MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis M01-240149 chromosome

Total Repeats: 39088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017514	GCT	2	6	288896	288901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341223
5002	NC_017514	GAA	2	6	288948	288953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385341223
5003	NC_017514	CGC	2	6	288956	288961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341223
5004	NC_017514	CTGC	2	8	288969	288976	0 %	25 %	25 %	50 %	385341223
5005	NC_017514	ACGC	2	8	289021	289028	25 %	0 %	25 %	50 %	385341223
5006	NC_017514	CGC	2	6	289151	289156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341223
5007	NC_017514	CCG	2	6	289287	289292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341224
5008	NC_017514	GGCG	2	8	289440	289447	0 %	0 %	75 %	25 %	385341224
5009	NC_017514	GCG	2	6	289457	289462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341224
5010	NC_017514	A	6	6	289516	289521	100 %	0 %	0 %	0 %	385341224
5011	NC_017514	TGGC	2	8	289534	289541	0 %	25 %	50 %	25 %	385341224
5012	NC_017514	ATG	2	6	289668	289673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341225
5013	NC_017514	GAA	2	6	289704	289709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385341225
5014	NC_017514	AAT	2	6	289728	289733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385341225
5015	NC_017514	GCC	3	9	289749	289757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5016	NC_017514	CGC	2	6	289822	289827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5017	NC_017514	A	6	6	289876	289881	100 %	0 %	0 %	0 %	385341225
5018	NC_017514	A	6	6	289887	289892	100 %	0 %	0 %	0 %	385341225
5019	NC_017514	ACG	2	6	289996	290001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341225
5020	NC_017514	ATCA	2	8	290073	290080	50 %	25 %	0 %	25 %	385341225
5021	NC_017514	GCA	3	9	290122	290130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341225
5022	NC_017514	TGC	2	6	290167	290172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341225
5023	NC_017514	CGG	2	6	290174	290179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341225
5024	NC_017514	AGC	2	6	290214	290219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341225
5025	NC_017514	CTT	2	6	290240	290245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385341225
5026	NC_017514	GTC	2	6	290313	290318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341225
5027	NC_017514	GC	3	6	290370	290375	0 %	0 %	50 %	50 %	385341225
5028	NC_017514	GCC	2	6	290394	290399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5029	NC_017514	GTT	2	6	290445	290450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385341225
5030	NC_017514	GCA	2	6	290513	290518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341225
5031	NC_017514	GCT	2	6	290537	290542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341225
5032	NC_017514	TGA	2	6	290560	290565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341225
5033	NC_017514	CTG	2	6	290574	290579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341225
5034	NC_017514	CAT	2	6	290612	290617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341225
5035	NC_017514	AACG	2	8	290625	290632	50 %	0 %	25 %	25 %	385341225
5036	NC_017514	GC	5	10	290639	290648	0 %	0 %	50 %	50 %	385341225
5037	NC_017514	TTC	2	6	290664	290669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385341225
5038	NC_017514	ACAA	2	8	290671	290678	75 %	0 %	0 %	25 %	385341225
5039	NC_017514	GCC	2	6	290701	290706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5040	NC_017514	CAA	2	6	290735	290740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385341225
5041	NC_017514	GCC	2	6	290784	290789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5042	NC_017514	GCC	4	12	290817	290828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5043	NC_017514	CGCGC	2	10	290832	290841	0 %	0 %	40 %	60 %	385341225
5044	NC_017514	GAA	2	6	290940	290945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385341225
5045	NC_017514	CCG	2	6	291019	291024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5046	NC_017514	GCGCC	2	10	291110	291119	0 %	0 %	40 %	60 %	385341225
5047	NC_017514	GAAC	2	8	291164	291171	50 %	0 %	25 %	25 %	385341225
5048	NC_017514	A	6	6	291217	291222	100 %	0 %	0 %	0 %	385341225
5049	NC_017514	CCG	2	6	291235	291240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5050	NC_017514	GC	3	6	291252	291257	0 %	0 %	50 %	50 %	385341225
5051	NC_017514	TGC	2	6	291268	291273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341225
5052	NC_017514	GCC	2	6	291300	291305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5053	NC_017514	GAC	2	6	291333	291338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341225
5054	NC_017514	AAC	2	6	291373	291378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385341225
5055	NC_017514	GCC	2	6	291387	291392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5056	NC_017514	CGC	3	9	291398	291406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5057	NC_017514	CAA	2	6	291407	291412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385341225
5058	NC_017514	CTG	2	6	291426	291431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341225
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5060	NC_017514	CTG	2	6	291471	291476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341225
5061	NC_017514	GAA	2	6	291486	291491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385341225
5062	NC_017514	GCC	2	6	291504	291509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5063	NC_017514	CGC	3	9	291533	291541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5064	NC_017514	CTT	2	6	291608	291613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385341225
5065	NC_017514	GTGATG	2	12	291621	291632	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385341225
5066	NC_017514	GCC	2	6	291642	291647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341225
5067	NC_017514	AAAAC	2	10	291650	291659	80 %	0 %	0 %	20 %	385341225
5068	NC_017514	GCAGA	2	10	291684	291693	40 %	0 %	40 %	20 %	385341225
5069	NC_017514	GCC	2	6	291862	291867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341226
5070	NC_017514	TTGCCA	2	12	291935	291946	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385341226
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5073	NC_017514	GAC	2	6	292182	292187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341227
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5075	NC_017514	TTGCG	2	10	292205	292214	0 %	40 %	40 %	20 %	385341227
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5081	NC_017514	A	6	6	292579	292584	100 %	0 %	0 %	0 %	385341227
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5091	NC_017514	G	8	8	293402	293409	0 %	0 %	100 %	0 %	385341228
5092	NC_017514	AT	3	6	293411	293416	50 %	50 %	0 %	0 %	385341228
5093	NC_017514	GCAC	2	8	293418	293425	25 %	0 %	25 %	50 %	385341228
5094	NC_017514	CGA	2	6	293432	293437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341228
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5102	NC_017514	ACA	2	6	293695	293700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385341228
5103	NC_017514	GGCT	2	8	293758	293765	0 %	25 %	50 %	25 %	385341228
5104	NC_017514	TAT	2	6	293766	293771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385341228
5105	NC_017514	A	6	6	293860	293865	100 %	0 %	0 %	0 %	385341228
5106	NC_017514	T	6	6	293879	293884	0 %	100 %	0 %	0 %	385341228
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5109	NC_017514	ACGG	2	8	294023	294030	25 %	0 %	50 %	25 %	385341228
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5112	NC_017514	AGCTT	2	10	294203	294212	20 %	40 %	20 %	20 %	385341229
5113	NC_017514	CCG	2	6	294213	294218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341229
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5120	NC_017514	ATG	2	6	294734	294739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341229
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5364	NC_017514	CGG	2	6	309304	309309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341242
5365	NC_017514	GC	3	6	309365	309370	0 %	0 %	50 %	50 %	385341242
5366	NC_017514	GTC	2	6	309410	309415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341242
5367	NC_017514	GAT	2	6	309531	309536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341243
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5370	NC_017514	TCT	2	6	309894	309899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385341244
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5373	NC_017514	AAT	2	6	309980	309985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385341244
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5377	NC_017514	TGT	2	6	310093	310098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385341244
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5381	NC_017514	AAT	2	6	310299	310304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385341245
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5399	NC_017514	CG	3	6	311079	311084	0 %	0 %	50 %	50 %	385341246
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5403	NC_017514	CTT	2	6	311331	311336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385341246
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5456	NC_017514	TGAG	2	8	313902	313909	25 %	25 %	50 %	0 %	385341251
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5460	NC_017514	GC	5	10	314039	314048	0 %	0 %	50 %	50 %	385341251
5461	NC_017514	GAAC	2	8	314104	314111	50 %	0 %	25 %	25 %	385341251
5462	NC_017514	AC	3	6	314110	314115	50 %	0 %	0 %	50 %	385341251
5463	NC_017514	AAG	2	6	314154	314159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385341251
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5466	NC_017514	A	7	7	314352	314358	100 %	0 %	0 %	0 %	385341251
5467	NC_017514	CAG	2	6	314402	314407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341251
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5471	NC_017514	A	6	6	314588	314593	100 %	0 %	0 %	0 %	385341251
5472	NC_017514	CGA	2	6	314598	314603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341251
5473	NC_017514	GTT	2	6	314733	314738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385341252
5474	NC_017514	TGC	2	6	314745	314750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341252
5475	NC_017514	AGG	2	6	314780	314785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385341252
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5477	NC_017514	ACC	2	6	314792	314797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385341252
5478	NC_017514	GAA	4	12	314821	314832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385341252
5479	NC_017514	TCA	2	6	314862	314867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341252
5480	NC_017514	GTCG	2	8	314884	314891	0 %	25 %	50 %	25 %	385341252
5481	NC_017514	GCG	2	6	314892	314897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341252
5482	NC_017514	GCC	2	6	314927	314932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341252
5483	NC_017514	ATG	2	6	314936	314941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341252
5484	NC_017514	GTA	2	6	314950	314955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341252
5485	NC_017514	AGGC	2	8	315070	315077	25 %	0 %	50 %	25 %	385341252
5486	NC_017514	GCC	2	6	315079	315084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341252
5487	NC_017514	CAT	2	6	315118	315123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341252
5488	NC_017514	TTG	2	6	315127	315132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385341252
5489	NC_017514	GTC	2	6	315145	315150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341252
5490	NC_017514	GCG	2	6	315185	315190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341252
5491	NC_017514	GAT	2	6	315253	315258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341252
5492	NC_017514	GAT	2	6	315292	315297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341252
5493	NC_017514	G	6	6	315327	315332	0 %	0 %	100 %	0 %	385341252
5494	NC_017514	ACGCTG	2	12	315476	315487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385341252
5495	NC_017514	GCG	2	6	315508	315513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341252
5496	NC_017514	GCG	2	6	315539	315544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341252
5497	NC_017514	GGA	2	6	315570	315575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385341252
5498	NC_017514	GTG	2	6	315592	315597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385341252
5499	NC_017514	AGCC	2	8	315611	315618	25 %	0 %	25 %	50 %	385341252
5500	NC_017514	TCG	2	6	315668	315673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341252

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