MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Mpl

Total Repeats: 21223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015583	GCC	2	6	169821	169826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144901
3002	NC_015583	CTG	2	6	169836	169841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144901
3003	NC_015583	CG	3	6	169876	169881	0 %	0 %	50 %	50 %	334144901
3004	NC_015583	ACG	2	6	169897	169902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144901
3005	NC_015583	CAA	2	6	170000	170005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144901
3006	NC_015583	GCCCT	2	10	170016	170025	0 %	20 %	20 %	60 %	334144901
3007	NC_015583	TGC	2	6	170077	170082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144901
3008	NC_015583	TCT	2	6	170120	170125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144901
3009	NC_015583	CGG	3	9	170144	170152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144901
3010	NC_015583	AGC	2	6	170178	170183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144901
3011	NC_015583	TTC	2	6	170184	170189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144901
3012	NC_015583	GGT	2	6	170198	170203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144901
3013	NC_015583	GGC	2	6	170255	170260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144901
3014	NC_015583	CG	3	6	170272	170277	0 %	0 %	50 %	50 %	334144901
3015	NC_015583	GC	3	6	170282	170287	0 %	0 %	50 %	50 %	334144901
3016	NC_015583	CCG	2	6	170326	170331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144901
3017	NC_015583	AGG	2	6	170344	170349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144901
3018	NC_015583	CGG	2	6	170440	170445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144901
3019	NC_015583	GGC	2	6	170481	170486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144901
3020	NC_015583	AGA	2	6	170813	170818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144902
3021	NC_015583	GGC	2	6	170875	170880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144902
3022	NC_015583	AAG	2	6	170941	170946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144902
3023	NC_015583	GTC	2	6	170979	170984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3024	NC_015583	ATC	2	6	171006	171011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144902
3025	NC_015583	ACG	2	6	171016	171021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3026	NC_015583	GTA	2	6	171030	171035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144902
3027	NC_015583	TGCC	2	8	171102	171109	0 %	25 %	25 %	50 %	334144902
3028	NC_015583	CAGA	2	8	171200	171207	50 %	0 %	25 %	25 %	334144902
3029	NC_015583	TTGAAG	2	12	171244	171255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144902
3030	NC_015583	GTA	2	6	171282	171287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144902
3031	NC_015583	GTC	2	6	171339	171344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3032	NC_015583	GATCG	2	10	171363	171372	20 %	20 %	40 %	20 %	334144902
3033	NC_015583	CCG	2	6	171404	171409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144902
3034	NC_015583	GC	3	6	171418	171423	0 %	0 %	50 %	50 %	334144902
3035	NC_015583	CGC	2	6	171428	171433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144902
3036	NC_015583	GCT	2	6	171515	171520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3037	NC_015583	TTC	2	6	171595	171600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144902
3038	NC_015583	GCG	2	6	171627	171632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144902
3039	NC_015583	TAG	2	6	171709	171714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144902
3040	NC_015583	GC	3	6	171770	171775	0 %	0 %	50 %	50 %	334144902
3041	NC_015583	AGCTGG	2	12	171802	171813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334144902
3042	NC_015583	CCAG	2	8	171886	171893	25 %	0 %	25 %	50 %	334144902
3043	NC_015583	GC	4	8	171905	171912	0 %	0 %	50 %	50 %	334144902
3044	NC_015583	ATG	2	6	172018	172023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144902
3045	NC_015583	GTC	2	6	172069	172074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3046	NC_015583	GTC	2	6	172086	172091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3047	NC_015583	AGG	2	6	172165	172170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144902
3048	NC_015583	CGT	2	6	172206	172211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3049	NC_015583	TCG	2	6	172250	172255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3050	NC_015583	GCC	2	6	172302	172307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144902
3051	NC_015583	TCG	2	6	172394	172399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3052	NC_015583	CAG	2	6	172464	172469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3053	NC_015583	ACG	2	6	172516	172521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3054	NC_015583	TCG	2	6	172552	172557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3055	NC_015583	GC	3	6	172595	172600	0 %	0 %	50 %	50 %	334144902
3056	NC_015583	CG	4	8	172684	172691	0 %	0 %	50 %	50 %	334144902
3057	NC_015583	TGA	2	6	172739	172744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144902
3058	NC_015583	CGC	2	6	172901	172906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144902
3059	NC_015583	CGA	2	6	173012	173017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3060	NC_015583	CGA	2	6	173070	173075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3061	NC_015583	GTA	2	6	173079	173084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144902
3062	NC_015583	CAGCGA	2	12	173088	173099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3063	NC_015583	CGTG	2	8	173102	173109	0 %	25 %	50 %	25 %	334144902
3064	NC_015583	GCC	2	6	173130	173135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144902
3065	NC_015583	CG	3	6	173196	173201	0 %	0 %	50 %	50 %	334144902
3066	NC_015583	GTC	2	6	173217	173222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3067	NC_015583	TGC	2	6	173377	173382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3068	NC_015583	CGG	2	6	173389	173394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144902
3069	NC_015583	TGC	2	6	173429	173434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3070	NC_015583	CGC	2	6	173456	173461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144902
3071	NC_015583	GC	3	6	173460	173465	0 %	0 %	50 %	50 %	334144902
3072	NC_015583	CTG	2	6	173581	173586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3073	NC_015583	GCT	2	6	173663	173668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144902
3074	NC_015583	GGT	2	6	173718	173723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144902
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3077	NC_015583	GC	5	10	174002	174011	0 %	0 %	50 %	50 %	334144903
3078	NC_015583	TTC	2	6	174042	174047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144903
3079	NC_015583	GATT	2	8	174099	174106	25 %	50 %	25 %	0 %	334144903
3080	NC_015583	GCC	2	6	174165	174170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144903
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3082	NC_015583	CG	3	6	174447	174452	0 %	0 %	50 %	50 %	334144903
3083	NC_015583	GCCGT	2	10	174471	174480	0 %	20 %	40 %	40 %	334144903
3084	NC_015583	CG	3	6	174582	174587	0 %	0 %	50 %	50 %	334144903
3085	NC_015583	CGG	2	6	174672	174677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144903
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3087	NC_015583	CG	3	6	175109	175114	0 %	0 %	50 %	50 %	334144904
3088	NC_015583	CGG	2	6	175307	175312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144904
3089	NC_015583	GCAAG	2	10	175326	175335	40 %	0 %	40 %	20 %	334144904
3090	NC_015583	ACGT	2	8	175352	175359	25 %	25 %	25 %	25 %	334144904
3091	NC_015583	CAC	2	6	175417	175422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144904
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3093	NC_015583	CAGA	2	8	175522	175529	50 %	0 %	25 %	25 %	334144904
3094	NC_015583	CGG	2	6	175569	175574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144904
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3099	NC_015583	CCCGG	2	10	175697	175706	0 %	0 %	40 %	60 %	334144904
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3101	NC_015583	GC	3	6	175750	175755	0 %	0 %	50 %	50 %	334144904
3102	NC_015583	CGA	2	6	175914	175919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144904
3103	NC_015583	GGC	3	9	175939	175947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144904
3104	NC_015583	CGG	2	6	175965	175970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144904
3105	NC_015583	GCC	2	6	176083	176088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144904
3106	NC_015583	TTCCA	2	10	176164	176173	20 %	40 %	0 %	40 %	334144904
3107	NC_015583	AG	3	6	176203	176208	50 %	0 %	50 %	0 %	334144904
3108	NC_015583	GCTCT	2	10	176210	176219	0 %	40 %	20 %	40 %	334144904
3109	NC_015583	GCG	2	6	176248	176253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144904
3110	NC_015583	CGC	2	6	176383	176388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144904
3111	NC_015583	GC	3	6	176431	176436	0 %	0 %	50 %	50 %	334144905
3112	NC_015583	CCTGCC	2	12	176463	176474	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	334144905
3113	NC_015583	GAA	2	6	176493	176498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144905
3114	NC_015583	TCG	2	6	176551	176556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144905
3115	NC_015583	CGT	2	6	176561	176566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144905
3116	NC_015583	CG	4	8	176570	176577	0 %	0 %	50 %	50 %	334144905
3117	NC_015583	TCG	2	6	176650	176655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144905
3118	NC_015583	GGC	2	6	176719	176724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144905
3119	NC_015583	GAC	2	6	176753	176758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144905
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3121	NC_015583	CGG	2	6	176777	176782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144905
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3242	NC_015583	CCAG	2	8	183623	183630	25 %	0 %	25 %	50 %	334144909
3243	NC_015583	GAT	2	6	183651	183656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144909
3244	NC_015583	CG	3	6	183658	183663	0 %	0 %	50 %	50 %	334144909
3245	NC_015583	GCC	2	6	183672	183677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144909
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3347	NC_015583	CATCT	2	10	189412	189421	20 %	40 %	0 %	40 %	334144915
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3350	NC_015583	ACA	2	6	189512	189517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144915
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3352	NC_015583	GCT	2	6	190451	190456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144916
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3354	NC_015583	GCCT	2	8	190502	190509	0 %	25 %	25 %	50 %	334144916
3355	NC_015583	CGC	3	9	190511	190519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144916
3356	NC_015583	AGCGG	2	10	190568	190577	20 %	0 %	60 %	20 %	334144916
3357	NC_015583	GGCG	2	8	190655	190662	0 %	0 %	75 %	25 %	334144916
3358	NC_015583	TCG	2	6	190681	190686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144916
3359	NC_015583	GC	3	6	190697	190702	0 %	0 %	50 %	50 %	334144916
3360	NC_015583	AAT	2	6	190711	190716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144916
3361	NC_015583	GCGCG	2	10	191126	191135	0 %	0 %	60 %	40 %	334144917
3362	NC_015583	ATG	2	6	191154	191159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144917
3363	NC_015583	CTGC	2	8	191165	191172	0 %	25 %	25 %	50 %	334144917
3364	NC_015583	GTC	2	6	191259	191264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144917
3365	NC_015583	GCT	2	6	191282	191287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144917
3366	NC_015583	GAC	2	6	191300	191305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144917
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3368	NC_015583	ATC	2	6	191376	191381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144917
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3371	NC_015583	CGT	2	6	191516	191521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144917
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3374	NC_015583	GCC	2	6	191596	191601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144917
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3376	NC_015583	ATG	2	6	191682	191687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144917
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3379	NC_015583	GCC	2	6	191826	191831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144917
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3384	NC_015583	GCC	2	6	191970	191975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144917
3385	NC_015583	TGA	2	6	191998	192003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144917
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3387	NC_015583	CGC	2	6	192025	192030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144917
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3391	NC_015583	CTG	2	6	192344	192349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144918
3392	NC_015583	GC	3	6	192448	192453	0 %	0 %	50 %	50 %	334144918
3393	NC_015583	GC	3	6	192539	192544	0 %	0 %	50 %	50 %	334144918
3394	NC_015583	GGCGAA	2	12	192557	192568	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	334144918
3395	NC_015583	CGA	2	6	192580	192585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144918
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3484	NC_015583	CCG	2	6	197357	197362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144923
3485	NC_015583	CAA	2	6	197364	197369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144923
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3487	NC_015583	GCCA	2	8	197616	197623	25 %	0 %	25 %	50 %	334144924
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3489	NC_015583	CGA	2	6	197657	197662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144924
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3491	NC_015583	CATT	2	8	197690	197697	25 %	50 %	0 %	25 %	334144924
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