MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Spl

Total Repeats: 556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015582	GAA	2	6	189	194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143045
2	NC_015582	CGC	2	6	285	290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143045
3	NC_015582	AGC	2	6	471	476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143045
4	NC_015582	GCC	2	6	586	591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143045
5	NC_015582	AGA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143046
6	NC_015582	ACC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143046
7	NC_015582	AAG	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143047
8	NC_015582	TCG	2	6	1565	1570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143047
9	NC_015582	GGT	2	6	1605	1610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143047
10	NC_015582	TTC	2	6	1652	1657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143047
11	NC_015582	CGA	2	6	2041	2046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143048
12	NC_015582	CGA	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143048
13	NC_015582	ATC	2	6	2087	2092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143048
14	NC_015582	GCC	2	6	2145	2150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143048
15	NC_015582	CAC	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143048
16	NC_015582	CGA	3	9	2852	2860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143049
17	NC_015582	ATG	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143049
18	NC_015582	GTG	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143049
19	NC_015582	CCG	2	6	3007	3012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143049
20	NC_015582	ACT	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143049
21	NC_015582	ACT	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143049
22	NC_015582	CGT	2	6	3191	3196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143049
23	NC_015582	CGA	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143049
24	NC_015582	ACC	2	6	3295	3300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143050
25	NC_015582	CGA	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143050
26	NC_015582	AAG	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143050
27	NC_015582	ATC	2	6	3529	3534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143050
28	NC_015582	CGA	2	6	3633	3638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143050
29	NC_015582	GGC	2	6	3640	3645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143050
30	NC_015582	CGC	2	6	3747	3752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143050
31	NC_015582	CGC	2	6	3804	3809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143050
32	NC_015582	CGC	2	6	3846	3851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143050
33	NC_015582	CCG	2	6	3855	3860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143050
34	NC_015582	TCG	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143050
35	NC_015582	GGC	2	6	3937	3942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143050
36	NC_015582	GAT	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143050
37	NC_015582	GCG	2	6	4012	4017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143050
38	NC_015582	GTC	2	6	4063	4068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143050
39	NC_015582	GGC	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143050
40	NC_015582	GCC	2	6	4222	4227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143050
41	NC_015582	TCA	2	6	4250	4255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143050
42	NC_015582	CGG	2	6	4296	4301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143050
43	NC_015582	GAA	2	6	4384	4389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143050
44	NC_015582	GCC	2	6	4402	4407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143050
45	NC_015582	CTG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143050
46	NC_015582	GCC	2	6	4546	4551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143050
47	NC_015582	GCC	2	6	4607	4612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143050
48	NC_015582	TGG	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143050
49	NC_015582	CGG	2	6	4764	4769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143050
50	NC_015582	GCA	2	6	4830	4835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143050
51	NC_015582	AAG	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143050
52	NC_015582	GCG	2	6	4907	4912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143050
53	NC_015582	AGG	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143050
54	NC_015582	CCG	2	6	4919	4924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143050
55	NC_015582	GAA	2	6	4941	4946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143050
56	NC_015582	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143050
57	NC_015582	CGC	2	6	5150	5155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
58	NC_015582	TCG	2	6	5258	5263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
59	NC_015582	GCA	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143051
60	NC_015582	GCC	2	6	5639	5644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
61	NC_015582	GCA	2	6	5826	5831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143051
62	NC_015582	CCG	2	6	6045	6050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
63	NC_015582	GTT	2	6	6072	6077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143051
64	NC_015582	GAA	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143051
65	NC_015582	CGC	2	6	6286	6291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
66	NC_015582	TGT	2	6	6597	6602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143051
67	NC_015582	TGA	2	6	6660	6665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143051
68	NC_015582	TCG	2	6	6677	6682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
69	NC_015582	CAC	2	6	6823	6828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143051
70	NC_015582	TCG	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
71	NC_015582	CCG	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
72	NC_015582	CCG	2	6	7173	7178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
73	NC_015582	TTC	2	6	7307	7312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143051
74	NC_015582	CGC	2	6	7419	7424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
75	NC_015582	CTC	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143051
76	NC_015582	GAA	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143051
77	NC_015582	TCG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
78	NC_015582	ATG	2	6	7619	7624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143051
79	NC_015582	TGA	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143051
80	NC_015582	CCG	2	6	7821	7826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
81	NC_015582	TCA	2	6	7841	7846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143051
82	NC_015582	AGT	2	6	7914	7919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143051
83	NC_015582	TGC	2	6	8085	8090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
84	NC_015582	ATC	2	6	8092	8097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143051
85	NC_015582	CAC	2	6	8123	8128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143051
86	NC_015582	CGG	2	6	8133	8138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143051
87	NC_015582	GGA	2	6	8164	8169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143051
88	NC_015582	GCC	2	6	8368	8373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
89	NC_015582	GGC	2	6	8466	8471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143051
90	NC_015582	TGA	2	6	8541	8546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143051
91	NC_015582	CAG	2	6	8569	8574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143051
92	NC_015582	GTA	2	6	8723	8728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143051
93	NC_015582	CGC	2	6	8805	8810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
94	NC_015582	GCT	2	6	8883	8888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
95	NC_015582	TTC	2	6	8959	8964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143051
96	NC_015582	TCG	2	6	9014	9019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
97	NC_015582	TCA	2	6	9065	9070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143051
98	NC_015582	CGG	2	6	9084	9089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143051
99	NC_015582	TGA	2	6	9102	9107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143051
100	NC_015582	GTC	2	6	9109	9114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
101	NC_015582	ATC	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143051
102	NC_015582	GTC	2	6	9217	9222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
103	NC_015582	GCA	2	6	9345	9350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143051
104	NC_015582	GCT	2	6	9414	9419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
105	NC_015582	ACC	2	6	9542	9547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143051
106	NC_015582	ATG	2	6	9629	9634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143051
107	NC_015582	TCG	2	6	9695	9700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
108	NC_015582	CGA	2	6	9786	9791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143051
109	NC_015582	TCG	2	6	9974	9979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
110	NC_015582	GCC	2	6	10024	10029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
111	NC_015582	GCG	2	6	10039	10044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143051
112	NC_015582	GCC	2	6	10210	10215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143051
113	NC_015582	GCA	2	6	10494	10499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143051
114	NC_015582	GTG	2	6	10637	10642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143051
115	NC_015582	AGC	2	6	10676	10681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143051
116	NC_015582	ACC	2	6	10740	10745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143051
117	NC_015582	CAT	2	6	10876	10881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143051
118	NC_015582	CCG	2	6	10941	10946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143052
119	NC_015582	GTG	2	6	10984	10989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143052
120	NC_015582	TCA	2	6	11005	11010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143052
121	NC_015582	CAT	2	6	11063	11068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143052
122	NC_015582	GTC	2	6	11109	11114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143052
123	NC_015582	CAC	2	6	11118	11123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143052
124	NC_015582	ACA	2	6	11174	11179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143052
125	NC_015582	CTT	3	9	11304	11312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143052
126	NC_015582	AAC	2	6	11421	11426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143052
127	NC_015582	TGC	2	6	11528	11533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143052
128	NC_015582	TTC	2	6	11565	11570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143052
129	NC_015582	TCG	2	6	11645	11650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143052
130	NC_015582	GCC	2	6	11797	11802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143052
131	NC_015582	TGG	2	6	11849	11854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143052
132	NC_015582	CTT	2	6	11916	11921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143052
133	NC_015582	TCA	2	6	12004	12009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143053
134	NC_015582	CTG	2	6	12055	12060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143053
135	NC_015582	CTT	2	6	12115	12120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143053
136	NC_015582	GAA	2	6	12312	12317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143053
137	NC_015582	TCC	2	6	12358	12363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143053
138	NC_015582	ACC	2	6	12601	12606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143053
139	NC_015582	TCC	2	6	12629	12634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143053
140	NC_015582	CGG	2	6	13063	13068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143054
141	NC_015582	GAT	2	6	13097	13102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143054
142	NC_015582	TGA	2	6	13111	13116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143054
143	NC_015582	GCC	2	6	13118	13123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143054
144	NC_015582	TCA	2	6	13138	13143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143054
145	NC_015582	TGC	2	6	13160	13165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143054
146	NC_015582	GAT	2	6	13205	13210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143055
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149	NC_015582	GGC	2	6	13429	13434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143055
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153	NC_015582	CAA	2	6	14022	14027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143056
154	NC_015582	CCG	2	6	14054	14059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143056
155	NC_015582	AAT	2	6	14115	14120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143056
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160	NC_015582	GGC	2	6	14785	14790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143057
161	NC_015582	ATC	2	6	15142	15147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143058
162	NC_015582	GGC	2	6	15198	15203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143058
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165	NC_015582	CCT	2	6	15312	15317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143058
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168	NC_015582	CAC	2	6	15751	15756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143059
169	NC_015582	GAA	2	6	16085	16090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143059
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177	NC_015582	ATC	2	6	17648	17653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143063
178	NC_015582	AGC	2	6	17660	17665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143063
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180	NC_015582	AGG	2	6	17918	17923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143064
181	NC_015582	TTA	2	6	17925	17930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143064
182	NC_015582	TGG	2	6	18041	18046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143065
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249	NC_015582	GGC	2	6	23669	23674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143069
250	NC_015582	GAT	2	6	23795	23800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143069
251	NC_015582	GGT	2	6	24240	24245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143070
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253	NC_015582	GCC	2	6	24358	24363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143070
254	NC_015582	AGC	2	6	24549	24554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143070
255	NC_015582	GCG	2	6	24713	24718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143071
256	NC_015582	ACG	2	6	24818	24823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143071
257	NC_015582	CGA	2	6	24881	24886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143071
258	NC_015582	TGC	2	6	24896	24901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143071
259	NC_015582	CGA	2	6	24950	24955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143071
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274	NC_015582	GTG	2	6	26077	26082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143071
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332	NC_015582	GAG	2	6	30764	30769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143075
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498	NC_015582	GCC	2	6	42298	42303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143089
499	NC_015582	CAG	2	6	42319	42324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143089
500	NC_015582	GTC	2	6	42343	42348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143089

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