MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 76428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015580	TGCG	2	8	253735	253742	0 %	25 %	50 %	25 %	334139820
5002	NC_015580	TCG	2	6	253814	253819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139820
5003	NC_015580	GAC	3	9	253825	253833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139820
5004	NC_015580	GCG	2	6	253894	253899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139820
5005	NC_015580	AAGGAA	2	12	253990	254001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139820
5006	NC_015580	CGC	2	6	254010	254015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139820
5007	NC_015580	TTC	2	6	254117	254122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139820
5008	NC_015580	CCG	2	6	254236	254241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139820
5009	NC_015580	GCG	2	6	254620	254625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139821
5010	NC_015580	TGC	2	6	254633	254638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139821
5011	NC_015580	GGCCGC	2	12	254645	254656	0 %	0 %	50 %	50 %	334139821
5012	NC_015580	GCC	3	9	254657	254665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139821
5013	NC_015580	GCC	2	6	254699	254704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139821
5014	NC_015580	GGC	2	6	254718	254723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139821
5015	NC_015580	TCT	3	9	254821	254829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139821
5016	NC_015580	CGCT	2	8	254880	254887	0 %	25 %	25 %	50 %	334139821
5017	NC_015580	GCC	2	6	254925	254930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139822
5018	NC_015580	AGG	2	6	254962	254967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139822
5019	NC_015580	CTCGT	2	10	254971	254980	0 %	40 %	20 %	40 %	334139822
5020	NC_015580	TGA	2	6	254999	255004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139822
5021	NC_015580	TCTCC	2	10	255050	255059	0 %	40 %	0 %	60 %	334139822
5022	NC_015580	CGATGC	2	12	255074	255085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334139822
5023	NC_015580	CGT	2	6	255138	255143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139822
5024	NC_015580	TCC	2	6	255154	255159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139822
5025	NC_015580	ACT	2	6	255640	255645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139823
5026	NC_015580	CAG	3	9	255654	255662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139823
5027	NC_015580	CTT	2	6	255764	255769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139823
5028	NC_015580	CG	3	6	255815	255820	0 %	0 %	50 %	50 %	334139823
5029	NC_015580	CCGA	2	8	255831	255838	25 %	0 %	25 %	50 %	334139823
5030	NC_015580	GAT	2	6	255845	255850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139823
5031	NC_015580	CGG	2	6	256040	256045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139823
5032	NC_015580	TGA	2	6	256087	256092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139823
5033	NC_015580	CAA	2	6	256106	256111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139823
5034	NC_015580	CGA	2	6	256151	256156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139823
5035	NC_015580	GAAG	2	8	256232	256239	50 %	0 %	50 %	0 %	334139823
5036	NC_015580	GAC	2	6	256259	256264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139823
5037	NC_015580	AAG	2	6	256341	256346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139823
5038	NC_015580	CGA	2	6	256409	256414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139823
5039	NC_015580	GCT	2	6	256439	256444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139823
5040	NC_015580	CTT	2	6	256466	256471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139823
5041	NC_015580	ACG	2	6	256522	256527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139823
5042	NC_015580	CAAGGC	2	12	256553	256564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139823
5043	NC_015580	ACG	2	6	256567	256572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139823
5044	NC_015580	CGA	2	6	256574	256579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139823
5045	NC_015580	CGA	2	6	256583	256588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139823
5046	NC_015580	CGG	2	6	256610	256615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139823
5047	NC_015580	GCAG	2	8	256619	256626	25 %	0 %	50 %	25 %	334139823
5048	NC_015580	GCCA	2	8	257132	257139	25 %	0 %	25 %	50 %	334139824
5049	NC_015580	CGG	2	6	257220	257225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139824
5050	NC_015580	ATC	2	6	257252	257257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139824
5051	NC_015580	CGA	2	6	257379	257384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139824
5052	NC_015580	TGA	2	6	257427	257432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139824
5053	NC_015580	TCG	2	6	257433	257438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139824
5054	NC_015580	ATT	2	6	257440	257445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334139824
5055	NC_015580	TTCAT	2	10	257483	257492	20 %	60 %	0 %	20 %	334139824
5056	NC_015580	TCA	2	6	257669	257674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139825
5057	NC_015580	GC	4	8	257699	257706	0 %	0 %	50 %	50 %	334139825
5058	NC_015580	GGCG	2	8	257714	257721	0 %	0 %	75 %	25 %	334139825
5059	NC_015580	CCG	2	6	257749	257754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139825
5060	NC_015580	GAG	2	6	257779	257784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139825
5061	NC_015580	ACG	2	6	257815	257820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139825
5062	NC_015580	GCCGC	2	10	257845	257854	0 %	0 %	40 %	60 %	334139825
5063	NC_015580	CGA	2	6	257870	257875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139825
5064	NC_015580	GCG	2	6	257941	257946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139825
5065	NC_015580	AGA	2	6	257954	257959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139825
5066	NC_015580	AGC	2	6	257980	257985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139825
5067	NC_015580	CAGCC	2	10	258023	258032	20 %	0 %	20 %	60 %	334139825
5068	NC_015580	GC	3	6	258116	258121	0 %	0 %	50 %	50 %	334139825
5069	NC_015580	ATG	2	6	258136	258141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139825
5070	NC_015580	CGC	2	6	258185	258190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139825
5071	NC_015580	ATC	2	6	258253	258258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139825
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5073	NC_015580	GGC	2	6	258294	258299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139825
5074	NC_015580	GGC	2	6	258339	258344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139825
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5077	NC_015580	GC	3	6	258518	258523	0 %	0 %	50 %	50 %	334139825
5078	NC_015580	GTA	2	6	258561	258566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139825
5079	NC_015580	GAA	2	6	258588	258593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139825
5080	NC_015580	GAT	2	6	258594	258599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139825
5081	NC_015580	GCC	2	6	258630	258635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139825
5082	NC_015580	CGGG	2	8	258642	258649	0 %	0 %	75 %	25 %	334139825
5083	NC_015580	CAG	2	6	258726	258731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139825
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5086	NC_015580	GAG	2	6	258834	258839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139825
5087	NC_015580	C	6	6	259007	259012	0 %	0 %	0 %	100 %	334139826
5088	NC_015580	GGC	2	6	259067	259072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139826
5089	NC_015580	GCG	2	6	259086	259091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139826
5090	NC_015580	TGG	2	6	259161	259166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139826
5091	NC_015580	GC	3	6	259220	259225	0 %	0 %	50 %	50 %	334139826
5092	NC_015580	TGC	2	6	259272	259277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139826
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5094	NC_015580	GAT	2	6	259351	259356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139826
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5100	NC_015580	GAT	2	6	259492	259497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139826
5101	NC_015580	TCA	2	6	259500	259505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139826
5102	NC_015580	CGT	2	6	259582	259587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139826
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5104	NC_015580	CG	3	6	259661	259666	0 %	0 %	50 %	50 %	334139826
5105	NC_015580	TCG	2	6	259735	259740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139827
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5110	NC_015580	GTC	2	6	259881	259886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139827
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5116	NC_015580	CGG	2	6	260081	260086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139827
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5118	NC_015580	TCG	2	6	260164	260169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139827
5119	NC_015580	ATCGA	2	10	260199	260208	40 %	20 %	20 %	20 %	334139827
5120	NC_015580	CGG	3	9	260212	260220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139827
5121	NC_015580	CGG	2	6	260308	260313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139827
5122	NC_015580	GC	3	6	260325	260330	0 %	0 %	50 %	50 %	334139827
5123	NC_015580	GCT	2	6	260378	260383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139827
5124	NC_015580	GGGA	2	8	260438	260445	25 %	0 %	75 %	0 %	334139827
5125	NC_015580	GCC	2	6	260496	260501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139827
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5128	NC_015580	GCC	2	6	260914	260919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139828
5129	NC_015580	CGG	2	6	260973	260978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139828
5130	NC_015580	TGG	2	6	261056	261061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139828
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5132	NC_015580	ATC	2	6	261319	261324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139829
5133	NC_015580	CAT	2	6	261339	261344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139829
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5135	NC_015580	GCT	2	6	261462	261467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139829
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5143	NC_015580	CAA	2	6	261746	261751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139830
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5145	NC_015580	CTG	2	6	261825	261830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139830
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5152	NC_015580	TGC	2	6	262033	262038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139830
5153	NC_015580	CGGCT	2	10	262047	262056	0 %	20 %	40 %	40 %	334139830
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5192	NC_015580	CTG	2	6	263771	263776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139832
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5227	NC_015580	GTGC	2	8	265087	265094	0 %	25 %	50 %	25 %	334139834
5228	NC_015580	TCG	2	6	265186	265191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139834
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5230	NC_015580	TCG	2	6	265366	265371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139834
5231	NC_015580	TGCT	2	8	265397	265404	0 %	50 %	25 %	25 %	334139834
5232	NC_015580	TGC	2	6	265414	265419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139834
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5234	NC_015580	GGT	2	6	266452	266457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139835
5235	NC_015580	GCT	2	6	266641	266646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139836
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5237	NC_015580	GGC	2	6	266752	266757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139836
5238	NC_015580	CTC	2	6	266834	266839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139836
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5240	NC_015580	TGC	2	6	266913	266918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139836
5241	NC_015580	GCT	2	6	266939	266944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139836
5242	NC_015580	TCAG	2	8	267528	267535	25 %	25 %	25 %	25 %	334139837
5243	NC_015580	TCG	2	6	267538	267543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139837
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5245	NC_015580	GAC	2	6	267633	267638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139837
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5247	NC_015580	TCTGG	2	10	267728	267737	0 %	40 %	40 %	20 %	334139837
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5361	NC_015580	CTG	2	6	276137	276142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139846
5362	NC_015580	TCC	2	6	276301	276306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139846
5363	NC_015580	GGC	2	6	276441	276446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139846
5364	NC_015580	CTT	2	6	276451	276456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139846
5365	NC_015580	TTG	2	6	276474	276479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139846
5366	NC_015580	AAC	2	6	276548	276553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139846
5367	NC_015580	CGCGT	2	10	276578	276587	0 %	20 %	40 %	40 %	334139846
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5370	NC_015580	TTG	2	6	276737	276742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139846
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5372	NC_015580	TGG	2	6	276789	276794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139846
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5374	NC_015580	CG	3	6	276812	276817	0 %	0 %	50 %	50 %	334139846
5375	NC_015580	CG	4	8	276851	276858	0 %	0 %	50 %	50 %	334139846
5376	NC_015580	CACCCA	2	12	276870	276881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139846
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5380	NC_015580	GAA	2	6	277266	277271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139847
5381	NC_015580	CAAA	2	8	277281	277288	75 %	0 %	0 %	25 %	334139847
5382	NC_015580	GGA	2	6	277323	277328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139847
5383	NC_015580	CG	3	6	277330	277335	0 %	0 %	50 %	50 %	334139847
5384	NC_015580	GTG	2	6	277363	277368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139847
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5389	NC_015580	CCG	2	6	277537	277542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139847
5390	NC_015580	GGC	2	6	277563	277568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139847
5391	NC_015580	AAG	2	6	277582	277587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139847
5392	NC_015580	ATCA	2	8	277677	277684	50 %	25 %	0 %	25 %	334139847
5393	NC_015580	CAT	2	6	277800	277805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139848
5394	NC_015580	C	7	7	277818	277824	0 %	0 %	0 %	100 %	334139848
5395	NC_015580	CT	3	6	277844	277849	0 %	50 %	0 %	50 %	334139848
5396	NC_015580	T	6	6	277849	277854	0 %	100 %	0 %	0 %	334139848
5397	NC_015580	GTTG	2	8	277960	277967	0 %	50 %	50 %	0 %	334139848
5398	NC_015580	AACG	2	8	277984	277991	50 %	0 %	25 %	25 %	334139848
5399	NC_015580	ATTCA	2	10	278029	278038	40 %	40 %	0 %	20 %	334139848
5400	NC_015580	GCC	2	6	278062	278067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139848
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5425	NC_015580	TCA	2	6	279205	279210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139851
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5433	NC_015580	CT	3	6	279722	279727	0 %	50 %	0 %	50 %	334139852
5434	NC_015580	CCAC	2	8	279737	279744	25 %	0 %	0 %	75 %	334139852
5435	NC_015580	AAC	2	6	279745	279750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139852
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5438	NC_015580	GCT	2	6	280013	280018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139852
5439	NC_015580	CTG	2	6	280073	280078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139852
5440	NC_015580	TGC	2	6	280105	280110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139852
5441	NC_015580	CGA	2	6	280114	280119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139852
5442	NC_015580	AGA	2	6	280177	280182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139852
5443	NC_015580	CTA	2	6	280301	280306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139853
5444	NC_015580	CCCGGC	2	12	280329	280340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139853
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5450	NC_015580	CCG	2	6	280650	280655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139853
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5454	NC_015580	GCT	3	9	280748	280756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139853
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5464	NC_015580	GCT	2	6	281231	281236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139853
5465	NC_015580	GGTCAC	2	12	281253	281264	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334139853
5466	NC_015580	CAT	2	6	281321	281326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139853
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5469	NC_015580	CCATG	2	10	281621	281630	20 %	20 %	20 %	40 %	334139854
5470	NC_015580	CGA	2	6	281632	281637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139854
5471	NC_015580	CCTG	2	8	281664	281671	0 %	25 %	25 %	50 %	334139854
5472	NC_015580	CG	3	6	281713	281718	0 %	0 %	50 %	50 %	334139854
5473	NC_015580	GGT	2	6	281852	281857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139854
5474	NC_015580	GCGG	2	8	281874	281881	0 %	0 %	75 %	25 %	334139854
5475	NC_015580	CTTGAT	2	12	281900	281911	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	334139854
5476	NC_015580	GCTG	2	8	281950	281957	0 %	25 %	50 %	25 %	334139854
5477	NC_015580	AGC	2	6	281976	281981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139854
5478	NC_015580	AAGTCC	2	12	282114	282125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	334139854
5479	NC_015580	GCC	2	6	282167	282172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139854
5480	NC_015580	GAA	2	6	282191	282196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139854
5481	NC_015580	GC	3	6	282201	282206	0 %	0 %	50 %	50 %	334139854
5482	NC_015580	GGA	2	6	282232	282237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139854
5483	NC_015580	TGG	2	6	282271	282276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139854
5484	NC_015580	TGA	2	6	282301	282306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139854
5485	NC_015580	GTC	2	6	282346	282351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139855
5486	NC_015580	AAGG	2	8	282375	282382	50 %	0 %	50 %	0 %	334139855
5487	NC_015580	GC	3	6	282535	282540	0 %	0 %	50 %	50 %	334139855
5488	NC_015580	TTG	2	6	282568	282573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139855
5489	NC_015580	CGC	2	6	282590	282595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139855
5490	NC_015580	GAT	2	6	282626	282631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139855
5491	NC_015580	GC	3	6	282737	282742	0 %	0 %	50 %	50 %	334139855
5492	NC_015580	CGC	2	6	282895	282900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139855
5493	NC_015580	C	6	6	282910	282915	0 %	0 %	0 %	100 %	334139855
5494	NC_015580	GC	3	6	282959	282964	0 %	0 %	50 %	50 %	334139855
5495	NC_015580	TGC	2	6	283313	283318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139856
5496	NC_015580	ATCG	2	8	283335	283342	25 %	25 %	25 %	25 %	334139856
5497	NC_015580	CTGG	2	8	283347	283354	0 %	25 %	50 %	25 %	334139856
5498	NC_015580	CAT	2	6	283470	283475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139856
5499	NC_015580	CAT	2	6	283489	283494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139856
5500	NC_015580	CG	3	6	283523	283528	0 %	0 %	50 %	50 %	334139856

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