MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 39245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017516	GCG	2	6	234325	234330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852430
4002	NC_017516	GCC	2	6	234439	234444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852430
4003	NC_017516	GCGG	2	8	234466	234473	0 %	0 %	75 %	25 %	385852430
4004	NC_017516	GCA	2	6	234559	234564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852430
4005	NC_017516	CGTT	2	8	234579	234586	0 %	50 %	25 %	25 %	385852430
4006	NC_017516	GGC	2	6	234592	234597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852430
4007	NC_017516	GGT	2	6	234601	234606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852430
4008	NC_017516	GCG	2	6	234615	234620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852430
4009	NC_017516	GAC	2	6	234648	234653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852430
4010	NC_017516	TGGG	2	8	234731	234738	0 %	25 %	75 %	0 %	385852430
4011	NC_017516	TCGTT	2	10	234781	234790	0 %	60 %	20 %	20 %	385852430
4012	NC_017516	GCC	2	6	234792	234797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852430
4013	NC_017516	A	6	6	234824	234829	100 %	0 %	0 %	0 %	385852430
4014	NC_017516	TTCGAT	2	12	234905	234916	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385852430
4015	NC_017516	GCC	2	6	235075	235080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
4016	NC_017516	AT	3	6	235082	235087	50 %	50 %	0 %	0 %	385852431
4017	NC_017516	TGATGG	2	12	235092	235103	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385852431
4018	NC_017516	GGC	2	6	235195	235200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852431
4019	NC_017516	AATCAG	2	12	235201	235212	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385852431
4020	NC_017516	TGG	2	6	235284	235289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852431
4021	NC_017516	CGG	2	6	235296	235301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852431
4022	NC_017516	AAT	2	6	235321	235326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385852431
4023	NC_017516	GAA	2	6	235369	235374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852431
4024	NC_017516	GCC	2	6	235418	235423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
4025	NC_017516	CAC	2	6	235429	235434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852431
4026	NC_017516	CAG	2	6	235444	235449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852431
4027	NC_017516	CGC	2	6	235462	235467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
4028	NC_017516	ACAAT	2	10	235545	235554	60 %	20 %	0 %	20 %	385852431
4029	NC_017516	CAG	2	6	235639	235644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852431
4030	NC_017516	GCC	2	6	235672	235677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
4031	NC_017516	GCC	2	6	235684	235689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
4032	NC_017516	CGG	2	6	235743	235748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852431
4033	NC_017516	GCG	2	6	235758	235763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852431
4034	NC_017516	TGCCA	2	10	235772	235781	20 %	20 %	20 %	40 %	385852431
4035	NC_017516	CTT	2	6	235848	235853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852431
4036	NC_017516	AC	3	6	235863	235868	50 %	0 %	0 %	50 %	385852431
4037	NC_017516	CGC	2	6	235881	235886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
4038	NC_017516	CAG	2	6	235921	235926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852431
4039	NC_017516	GCC	2	6	235945	235950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
4040	NC_017516	GCC	2	6	236138	236143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
4041	NC_017516	T	7	7	236240	236246	0 %	100 %	0 %	0 %	385852431
4042	NC_017516	TGCC	2	8	236402	236409	0 %	25 %	25 %	50 %	385852432
4043	NC_017516	AGT	2	6	236413	236418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852432
4044	NC_017516	T	6	6	236429	236434	0 %	100 %	0 %	0 %	385852432
4045	NC_017516	CAGA	2	8	236469	236476	50 %	0 %	25 %	25 %	385852432
4046	NC_017516	CTT	2	6	236561	236566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852432
4047	NC_017516	GGC	2	6	236591	236596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852432
4048	NC_017516	GCG	2	6	236628	236633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852432
4049	NC_017516	TCAATT	2	12	236711	236722	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385852432
4050	NC_017516	CGC	2	6	236778	236783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852432
4051	NC_017516	TTG	2	6	236973	236978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852432
4052	NC_017516	GCC	2	6	236992	236997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852432
4053	NC_017516	TGC	2	6	237011	237016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852432
4054	NC_017516	CAA	2	6	237060	237065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852432
4055	NC_017516	TCG	2	6	237070	237075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852432
4056	NC_017516	CTT	2	6	237180	237185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852433
4057	NC_017516	ATT	2	6	237194	237199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852433
4058	NC_017516	TGC	2	6	237213	237218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852433
4059	NC_017516	CGG	3	9	237249	237257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852433
4060	NC_017516	CCG	2	6	237281	237286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852433
4061	NC_017516	CAG	2	6	237304	237309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852433
4062	NC_017516	GCC	2	6	237322	237327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852433
4063	NC_017516	GGC	2	6	237329	237334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852433
4064	NC_017516	CCTG	2	8	237347	237354	0 %	25 %	25 %	50 %	385852433
4065	NC_017516	CGA	2	6	237502	237507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852433
4066	NC_017516	GCA	2	6	237606	237611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852433
4067	NC_017516	GCC	2	6	237625	237630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852433
4068	NC_017516	CCGC	2	8	237686	237693	0 %	0 %	25 %	75 %	385852433
4069	NC_017516	CA	3	6	237698	237703	50 %	0 %	0 %	50 %	385852433
4070	NC_017516	GCACG	2	10	237720	237729	20 %	0 %	40 %	40 %	385852433
4071	NC_017516	GCGG	2	8	237754	237761	0 %	0 %	75 %	25 %	385852433
4072	NC_017516	TCG	2	6	237896	237901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852433
4073	NC_017516	CGC	2	6	237922	237927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852433
4074	NC_017516	CAA	2	6	238055	238060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852434
4075	NC_017516	CGC	2	6	238077	238082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852434
4076	NC_017516	CAG	2	6	238083	238088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852434
4077	NC_017516	CGG	2	6	238092	238097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852434
4078	NC_017516	GCC	2	6	238149	238154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852434
4079	NC_017516	GCGAA	2	10	238157	238166	40 %	0 %	40 %	20 %	385852434
4080	NC_017516	AC	3	6	238172	238177	50 %	0 %	0 %	50 %	385852434
4081	NC_017516	GCC	2	6	238188	238193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852434
4082	NC_017516	ACCG	2	8	238197	238204	25 %	0 %	25 %	50 %	385852434
4083	NC_017516	CGGCA	2	10	238227	238236	20 %	0 %	40 %	40 %	385852434
4084	NC_017516	CGG	2	6	238237	238242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852434
4085	NC_017516	GCC	2	6	238266	238271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852434
4086	NC_017516	CAT	2	6	238299	238304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852434
4087	NC_017516	GGC	2	6	238331	238336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852434
4088	NC_017516	AGC	2	6	238368	238373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852434
4089	NC_017516	CGC	2	6	238400	238405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852434
4090	NC_017516	CCA	2	6	238424	238429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852434
4091	NC_017516	CGG	2	6	238451	238456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852434
4092	NC_017516	CA	3	6	238465	238470	50 %	0 %	0 %	50 %	385852434
4093	NC_017516	ACC	2	6	238543	238548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852434
4094	NC_017516	TGC	2	6	238567	238572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852434
4095	NC_017516	CTG	2	6	238893	238898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852435
4096	NC_017516	AAC	2	6	238915	238920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852435
4097	NC_017516	CCG	2	6	238924	238929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
4098	NC_017516	GCC	2	6	238937	238942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
4099	NC_017516	GGCG	2	8	238961	238968	0 %	0 %	75 %	25 %	385852435
4100	NC_017516	CG	3	6	238984	238989	0 %	0 %	50 %	50 %	385852435
4101	NC_017516	CGCAT	2	10	239001	239010	20 %	20 %	20 %	40 %	385852435
4102	NC_017516	CAA	2	6	239066	239071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852435
4103	NC_017516	GCC	2	6	239073	239078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
4104	NC_017516	GAT	2	6	239105	239110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852435
4105	NC_017516	CAC	2	6	239178	239183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852435
4106	NC_017516	CGG	2	6	239222	239227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852435
4107	NC_017516	TCA	2	6	239242	239247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852435
4108	NC_017516	GAA	2	6	239277	239282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852435
4109	NC_017516	ATC	2	6	239283	239288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852435
4110	NC_017516	GC	3	6	239339	239344	0 %	0 %	50 %	50 %	385852435
4111	NC_017516	GC	3	6	239356	239361	0 %	0 %	50 %	50 %	385852435
4112	NC_017516	CA	3	6	239370	239375	50 %	0 %	0 %	50 %	385852435
4113	NC_017516	CGC	2	6	239376	239381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
4114	NC_017516	TGC	2	6	239470	239475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852435
4115	NC_017516	AAC	2	6	239478	239483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852435
4116	NC_017516	CAA	2	6	239549	239554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852435
4117	NC_017516	GCA	2	6	239595	239600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852435
4118	NC_017516	CGA	3	9	239615	239623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852435
4119	NC_017516	GAA	2	6	239679	239684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852435
4120	NC_017516	GCC	3	9	239745	239753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
4121	NC_017516	ACG	2	6	239773	239778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852435
4122	NC_017516	CTA	2	6	239831	239836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852435
4123	NC_017516	GAA	2	6	239856	239861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852435
4124	NC_017516	CGG	2	6	240005	240010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852435
4125	NC_017516	CGA	3	9	240077	240085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852435
4126	NC_017516	TCA	2	6	240103	240108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852435
4127	NC_017516	CG	3	6	240118	240123	0 %	0 %	50 %	50 %	385852435
4128	NC_017516	GCC	2	6	240192	240197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
4129	NC_017516	GCC	2	6	240216	240221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
4130	NC_017516	GTC	2	6	240225	240230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852435
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4135	NC_017516	GAC	2	6	240453	240458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852435
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4142	NC_017516	CGC	2	6	240666	240671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
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4154	NC_017516	CGG	2	6	241767	241772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852436
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4200	NC_017516	CGC	2	6	244984	244989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852439
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4225	NC_017516	A	6	6	246461	246466	100 %	0 %	0 %	0 %	385852441
4226	NC_017516	TCA	2	6	246471	246476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852441
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4229	NC_017516	ATG	2	6	246563	246568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852441
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4231	NC_017516	TCCG	2	8	246615	246622	0 %	25 %	25 %	50 %	385852441
4232	NC_017516	C	6	6	246624	246629	0 %	0 %	0 %	100 %	385852441
4233	NC_017516	TGA	2	6	246642	246647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852441
4234	NC_017516	GCCC	2	8	246679	246686	0 %	0 %	25 %	75 %	385852441
4235	NC_017516	CGG	3	9	246751	246759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852441
4236	NC_017516	TAT	2	6	246761	246766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852441
4237	NC_017516	CGT	2	6	246802	246807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852441
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4239	NC_017516	CAA	2	6	246878	246883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852441
4240	NC_017516	A	6	6	246882	246887	100 %	0 %	0 %	0 %	385852441
4241	NC_017516	CCA	2	6	246900	246905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852441
4242	NC_017516	CAGG	2	8	246986	246993	25 %	0 %	50 %	25 %	385852442
4243	NC_017516	CGT	2	6	247168	247173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852442
4244	NC_017516	CAGT	2	8	247174	247181	25 %	25 %	25 %	25 %	385852442
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4366	NC_017516	GCC	2	6	254258	254263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852448
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4485	NC_017516	TCCG	2	8	260725	260732	0 %	25 %	25 %	50 %	385852456
4486	NC_017516	TTTG	2	8	260741	260748	0 %	75 %	25 %	0 %	385852456
4487	NC_017516	TAC	2	6	260757	260762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852456
4488	NC_017516	TCT	2	6	260818	260823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852456
4489	NC_017516	ATT	2	6	260844	260849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852456
4490	NC_017516	CGC	3	9	260939	260947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852456
4491	NC_017516	CTAC	2	8	261112	261119	25 %	25 %	0 %	50 %	385852457
4492	NC_017516	CGC	2	6	261145	261150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852457
4493	NC_017516	GCG	2	6	261276	261281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852457
4494	NC_017516	ATC	2	6	261368	261373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852457
4495	NC_017516	TTA	2	6	261384	261389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852457
4496	NC_017516	TGG	2	6	261396	261401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852457
4497	NC_017516	GGC	2	6	261448	261453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852457
4498	NC_017516	TTC	2	6	261521	261526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852457
4499	NC_017516	CCGCG	2	10	261575	261584	0 %	0 %	40 %	60 %	385852457
4500	NC_017516	TAT	2	6	261659	261664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852457

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