MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 40668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015731	CAA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481523
2	NC_015731	GTC	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481523
3	NC_015731	TAC	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481523
4	NC_015731	CGA	2	6	733	738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481523
5	NC_015731	TCA	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481523
6	NC_015731	GAA	2	6	866	871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481523
7	NC_015731	AAG	2	6	1110	1115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481523
8	NC_015731	GCC	2	6	1143	1148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481523
9	NC_015731	ATT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481523
10	NC_015731	TCG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481523
11	NC_015731	GCG	2	6	1694	1699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481524
12	NC_015731	GAA	2	6	1743	1748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481524
13	NC_015731	GCA	2	6	1968	1973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481524
14	NC_015731	GTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481524
15	NC_015731	GAA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481524
16	NC_015731	CAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481524
17	NC_015731	TAT	2	6	2110	2115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481524
18	NC_015731	AGA	2	6	2264	2269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481524
19	NC_015731	ATT	2	6	2514	2519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481524
20	NC_015731	GAA	2	6	2538	2543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481524
21	NC_015731	GAA	3	9	2547	2555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481524
22	NC_015731	TGA	2	6	2573	2578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481524
23	NC_015731	AGC	2	6	2634	2639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481524
24	NC_015731	TGA	2	6	2822	2827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
25	NC_015731	GAT	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
26	NC_015731	GAT	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
27	NC_015731	CTG	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481525
28	NC_015731	TGA	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
29	NC_015731	CGG	2	6	3162	3167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481525
30	NC_015731	CGA	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481525
31	NC_015731	CGG	2	6	3198	3203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481525
32	NC_015731	GGT	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481525
33	NC_015731	CCG	2	6	3264	3269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481525
34	NC_015731	CAA	2	6	3450	3455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481525
35	NC_015731	CGG	2	6	3516	3521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481525
36	NC_015731	TTG	2	6	3533	3538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481525
37	NC_015731	GCA	2	6	3551	3556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481525
38	NC_015731	ACA	2	6	3602	3607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481525
39	NC_015731	CAA	2	6	3669	3674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481525
40	NC_015731	TGC	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481525
41	NC_015731	AAC	2	6	3739	3744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481525
42	NC_015731	TCC	2	6	3883	3888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339481525
43	NC_015731	GGT	2	6	3900	3905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481525
44	NC_015731	GAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481525
45	NC_015731	GCC	2	6	3991	3996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481525
46	NC_015731	GCG	2	6	4009	4014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481525
47	NC_015731	CAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481525
48	NC_015731	TCC	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339481525
49	NC_015731	ATT	2	6	4258	4263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481525
50	NC_015731	CAT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481525
51	NC_015731	CTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481525
52	NC_015731	ACA	2	6	4518	4523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481525
53	NC_015731	GAA	2	6	4567	4572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481525
54	NC_015731	GCC	2	6	4575	4580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481525
55	NC_015731	CTG	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481525
56	NC_015731	AGC	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481525
57	NC_015731	TCG	2	6	4775	4780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481525
58	NC_015731	ATG	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
59	NC_015731	GCG	2	6	4880	4885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481525
60	NC_015731	GAA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481525
61	NC_015731	ACC	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481525
62	NC_015731	CCG	2	6	5106	5111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481525
63	NC_015731	CTG	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481525
64	NC_015731	TGA	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
65	NC_015731	TAC	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481525
66	NC_015731	GAA	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481525
67	NC_015731	CGA	2	6	5225	5230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481525
68	NC_015731	GCT	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
69	NC_015731	GCA	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
70	NC_015731	GGC	2	6	5440	5445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481526
71	NC_015731	AGC	2	6	5511	5516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
72	NC_015731	GCC	3	9	5627	5635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481526
73	NC_015731	CGA	2	6	5865	5870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
74	NC_015731	AGG	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339481526
75	NC_015731	GAT	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481526
76	NC_015731	TCG	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
77	NC_015731	TTG	2	6	6233	6238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481526
78	NC_015731	GCG	2	6	6249	6254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481526
79	NC_015731	CTG	2	6	6316	6321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
80	NC_015731	CGT	2	6	6323	6328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
81	NC_015731	GAT	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481526
82	NC_015731	CCG	2	6	6455	6460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481526
83	NC_015731	CAT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481526
84	NC_015731	GGC	2	6	6561	6566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481526
85	NC_015731	CTG	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
86	NC_015731	ATC	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481526
87	NC_015731	AGC	2	6	6800	6805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
88	NC_015731	AGC	2	6	6852	6857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
89	NC_015731	TGA	2	6	6890	6895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481526
90	NC_015731	TCA	2	6	6947	6952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481526
91	NC_015731	GCA	2	6	7055	7060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
92	NC_015731	CTG	2	6	7087	7092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
93	NC_015731	CGA	2	6	7134	7139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
94	NC_015731	GCG	2	6	7176	7181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481526
95	NC_015731	CGA	2	6	7434	7439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
96	NC_015731	CCA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481526
97	NC_015731	CCG	2	6	7524	7529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481526
98	NC_015731	CGC	2	6	7611	7616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481526
99	NC_015731	TGG	2	6	7745	7750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481526
100	NC_015731	AGA	2	6	7785	7790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481526
101	NC_015731	GCT	3	9	7803	7811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
102	NC_015731	GCT	2	6	7896	7901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
103	NC_015731	CAG	3	9	8200	8208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
104	NC_015731	GAA	2	6	8288	8293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481527
105	NC_015731	CCA	2	6	8325	8330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481527
106	NC_015731	CTG	2	6	8350	8355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481527
107	NC_015731	CAG	2	6	8361	8366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481527
108	NC_015731	GCT	2	6	8411	8416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481527
109	NC_015731	CCA	2	6	8424	8429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481527
110	NC_015731	AAG	2	6	8431	8436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481527
111	NC_015731	CGA	2	6	8453	8458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481527
112	NC_015731	TAC	2	6	8487	8492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481527
113	NC_015731	TGA	2	6	8533	8538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481527
114	NC_015731	AAG	2	6	8733	8738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481527
115	NC_015731	TTC	2	6	8740	8745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481527
116	NC_015731	ACT	2	6	8750	8755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481527
117	NC_015731	GAC	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481527
118	NC_015731	CGA	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481527
119	NC_015731	TAC	2	6	8802	8807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481527
120	NC_015731	AGC	2	6	9009	9014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481527
121	NC_015731	CAA	2	6	9026	9031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481527
122	NC_015731	TGA	2	6	9053	9058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481527
123	NC_015731	CTT	2	6	9068	9073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481527
124	NC_015731	CTG	2	6	9094	9099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481527
125	NC_015731	CAT	2	6	9173	9178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481527
126	NC_015731	ATC	2	6	9322	9327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481527
127	NC_015731	GCG	2	6	9438	9443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481527
128	NC_015731	CGC	2	6	9488	9493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481527
129	NC_015731	CGT	2	6	9515	9520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481527
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131	NC_015731	CGA	2	6	9730	9735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481527
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134	NC_015731	ATC	2	6	9774	9779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481527
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253	NC_015731	GGA	2	6	18432	18437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339481534
254	NC_015731	GCG	2	6	18458	18463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481534
255	NC_015731	TCA	2	6	18506	18511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481534
256	NC_015731	CGC	2	6	18629	18634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481534
257	NC_015731	CAG	2	6	18792	18797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481534
258	NC_015731	CGC	2	6	18815	18820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481534
259	NC_015731	TTC	2	6	18855	18860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481534
260	NC_015731	TAA	2	6	18882	18887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481534
261	NC_015731	GAC	2	6	18914	18919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481534
262	NC_015731	CCA	2	6	18995	19000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481534
263	NC_015731	AGT	2	6	19041	19046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481534
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265	NC_015731	CTT	2	6	19100	19105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481534
266	NC_015731	ATC	2	6	19186	19191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481534
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269	NC_015731	TGA	2	6	19328	19333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481534
270	NC_015731	AAC	2	6	19342	19347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481534
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273	NC_015731	CCA	2	6	19625	19630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481534
274	NC_015731	CGC	2	6	19652	19657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481534
275	NC_015731	CGA	2	6	19682	19687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481534
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278	NC_015731	AAT	2	6	20278	20283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481535
279	NC_015731	ATG	2	6	20308	20313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481535
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281	NC_015731	GGC	2	6	20425	20430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481535
282	NC_015731	ATG	2	6	20456	20461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481535
283	NC_015731	GGT	2	6	20575	20580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481535
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285	NC_015731	CGC	2	6	20645	20650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481535
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369	NC_015731	GGC	2	6	27595	27600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481545
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373	NC_015731	AGC	2	6	27939	27944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481545
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375	NC_015731	TTC	2	6	28157	28162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481546
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