MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 3160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015579	GCGG	2	8	119940	119947	0 %	0 %	75 %	25 %	334133336
2002	NC_015579	GCT	2	6	119964	119969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133336
2003	NC_015579	GC	3	6	120063	120068	0 %	0 %	50 %	50 %	334133336
2004	NC_015579	GAG	2	6	120150	120155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133337
2005	NC_015579	TCG	2	6	120160	120165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133337
2006	NC_015579	ATG	2	6	120178	120183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133337
2007	NC_015579	TCG	2	6	120286	120291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133337
2008	NC_015579	GAA	2	6	120435	120440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133337
2009	NC_015579	TATT	2	8	120485	120492	25 %	75 %	0 %	0 %	334133337
2010	NC_015579	CGG	2	6	120506	120511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133337
2011	NC_015579	ACG	2	6	120523	120528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133337
2012	NC_015579	CGC	2	6	120531	120536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133337
2013	NC_015579	CCG	2	6	120581	120586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133337
2014	NC_015579	CCGCG	2	10	120595	120604	0 %	0 %	40 %	60 %	334133337
2015	NC_015579	CGC	2	6	120605	120610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133337
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2018	NC_015579	GCT	2	6	120891	120896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133338
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2021	NC_015579	GGC	2	6	120975	120980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133338
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2023	NC_015579	GGTCGC	2	12	121061	121072	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334133338
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2030	NC_015579	CAG	2	6	121698	121703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133340
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2033	NC_015579	CCA	2	6	122149	122154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133341
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2053	NC_015579	GAG	2	6	123308	123313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133342
2054	NC_015579	GA	3	6	123333	123338	50 %	0 %	50 %	0 %	334133342
2055	NC_015579	TGC	2	6	123351	123356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133342
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2058	NC_015579	CCGG	2	8	123514	123521	0 %	0 %	50 %	50 %	334133342
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2062	NC_015579	GGC	2	6	123639	123644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133342
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2089	NC_015579	GCTTCC	2	12	124729	124740	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	334133343
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2117	NC_015579	TCT	2	6	127694	127699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133348
2118	NC_015579	GTA	2	6	127717	127722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133348
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2121	NC_015579	TCG	2	6	127991	127996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133349
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2231	NC_015579	GAA	2	6	136077	136082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133360
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2235	NC_015579	CCCA	2	8	136258	136265	25 %	0 %	0 %	75 %	334133360
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2239	NC_015579	GGA	2	6	136928	136933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133361
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2241	NC_015579	CGA	2	6	136964	136969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133361
2242	NC_015579	CGA	2	6	137401	137406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133362
2243	NC_015579	TGA	2	6	137464	137469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133362
2244	NC_015579	ATC	2	6	137487	137492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133362
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2353	NC_015579	CAGT	2	8	143900	143907	25 %	25 %	25 %	25 %	334133373
2354	NC_015579	GGT	2	6	143931	143936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133373
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2362	NC_015579	GGC	2	6	145118	145123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133375
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2364	NC_015579	CTG	2	6	145155	145160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133375
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2485	NC_015579	GC	3	6	151259	151264	0 %	0 %	50 %	50 %	334133380
2486	NC_015579	GCT	2	6	151441	151446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133380
2487	NC_015579	TTC	2	6	151604	151609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133380
2488	NC_015579	CCTGA	2	10	151678	151687	20 %	20 %	20 %	40 %	334133380
2489	NC_015579	TCT	2	6	151763	151768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133380
2490	NC_015579	CGA	2	6	151804	151809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133380
2491	NC_015579	TCA	2	6	151842	151847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133380
2492	NC_015579	AAG	2	6	151882	151887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133380
2493	NC_015579	GGCA	2	8	151963	151970	25 %	0 %	50 %	25 %	334133380
2494	NC_015579	GCT	2	6	151973	151978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133380
2495	NC_015579	TCG	2	6	152051	152056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133380
2496	NC_015579	GCT	2	6	152180	152185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133380
2497	NC_015579	CTG	2	6	152212	152217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133380
2498	NC_015579	CGCTG	2	10	152274	152283	0 %	20 %	40 %	40 %	334133380
2499	NC_015579	GCT	2	6	152289	152294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133380
2500	NC_015579	CTT	2	6	152350	152355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133380

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