MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 76428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015580	TC	3	6	179902	179907	0 %	50 %	0 %	50 %	334139753
3502	NC_015580	GTC	2	6	179915	179920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139753
3503	NC_015580	TCG	2	6	179993	179998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139753
3504	NC_015580	GGCG	3	12	180111	180122	0 %	0 %	75 %	25 %	334139753
3505	NC_015580	AGA	2	6	180146	180151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139753
3506	NC_015580	GC	3	6	180222	180227	0 %	0 %	50 %	50 %	334139753
3507	NC_015580	CTA	2	6	180228	180233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139753
3508	NC_015580	CACG	2	8	180285	180292	25 %	0 %	25 %	50 %	334139753
3509	NC_015580	GGT	2	6	180334	180339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139753
3510	NC_015580	TGA	2	6	180411	180416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139753
3511	NC_015580	GCT	2	6	180426	180431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139753
3512	NC_015580	CGGT	2	8	180439	180446	0 %	25 %	50 %	25 %	334139753
3513	NC_015580	GAA	2	6	180448	180453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139753
3514	NC_015580	CAA	2	6	180456	180461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139753
3515	NC_015580	TCG	2	6	180485	180490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139753
3516	NC_015580	GCG	2	6	180644	180649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139753
3517	NC_015580	GTC	2	6	180692	180697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139753
3518	NC_015580	CGG	2	6	180750	180755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139753
3519	NC_015580	TGC	2	6	180788	180793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139753
3520	NC_015580	TCCA	2	8	180823	180830	25 %	25 %	0 %	50 %	334139753
3521	NC_015580	AAC	2	6	180865	180870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139753
3522	NC_015580	CG	3	6	180878	180883	0 %	0 %	50 %	50 %	334139753
3523	NC_015580	GAG	2	6	181454	181459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139754
3524	NC_015580	AGA	2	6	181470	181475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139754
3525	NC_015580	TGA	2	6	181574	181579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139754
3526	NC_015580	GCCA	2	8	181588	181595	25 %	0 %	25 %	50 %	334139754
3527	NC_015580	CGA	2	6	181613	181618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139754
3528	NC_015580	GC	3	6	181861	181866	0 %	0 %	50 %	50 %	334139754
3529	NC_015580	CGC	2	6	181921	181926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139754
3530	NC_015580	G	6	6	181987	181992	0 %	0 %	100 %	0 %	334139754
3531	NC_015580	CGC	2	6	181995	182000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139754
3532	NC_015580	GCT	2	6	182037	182042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139754
3533	NC_015580	CGT	2	6	182565	182570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139755
3534	NC_015580	CGGC	2	8	182589	182596	0 %	0 %	50 %	50 %	334139755
3535	NC_015580	CGG	2	6	182601	182606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139755
3536	NC_015580	TCT	2	6	182654	182659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139755
3537	NC_015580	GC	3	6	182683	182688	0 %	0 %	50 %	50 %	334139755
3538	NC_015580	GCT	2	6	182712	182717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139755
3539	NC_015580	TGC	3	9	182759	182767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139755
3540	NC_015580	TGG	2	6	182816	182821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139755
3541	NC_015580	AACG	2	8	182866	182873	50 %	0 %	25 %	25 %	334139755
3542	NC_015580	CAG	2	6	182899	182904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139755
3543	NC_015580	GCC	2	6	182942	182947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139755
3544	NC_015580	CGC	2	6	182992	182997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139755
3545	NC_015580	TCG	2	6	183026	183031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139755
3546	NC_015580	G	7	7	183117	183123	0 %	0 %	100 %	0 %	334139756
3547	NC_015580	TGC	2	6	183210	183215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139756
3548	NC_015580	GCTG	2	8	183223	183230	0 %	25 %	50 %	25 %	334139756
3549	NC_015580	GCG	2	6	183248	183253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139756
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3551	NC_015580	GC	3	6	183380	183385	0 %	0 %	50 %	50 %	334139756
3552	NC_015580	TCT	2	6	183415	183420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139756
3553	NC_015580	GCCG	2	8	183430	183437	0 %	0 %	50 %	50 %	334139756
3554	NC_015580	TCG	2	6	183456	183461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139756
3555	NC_015580	ACG	2	6	183507	183512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139756
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3557	NC_015580	GAA	2	6	183565	183570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139757
3558	NC_015580	CGT	2	6	183619	183624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139757
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3560	NC_015580	TGC	2	6	183704	183709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139757
3561	NC_015580	CGC	2	6	183751	183756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139757
3562	NC_015580	CGA	2	6	183801	183806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139757
3563	NC_015580	TCG	2	6	183845	183850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139757
3564	NC_015580	ATG	2	6	183911	183916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139757
3565	NC_015580	CGGT	2	8	184138	184145	0 %	25 %	50 %	25 %	334139758
3566	NC_015580	TCG	2	6	184192	184197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139758
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3568	NC_015580	TCTCA	2	10	184261	184270	20 %	40 %	0 %	40 %	334139758
3569	NC_015580	TGA	2	6	184272	184277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139758
3570	NC_015580	TGG	2	6	184302	184307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139758
3571	NC_015580	CTG	2	6	184349	184354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139758
3572	NC_015580	CAT	2	6	184441	184446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139758
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3574	NC_015580	CAACG	2	10	184546	184555	40 %	0 %	20 %	40 %	334139758
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3579	NC_015580	GGGCC	2	10	184899	184908	0 %	0 %	60 %	40 %	334139759
3580	NC_015580	GCC	2	6	184933	184938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139759
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3600	NC_015580	CGA	2	6	185973	185978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139760
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3609	NC_015580	GCTCG	2	10	186307	186316	0 %	20 %	40 %	40 %	334139760
3610	NC_015580	GC	3	6	186348	186353	0 %	0 %	50 %	50 %	334139760
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