MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Mpl

Total Repeats: 909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015583	GAATG	2	10	1962	1971	40 %	20 %	40 %	0 %	334144768
2	NC_015583	CCGTC	2	10	3404	3413	0 %	20 %	20 %	60 %	334144769
3	NC_015583	GTCTT	2	10	4129	4138	0 %	60 %	20 %	20 %	334144769
4	NC_015583	CGAGA	2	10	7011	7020	40 %	0 %	40 %	20 %	334144771
5	NC_015583	GCACC	2	10	8093	8102	20 %	0 %	20 %	60 %	334144771
6	NC_015583	CGGCG	2	10	8759	8768	0 %	0 %	60 %	40 %	334144771
7	NC_015583	AATCC	2	10	9694	9703	40 %	20 %	0 %	40 %	334144772
8	NC_015583	GGCAT	2	10	10248	10257	20 %	20 %	40 %	20 %	334144773
9	NC_015583	GACCG	2	10	11328	11337	20 %	0 %	40 %	40 %	334144774
10	NC_015583	CGGCC	2	10	11769	11778	0 %	0 %	40 %	60 %	334144774
11	NC_015583	CCAGC	2	10	12477	12486	20 %	0 %	20 %	60 %	334144775
12	NC_015583	CGCAG	2	10	13629	13638	20 %	0 %	40 %	40 %	334144776
13	NC_015583	GGCTT	2	10	13992	14001	0 %	40 %	40 %	20 %	334144776
14	NC_015583	CGAAC	2	10	21013	21022	40 %	0 %	20 %	40 %	334144781
15	NC_015583	GATTC	2	10	22380	22389	20 %	40 %	20 %	20 %	334144782
16	NC_015583	CGGAG	2	10	23097	23106	20 %	0 %	60 %	20 %	334144783
17	NC_015583	GGTCA	2	10	24374	24383	20 %	20 %	40 %	20 %	334144786
18	NC_015583	CAGGC	2	10	25651	25660	20 %	0 %	40 %	40 %	334144788
19	NC_015583	TGCGG	2	10	26119	26128	0 %	20 %	60 %	20 %	334144788
20	NC_015583	CCCAC	2	10	27512	27521	20 %	0 %	0 %	80 %	334144788
21	NC_015583	CCGGG	2	10	28267	28276	0 %	0 %	60 %	40 %	334144789
22	NC_015583	CGGAC	2	10	28384	28393	20 %	0 %	40 %	40 %	334144789
23	NC_015583	TGGCC	2	10	29182	29191	0 %	20 %	40 %	40 %	334144790
24	NC_015583	CGTTG	2	10	32099	32108	0 %	40 %	40 %	20 %	334144792
25	NC_015583	GCGCG	2	10	33835	33844	0 %	0 %	60 %	40 %	334144792
26	NC_015583	GGCGG	2	10	36671	36680	0 %	0 %	80 %	20 %	334144795
27	NC_015583	CGAGC	2	10	40462	40471	20 %	0 %	40 %	40 %	334144798
28	NC_015583	CCTCC	2	10	42191	42200	0 %	20 %	0 %	80 %	334144800
29	NC_015583	CGCTG	2	10	43043	43052	0 %	20 %	40 %	40 %	334144800
30	NC_015583	GCATG	2	10	43782	43791	20 %	20 %	40 %	20 %	334144801
31	NC_015583	GCAGA	2	10	44009	44018	40 %	0 %	40 %	20 %	334144801
32	NC_015583	CATCG	2	10	44899	44908	20 %	20 %	20 %	40 %	334144802
33	NC_015583	ACCGT	2	10	45320	45329	20 %	20 %	20 %	40 %	334144802
34	NC_015583	ACGCC	2	10	49102	49111	20 %	0 %	20 %	60 %	334144804
35	NC_015583	CGCAT	2	10	49393	49402	20 %	20 %	20 %	40 %	334144804
36	NC_015583	TGACC	2	10	50277	50286	20 %	20 %	20 %	40 %	334144806
37	NC_015583	GCACC	2	10	51814	51823	20 %	0 %	20 %	60 %	334144810
38	NC_015583	GATGG	2	10	55819	55828	20 %	20 %	60 %	0 %	334144816
39	NC_015583	ATCGT	2	10	56528	56537	20 %	40 %	20 %	20 %	334144816
40	NC_015583	ATCGA	2	10	56543	56552	40 %	20 %	20 %	20 %	334144816
41	NC_015583	CGGAT	2	10	57834	57843	20 %	20 %	40 %	20 %	334144817
42	NC_015583	CGCTG	2	10	58201	58210	0 %	20 %	40 %	40 %	334144818
43	NC_015583	TGCCC	2	10	58939	58948	0 %	20 %	20 %	60 %	334144818
44	NC_015583	TGCCC	2	10	59023	59032	0 %	20 %	20 %	60 %	334144818
45	NC_015583	GGCCG	2	10	59071	59080	0 %	0 %	60 %	40 %	334144818
46	NC_015583	TCCGA	2	10	59155	59164	20 %	20 %	20 %	40 %	334144818
47	NC_015583	GAATG	2	10	63325	63334	40 %	20 %	40 %	0 %	334144821
48	NC_015583	CCGAT	2	10	64079	64088	20 %	20 %	20 %	40 %	334144821
49	NC_015583	CGATA	2	10	65093	65102	40 %	20 %	20 %	20 %	334144822
50	NC_015583	GCCGC	2	10	65844	65853	0 %	0 %	40 %	60 %	334144823
51	NC_015583	GCAGG	2	10	68330	68339	20 %	0 %	60 %	20 %	334144825
52	NC_015583	CCCCT	2	10	68378	68387	0 %	20 %	0 %	80 %	334144825
53	NC_015583	TGCGC	2	10	68868	68877	0 %	20 %	40 %	40 %	334144825
54	NC_015583	GCCGC	2	10	69317	69326	0 %	0 %	40 %	60 %	334144825
55	NC_015583	GCCGC	2	10	72130	72139	0 %	0 %	40 %	60 %	334144827
56	NC_015583	GACGT	2	10	74587	74596	20 %	20 %	40 %	20 %	334144828
57	NC_015583	CCGGC	2	10	75360	75369	0 %	0 %	40 %	60 %	334144829
58	NC_015583	GACAG	2	10	76859	76868	40 %	0 %	40 %	20 %	334144830
59	NC_015583	TGCGC	2	10	77373	77382	0 %	20 %	40 %	40 %	334144831
60	NC_015583	GGCGA	2	10	78169	78178	20 %	0 %	60 %	20 %	334144831
61	NC_015583	GCACA	2	10	78217	78226	40 %	0 %	20 %	40 %	334144831
62	NC_015583	TGATG	2	10	79359	79368	20 %	40 %	40 %	0 %	334144832
63	NC_015583	TCGCT	2	10	80597	80606	0 %	40 %	20 %	40 %	334144834
64	NC_015583	GCCCT	2	10	80998	81007	0 %	20 %	20 %	60 %	334144834
65	NC_015583	ATCGC	2	10	83414	83423	20 %	20 %	20 %	40 %	334144837
66	NC_015583	AGCGC	2	10	85161	85170	20 %	0 %	40 %	40 %	334144837
67	NC_015583	TCGCG	2	10	85284	85293	0 %	20 %	40 %	40 %	334144838
68	NC_015583	CCGGA	2	10	86157	86166	20 %	0 %	40 %	40 %	334144838
69	NC_015583	GCCCT	2	10	87232	87241	0 %	20 %	20 %	60 %	334144838
70	NC_015583	TGGCG	2	10	87357	87366	0 %	20 %	60 %	20 %	334144838
71	NC_015583	CTGCG	2	10	88499	88508	0 %	20 %	40 %	40 %	334144839
72	NC_015583	CGCAT	2	10	89473	89482	20 %	20 %	20 %	40 %	334144839
73	NC_015583	TCGGC	2	10	89965	89974	0 %	20 %	40 %	40 %	334144840
74	NC_015583	GCCTC	2	10	92568	92577	0 %	20 %	20 %	60 %	334144840
75	NC_015583	CGACC	2	10	93338	93347	20 %	0 %	20 %	60 %	334144841
76	NC_015583	TCCGG	2	10	93776	93785	0 %	20 %	40 %	40 %	334144842
77	NC_015583	CCAGT	2	10	95633	95642	20 %	20 %	20 %	40 %	334144843
78	NC_015583	TCCAT	2	10	97411	97420	20 %	40 %	0 %	40 %	334144844
79	NC_015583	CGGCC	2	10	98059	98068	0 %	0 %	40 %	60 %	334144844
80	NC_015583	GATGG	2	10	100055	100064	20 %	20 %	60 %	0 %	334144846
81	NC_015583	GGCTT	2	10	103842	103851	0 %	40 %	40 %	20 %	334144848
82	NC_015583	GCAAC	2	10	104587	104596	40 %	0 %	20 %	40 %	334144848
83	NC_015583	GTATC	2	10	104607	104616	20 %	40 %	20 %	20 %	334144848
84	NC_015583	GATCG	2	10	104651	104660	20 %	20 %	40 %	20 %	334144848
85	NC_015583	CGGCT	2	10	104890	104899	0 %	20 %	40 %	40 %	334144848
86	NC_015583	ATGAC	2	10	105931	105940	40 %	20 %	20 %	20 %	334144849
87	NC_015583	AGGCA	2	10	106833	106842	40 %	0 %	40 %	20 %	334144850
88	NC_015583	CCGAA	2	10	107756	107765	40 %	0 %	20 %	40 %	334144850
89	NC_015583	TCCGC	2	10	108564	108573	0 %	20 %	20 %	60 %	334144851
90	NC_015583	ACCCA	2	10	109128	109137	40 %	0 %	0 %	60 %	334144851
91	NC_015583	CTGCA	2	10	111137	111146	20 %	20 %	20 %	40 %	334144853
92	NC_015583	GCCCT	2	10	111547	111556	0 %	20 %	20 %	60 %	334144854
93	NC_015583	GACCG	2	10	112282	112291	20 %	0 %	40 %	40 %	334144854
94	NC_015583	GCCGG	2	10	112789	112798	0 %	0 %	60 %	40 %	334144854
95	NC_015583	GCCCG	2	10	114967	114976	0 %	0 %	40 %	60 %	334144855
96	NC_015583	ATGCG	2	10	115657	115666	20 %	20 %	40 %	20 %	334144856
97	NC_015583	CGGCG	2	10	116844	116853	0 %	0 %	60 %	40 %	334144857
98	NC_015583	CGGAC	2	10	119200	119209	20 %	0 %	40 %	40 %	334144858
99	NC_015583	GCGAT	2	10	119330	119339	20 %	20 %	40 %	20 %	334144858
100	NC_015583	TGCCC	2	10	121073	121082	0 %	20 %	20 %	60 %	334144859
101	NC_015583	CGGAA	2	10	124415	124424	40 %	0 %	40 %	20 %	334144862
102	NC_015583	CGGCC	2	10	124870	124879	0 %	0 %	40 %	60 %	334144863
103	NC_015583	GGCAT	2	10	125047	125056	20 %	20 %	40 %	20 %	334144863
104	NC_015583	CCGCG	2	10	128288	128297	0 %	0 %	40 %	60 %	334144867
105	NC_015583	ACCGA	2	10	130368	130377	40 %	0 %	20 %	40 %	334144868
106	NC_015583	CAGGT	2	10	132128	132137	20 %	20 %	40 %	20 %	334144869
107	NC_015583	CGGAT	2	10	132491	132500	20 %	20 %	40 %	20 %	334144869
108	NC_015583	TCATG	2	10	133835	133844	20 %	40 %	20 %	20 %	334144871
109	NC_015583	TGCAA	2	10	134960	134969	40 %	20 %	20 %	20 %	334144873
110	NC_015583	CGATC	2	10	136011	136020	20 %	20 %	20 %	40 %	334144874
111	NC_015583	TCCTG	2	10	136956	136965	0 %	40 %	20 %	40 %	334144875
112	NC_015583	CGAGC	2	10	137795	137804	20 %	0 %	40 %	40 %	334144876
113	NC_015583	CGACG	2	10	138557	138566	20 %	0 %	40 %	40 %	334144876
114	NC_015583	CCGGT	2	10	140358	140367	0 %	20 %	40 %	40 %	334144877
115	NC_015583	CCGCG	2	10	140970	140979	0 %	0 %	40 %	60 %	334144878
116	NC_015583	GCGAT	2	10	141296	141305	20 %	20 %	40 %	20 %	334144878
117	NC_015583	CGGTG	2	10	141474	141483	0 %	20 %	60 %	20 %	334144878
118	NC_015583	GGTTG	2	10	142973	142982	0 %	40 %	60 %	0 %	334144879
119	NC_015583	AACAT	2	10	145162	145171	60 %	20 %	0 %	20 %	334144880
120	NC_015583	AACGA	2	10	148191	148200	60 %	0 %	20 %	20 %	334144881
121	NC_015583	CGGTC	2	10	149294	149303	0 %	20 %	40 %	40 %	334144882
122	NC_015583	TCGAT	2	10	150284	150293	20 %	40 %	20 %	20 %	334144883
123	NC_015583	CGATG	2	10	152548	152557	20 %	20 %	40 %	20 %	334144886
124	NC_015583	TCCCG	2	10	153040	153049	0 %	20 %	20 %	60 %	334144886
125	NC_015583	GCGAT	2	10	153488	153497	20 %	20 %	40 %	20 %	334144887
126	NC_015583	CCCCT	2	10	154351	154360	0 %	20 %	0 %	80 %	334144888
127	NC_015583	GCGCC	2	10	156186	156195	0 %	0 %	40 %	60 %	334144889
128	NC_015583	TCGCC	2	10	156365	156374	0 %	20 %	20 %	60 %	334144889
129	NC_015583	CGGGC	2	10	156875	156884	0 %	0 %	60 %	40 %	334144890
130	NC_015583	TCCAA	2	10	157756	157765	40 %	20 %	0 %	40 %	334144890
131	NC_015583	GCCAA	2	10	158038	158047	40 %	0 %	20 %	40 %	334144890
132	NC_015583	AGCCC	2	10	159784	159793	20 %	0 %	20 %	60 %	334144892
133	NC_015583	AGCCC	2	10	159940	159949	20 %	0 %	20 %	60 %	334144892
134	NC_015583	CATCG	2	10	165165	165174	20 %	20 %	20 %	40 %	334144896
135	NC_015583	CCAGG	2	10	165898	165907	20 %	0 %	40 %	40 %	334144897
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240	NC_015583	CCGAT	2	10	284674	284683	20 %	20 %	20 %	40 %	334144992
241	NC_015583	CACGC	2	10	285412	285421	20 %	0 %	20 %	60 %	334144992
242	NC_015583	TTCAT	2	10	287406	287415	20 %	60 %	0 %	20 %	334144994
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245	NC_015583	GATCG	2	10	296367	296376	20 %	20 %	40 %	20 %	334145002
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248	NC_015583	CGGAT	2	10	299975	299984	20 %	20 %	40 %	20 %	334145005
249	NC_015583	TGCGG	2	10	301365	301374	0 %	20 %	60 %	20 %	334145007
250	NC_015583	CAGCC	2	10	302391	302400	20 %	0 %	20 %	60 %	334145007
251	NC_015583	AGGAA	2	10	304688	304697	60 %	0 %	40 %	0 %	334145010
252	NC_015583	GCGCG	2	10	305750	305759	0 %	0 %	60 %	40 %	334145011
253	NC_015583	GAAAC	2	10	305817	305826	60 %	0 %	20 %	20 %	334145011
254	NC_015583	CAGCG	2	10	305847	305856	20 %	0 %	40 %	40 %	334145011
255	NC_015583	ATTCC	2	10	305910	305919	20 %	40 %	0 %	40 %	334145011
256	NC_015583	TGCCG	2	10	306298	306307	0 %	20 %	40 %	40 %	334145012
257	NC_015583	CCCTG	2	10	307655	307664	0 %	20 %	20 %	60 %	334145013
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261	NC_015583	CCCGC	2	10	312901	312910	0 %	0 %	20 %	80 %	334145019
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263	NC_015583	CTGGA	2	10	314711	314720	20 %	20 %	40 %	20 %	334145021
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