MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 61714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015731	GGC	2	6	26775	26780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481543
502	NC_015731	GAA	2	6	26822	26827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481543
503	NC_015731	GCG	2	6	26840	26845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481543
504	NC_015731	TGCC	2	8	26951	26958	0 %	25 %	25 %	50 %	339481543
505	NC_015731	AAG	2	6	26976	26981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481543
506	NC_015731	AAT	2	6	26993	26998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481543
507	NC_015731	GAA	2	6	27005	27010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481543
508	NC_015731	ATCA	2	8	27043	27050	50 %	25 %	0 %	25 %	339481544
509	NC_015731	TTG	2	6	27062	27067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481544
510	NC_015731	ATG	2	6	27186	27191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481544
511	NC_015731	A	7	7	27211	27217	100 %	0 %	0 %	0 %	339481544
512	NC_015731	GCTG	2	8	27340	27347	0 %	25 %	50 %	25 %	339481544
513	NC_015731	CAGTCA	2	12	27491	27502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339481544
514	NC_015731	GCAAA	2	10	27566	27575	60 %	0 %	20 %	20 %	339481545
515	NC_015731	CTG	2	6	27581	27586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481545
516	NC_015731	GGC	2	6	27595	27600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481545
517	NC_015731	CAC	2	6	27627	27632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481545
518	NC_015731	GTTG	2	8	27743	27750	0 %	50 %	50 %	0 %	339481545
519	NC_015731	CAT	2	6	27848	27853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481545
520	NC_015731	GAA	2	6	27868	27873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481545
521	NC_015731	AGC	2	6	27939	27944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481545
522	NC_015731	GAT	2	6	27950	27955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481545
523	NC_015731	TTC	2	6	28157	28162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481546
524	NC_015731	AATT	2	8	28180	28187	50 %	50 %	0 %	0 %	339481546
525	NC_015731	TTGC	2	8	28198	28205	0 %	50 %	25 %	25 %	339481546
526	NC_015731	TCT	2	6	28275	28280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481546
527	NC_015731	GCG	2	6	28366	28371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481546
528	NC_015731	ATC	2	6	28401	28406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481546
529	NC_015731	TTG	2	6	28436	28441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481546
530	NC_015731	GCT	2	6	28465	28470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481546
531	NC_015731	TGC	2	6	28478	28483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481546
532	NC_015731	CAATAA	2	12	28517	28528	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339481546
533	NC_015731	TAA	2	6	28820	28825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481547
534	NC_015731	T	6	6	28838	28843	0 %	100 %	0 %	0 %	339481547
535	NC_015731	T	6	6	28862	28867	0 %	100 %	0 %	0 %	339481547
536	NC_015731	TGA	2	6	28916	28921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481547
537	NC_015731	GTT	2	6	29010	29015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481547
538	NC_015731	TGA	2	6	29121	29126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481547
539	NC_015731	TTTC	2	8	29763	29770	0 %	75 %	0 %	25 %	339481548
540	NC_015731	GGC	2	6	29806	29811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481548
541	NC_015731	ACGC	2	8	29821	29828	25 %	0 %	25 %	50 %	339481548
542	NC_015731	GCC	2	6	29838	29843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481548
543	NC_015731	TTCG	2	8	29846	29853	0 %	50 %	25 %	25 %	339481548
544	NC_015731	AAC	2	6	29879	29884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481548
545	NC_015731	TGA	2	6	29942	29947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481548
546	NC_015731	GGC	2	6	29955	29960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481548
547	NC_015731	CGG	3	9	29999	30007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481548
548	NC_015731	CAG	2	6	30019	30024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481548
549	NC_015731	GCT	2	6	30045	30050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481548
550	NC_015731	TTG	2	6	30133	30138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481548
551	NC_015731	GT	3	6	30164	30169	0 %	50 %	50 %	0 %	339481548
552	NC_015731	TCGTT	2	10	30231	30240	0 %	60 %	20 %	20 %	339481548
553	NC_015731	TGC	2	6	30299	30304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481548
554	NC_015731	GCG	2	6	30327	30332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481548
555	NC_015731	CGC	2	6	30348	30353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481548
556	NC_015731	ATG	2	6	30397	30402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481548
557	NC_015731	CTGGTG	2	12	30430	30441	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339481548
558	NC_015731	GGT	2	6	30670	30675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481548
559	NC_015731	A	6	6	30797	30802	100 %	0 %	0 %	0 %	339481548
560	NC_015731	A	6	6	30983	30988	100 %	0 %	0 %	0 %	339481548
561	NC_015731	GCT	2	6	31050	31055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481548
562	NC_015731	CCA	2	6	31142	31147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481548
563	NC_015731	GCTC	2	8	31158	31165	0 %	25 %	25 %	50 %	339481548
564	NC_015731	GTC	2	6	31258	31263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481548
565	NC_015731	GAC	2	6	31342	31347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481548
566	NC_015731	GAA	2	6	31390	31395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481548
567	NC_015731	CGA	2	6	31401	31406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481548
568	NC_015731	T	7	7	31484	31490	0 %	100 %	0 %	0 %	339481548
569	NC_015731	GCT	2	6	31508	31513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481548
570	NC_015731	TGC	2	6	31583	31588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481548
571	NC_015731	TTG	2	6	31631	31636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481548
572	NC_015731	TCA	2	6	31670	31675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481548
573	NC_015731	GGATAC	2	12	31680	31691	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339481548
574	NC_015731	CG	3	6	31710	31715	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
575	NC_015731	AGTT	2	8	31718	31725	25 %	50 %	25 %	0 %	339481548
576	NC_015731	CAG	3	9	31768	31776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481548
577	NC_015731	GT	3	6	31780	31785	0 %	50 %	50 %	0 %	339481548
578	NC_015731	TTC	2	6	31799	31804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481548
579	NC_015731	CG	3	6	31808	31813	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
580	NC_015731	TTG	2	6	32026	32031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481548
581	NC_015731	GC	4	8	32044	32051	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
582	NC_015731	GCTG	2	8	32156	32163	0 %	25 %	50 %	25 %	339481548
583	NC_015731	TAT	2	6	32343	32348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481548
584	NC_015731	GTT	2	6	32406	32411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481548
585	NC_015731	GCA	2	6	32415	32420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481548
586	NC_015731	TAACC	2	10	32472	32481	40 %	20 %	0 %	40 %	339481548
587	NC_015731	GC	3	6	32521	32526	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
588	NC_015731	AGC	2	6	32596	32601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481548
589	NC_015731	TACG	2	8	32624	32631	25 %	25 %	25 %	25 %	339481548
590	NC_015731	CTG	3	9	32674	32682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481548
591	NC_015731	TCGCGG	2	12	32699	32710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339481548
592	NC_015731	CTG	3	9	32719	32727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481548
593	NC_015731	TGG	2	6	32752	32757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481548
594	NC_015731	CGC	2	6	32776	32781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481548
595	NC_015731	GCC	2	6	32883	32888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481548
596	NC_015731	GTG	2	6	32909	32914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481548
597	NC_015731	CCGG	2	8	32998	33005	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
598	NC_015731	CTC	2	6	33010	33015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339481548
599	NC_015731	AT	3	6	33120	33125	50 %	50 %	0 %	0 %	339481548
600	NC_015731	TTA	2	6	33160	33165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481548
601	NC_015731	AC	3	6	33212	33217	50 %	0 %	0 %	50 %	339481548
602	NC_015731	ATCGA	2	10	33310	33319	40 %	20 %	20 %	20 %	339481548
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605	NC_015731	GC	3	6	33443	33448	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
606	NC_015731	GAA	2	6	33460	33465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481548
607	NC_015731	GGA	2	6	33493	33498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339481548
608	NC_015731	TCC	2	6	33571	33576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339481548
609	NC_015731	ATG	2	6	33581	33586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481548
610	NC_015731	TGG	2	6	33592	33597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481548
611	NC_015731	GCAT	2	8	33600	33607	25 %	25 %	25 %	25 %	339481548
612	NC_015731	GCCG	2	8	33669	33676	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
613	NC_015731	TGC	2	6	33755	33760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481548
614	NC_015731	ATC	2	6	33778	33783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481548
615	NC_015731	AGC	2	6	33784	33789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481548
616	NC_015731	CAA	2	6	33826	33831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481548
617	NC_015731	CTG	2	6	33952	33957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481548
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620	NC_015731	TCG	2	6	34040	34045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481548
621	NC_015731	CGG	2	6	34110	34115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481548
622	NC_015731	GGC	2	6	34218	34223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481548
623	NC_015731	GAC	2	6	34247	34252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481548
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625	NC_015731	GAT	2	6	34369	34374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481548
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627	NC_015731	GAA	2	6	34423	34428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481548
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