MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 39245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017516	CTG	2	6	178693	178698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852391
3002	NC_017516	GTC	2	6	178701	178706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852391
3003	NC_017516	CTGC	2	8	178729	178736	0 %	25 %	25 %	50 %	385852391
3004	NC_017516	GC	3	6	178764	178769	0 %	0 %	50 %	50 %	385852391
3005	NC_017516	AGC	2	6	178795	178800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852391
3006	NC_017516	CGG	2	6	178802	178807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852391
3007	NC_017516	T	6	6	178818	178823	0 %	100 %	0 %	0 %	385852391
3008	NC_017516	GCC	2	6	178827	178832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852391
3009	NC_017516	T	6	6	178841	178846	0 %	100 %	0 %	0 %	385852391
3010	NC_017516	GCC	3	9	178911	178919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852391
3011	NC_017516	AAG	2	6	178933	178938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852391
3012	NC_017516	GCC	2	6	178962	178967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852391
3013	NC_017516	CGC	2	6	178982	178987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852391
3014	NC_017516	GAA	2	6	179019	179024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852391
3015	NC_017516	AGT	2	6	179048	179053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852391
3016	NC_017516	TGC	2	6	179063	179068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852391
3017	NC_017516	CAGG	2	8	179069	179076	25 %	0 %	50 %	25 %	385852391
3018	NC_017516	CG	3	6	179108	179113	0 %	0 %	50 %	50 %	385852391
3019	NC_017516	TTG	2	6	179137	179142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852391
3020	NC_017516	CAGC	2	8	179169	179176	25 %	0 %	25 %	50 %	385852391
3021	NC_017516	TGT	2	6	179249	179254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852391
3022	NC_017516	CCA	2	6	179279	179284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852391
3023	NC_017516	GCCTGC	2	12	179334	179345	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385852391
3024	NC_017516	GTG	2	6	179347	179352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852391
3025	NC_017516	GC	3	6	179497	179502	0 %	0 %	50 %	50 %	385852391
3026	NC_017516	AACCC	2	10	179577	179586	40 %	0 %	0 %	60 %	385852391
3027	NC_017516	CGG	2	6	179776	179781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852391
3028	NC_017516	TCG	2	6	179788	179793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852391
3029	NC_017516	TGT	2	6	179801	179806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852391
3030	NC_017516	CGG	2	6	179966	179971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852391
3031	NC_017516	CTG	2	6	179976	179981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852391
3032	NC_017516	CAG	2	6	180012	180017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852391
3033	NC_017516	GCC	2	6	180270	180275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852391
3034	NC_017516	GATGTC	2	12	180378	180389	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385852391
3035	NC_017516	TTC	2	6	180459	180464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852391
3036	NC_017516	CGT	2	6	180554	180559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852391
3037	NC_017516	GCA	2	6	180563	180568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852391
3038	NC_017516	GAGC	2	8	180588	180595	25 %	0 %	50 %	25 %	385852391
3039	NC_017516	TGG	2	6	180599	180604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852391
3040	NC_017516	CAG	2	6	180621	180626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852391
3041	NC_017516	CGT	2	6	180656	180661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852391
3042	NC_017516	TGA	2	6	180689	180694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852391
3043	NC_017516	GT	4	8	180705	180712	0 %	50 %	50 %	0 %	385852391
3044	NC_017516	CTCGG	2	10	180760	180769	0 %	20 %	40 %	40 %	385852391
3045	NC_017516	CAT	2	6	180840	180845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852391
3046	NC_017516	GTTTCA	2	12	180863	180874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385852391
3047	NC_017516	AGC	2	6	180939	180944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852392
3048	NC_017516	CGT	2	6	180952	180957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852392
3049	NC_017516	GAA	2	6	180959	180964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852392
3050	NC_017516	CAT	2	6	180974	180979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852392
3051	NC_017516	CAT	2	6	180983	180988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852392
3052	NC_017516	CCG	2	6	181080	181085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852392
3053	NC_017516	CGG	2	6	181174	181179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852392
3054	NC_017516	T	6	6	181291	181296	0 %	100 %	0 %	0 %	385852392
3055	NC_017516	ACA	2	6	181320	181325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852392
3056	NC_017516	GACG	2	8	181326	181333	25 %	0 %	50 %	25 %	385852392
3057	NC_017516	GCG	2	6	181340	181345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852392
3058	NC_017516	CGGA	2	8	181376	181383	25 %	0 %	50 %	25 %	385852392
3059	NC_017516	CGG	2	6	181441	181446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852392
3060	NC_017516	T	7	7	181483	181489	0 %	100 %	0 %	0 %	385852392
3061	NC_017516	CGG	2	6	181549	181554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852392
3062	NC_017516	CGG	2	6	181591	181596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852392
3063	NC_017516	CGC	2	6	181612	181617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852392
3064	NC_017516	T	6	6	181665	181670	0 %	100 %	0 %	0 %	385852392
3065	NC_017516	GC	3	6	181723	181728	0 %	0 %	50 %	50 %	385852392
3066	NC_017516	GC	3	6	181792	181797	0 %	0 %	50 %	50 %	385852392
3067	NC_017516	CGC	2	6	181843	181848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852392
3068	NC_017516	GCGG	2	8	181862	181869	0 %	0 %	75 %	25 %	385852392
3069	NC_017516	CGG	2	6	181978	181983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852392
3070	NC_017516	CGA	2	6	181984	181989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852392
3071	NC_017516	GTT	2	6	182011	182016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852392
3072	NC_017516	CTTCGC	2	12	182050	182061	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385852392
3073	NC_017516	CGC	2	6	182122	182127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852392
3074	NC_017516	CGC	2	6	182182	182187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852392
3075	NC_017516	C	6	6	182370	182375	0 %	0 %	0 %	100 %	385852393
3076	NC_017516	GTCC	2	8	182453	182460	0 %	25 %	25 %	50 %	385852393
3077	NC_017516	GGC	2	6	182466	182471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852393
3078	NC_017516	CGG	2	6	182474	182479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852393
3079	NC_017516	GGC	2	6	182487	182492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852393
3080	NC_017516	CAGG	2	8	182547	182554	25 %	0 %	50 %	25 %	385852393
3081	NC_017516	GGAT	2	8	182746	182753	25 %	25 %	50 %	0 %	385852393
3082	NC_017516	GAC	2	6	182754	182759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852393
3083	NC_017516	TCA	2	6	182822	182827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852393
3084	NC_017516	TGG	2	6	182828	182833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852393
3085	NC_017516	GGGC	2	8	182888	182895	0 %	0 %	75 %	25 %	385852393
3086	NC_017516	CGG	2	6	182921	182926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852393
3087	NC_017516	GCC	2	6	182937	182942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852393
3088	NC_017516	GTTC	2	8	182975	182982	0 %	50 %	25 %	25 %	385852393
3089	NC_017516	CGGC	2	8	182986	182993	0 %	0 %	50 %	50 %	385852393
3090	NC_017516	CG	3	6	182999	183004	0 %	0 %	50 %	50 %	385852393
3091	NC_017516	GCA	2	6	183044	183049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852393
3092	NC_017516	AAC	2	6	183082	183087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852393
3093	NC_017516	ACC	2	6	183097	183102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852393
3094	NC_017516	TTTG	2	8	183111	183118	0 %	75 %	25 %	0 %	385852393
3095	NC_017516	CGA	2	6	183179	183184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852393
3096	NC_017516	TCG	2	6	183208	183213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852393
3097	NC_017516	GC	3	6	183239	183244	0 %	0 %	50 %	50 %	385852393
3098	NC_017516	GCCGT	2	10	183262	183271	0 %	20 %	40 %	40 %	385852393
3099	NC_017516	GCG	2	6	183298	183303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852393
3100	NC_017516	ACG	2	6	183319	183324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852393
3101	NC_017516	GCC	2	6	183355	183360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852393
3102	NC_017516	TGC	2	6	183449	183454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852393
3103	NC_017516	CAT	2	6	183562	183567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852394
3104	NC_017516	CGC	2	6	183618	183623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852394
3105	NC_017516	GCA	2	6	183633	183638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852394
3106	NC_017516	TGC	2	6	183642	183647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852394
3107	NC_017516	TGCC	2	8	183657	183664	0 %	25 %	25 %	50 %	385852394
3108	NC_017516	GC	3	6	183665	183670	0 %	0 %	50 %	50 %	385852394
3109	NC_017516	CGC	2	6	183693	183698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852394
3110	NC_017516	GCCA	2	8	183761	183768	25 %	0 %	25 %	50 %	385852394
3111	NC_017516	CGG	2	6	183783	183788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852394
3112	NC_017516	CGC	2	6	183813	183818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852394
3113	NC_017516	AGC	2	6	183938	183943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852394
3114	NC_017516	CAT	2	6	183951	183956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852394
3115	NC_017516	AGCC	2	8	184007	184014	25 %	0 %	25 %	50 %	385852394
3116	NC_017516	CCG	2	6	184034	184039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852394
3117	NC_017516	ACA	2	6	184097	184102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852394
3118	NC_017516	ACCAA	2	10	184104	184113	60 %	0 %	0 %	40 %	385852394
3119	NC_017516	GCA	2	6	184119	184124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852394
3120	NC_017516	GCC	2	6	184129	184134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852394
3121	NC_017516	GCG	2	6	184166	184171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852394
3122	NC_017516	TGGT	2	8	184178	184185	0 %	50 %	50 %	0 %	385852394
3123	NC_017516	GCG	2	6	184272	184277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852394
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3241	NC_017516	GCG	2	6	191837	191842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852401
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3484	NC_017516	GAT	3	9	204405	204413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852408
3485	NC_017516	CGT	2	6	204512	204517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852408
3486	NC_017516	GC	3	6	204596	204601	0 %	0 %	50 %	50 %	385852408
3487	NC_017516	GTT	2	6	204624	204629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852408
3488	NC_017516	TG	3	6	204698	204703	0 %	50 %	50 %	0 %	385852408
3489	NC_017516	TGC	2	6	204815	204820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852409
3490	NC_017516	TGA	2	6	204827	204832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852409
3491	NC_017516	CGGT	2	8	204868	204875	0 %	25 %	50 %	25 %	385852409
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3493	NC_017516	GGC	2	6	204948	204953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852409
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