MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 76428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_015580	GCA	2	6	204702	204707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139778
4003	NC_015580	GC	3	6	204799	204804	0 %	0 %	50 %	50 %	334139778
4004	NC_015580	CGA	2	6	204831	204836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139778
4005	NC_015580	TGC	2	6	204849	204854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139778
4006	NC_015580	GGGA	2	8	204863	204870	25 %	0 %	75 %	0 %	334139778
4007	NC_015580	GCG	3	9	204884	204892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139778
4008	NC_015580	CGG	2	6	204893	204898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139778
4009	NC_015580	GCA	2	6	205081	205086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139779
4010	NC_015580	GGT	2	6	205179	205184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139779
4011	NC_015580	GAC	2	6	205215	205220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139779
4012	NC_015580	CCG	2	6	205276	205281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139779
4013	NC_015580	TCGA	2	8	205285	205292	25 %	25 %	25 %	25 %	334139779
4014	NC_015580	CCG	2	6	205309	205314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139779
4015	NC_015580	GAC	2	6	205332	205337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139779
4016	NC_015580	CGTGG	2	10	205347	205356	0 %	20 %	60 %	20 %	334139779
4017	NC_015580	AGC	2	6	205374	205379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139779
4018	NC_015580	GCG	2	6	205401	205406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139779
4019	NC_015580	GCT	2	6	205440	205445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139779
4020	NC_015580	CG	3	6	205472	205477	0 %	0 %	50 %	50 %	334139779
4021	NC_015580	CGG	2	6	205490	205495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139779
4022	NC_015580	CGC	3	9	205601	205609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139779
4023	NC_015580	CG	3	6	205635	205640	0 %	0 %	50 %	50 %	334139779
4024	NC_015580	GCTGCA	2	12	205660	205671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334139779
4025	NC_015580	CTG	2	6	205672	205677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139779
4026	NC_015580	CG	3	6	205949	205954	0 %	0 %	50 %	50 %	334139780
4027	NC_015580	CGA	2	6	206075	206080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139780
4028	NC_015580	TCG	2	6	206113	206118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139780
4029	NC_015580	CG	3	6	206204	206209	0 %	0 %	50 %	50 %	334139780
4030	NC_015580	GCG	2	6	206242	206247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139780
4031	NC_015580	GGC	2	6	206268	206273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139780
4032	NC_015580	TCG	2	6	206362	206367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139780
4033	NC_015580	GCG	2	6	206368	206373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139780
4034	NC_015580	CGC	2	6	206411	206416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139780
4035	NC_015580	CGA	2	6	206426	206431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139780
4036	NC_015580	CGA	2	6	206453	206458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139780
4037	NC_015580	GCGA	2	8	206470	206477	25 %	0 %	50 %	25 %	334139780
4038	NC_015580	GCA	2	6	206543	206548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139780
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4040	NC_015580	CG	4	8	206627	206634	0 %	0 %	50 %	50 %	334139780
4041	NC_015580	GC	3	6	206640	206645	0 %	0 %	50 %	50 %	334139780
4042	NC_015580	AGC	2	6	206677	206682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139780
4043	NC_015580	CGTG	2	8	206694	206701	0 %	25 %	50 %	25 %	334139780
4044	NC_015580	CGA	2	6	206809	206814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139781
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4047	NC_015580	CTT	2	6	206960	206965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139781
4048	NC_015580	CAG	2	6	206987	206992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139781
4049	NC_015580	GCCT	2	8	206999	207006	0 %	25 %	25 %	50 %	334139781
4050	NC_015580	GCC	2	6	207024	207029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139781
4051	NC_015580	AGA	2	6	207079	207084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139781
4052	NC_015580	ACG	2	6	207087	207092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139781
4053	NC_015580	GCC	2	6	207128	207133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139781
4054	NC_015580	GC	3	6	207302	207307	0 %	0 %	50 %	50 %	334139782
4055	NC_015580	CATG	2	8	207316	207323	25 %	25 %	25 %	25 %	334139782
4056	NC_015580	CAG	2	6	207355	207360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139782
4057	NC_015580	GCGG	2	8	207361	207368	0 %	0 %	75 %	25 %	334139782
4058	NC_015580	GCA	2	6	207417	207422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139782
4059	NC_015580	CGA	2	6	207519	207524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139782
4060	NC_015580	C	8	8	207526	207533	0 %	0 %	0 %	100 %	334139782
4061	NC_015580	CG	3	6	207627	207632	0 %	0 %	50 %	50 %	334139782
4062	NC_015580	GCG	2	6	207680	207685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139782
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4064	NC_015580	GGCT	2	8	207771	207778	0 %	25 %	50 %	25 %	334139782
4065	NC_015580	CGG	2	6	207781	207786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139782
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4070	NC_015580	GTA	2	6	207889	207894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139782
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4074	NC_015580	ATGG	2	8	208090	208097	25 %	25 %	50 %	0 %	334139782
4075	NC_015580	CGATCG	2	12	208128	208139	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334139782
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4080	NC_015580	CAG	2	6	208411	208416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139782
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4083	NC_015580	GCA	2	6	208467	208472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139782
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4085	NC_015580	GCG	2	6	208493	208498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139782
4086	NC_015580	GCG	2	6	208505	208510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139782
4087	NC_015580	GC	3	6	208543	208548	0 %	0 %	50 %	50 %	334139782
4088	NC_015580	GC	3	6	208565	208570	0 %	0 %	50 %	50 %	334139782
4089	NC_015580	CGA	2	6	208602	208607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139782
4090	NC_015580	GCTGC	2	10	208654	208663	0 %	20 %	40 %	40 %	334139782
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4093	NC_015580	TGG	2	6	209018	209023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139782
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4102	NC_015580	CGCAGG	2	12	209345	209356	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334139782
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4104	NC_015580	TCG	2	6	209444	209449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139782
4105	NC_015580	GCA	2	6	209463	209468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139782
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4108	NC_015580	CGGC	2	8	209559	209566	0 %	0 %	50 %	50 %	334139782
4109	NC_015580	GC	3	6	209577	209582	0 %	0 %	50 %	50 %	334139782
4110	NC_015580	GGC	2	6	209583	209588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139782
4111	NC_015580	GCA	2	6	209655	209660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139782
4112	NC_015580	GGCGAG	3	18	209689	209706	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	334139782
4113	NC_015580	GCG	2	6	209719	209724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139782
4114	NC_015580	GCCG	2	8	209755	209762	0 %	0 %	50 %	50 %	334139782
4115	NC_015580	GC	3	6	209859	209864	0 %	0 %	50 %	50 %	334139782
4116	NC_015580	CGAT	2	8	209870	209877	25 %	25 %	25 %	25 %	334139782
4117	NC_015580	CTGC	2	8	209911	209918	0 %	25 %	25 %	50 %	334139783
4118	NC_015580	C	6	6	210022	210027	0 %	0 %	0 %	100 %	334139783
4119	NC_015580	AG	3	6	210057	210062	50 %	0 %	50 %	0 %	334139783
4120	NC_015580	CGC	2	6	210073	210078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139783
4121	NC_015580	GCA	2	6	210096	210101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139783
4122	NC_015580	GCC	2	6	210142	210147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139783
4123	NC_015580	C	6	6	210146	210151	0 %	0 %	0 %	100 %	334139783
4124	NC_015580	CGA	2	6	210226	210231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139783
4125	NC_015580	GCG	2	6	210252	210257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139783
4126	NC_015580	AGG	2	6	210410	210415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139784
4127	NC_015580	CTG	2	6	210416	210421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139784
4128	NC_015580	GCC	2	6	210438	210443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139784
4129	NC_015580	CTGGAT	2	12	210462	210473	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334139784
4130	NC_015580	CG	3	6	210610	210615	0 %	0 %	50 %	50 %	334139784
4131	NC_015580	GCG	3	9	210613	210621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139784
4132	NC_015580	GCG	2	6	210651	210656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139784
4133	NC_015580	GGCG	2	8	210708	210715	0 %	0 %	75 %	25 %	334139784
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4142	NC_015580	GC	4	8	211129	211136	0 %	0 %	50 %	50 %	334139784
4143	NC_015580	GCCGG	2	10	211173	211182	0 %	0 %	60 %	40 %	334139784
4144	NC_015580	TGG	3	9	211244	211252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139784
4145	NC_015580	ACG	4	12	211274	211285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139784
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4148	NC_015580	GGGCA	2	10	211884	211893	20 %	0 %	60 %	20 %	334139785
4149	NC_015580	ACTG	2	8	211973	211980	25 %	25 %	25 %	25 %	334139785
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4154	NC_015580	CTG	2	6	212193	212198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139785
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4160	NC_015580	TCG	2	6	212351	212356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139786
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4236	NC_015580	GGCT	2	8	215570	215577	0 %	25 %	50 %	25 %	334139788
4237	NC_015580	TGC	2	6	215580	215585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139788
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4240	NC_015580	GGA	2	6	215713	215718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139788
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4363	NC_015580	TCG	2	6	221593	221598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139794
4364	NC_015580	GCA	2	6	221630	221635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139794
4365	NC_015580	CGG	2	6	221638	221643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139794
4366	NC_015580	CGA	2	6	221675	221680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139794
4367	NC_015580	GCGG	2	8	221693	221700	0 %	0 %	75 %	25 %	334139794
4368	NC_015580	CGA	2	6	221757	221762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139794
4369	NC_015580	TCG	2	6	221797	221802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139794
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4372	NC_015580	CG	3	6	221932	221937	0 %	0 %	50 %	50 %	334139794
4373	NC_015580	TGC	2	6	222031	222036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139794
4374	NC_015580	GAT	2	6	222050	222055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139794
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4392	NC_015580	CGCT	2	8	222835	222842	0 %	25 %	25 %	50 %	334139795
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4394	NC_015580	CTGG	2	8	222866	222873	0 %	25 %	50 %	25 %	334139795
4395	NC_015580	GCG	2	6	222913	222918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139795
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4479	NC_015580	CAC	2	6	227400	227405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139799
4480	NC_015580	TCA	2	6	227477	227482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139799
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4482	NC_015580	GGCGA	2	10	227536	227545	20 %	0 %	60 %	20 %	334139799
4483	NC_015580	CGG	2	6	227547	227552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139799
4484	NC_015580	GCG	2	6	227558	227563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139799
4485	NC_015580	TCG	2	6	227630	227635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139799
4486	NC_015580	TCC	3	9	227636	227644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139799
4487	NC_015580	TGGTC	2	10	227706	227715	0 %	40 %	40 %	20 %	334139799
4488	NC_015580	CCGC	2	8	227859	227866	0 %	0 %	25 %	75 %	334139800
4489	NC_015580	CCTCGC	2	12	227900	227911	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	334139800
4490	NC_015580	GCG	2	6	227920	227925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139800
4491	NC_015580	GAA	2	6	227939	227944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139800
4492	NC_015580	GCG	2	6	228049	228054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139800
4493	NC_015580	GCT	2	6	228074	228079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139800
4494	NC_015580	TCG	2	6	228097	228102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139800
4495	NC_015580	GGGC	2	8	228383	228390	0 %	0 %	75 %	25 %	334139800
4496	NC_015580	GC	3	6	228448	228453	0 %	0 %	50 %	50 %	334139800
4497	NC_015580	GCG	2	6	228475	228480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139800
4498	NC_015580	GAG	2	6	228591	228596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139800
4499	NC_015580	CGCGAC	2	12	228597	228608	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334139800
4500	NC_015580	CGA	2	6	228677	228682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139800

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