CGC	3	9	11924	11932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852245
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239	NC_017516	CAT	2	6	22421	22426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852253
240	NC_017516	GGC	2	6	22852	22857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852254
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243	NC_017516	CGC	2	6	22989	22994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852254
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246	NC_017516	GTT	2	6	23092	23097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852254
247	NC_017516	TGC	2	6	23155	23160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852254
248	NC_017516	TTG	2	6	23201	23206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852254
249	NC_017516	CGG	2	6	23217	23222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852254
250	NC_017516	GTC	2	6	23230	23235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852254
251	NC_017516	CGC	2	6	23337	23342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852254
252	NC_017516	ACG	2	6	23363	23368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852254
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254	NC_017516	CGG	2	6	23430	23435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852254
255	NC_017516	CAT	2	6	23436	23441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852254
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257	NC_017516	TCT	2	6	23659	23664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852255
258	NC_017516	GGC	5	15	23672	23686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852255
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373	NC_017516	GCG	2	6	32163	32168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852262
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375	NC_017516	CTT	2	6	32532	32537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852263
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