MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 3160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015579	GGC	2	6	59454	59459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133280
1002	NC_015579	GTG	2	6	59463	59468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133280
1003	NC_015579	ACC	2	6	59502	59507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133280
1004	NC_015579	T	6	6	59548	59553	0 %	100 %	0 %	0 %	334133280
1005	NC_015579	AAC	2	6	59690	59695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334133280
1006	NC_015579	ACC	3	9	59751	59759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133280
1007	NC_015579	AGCG	2	8	59761	59768	25 %	0 %	50 %	25 %	334133280
1008	NC_015579	AAAC	2	8	59782	59789	75 %	0 %	0 %	25 %	334133280
1009	NC_015579	TGCG	2	8	59810	59817	0 %	25 %	50 %	25 %	334133280
1010	NC_015579	TGC	2	6	59819	59824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133280
1011	NC_015579	ACC	2	6	59827	59832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133280
1012	NC_015579	CTG	2	6	59960	59965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133280
1013	NC_015579	CGATTG	2	12	59984	59995	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334133280
1014	NC_015579	AGT	2	6	60056	60061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133280
1015	NC_015579	ATC	2	6	60202	60207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133280
1016	NC_015579	ATC	2	6	60470	60475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133281
1017	NC_015579	GAGG	2	8	60490	60497	25 %	0 %	75 %	0 %	334133281
1018	NC_015579	CAA	2	6	60608	60613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334133281
1019	NC_015579	TTTCAT	2	12	60716	60727	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	334133281
1020	NC_015579	TCC	2	6	60765	60770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334133281
1021	NC_015579	CAT	2	6	60797	60802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133281
1022	NC_015579	GCG	2	6	60816	60821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133281
1023	NC_015579	CCA	2	6	60931	60936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133281
1024	NC_015579	TAG	2	6	60966	60971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133281
1025	NC_015579	GTT	2	6	61033	61038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133281
1026	NC_015579	AGT	2	6	61089	61094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133281
1027	NC_015579	GAG	2	6	61128	61133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133281
1028	NC_015579	GC	3	6	61154	61159	0 %	0 %	50 %	50 %	334133281
1029	NC_015579	CGG	3	9	61174	61182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133281
1030	NC_015579	GAT	2	6	61205	61210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133281
1031	NC_015579	T	6	6	61238	61243	0 %	100 %	0 %	0 %	334133281
1032	NC_015579	AAT	2	6	61291	61296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334133281
1033	NC_015579	TC	3	6	61334	61339	0 %	50 %	0 %	50 %	334133281
1034	NC_015579	TCT	2	6	61356	61361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133281
1035	NC_015579	CGA	2	6	61604	61609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133282
1036	NC_015579	CAAG	2	8	61623	61630	50 %	0 %	25 %	25 %	334133282
1037	NC_015579	GCC	2	6	61760	61765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133282
1038	NC_015579	AGC	2	6	61943	61948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133282
1039	NC_015579	TAG	2	6	61996	62001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133282
1040	NC_015579	TGG	2	6	62006	62011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133282
1041	NC_015579	TACG	2	8	62044	62051	25 %	25 %	25 %	25 %	334133282
1042	NC_015579	TCG	2	6	62069	62074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133282
1043	NC_015579	TGC	2	6	62128	62133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133282
1044	NC_015579	CCTT	2	8	62174	62181	0 %	50 %	0 %	50 %	334133282
1045	NC_015579	A	6	6	62281	62286	100 %	0 %	0 %	0 %	334133282
1046	NC_015579	TGC	2	6	62338	62343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133282
1047	NC_015579	GTC	2	6	62428	62433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133282
1048	NC_015579	CTT	2	6	62479	62484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133282
1049	NC_015579	ATG	2	6	62645	62650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133282
1050	NC_015579	CGA	2	6	62660	62665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133282
1051	NC_015579	ATG	2	6	62693	62698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133282
1052	NC_015579	TCC	2	6	62758	62763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334133283
1053	NC_015579	AAGT	2	8	62765	62772	50 %	25 %	25 %	0 %	334133283
1054	NC_015579	TCC	2	6	62797	62802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334133283
1055	NC_015579	GCG	2	6	62808	62813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133283
1056	NC_015579	TGC	2	6	62947	62952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133283
1057	NC_015579	GCC	2	6	62965	62970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133283
1058	NC_015579	TCG	2	6	63040	63045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133283
1059	NC_015579	ATTT	2	8	63063	63070	25 %	75 %	0 %	0 %	334133283
1060	NC_015579	CCA	2	6	63073	63078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133283
1061	NC_015579	GTC	2	6	63114	63119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133283
1062	NC_015579	GGT	2	6	63318	63323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133283
1063	NC_015579	CAGG	2	8	63359	63366	25 %	0 %	50 %	25 %	334133283
1064	NC_015579	GC	3	6	63396	63401	0 %	0 %	50 %	50 %	334133283
1065	NC_015579	GC	3	6	63443	63448	0 %	0 %	50 %	50 %	334133283
1066	NC_015579	TGC	2	6	63469	63474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133283
1067	NC_015579	TTG	2	6	63480	63485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133283
1068	NC_015579	TCG	2	6	63493	63498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133283
1069	NC_015579	TCG	2	6	63593	63598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133283
1070	NC_015579	GTC	2	6	63636	63641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133283
1071	NC_015579	TGC	2	6	63690	63695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133283
1072	NC_015579	AGGT	2	8	63811	63818	25 %	25 %	50 %	0 %	334133283
1073	NC_015579	CAT	2	6	63920	63925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133283
1074	NC_015579	GGT	2	6	64105	64110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133284
1075	NC_015579	GAA	2	6	64135	64140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133284
1076	NC_015579	GGCTT	2	10	64145	64154	0 %	40 %	40 %	20 %	334133284
1077	NC_015579	AGCT	2	8	64539	64546	25 %	25 %	25 %	25 %	334133285
1078	NC_015579	GAT	2	6	64608	64613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133285
1079	NC_015579	TCG	2	6	64696	64701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133285
1080	NC_015579	GAT	2	6	64722	64727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133285
1081	NC_015579	GC	3	6	64753	64758	0 %	0 %	50 %	50 %	334133285
1082	NC_015579	AGAT	2	8	64792	64799	50 %	25 %	25 %	0 %	334133285
1083	NC_015579	TGA	2	6	64865	64870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133285
1084	NC_015579	TC	3	6	65042	65047	0 %	50 %	0 %	50 %	334133285
1085	NC_015579	GAC	2	6	65079	65084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133285
1086	NC_015579	AGG	2	6	65321	65326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133286
1087	NC_015579	TCT	2	6	65496	65501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133286
1088	NC_015579	GGC	2	6	65502	65507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133286
1089	NC_015579	CCAG	2	8	65509	65516	25 %	0 %	25 %	50 %	334133286
1090	NC_015579	CACG	2	8	65608	65615	25 %	0 %	25 %	50 %	334133286
1091	NC_015579	AGG	2	6	65731	65736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133286
1092	NC_015579	GGT	2	6	65780	65785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133286
1093	NC_015579	CAG	2	6	65861	65866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133286
1094	NC_015579	GAC	2	6	65873	65878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133286
1095	NC_015579	GCT	2	6	65917	65922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133286
1096	NC_015579	GCA	2	6	65995	66000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133287
1097	NC_015579	TCG	2	6	66055	66060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133287
1098	NC_015579	GC	3	6	66202	66207	0 %	0 %	50 %	50 %	334133287
1099	NC_015579	GCAC	2	8	66277	66284	25 %	0 %	25 %	50 %	334133287
1100	NC_015579	GCG	2	6	66311	66316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133287
1101	NC_015579	ATC	2	6	66379	66384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133287
1102	NC_015579	CCA	2	6	66416	66421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133287
1103	NC_015579	CGCC	2	8	66422	66429	0 %	0 %	25 %	75 %	334133287
1104	NC_015579	CGTT	2	8	66529	66536	0 %	50 %	25 %	25 %	334133287
1105	NC_015579	TTG	2	6	66541	66546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133287
1106	NC_015579	GCA	2	6	66589	66594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133287
1107	NC_015579	CGT	2	6	66639	66644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133287
1108	NC_015579	CTG	2	6	66648	66653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133287
1109	NC_015579	CTT	2	6	66663	66668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133287
1110	NC_015579	CG	3	6	66800	66805	0 %	0 %	50 %	50 %	334133287
1111	NC_015579	GCG	2	6	66823	66828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133287
1112	NC_015579	AGC	2	6	66868	66873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133287
1113	NC_015579	GAC	2	6	66990	66995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133287
1114	NC_015579	TGCT	2	8	67028	67035	0 %	50 %	25 %	25 %	334133287
1115	NC_015579	ACG	2	6	67040	67045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133287
1116	NC_015579	TTCA	2	8	67048	67055	25 %	50 %	0 %	25 %	334133287
1117	NC_015579	TGC	2	6	67484	67489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133288
1118	NC_015579	ACG	2	6	67537	67542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133288
1119	NC_015579	GCC	2	6	67607	67612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133288
1120	NC_015579	CCT	2	6	67668	67673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334133288
1121	NC_015579	GGA	2	6	67695	67700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133288
1122	NC_015579	CCT	2	6	67741	67746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334133288
1123	NC_015579	TCG	2	6	67792	67797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133288
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1125	NC_015579	ACGC	2	8	67817	67824	25 %	0 %	25 %	50 %	334133288
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1376	NC_015579	ATC	2	6	83245	83250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133302
1377	NC_015579	GCT	2	6	83261	83266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133302
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1498	NC_015579	CGAT	2	8	89061	89068	25 %	25 %	25 %	25 %	334133306
1499	NC_015579	CGA	2	6	89130	89135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133306
1500	NC_015579	CGGCG	2	10	89189	89198	0 %	0 %	60 %	40 %	334133306

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