MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 39296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017515	GCC	2	6	181950	181955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850448
3002	NC_017515	ACG	2	6	181960	181965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850448
3003	NC_017515	GTT	2	6	182001	182006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850448
3004	NC_017515	GTC	2	6	182073	182078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850448
3005	NC_017515	GGT	2	6	182124	182129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850448
3006	NC_017515	GTTGCC	2	12	182145	182156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850448
3007	NC_017515	TCG	2	6	182176	182181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850448
3008	NC_017515	T	6	6	182187	182192	0 %	100 %	0 %	0 %	385850448
3009	NC_017515	GTT	2	6	182235	182240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850448
3010	NC_017515	TGA	2	6	182264	182269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850448
3011	NC_017515	CGG	2	6	182378	182383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850448
3012	NC_017515	CAG	2	6	182588	182593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850449
3013	NC_017515	GAA	4	12	182663	182674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850449
3014	NC_017515	GAT	2	6	182741	182746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850449
3015	NC_017515	TGTC	2	8	182938	182945	0 %	50 %	25 %	25 %	385850449
3016	NC_017515	GCT	3	9	183001	183009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850450
3017	NC_017515	GC	3	6	183065	183070	0 %	0 %	50 %	50 %	385850450
3018	NC_017515	GACG	2	8	183140	183147	25 %	0 %	50 %	25 %	385850450
3019	NC_017515	GCC	3	9	183149	183157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850450
3020	NC_017515	TGG	2	6	183160	183165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850450
3021	NC_017515	CGC	3	9	183202	183210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850450
3022	NC_017515	GAT	2	6	183212	183217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850450
3023	NC_017515	GGC	2	6	183260	183265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850450
3024	NC_017515	GGT	2	6	183341	183346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850450
3025	NC_017515	CGC	2	6	183358	183363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850450
3026	NC_017515	CGT	2	6	183394	183399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850450
3027	NC_017515	CGC	2	6	183487	183492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850450
3028	NC_017515	TAA	2	6	183528	183533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850450
3029	NC_017515	ACG	2	6	183534	183539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850450
3030	NC_017515	GAC	2	6	183554	183559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850450
3031	NC_017515	TCG	2	6	183561	183566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850450
3032	NC_017515	GAC	2	6	183587	183592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850450
3033	NC_017515	CGA	2	6	183694	183699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850450
3034	NC_017515	CGG	2	6	183700	183705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850450
3035	NC_017515	GGAT	2	8	183708	183715	25 %	25 %	50 %	0 %	385850450
3036	NC_017515	GCC	2	6	183716	183721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850450
3037	NC_017515	GC	3	6	183722	183727	0 %	0 %	50 %	50 %	385850450
3038	NC_017515	GAC	2	6	183731	183736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850450
3039	NC_017515	GGCG	2	8	183748	183755	0 %	0 %	75 %	25 %	385850450
3040	NC_017515	GTC	2	6	183779	183784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850450
3041	NC_017515	CCGCGC	2	12	183841	183852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850450
3042	NC_017515	CGG	2	6	183934	183939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850450
3043	NC_017515	CGC	2	6	183955	183960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850450
3044	NC_017515	CGC	2	6	183967	183972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850450
3045	NC_017515	CG	3	6	183978	183983	0 %	0 %	50 %	50 %	385850450
3046	NC_017515	CGT	2	6	184089	184094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850451
3047	NC_017515	GGAG	2	8	184185	184192	25 %	0 %	75 %	0 %	385850451
3048	NC_017515	GCG	2	6	184207	184212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850451
3049	NC_017515	TCT	2	6	184223	184228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850451
3050	NC_017515	T	6	6	184243	184248	0 %	100 %	0 %	0 %	385850451
3051	NC_017515	TTC	2	6	184279	184284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850451
3052	NC_017515	T	6	6	184295	184300	0 %	100 %	0 %	0 %	385850451
3053	NC_017515	T	6	6	184404	184409	0 %	100 %	0 %	0 %	385850451
3054	NC_017515	GC	3	6	184417	184422	0 %	0 %	50 %	50 %	385850451
3055	NC_017515	T	6	6	184467	184472	0 %	100 %	0 %	0 %	385850451
3056	NC_017515	GC	3	6	184488	184493	0 %	0 %	50 %	50 %	385850451
3057	NC_017515	GCA	2	6	184501	184506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850451
3058	NC_017515	CG	3	6	184531	184536	0 %	0 %	50 %	50 %	385850451
3059	NC_017515	CGT	2	6	184623	184628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3060	NC_017515	TTGGAA	2	12	184635	184646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850452
3061	NC_017515	T	6	6	184668	184673	0 %	100 %	0 %	0 %	385850452
3062	NC_017515	CGC	2	6	184733	184738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850452
3063	NC_017515	CGG	2	6	184739	184744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850452
3064	NC_017515	GCC	2	6	184812	184817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850452
3065	NC_017515	CTG	2	6	184828	184833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3066	NC_017515	GTC	2	6	184836	184841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3067	NC_017515	CTGC	2	8	184864	184871	0 %	25 %	25 %	50 %	385850452
3068	NC_017515	GC	3	6	184899	184904	0 %	0 %	50 %	50 %	385850452
3069	NC_017515	AGC	2	6	184930	184935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3070	NC_017515	CGG	2	6	184937	184942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850452
3071	NC_017515	T	6	6	184953	184958	0 %	100 %	0 %	0 %	385850452
3072	NC_017515	GCC	2	6	184962	184967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850452
3073	NC_017515	T	6	6	184976	184981	0 %	100 %	0 %	0 %	385850452
3074	NC_017515	GCC	3	9	185046	185054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850452
3075	NC_017515	AAG	2	6	185068	185073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850452
3076	NC_017515	CGC	2	6	185117	185122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850452
3077	NC_017515	GAA	2	6	185154	185159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850452
3078	NC_017515	AGT	2	6	185183	185188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850452
3079	NC_017515	TGC	2	6	185198	185203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3080	NC_017515	CG	3	6	185243	185248	0 %	0 %	50 %	50 %	385850452
3081	NC_017515	TTG	2	6	185272	185277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850452
3082	NC_017515	CAGC	2	8	185304	185311	25 %	0 %	25 %	50 %	385850452
3083	NC_017515	TGT	2	6	185384	185389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850452
3084	NC_017515	CCA	2	6	185414	185419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385850452
3085	NC_017515	GCCTGC	2	12	185469	185480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385850452
3086	NC_017515	GTG	2	6	185482	185487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850452
3087	NC_017515	GC	3	6	185632	185637	0 %	0 %	50 %	50 %	385850452
3088	NC_017515	GGC	2	6	185640	185645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850452
3089	NC_017515	CGAG	2	8	185732	185739	25 %	0 %	50 %	25 %	385850452
3090	NC_017515	TCG	2	6	185923	185928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3091	NC_017515	TGT	2	6	185936	185941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850452
3092	NC_017515	CGG	2	6	186101	186106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850452
3093	NC_017515	CTG	2	6	186111	186116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3094	NC_017515	CAG	2	6	186147	186152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3095	NC_017515	GTT	2	6	186315	186320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850452
3096	NC_017515	GCC	2	6	186405	186410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850452
3097	NC_017515	GATGTC	2	12	186513	186524	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385850452
3098	NC_017515	TTC	2	6	186594	186599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850452
3099	NC_017515	CGT	2	6	186689	186694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3100	NC_017515	GCA	2	6	186698	186703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3101	NC_017515	GAGC	2	8	186723	186730	25 %	0 %	50 %	25 %	385850452
3102	NC_017515	TGG	2	6	186734	186739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850452
3103	NC_017515	CAG	2	6	186756	186761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3104	NC_017515	CGT	2	6	186791	186796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850452
3105	NC_017515	TGA	2	6	186824	186829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850452
3106	NC_017515	GT	4	8	186840	186847	0 %	50 %	50 %	0 %	385850452
3107	NC_017515	CTCGG	2	10	186895	186904	0 %	20 %	40 %	40 %	385850452
3108	NC_017515	GTTTCA	2	12	186998	187009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385850452
3109	NC_017515	AGC	2	6	187074	187079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850453
3110	NC_017515	CGT	2	6	187087	187092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850453
3111	NC_017515	GAA	2	6	187094	187099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850453
3112	NC_017515	CAT	2	6	187109	187114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850453
3113	NC_017515	CAT	2	6	187118	187123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850453
3114	NC_017515	GCC	2	6	187214	187219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850453
3115	NC_017515	GCA	2	6	187237	187242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850453
3116	NC_017515	CGG	2	6	187309	187314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850453
3117	NC_017515	T	6	6	187426	187431	0 %	100 %	0 %	0 %	385850453
3118	NC_017515	ACA	2	6	187455	187460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850453
3119	NC_017515	GACG	2	8	187461	187468	25 %	0 %	50 %	25 %	385850453
3120	NC_017515	GCG	2	6	187475	187480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850453
3121	NC_017515	CGGA	2	8	187511	187518	25 %	0 %	50 %	25 %	385850453
3122	NC_017515	CGG	2	6	187576	187581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850453
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3231	NC_017515	TGC	2	6	192407	192412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850458
3232	NC_017515	CAT	2	6	192421	192426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850458
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3234	NC_017515	TGCG	2	8	192486	192493	0 %	25 %	50 %	25 %	385850458
3235	NC_017515	TGC	2	6	192576	192581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850458
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3237	NC_017515	GGC	3	9	192646	192654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850458
3238	NC_017515	GATGGC	2	12	192655	192666	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385850458
3239	NC_017515	GC	3	6	192689	192694	0 %	0 %	50 %	50 %	385850458
3240	NC_017515	CCG	2	6	192789	192794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850458
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3242	NC_017515	AGA	2	6	192834	192839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850458
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3363	NC_017515	TGG	2	6	200476	200481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850463
3364	NC_017515	CCG	2	6	200587	200592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850463
3365	NC_017515	GATGGC	2	12	200598	200609	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385850463
3366	NC_017515	GCCCAC	2	12	200625	200636	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385850463
3367	NC_017515	GTC	2	6	200688	200693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850463
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3369	NC_017515	TGC	2	6	200726	200731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850463
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3372	NC_017515	CCTGC	2	10	201119	201128	0 %	20 %	20 %	60 %	385850464
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3471	NC_017515	GTCCAA	2	12	205848	205859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385850465
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3475	NC_017515	GTT	2	6	206710	206715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850466
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3483	NC_017515	ACC	2	6	206936	206941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385850466
3484	NC_017515	A	7	7	206944	206950	100 %	0 %	0 %	0 %	385850466
3485	NC_017515	GAC	2	6	206983	206988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850466
3486	NC_017515	GCAC	2	8	207176	207183	25 %	0 %	25 %	50 %	385850466
3487	NC_017515	CGA	2	6	207228	207233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850466
3488	NC_017515	CGT	2	6	207259	207264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850466
3489	NC_017515	GCC	2	6	207363	207368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850466
3490	NC_017515	A	7	7	207492	207498	100 %	0 %	0 %	0 %	385850467
3491	NC_017515	CGG	2	6	207605	207610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850467
3492	NC_017515	TGA	2	6	207616	207621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850467
3493	NC_017515	GGC	2	6	207691	207696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850467
3494	NC_017515	GGC	2	6	207865	207870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850467
3495	NC_017515	TGT	2	6	207910	207915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850467
3496	NC_017515	GCGG	2	8	207951	207958	0 %	0 %	75 %	25 %	385850467
3497	NC_017515	GAC	2	6	208008	208013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850467
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3500	NC_017515	ATT	2	6	208130	208135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385850467

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