MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria meningitidis M01-240149 chromosome

Total Repeats: 1201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017514	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385340993
2	NC_017514	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385340994
3	NC_017514	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385340994
4	NC_017514	GACAT	2	10	3506	3515	40 %	20 %	20 %	20 %	385340996
5	NC_017514	AAGGC	2	10	6082	6091	40 %	0 %	40 %	20 %	385341000
6	NC_017514	TGCTT	2	10	6441	6450	0 %	60 %	20 %	20 %	385341001
7	NC_017514	GGTGC	2	10	8363	8372	0 %	20 %	60 %	20 %	385341002
8	NC_017514	CAATC	2	10	9037	9046	40 %	20 %	0 %	40 %	385341003
9	NC_017514	TCAAT	2	10	10555	10564	40 %	40 %	0 %	20 %	385341004
10	NC_017514	CGCGC	2	10	11568	11577	0 %	0 %	40 %	60 %	385341005
11	NC_017514	CCCGT	2	10	11589	11598	0 %	20 %	20 %	60 %	385341005
12	NC_017514	TCCCG	2	10	12738	12747	0 %	20 %	20 %	60 %	385341006
13	NC_017514	TGTCG	2	10	14194	14203	0 %	40 %	40 %	20 %	385341007
14	NC_017514	AGGCG	2	10	23507	23516	20 %	0 %	60 %	20 %	385341015
15	NC_017514	AGGGC	2	10	25629	25638	20 %	0 %	60 %	20 %	385341016
16	NC_017514	AAACC	2	10	26332	26341	60 %	0 %	0 %	40 %	385341017
17	NC_017514	TCCGC	2	10	29632	29641	0 %	20 %	20 %	60 %	385341019
18	NC_017514	CATTC	2	10	34220	34229	20 %	40 %	0 %	40 %	385341023
19	NC_017514	AGGTG	2	10	34668	34677	20 %	20 %	60 %	0 %	385341024
20	NC_017514	GGGCT	2	10	37333	37342	0 %	20 %	60 %	20 %	385341025
21	NC_017514	GGCGG	2	10	40831	40840	0 %	0 %	80 %	20 %	385341028
22	NC_017514	GCGGT	2	10	41306	41315	0 %	20 %	60 %	20 %	385341029
23	NC_017514	GCGCG	2	10	41703	41712	0 %	0 %	60 %	40 %	385341029
24	NC_017514	ACGGC	2	10	42248	42257	20 %	0 %	40 %	40 %	385341029
25	NC_017514	GATTG	2	10	43624	43633	20 %	40 %	40 %	0 %	385341030
26	NC_017514	GAAAA	2	10	44421	44430	80 %	0 %	20 %	0 %	385341030
27	NC_017514	GAAAA	2	10	46168	46177	80 %	0 %	20 %	0 %	385341030
28	NC_017514	GTTGG	2	10	48465	48474	0 %	40 %	60 %	0 %	385341031
29	NC_017514	AAACC	2	10	50855	50864	60 %	0 %	0 %	40 %	385341032
30	NC_017514	AGGCG	2	10	52963	52972	20 %	0 %	60 %	20 %	385341034
31	NC_017514	GTGCG	2	10	53206	53215	0 %	20 %	60 %	20 %	385341034
32	NC_017514	ACGGC	2	10	62047	62056	20 %	0 %	40 %	40 %	385341039
33	NC_017514	TGCCG	2	10	64529	64538	0 %	20 %	40 %	40 %	385341041
34	NC_017514	TGGCT	2	10	64858	64867	0 %	40 %	40 %	20 %	385341041
35	NC_017514	TGCCC	2	10	65465	65474	0 %	20 %	20 %	60 %	385341041
36	NC_017514	TCTTT	2	10	67358	67367	0 %	80 %	0 %	20 %	385341043
37	NC_017514	GCGTA	2	10	67584	67593	20 %	20 %	40 %	20 %	385341044
38	NC_017514	AATGG	2	10	68764	68773	40 %	20 %	40 %	0 %	385341045
39	NC_017514	GGGTA	2	10	68948	68957	20 %	20 %	60 %	0 %	385341045
40	NC_017514	TCGGC	2	10	69341	69350	0 %	20 %	40 %	40 %	385341045
41	NC_017514	TGCTA	2	10	70750	70759	20 %	40 %	20 %	20 %	385341046
42	NC_017514	GTTTG	2	10	71615	71624	0 %	60 %	40 %	0 %	385341047
43	NC_017514	AGGCC	2	10	73185	73194	20 %	0 %	40 %	40 %	385341048
44	NC_017514	AAGCA	2	10	74760	74769	60 %	0 %	20 %	20 %	385341049
45	NC_017514	TTTAA	2	10	75010	75019	40 %	60 %	0 %	0 %	385341049
46	NC_017514	GATTT	2	10	76923	76932	20 %	60 %	20 %	0 %	385341051
47	NC_017514	TGTAT	2	10	78325	78334	20 %	60 %	20 %	0 %	385341052
48	NC_017514	AAAAG	2	10	78509	78518	80 %	0 %	20 %	0 %	385341053
49	NC_017514	TTTGA	2	10	79132	79141	20 %	60 %	20 %	0 %	385341053
50	NC_017514	TGGCT	2	10	80065	80074	0 %	40 %	40 %	20 %	385341054
51	NC_017514	GCAAG	2	10	81347	81356	40 %	0 %	40 %	20 %	385341056
52	NC_017514	GCGCG	2	10	82406	82415	0 %	0 %	60 %	40 %	385341056
53	NC_017514	CAACG	2	10	83328	83337	40 %	0 %	20 %	40 %	385341056
54	NC_017514	GCACG	2	10	85898	85907	20 %	0 %	40 %	40 %	385341058
55	NC_017514	GTTGG	2	10	86408	86417	0 %	40 %	60 %	0 %	385341058
56	NC_017514	TTGAT	2	10	88745	88754	20 %	60 %	20 %	0 %	385341061
57	NC_017514	GTTTG	2	10	89142	89151	0 %	60 %	40 %	0 %	385341061
58	NC_017514	CCCGT	2	10	89682	89691	0 %	20 %	20 %	60 %	385341061
59	NC_017514	CCGTA	2	10	89919	89928	20 %	20 %	20 %	40 %	385341061
60	NC_017514	ACATC	2	10	90820	90829	40 %	20 %	0 %	40 %	385341062
61	NC_017514	CGCAA	2	10	92529	92538	40 %	0 %	20 %	40 %	385341063
62	NC_017514	CAAGC	2	10	92894	92903	40 %	0 %	20 %	40 %	385341063
63	NC_017514	AAAAC	2	10	97134	97143	80 %	0 %	0 %	20 %	385341067
64	NC_017514	TTTGA	2	10	99460	99469	20 %	60 %	20 %	0 %	385341068
65	NC_017514	AAACC	2	10	101184	101193	60 %	0 %	0 %	40 %	385341069
66	NC_017514	CAGGT	2	10	105379	105388	20 %	20 %	40 %	20 %	385341070
67	NC_017514	TTTGA	2	10	106089	106098	20 %	60 %	20 %	0 %	385341070
68	NC_017514	AATGA	2	10	106796	106805	60 %	20 %	20 %	0 %	385341071
69	NC_017514	GAACA	2	10	108681	108690	60 %	0 %	20 %	20 %	385341071
70	NC_017514	TCCGC	2	10	114695	114704	0 %	20 %	20 %	60 %	385341076
71	NC_017514	GCTGG	2	10	115215	115224	0 %	20 %	60 %	20 %	385341076
72	NC_017514	TGCCG	2	10	116136	116145	0 %	20 %	40 %	40 %	385341078
73	NC_017514	TGGCT	2	10	116822	116831	0 %	40 %	40 %	20 %	385341079
74	NC_017514	ACCGA	2	10	117613	117622	40 %	0 %	20 %	40 %	385341079
75	NC_017514	AGGCA	2	10	119376	119385	40 %	0 %	40 %	20 %	385341081
76	NC_017514	CGGCG	2	10	122854	122863	0 %	0 %	60 %	40 %	385341084
77	NC_017514	CGGGC	2	10	124786	124795	0 %	0 %	60 %	40 %	385341085
78	NC_017514	AGGAG	2	10	128656	128665	40 %	0 %	60 %	0 %	385341089
79	NC_017514	TCGAT	2	10	129331	129340	20 %	40 %	20 %	20 %	385341090
80	NC_017514	CGGGG	2	10	131129	131138	0 %	0 %	80 %	20 %	385341091
81	NC_017514	AATCC	2	10	133367	133376	40 %	20 %	0 %	40 %	385341093
82	NC_017514	CAGGA	2	10	133482	133491	40 %	0 %	40 %	20 %	385341093
83	NC_017514	AGGGC	2	10	134559	134568	20 %	0 %	60 %	20 %	385341094
84	NC_017514	TCCGT	2	10	136040	136049	0 %	40 %	20 %	40 %	385341095
85	NC_017514	TTTCC	2	10	137860	137869	0 %	60 %	0 %	40 %	385341096
86	NC_017514	CAAAA	2	10	138957	138966	80 %	0 %	0 %	20 %	385341097
87	NC_017514	CAAAC	2	10	141552	141561	60 %	0 %	0 %	40 %	385341101
88	NC_017514	TTTGC	2	10	142190	142199	0 %	60 %	20 %	20 %	385341102
89	NC_017514	CGGCG	2	10	142335	142344	0 %	0 %	60 %	40 %	385341102
90	NC_017514	GTTTT	2	10	142529	142538	0 %	80 %	20 %	0 %	385341102
91	NC_017514	CGATA	2	10	142610	142619	40 %	20 %	20 %	20 %	385341102
92	NC_017514	GGCAA	2	10	144201	144210	40 %	0 %	40 %	20 %	385341104
93	NC_017514	CAAAC	2	10	144606	144615	60 %	0 %	0 %	40 %	385341105
94	NC_017514	AGCAA	2	10	144620	144629	60 %	0 %	20 %	20 %	385341105
95	NC_017514	GGTAT	2	10	145513	145522	20 %	40 %	40 %	0 %	385341105
96	NC_017514	TGCCG	2	10	150778	150787	0 %	20 %	40 %	40 %	385341110
97	NC_017514	GGGCA	2	10	152555	152564	20 %	0 %	60 %	20 %	385341113
98	NC_017514	GTTCA	2	10	155729	155738	20 %	40 %	20 %	20 %	385341114
99	NC_017514	CCGCA	2	10	157509	157518	20 %	0 %	20 %	60 %	385341116
100	NC_017514	ACGGC	2	10	158705	158714	20 %	0 %	40 %	40 %	385341116
101	NC_017514	GTTAC	2	10	158723	158732	20 %	40 %	20 %	20 %	385341116
102	NC_017514	ATAGG	2	10	164640	164649	40 %	20 %	40 %	0 %	385341120
103	NC_017514	TGAAA	2	10	166285	166294	60 %	20 %	20 %	0 %	385341121
104	NC_017514	GGCGT	2	10	166777	166786	0 %	20 %	60 %	20 %	385341122
105	NC_017514	AGGCG	2	10	167844	167853	20 %	0 %	60 %	20 %	385341123
106	NC_017514	TGCGG	2	10	167970	167979	0 %	20 %	60 %	20 %	385341124
107	NC_017514	GGCGC	3	15	170267	170281	0 %	0 %	60 %	40 %	385341126
108	NC_017514	TGGCG	2	10	174340	174349	0 %	20 %	60 %	20 %	385341130
109	NC_017514	CGCGG	2	10	177627	177636	0 %	0 %	60 %	40 %	385341134
110	NC_017514	CCGCG	2	10	179289	179298	0 %	0 %	40 %	60 %	385341137
111	NC_017514	GTTTT	2	10	187384	187393	0 %	80 %	20 %	0 %	385341141
112	NC_017514	GGATT	2	10	189768	189777	20 %	40 %	40 %	0 %	385341144
113	NC_017514	TTTGT	2	10	190775	190784	0 %	80 %	20 %	0 %	385341145
114	NC_017514	GGTTG	2	10	192618	192627	0 %	40 %	60 %	0 %	385341146
115	NC_017514	CAACC	2	10	192671	192680	40 %	0 %	0 %	60 %	385341146
116	NC_017514	AAGTG	2	10	196223	196232	40 %	20 %	40 %	0 %	385341148
117	NC_017514	GCCGC	2	10	199335	199344	0 %	0 %	40 %	60 %	385341150
118	NC_017514	CGGCA	2	10	201898	201907	20 %	0 %	40 %	40 %	385341152
119	NC_017514	GCGCG	2	10	202968	202977	0 %	0 %	60 %	40 %	385341155
120	NC_017514	GGGCG	2	10	203549	203558	0 %	0 %	80 %	20 %	385341155
121	NC_017514	ACCGT	2	10	204128	204137	20 %	20 %	20 %	40 %	385341156
122	NC_017514	GCTTG	2	10	206770	206779	0 %	40 %	40 %	20 %	385341158
123	NC_017514	TGCGG	2	10	209347	209356	0 %	20 %	60 %	20 %	385341158
124	NC_017514	GCGCG	2	10	212265	212274	0 %	0 %	60 %	40 %	385341160
125	NC_017514	CGGCG	2	10	212968	212977	0 %	0 %	60 %	40 %	385341160
126	NC_017514	CCGCG	2	10	214599	214608	0 %	0 %	40 %	60 %	385341160
127	NC_017514	GCCGC	2	10	214811	214820	0 %	0 %	40 %	60 %	385341160
128	NC_017514	GTACG	2	10	223452	223461	20 %	20 %	40 %	20 %	385341167
129	NC_017514	CGGCG	2	10	226950	226959	0 %	0 %	60 %	40 %	385341168
130	NC_017514	TCATA	2	10	229043	229052	40 %	40 %	0 %	20 %	385341170
131	NC_017514	GCGCC	2	10	231191	231200	0 %	0 %	40 %	60 %	385341170
132	NC_017514	CCGGC	2	10	231701	231710	0 %	0 %	40 %	60 %	385341170
133	NC_017514	GTTTG	2	10	233374	233383	0 %	60 %	40 %	0 %	385341171
134	NC_017514	TGCGG	2	10	236972	236981	0 %	20 %	60 %	20 %	385341173
135	NC_017514	GGCGC	2	10	236986	236995	0 %	0 %	60 %	40 %	385341173
136	NC_017514	CCGCA	2	10	240787	240796	20 %	0 %	20 %	60 %	385341176
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170	NC_017514	GTTTG	2	10	300037	300046	0 %	60 %	40 %	0 %	385341234
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248	NC_017514	CGGTA	2	10	466971	466980	20 %	20 %	40 %	20 %	385341371
249	NC_017514	GACAG	2	10	467731	467740	40 %	0 %	40 %	20 %	385341371
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253	NC_017514	ACGGT	2	10	476174	476183	20 %	20 %	40 %	20 %	385341378
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262	NC_017514	AACCA	2	10	489254	489263	60 %	0 %	0 %	40 %	385341384
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384	NC_017514	CCGAT	2	10	715902	715911	20 %	20 %	20 %	40 %	385341566
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