MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 61714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015731	AGC	2	6	226046	226051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4002	NC_015731	CCAAT	2	10	226053	226062	40 %	20 %	0 %	40 %	339481716
4003	NC_015731	GAA	2	6	226123	226128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481716
4004	NC_015731	AG	3	6	226156	226161	50 %	0 %	50 %	0 %	339481716
4005	NC_015731	GCGA	2	8	226166	226173	25 %	0 %	50 %	25 %	339481716
4006	NC_015731	GCT	2	6	226291	226296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4007	NC_015731	A	6	6	226324	226329	100 %	0 %	0 %	0 %	339481716
4008	NC_015731	ACC	2	6	226431	226436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481716
4009	NC_015731	AGCG	2	8	226579	226586	25 %	0 %	50 %	25 %	339481716
4010	NC_015731	TGC	2	6	226608	226613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4011	NC_015731	GGCG	2	8	226614	226621	0 %	0 %	75 %	25 %	339481716
4012	NC_015731	TGT	2	6	226630	226635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481716
4013	NC_015731	CCG	2	6	226655	226660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481716
4014	NC_015731	CCAG	2	8	226715	226722	25 %	0 %	25 %	50 %	339481716
4015	NC_015731	ACC	2	6	226742	226747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481716
4016	NC_015731	CCG	2	6	226861	226866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481716
4017	NC_015731	GTG	2	6	226919	226924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481716
4018	NC_015731	ATG	2	6	226925	226930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481716
4019	NC_015731	GT	3	6	226947	226952	0 %	50 %	50 %	0 %	339481716
4020	NC_015731	TGG	2	6	227007	227012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481716
4021	NC_015731	GTC	2	6	227032	227037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4022	NC_015731	AGC	2	6	227053	227058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4023	NC_015731	ATC	3	9	227060	227068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481716
4024	NC_015731	GAT	2	6	227074	227079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481716
4025	NC_015731	CAG	2	6	227080	227085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4026	NC_015731	GCC	2	6	227086	227091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481716
4027	NC_015731	CAG	3	9	227092	227100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4028	NC_015731	GGC	2	6	227128	227133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481716
4029	NC_015731	AGC	2	6	227254	227259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4030	NC_015731	TCG	2	6	227292	227297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4031	NC_015731	CT	3	6	227307	227312	0 %	50 %	0 %	50 %	339481717
4032	NC_015731	CAG	2	6	227330	227335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4033	NC_015731	GTT	2	6	227346	227351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481717
4034	NC_015731	CGT	2	6	227434	227439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4035	NC_015731	CGC	2	6	227459	227464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481717
4036	NC_015731	CG	3	6	227662	227667	0 %	0 %	50 %	50 %	339481717
4037	NC_015731	CAG	2	6	227684	227689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4038	NC_015731	ATG	2	6	227732	227737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481717
4039	NC_015731	GCTGCG	2	12	227757	227768	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339481717
4040	NC_015731	CCG	2	6	227772	227777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481717
4041	NC_015731	CCGG	2	8	227852	227859	0 %	0 %	50 %	50 %	339481717
4042	NC_015731	ATG	2	6	227895	227900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481717
4043	NC_015731	GAT	2	6	227908	227913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481717
4044	NC_015731	GGC	2	6	227990	227995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481717
4045	NC_015731	TGG	2	6	228058	228063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481717
4046	NC_015731	CAT	2	6	228130	228135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481717
4047	NC_015731	GCC	2	6	228175	228180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481717
4048	NC_015731	CGC	2	6	228246	228251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481717
4049	NC_015731	CCA	2	6	228376	228381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481717
4050	NC_015731	GC	3	6	228450	228455	0 %	0 %	50 %	50 %	339481717
4051	NC_015731	ATGGCC	2	12	228540	228551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4052	NC_015731	ACT	2	6	228591	228596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481717
4053	NC_015731	CAA	2	6	228754	228759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481717
4054	NC_015731	CAG	2	6	228836	228841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4055	NC_015731	T	7	7	228845	228851	0 %	100 %	0 %	0 %	339481717
4056	NC_015731	CAG	2	6	228869	228874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4057	NC_015731	GCTG	2	8	228940	228947	0 %	25 %	50 %	25 %	339481717
4058	NC_015731	CG	4	8	228961	228968	0 %	0 %	50 %	50 %	339481717
4059	NC_015731	CCGCTG	2	12	228999	229010	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339481717
4060	NC_015731	TACG	2	8	229035	229042	25 %	25 %	25 %	25 %	339481717
4061	NC_015731	GGT	2	6	229043	229048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481717
4062	NC_015731	GCT	2	6	229127	229132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481718
4063	NC_015731	CGG	2	6	229163	229168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481718
4064	NC_015731	AAC	2	6	229207	229212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481718
4065	NC_015731	CCG	2	6	229259	229264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481718
4066	NC_015731	GTCC	2	8	229350	229357	0 %	25 %	25 %	50 %	339481718
4067	NC_015731	TGT	2	6	229371	229376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481718
4068	NC_015731	CTT	2	6	229377	229382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481718
4069	NC_015731	GAC	2	6	229477	229482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481718
4070	NC_015731	TGC	2	6	229503	229508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481718
4071	NC_015731	GAAT	2	8	229548	229555	50 %	25 %	25 %	0 %	339481718
4072	NC_015731	TTC	3	9	229588	229596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481718
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4074	NC_015731	GCA	2	6	229611	229616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481718
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4077	NC_015731	CGA	2	6	229734	229739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481718
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4079	NC_015731	GTT	2	6	229872	229877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481718
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4085	NC_015731	TGC	2	6	230227	230232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481719
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4093	NC_015731	GCGT	2	8	230807	230814	0 %	25 %	50 %	25 %	339481720
4094	NC_015731	TTGC	2	8	230862	230869	0 %	50 %	25 %	25 %	339481720
4095	NC_015731	T	6	6	230873	230878	0 %	100 %	0 %	0 %	339481720
4096	NC_015731	CGCC	2	8	230972	230979	0 %	0 %	25 %	75 %	339481720
4097	NC_015731	GGAC	2	8	230989	230996	25 %	0 %	50 %	25 %	339481720
4098	NC_015731	CCGG	2	8	231073	231080	0 %	0 %	50 %	50 %	339481720
4099	NC_015731	TTG	2	6	231114	231119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481720
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4102	NC_015731	GCT	2	6	231182	231187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481720
4103	NC_015731	ATC	2	6	231210	231215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481720
4104	NC_015731	GATT	2	8	231295	231302	25 %	50 %	25 %	0 %	339481720
4105	NC_015731	GCC	2	6	231325	231330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481720
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4107	NC_015731	GAAA	2	8	231474	231481	75 %	0 %	25 %	0 %	339481720
4108	NC_015731	GAC	2	6	231684	231689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481721
4109	NC_015731	A	6	6	231711	231716	100 %	0 %	0 %	0 %	339481721
4110	NC_015731	CAG	2	6	231747	231752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481721
4111	NC_015731	ACCGA	2	10	231763	231772	40 %	0 %	20 %	40 %	339481721
4112	NC_015731	GCTG	2	8	231779	231786	0 %	25 %	50 %	25 %	339481721
4113	NC_015731	GCG	2	6	231851	231856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481721
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4116	NC_015731	ATC	2	6	231918	231923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481721
4117	NC_015731	TGC	2	6	231954	231959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481721
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4119	NC_015731	CG	3	6	232029	232034	0 %	0 %	50 %	50 %	339481721
4120	NC_015731	GAT	2	6	232044	232049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481721
4121	NC_015731	CGC	2	6	232086	232091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481721
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4241	NC_015731	A	6	6	238019	238024	100 %	0 %	0 %	0 %	339481724
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4245	NC_015731	GCC	2	6	238131	238136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481724
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4491	NC_015731	AG	3	6	253127	253132	50 %	0 %	50 %	0 %	339481737
4492	NC_015731	TTG	2	6	253322	253327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481738
4493	NC_015731	AAC	2	6	253365	253370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481738
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