MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 plasmid pNGTCDC08107

Total Repeats: 449

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017510	ATC	2	6	127	132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334850
2	NC_017510	GCG	2	6	191	196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334850
3	NC_017510	ATC	2	6	207	212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334850
4	NC_017510	TGT	2	6	319	324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334850
5	NC_017510	GAA	2	6	446	451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334850
6	NC_017510	GGA	2	6	508	513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
7	NC_017510	CAT	2	6	671	676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334850
8	NC_017510	AGG	2	6	837	842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
9	NC_017510	GGC	2	6	864	869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334850
10	NC_017510	CGC	2	6	941	946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334850
11	NC_017510	AGC	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334850
12	NC_017510	CCG	2	6	1051	1056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334850
13	NC_017510	TGC	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334850
14	NC_017510	AGG	2	6	1157	1162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
15	NC_017510	CGG	2	6	1393	1398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334850
16	NC_017510	GCC	2	6	1433	1438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334850
17	NC_017510	GCA	2	6	1582	1587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334850
18	NC_017510	GAG	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
19	NC_017510	AGG	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
20	NC_017510	AGC	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334850
21	NC_017510	AGG	2	6	1903	1908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
22	NC_017510	CCG	2	6	1970	1975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334850
23	NC_017510	GTA	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334850
24	NC_017510	TGT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334850
25	NC_017510	GCA	2	6	2419	2424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334851
26	NC_017510	CAA	2	6	2435	2440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334851
27	NC_017510	AGC	2	6	2656	2661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334851
28	NC_017510	CAT	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334851
29	NC_017510	TGG	2	6	2692	2697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334851
30	NC_017510	GAA	2	6	2741	2746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334851
31	NC_017510	GGC	2	6	2810	2815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334851
32	NC_017510	CTG	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334851
33	NC_017510	GAA	2	6	3053	3058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334851
34	NC_017510	CAA	2	6	3068	3073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334851
35	NC_017510	GAT	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334851
36	NC_017510	TCT	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334851
37	NC_017510	AGG	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334851
38	NC_017510	CGC	2	6	3518	3523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334851
39	NC_017510	TGA	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334851
40	NC_017510	ACG	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334851
41	NC_017510	CAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334851
42	NC_017510	CGG	2	6	3934	3939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334851
43	NC_017510	CGA	2	6	4073	4078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334851
44	NC_017510	GGC	2	6	4177	4182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334851
45	NC_017510	CCG	2	6	4341	4346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334852
46	NC_017510	AAG	2	6	4507	4512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334852
47	NC_017510	ATT	2	6	4548	4553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334852
48	NC_017510	TGA	2	6	4560	4565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334852
49	NC_017510	TTG	2	6	4569	4574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334852
50	NC_017510	GTT	2	6	4615	4620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334852
51	NC_017510	GGC	2	6	4640	4645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334852
52	NC_017510	TTA	2	6	4768	4773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334852
53	NC_017510	GCC	2	6	4885	4890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334853
54	NC_017510	ACA	2	6	4946	4951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334853
55	NC_017510	GTT	2	6	5166	5171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334853
56	NC_017510	AGA	2	6	5274	5279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334853
57	NC_017510	CGG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334853
58	NC_017510	ACA	2	6	5348	5353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334853
59	NC_017510	GTG	2	6	5443	5448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334853
60	NC_017510	ATT	2	6	5486	5491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334853
61	NC_017510	AGC	2	6	5622	5627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
62	NC_017510	CCG	2	6	5683	5688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334853
63	NC_017510	GAT	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334853
64	NC_017510	ATT	2	6	5974	5979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334853
65	NC_017510	GAC	2	6	6004	6009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
66	NC_017510	CTG	2	6	6037	6042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334853
67	NC_017510	GCA	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
68	NC_017510	CAG	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
69	NC_017510	CTG	2	6	6388	6393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334853
70	NC_017510	CGG	2	6	6426	6431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334853
71	NC_017510	CTG	2	6	6472	6477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334853
72	NC_017510	CTG	2	6	6490	6495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334853
73	NC_017510	AGC	2	6	6596	6601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
74	NC_017510	AAG	2	6	6715	6720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334853
75	NC_017510	CGT	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334853
76	NC_017510	GCA	2	6	6953	6958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
77	NC_017510	CGG	3	9	7313	7321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334854
78	NC_017510	GCC	2	6	7357	7362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334854
79	NC_017510	CAT	2	6	7438	7443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334854
80	NC_017510	TGT	2	6	7481	7486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334854
81	NC_017510	GGT	2	6	7610	7615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334854
82	NC_017510	GCC	2	6	7643	7648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334854
83	NC_017510	ACC	2	6	7726	7731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334854
84	NC_017510	TAT	2	6	7815	7820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334854
85	NC_017510	GGA	2	6	7916	7921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334854
86	NC_017510	CAG	2	6	8118	8123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334854
87	NC_017510	GGC	2	6	8129	8134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334854
88	NC_017510	TGA	2	6	8162	8167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334854
89	NC_017510	GAA	2	6	8181	8186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
90	NC_017510	ATG	2	6	8215	8220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334854
91	NC_017510	GGC	2	6	8222	8227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334854
92	NC_017510	ATC	2	6	8229	8234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334854
93	NC_017510	GAA	2	6	8436	8441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
94	NC_017510	AGG	2	6	8569	8574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334854
95	NC_017510	CCA	2	6	8638	8643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334854
96	NC_017510	AGA	2	6	8837	8842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
97	NC_017510	CTC	2	6	8860	8865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385334854
98	NC_017510	GAA	2	6	8868	8873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
99	NC_017510	AGA	2	6	8927	8932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
100	NC_017510	AGA	2	6	8942	8947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
101	NC_017510	GAA	2	6	8982	8987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
102	NC_017510	AGA	2	6	8990	8995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
103	NC_017510	CAA	2	6	9029	9034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334854
104	NC_017510	AAC	2	6	9300	9305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334854
105	NC_017510	GGA	2	6	9356	9361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334854
106	NC_017510	GCC	2	6	9375	9380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334854
107	NC_017510	GCT	2	6	9435	9440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334854
108	NC_017510	AGG	2	6	9655	9660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334854
109	NC_017510	ATT	2	6	9708	9713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334854
110	NC_017510	GCC	2	6	9735	9740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334854
111	NC_017510	AAG	2	6	9748	9753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
112	NC_017510	CGA	2	6	9758	9763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334854
113	NC_017510	TGG	2	6	9808	9813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334854
114	NC_017510	GAT	2	6	9867	9872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334854
115	NC_017510	CAA	2	6	9896	9901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334854
116	NC_017510	GGC	2	6	9926	9931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334854
117	NC_017510	GTC	2	6	9983	9988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334854
118	NC_017510	GAA	2	6	10131	10136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
119	NC_017510	GCA	2	6	10172	10177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334854
120	NC_017510	CAA	2	6	10183	10188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334854
121	NC_017510	GCC	2	6	10329	10334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334855
122	NC_017510	ATT	2	6	10407	10412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334855
123	NC_017510	GCC	2	6	10481	10486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334855
124	NC_017510	ATC	2	6	10518	10523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334855
125	NC_017510	TCG	2	6	10725	10730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334856
126	NC_017510	GGC	2	6	10777	10782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334856
127	NC_017510	GAT	2	6	10941	10946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334856
128	NC_017510	TGG	2	6	10955	10960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334856
129	NC_017510	CTG	2	6	11002	11007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334856
130	NC_017510	CAG	3	9	11014	11022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334856
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255	NC_017510	CTG	2	6	21654	21659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334871
256	NC_017510	TGC	2	6	21752	21757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334871
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258	NC_017510	CTG	2	6	21820	21825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334871
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378	NC_017510	GAA	2	6	31189	31194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334882
379	NC_017510	TCA	2	6	31282	31287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334883
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381	NC_017510	GAA	2	6	31391	31396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334883
382	NC_017510	AAC	2	6	31509	31514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334883
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385	NC_017510	TCA	2	6	31608	31613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334883
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391	NC_017510	TTA	2	6	32050	32055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334884
392	NC_017510	TAT	2	6	32085	32090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334884
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402	NC_017510	GGC	2	6	34224	34229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334887
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