MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis M01-240149 chromosome

Total Repeats: 39088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39001	NC_017514	CATCAA	2	12	2218285	2218296	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385342924
39002	NC_017514	ATC	2	6	2218305	2218310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385342924
39003	NC_017514	CGCC	2	8	2218486	2218493	0 %	0 %	25 %	75 %	385342925
39004	NC_017514	TG	3	6	2218585	2218590	0 %	50 %	50 %	0 %	385342925
39005	NC_017514	CGG	2	6	2218657	2218662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342925
39006	NC_017514	CAAA	2	8	2218663	2218670	75 %	0 %	0 %	25 %	385342925
39007	NC_017514	A	6	6	2218668	2218673	100 %	0 %	0 %	0 %	385342925
39008	NC_017514	GCG	2	6	2218779	2218784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342925
39009	NC_017514	CTG	2	6	2218790	2218795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342925
39010	NC_017514	TGA	2	6	2219019	2219024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385342925
39011	NC_017514	GCC	2	6	2219458	2219463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342926
39012	NC_017514	TCA	2	6	2219469	2219474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385342926
39013	NC_017514	GAA	2	6	2219528	2219533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385342926
39014	NC_017514	GGC	3	9	2219569	2219577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342926
39015	NC_017514	TCT	2	6	2219597	2219602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385342926
39016	NC_017514	GGC	2	6	2219725	2219730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342926
39017	NC_017514	GCG	3	9	2219759	2219767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342926
39018	NC_017514	GCG	2	6	2219773	2219778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342926
39019	NC_017514	TGCGG	2	10	2219790	2219799	0 %	20 %	60 %	20 %	385342926
39020	NC_017514	TGG	2	6	2219838	2219843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385342926
39021	NC_017514	TCA	2	6	2219844	2219849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385342926
39022	NC_017514	GCC	2	6	2219885	2219890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342926
39023	NC_017514	TGG	2	6	2219907	2219912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385342926
39024	NC_017514	AGC	2	6	2219920	2219925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342926
39025	NC_017514	ACG	2	6	2219975	2219980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342926
39026	NC_017514	CAT	2	6	2219988	2219993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385342926
39027	NC_017514	GCC	2	6	2219995	2220000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342926
39028	NC_017514	GC	4	8	2220022	2220029	0 %	0 %	50 %	50 %	385342926
39029	NC_017514	TG	3	6	2220039	2220044	0 %	50 %	50 %	0 %	385342926
39030	NC_017514	AAG	2	6	2220068	2220073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385342926
39031	NC_017514	GAC	2	6	2220088	2220093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342926
39032	NC_017514	TTC	2	6	2220121	2220126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385342926
39033	NC_017514	GCA	3	9	2220240	2220248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342926
39034	NC_017514	CGA	2	6	2220276	2220281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342926
39035	NC_017514	GGC	2	6	2220321	2220326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342926
39036	NC_017514	CCG	2	6	2220818	2220823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39037	NC_017514	ATG	2	6	2220832	2220837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385342927
39038	NC_017514	CGA	2	6	2220918	2220923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342927
39039	NC_017514	CG	3	6	2220965	2220970	0 %	0 %	50 %	50 %	385342927
39040	NC_017514	CGC	2	6	2221017	2221022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39041	NC_017514	GC	3	6	2221036	2221041	0 %	0 %	50 %	50 %	385342927
39042	NC_017514	AACC	2	8	2221182	2221189	50 %	0 %	0 %	50 %	385342927
39043	NC_017514	A	6	6	2221213	2221218	100 %	0 %	0 %	0 %	385342927
39044	NC_017514	GCG	2	6	2221250	2221255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342927
39045	NC_017514	GAC	2	6	2221291	2221296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342927
39046	NC_017514	GC	3	6	2221303	2221308	0 %	0 %	50 %	50 %	385342927
39047	NC_017514	GGC	2	6	2221314	2221319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342927
39048	NC_017514	GCC	2	6	2221402	2221407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39049	NC_017514	CTG	2	6	2221423	2221428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342927
39050	NC_017514	AT	3	6	2221590	2221595	50 %	50 %	0 %	0 %	385342927
39051	NC_017514	TGC	2	6	2221605	2221610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342927
39052	NC_017514	CGC	2	6	2221615	2221620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39053	NC_017514	A	6	6	2221651	2221656	100 %	0 %	0 %	0 %	385342927
39054	NC_017514	GCC	2	6	2221706	2221711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39055	NC_017514	CT	3	6	2221718	2221723	0 %	50 %	0 %	50 %	385342927
39056	NC_017514	CAC	2	6	2221729	2221734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385342927
39057	NC_017514	GC	3	6	2221762	2221767	0 %	0 %	50 %	50 %	385342927
39058	NC_017514	AAG	2	6	2221769	2221774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385342927
39059	NC_017514	TGC	2	6	2221848	2221853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342927
39060	NC_017514	CGCC	2	8	2221872	2221879	0 %	0 %	25 %	75 %	385342927
39061	NC_017514	CG	3	6	2221880	2221885	0 %	0 %	50 %	50 %	385342927
39062	NC_017514	GCA	2	6	2221946	2221951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342927
39063	NC_017514	TCA	2	6	2222060	2222065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385342927
39064	NC_017514	CGA	2	6	2222118	2222123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342927
39065	NC_017514	TCA	2	6	2222291	2222296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385342927
39066	NC_017514	AAC	2	6	2222363	2222368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385342927
39067	NC_017514	GCC	2	6	2222422	2222427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39068	NC_017514	GCC	3	9	2222431	2222439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39069	NC_017514	GCC	2	6	2222537	2222542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39070	NC_017514	CAG	2	6	2222557	2222562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342927
39071	NC_017514	TGC	2	6	2222615	2222620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342927
39072	NC_017514	GGC	2	6	2222638	2222643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342927
39073	NC_017514	CA	3	6	2222687	2222692	50 %	0 %	0 %	50 %	385342927
39074	NC_017514	TGCC	2	8	2222705	2222712	0 %	25 %	25 %	50 %	385342927
39075	NC_017514	GCC	2	6	2222716	2222721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39076	NC_017514	GAC	2	6	2222767	2222772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342927
39077	NC_017514	CCTCGC	2	12	2222898	2222909	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385342927
39078	NC_017514	CTG	2	6	2222929	2222934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342927
39079	NC_017514	A	7	7	2222936	2222942	100 %	0 %	0 %	0 %	385342927
39080	NC_017514	CCAC	2	8	2222963	2222970	25 %	0 %	0 %	75 %	385342927
39081	NC_017514	ACCT	2	8	2222983	2222990	25 %	25 %	0 %	50 %	385342927
39082	NC_017514	CGC	3	9	2223003	2223011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39083	NC_017514	GGACA	2	10	2223043	2223052	40 %	0 %	40 %	20 %	385342927
39084	NC_017514	CCG	2	6	2223083	2223088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39085	NC_017514	GCCT	2	8	2223125	2223132	0 %	25 %	25 %	50 %	385342927
39086	NC_017514	GAAC	2	8	2223165	2223172	50 %	0 %	25 %	25 %	385342927
39087	NC_017514	GCC	2	6	2223184	2223189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342927
39088	NC_017514	GCA	2	6	2223304	2223309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342927

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.