MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 39245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017516	GGC	2	6	59800	59805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852280
1002	NC_017516	TG	3	6	59844	59849	0 %	50 %	50 %	0 %	385852280
1003	NC_017516	AAT	2	6	59881	59886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385852280
1004	NC_017516	ATGA	2	8	60089	60096	50 %	25 %	25 %	0 %	385852281
1005	NC_017516	T	6	6	60109	60114	0 %	100 %	0 %	0 %	385852281
1006	NC_017516	CA	3	6	60220	60225	50 %	0 %	0 %	50 %	385852281
1007	NC_017516	GAA	2	6	60227	60232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852281
1008	NC_017516	TGA	2	6	60310	60315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852281
1009	NC_017516	GCT	2	6	60367	60372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852281
1010	NC_017516	GA	3	6	60417	60422	50 %	0 %	50 %	0 %	385852281
1011	NC_017516	A	6	6	60428	60433	100 %	0 %	0 %	0 %	385852281
1012	NC_017516	GAA	2	6	66437	66442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852282
1013	NC_017516	GCG	2	6	66489	66494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852282
1014	NC_017516	GCA	2	6	66515	66520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852282
1015	NC_017516	CGG	2	6	66550	66555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852282
1016	NC_017516	GC	3	6	66589	66594	0 %	0 %	50 %	50 %	385852282
1017	NC_017516	TGC	2	6	66622	66627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852282
1018	NC_017516	A	6	6	66636	66641	100 %	0 %	0 %	0 %	385852282
1019	NC_017516	A	6	6	66908	66913	100 %	0 %	0 %	0 %	385852283
1020	NC_017516	GAT	2	6	66964	66969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852283
1021	NC_017516	A	6	6	66976	66981	100 %	0 %	0 %	0 %	385852283
1022	NC_017516	AAG	2	6	67055	67060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852283
1023	NC_017516	GC	3	6	67098	67103	0 %	0 %	50 %	50 %	385852283
1024	NC_017516	GCG	2	6	67126	67131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852283
1025	NC_017516	GGC	2	6	67138	67143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852283
1026	NC_017516	G	6	6	67149	67154	0 %	0 %	100 %	0 %	385852283
1027	NC_017516	GC	3	6	67239	67244	0 %	0 %	50 %	50 %	385852283
1028	NC_017516	GAA	2	6	67297	67302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852283
1029	NC_017516	GAA	2	6	67317	67322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852283
1030	NC_017516	CAG	2	6	67438	67443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852283
1031	NC_017516	GCA	2	6	67458	67463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852283
1032	NC_017516	CCG	2	6	67571	67576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852283
1033	NC_017516	GCG	2	6	67607	67612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852283
1034	NC_017516	TGTA	2	8	67652	67659	25 %	50 %	25 %	0 %	385852283
1035	NC_017516	GCT	2	6	67741	67746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852283
1036	NC_017516	AGG	2	6	67822	67827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385852283
1037	NC_017516	AAGGGT	2	12	67837	67848	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385852283
1038	NC_017516	GCA	2	6	67862	67867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852283
1039	NC_017516	TTG	2	6	67895	67900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852283
1040	NC_017516	GACC	2	8	67920	67927	25 %	0 %	25 %	50 %	385852283
1041	NC_017516	GAA	2	6	67945	67950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852283
1042	NC_017516	TTTG	2	8	68022	68029	0 %	75 %	25 %	0 %	385852283
1043	NC_017516	AGA	2	6	68256	68261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852284
1044	NC_017516	TCG	2	6	68368	68373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852284
1045	NC_017516	CGG	3	9	68378	68386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852284
1046	NC_017516	GCA	2	6	68420	68425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852284
1047	NC_017516	ACA	2	6	68438	68443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852284
1048	NC_017516	CAT	2	6	68484	68489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852284
1049	NC_017516	GAC	2	6	68547	68552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852284
1050	NC_017516	CGG	2	6	68568	68573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852284
1051	NC_017516	TGG	2	6	68615	68620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852284
1052	NC_017516	GGC	2	6	68652	68657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852284
1053	NC_017516	GAA	2	6	68686	68691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852284
1054	NC_017516	GCGGCA	2	12	68708	68719	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385852284
1055	NC_017516	GGC	2	6	68730	68735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852284
1056	NC_017516	CGG	2	6	68736	68741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852284
1057	NC_017516	TGA	2	6	68756	68761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852284
1058	NC_017516	TTG	2	6	68863	68868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852284
1059	NC_017516	TGCCG	2	10	68940	68949	0 %	20 %	40 %	40 %	385852284
1060	NC_017516	CA	3	6	68960	68965	50 %	0 %	0 %	50 %	385852284
1061	NC_017516	GGC	2	6	68991	68996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852284
1062	NC_017516	GCG	2	6	69058	69063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852284
1063	NC_017516	TGC	2	6	69080	69085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852284
1064	NC_017516	TGG	2	6	69095	69100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852284
1065	NC_017516	GGC	2	6	69130	69135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852284
1066	NC_017516	T	6	6	69188	69193	0 %	100 %	0 %	0 %	385852284
1067	NC_017516	GAT	2	6	69204	69209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852284
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1069	NC_017516	TGGCT	2	10	69269	69278	0 %	40 %	40 %	20 %	385852284
1070	NC_017516	TGG	2	6	69281	69286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852284
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1072	NC_017516	CGT	3	9	69402	69410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852284
1073	NC_017516	TGC	2	6	69425	69430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852284
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1077	NC_017516	TGA	2	6	69746	69751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852284
1078	NC_017516	TCG	3	9	69833	69841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852284
1079	NC_017516	A	6	6	69853	69858	100 %	0 %	0 %	0 %	385852284
1080	NC_017516	TCA	2	6	69859	69864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852284
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1082	NC_017516	TGCCC	2	10	69876	69885	0 %	20 %	20 %	60 %	385852284
1083	NC_017516	CGGT	2	8	69893	69900	0 %	25 %	50 %	25 %	385852284
1084	NC_017516	GCC	2	6	69915	69920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852284
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1086	NC_017516	CAT	2	6	69975	69980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852284
1087	NC_017516	A	6	6	69985	69990	100 %	0 %	0 %	0 %	385852284
1088	NC_017516	CCG	2	6	70046	70051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852284
1089	NC_017516	TAT	2	6	70095	70100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852284
1090	NC_017516	CGG	2	6	70119	70124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852284
1091	NC_017516	GCC	2	6	70165	70170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852284
1092	NC_017516	CTT	2	6	70172	70177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852284
1093	NC_017516	TTC	2	6	70192	70197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852284
1094	NC_017516	T	6	6	70288	70293	0 %	100 %	0 %	0 %	385852285
1095	NC_017516	CAG	2	6	70361	70366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852285
1096	NC_017516	GTTT	2	8	70531	70538	0 %	75 %	25 %	0 %	385852285
1097	NC_017516	TG	3	6	70647	70652	0 %	50 %	50 %	0 %	385852285
1098	NC_017516	TCG	2	6	70752	70757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852285
1099	NC_017516	A	6	6	70772	70777	100 %	0 %	0 %	0 %	385852285
1100	NC_017516	CG	4	8	70780	70787	0 %	0 %	50 %	50 %	385852285
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1103	NC_017516	T	6	6	70906	70911	0 %	100 %	0 %	0 %	385852286
1104	NC_017516	GCA	2	6	70920	70925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852286
1105	NC_017516	GC	3	6	70957	70962	0 %	0 %	50 %	50 %	385852286
1106	NC_017516	TTC	2	6	70966	70971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852286
1107	NC_017516	AGGC	2	8	71018	71025	25 %	0 %	50 %	25 %	385852286
1108	NC_017516	GAGC	2	8	71140	71147	25 %	0 %	50 %	25 %	385852286
1109	NC_017516	CGC	2	6	71190	71195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852286
1110	NC_017516	TTC	2	6	71293	71298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852286
1111	NC_017516	GCC	2	6	71399	71404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852286
1112	NC_017516	A	6	6	71436	71441	100 %	0 %	0 %	0 %	385852286
1113	NC_017516	TTC	2	6	71485	71490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852286
1114	NC_017516	GAT	2	6	71494	71499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852286
1115	NC_017516	TAA	2	6	71663	71668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385852286
1116	NC_017516	ATC	2	6	71669	71674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852286
1117	NC_017516	CGC	2	6	71709	71714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852286
1118	NC_017516	TGCCGC	2	12	71736	71747	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385852286
1119	NC_017516	ATG	2	6	71756	71761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852286
1120	NC_017516	TCTTT	2	10	71769	71778	0 %	80 %	0 %	20 %	385852286
1121	NC_017516	CCA	2	6	71886	71891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852287
1122	NC_017516	TGT	2	6	71897	71902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852287
1123	NC_017516	CAGC	2	8	71955	71962	25 %	0 %	25 %	50 %	385852287
1124	NC_017516	GCGTA	2	10	71995	72004	20 %	20 %	40 %	20 %	385852287
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