MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21201

Total Repeats: 995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015223	TTC	2	6	250	255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325983715
2	NC_015223	ACA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325983715
3	NC_015223	CTT	2	6	315	320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325983715
4	NC_015223	ATT	2	6	583	588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983715
5	NC_015223	TAC	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983715
6	NC_015223	CAT	2	6	828	833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983715
7	NC_015223	TGC	2	6	872	877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983715
8	NC_015223	TTA	2	6	1238	1243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983715
9	NC_015223	TTG	2	6	1505	1510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325983716
10	NC_015223	AGC	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983716
11	NC_015223	TGA	2	6	1722	1727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983716
12	NC_015223	AGC	2	6	1808	1813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983716
13	NC_015223	GCT	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983716
14	NC_015223	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983716
15	NC_015223	AGT	2	6	2312	2317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983716
16	NC_015223	TCT	3	9	2383	2391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325983716
17	NC_015223	CTT	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325983716
18	NC_015223	TGC	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983716
19	NC_015223	GGT	2	6	2499	2504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325983716
20	NC_015223	ATT	2	6	2624	2629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983716
21	NC_015223	CCA	2	6	2697	2702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325983716
22	NC_015223	TAC	2	6	2705	2710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
23	NC_015223	CTG	2	6	2740	2745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983716
24	NC_015223	TTC	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325983716
25	NC_015223	CTT	3	9	2860	2868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325983716
26	NC_015223	CTA	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
27	NC_015223	TCA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
28	NC_015223	ACA	2	6	2928	2933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325983716
29	NC_015223	CTG	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983716
30	NC_015223	AGC	2	6	2999	3004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983716
31	NC_015223	CCA	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325983716
32	NC_015223	TTG	2	6	3197	3202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325983716
33	NC_015223	TAC	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
34	NC_015223	TCA	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
35	NC_015223	GAT	2	6	3611	3616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983716
36	NC_015223	ATC	2	6	3656	3661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
37	NC_015223	TCT	2	6	3684	3689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325983716
38	NC_015223	TAA	2	6	4006	4011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325983716
39	NC_015223	CAC	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325983716
40	NC_015223	CAA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325983716
41	NC_015223	TTA	2	6	4144	4149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983716
42	NC_015223	CAT	2	6	4271	4276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
43	NC_015223	TCA	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
44	NC_015223	CTA	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
45	NC_015223	CAA	2	6	4555	4560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325983716
46	NC_015223	TCA	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
47	NC_015223	GCA	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983716
48	NC_015223	TGA	2	6	4950	4955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983716
49	NC_015223	TCG	2	6	5034	5039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983716
50	NC_015223	GCC	2	6	5102	5107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325983716
51	NC_015223	TAT	2	6	5116	5121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983716
52	NC_015223	TTG	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325983716
53	NC_015223	CCA	2	6	5214	5219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325983716
54	NC_015223	CTA	2	6	5245	5250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
55	NC_015223	GTC	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983716
56	NC_015223	TGA	2	6	5266	5271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983716
57	NC_015223	TGC	2	6	5415	5420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983716
58	NC_015223	TAC	2	6	5492	5497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
59	NC_015223	TTA	2	6	5637	5642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983716
60	NC_015223	AAT	2	6	5746	5751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325983716
61	NC_015223	TTA	2	6	5752	5757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983716
62	NC_015223	AGG	2	6	5980	5985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325983717
63	NC_015223	AGC	2	6	6052	6057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983717
64	NC_015223	AGA	2	6	6087	6092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325983717
65	NC_015223	ATC	2	6	6145	6150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983717
66	NC_015223	TGA	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983717
67	NC_015223	TGA	2	6	6209	6214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983717
68	NC_015223	TAG	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983717
69	NC_015223	ACT	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983718
70	NC_015223	CCA	2	6	6786	6791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325983718
71	NC_015223	ACC	2	6	6860	6865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325983718
72	NC_015223	ACG	2	6	7043	7048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983718
73	NC_015223	GTG	2	6	7395	7400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325983718
74	NC_015223	GAT	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983718
75	NC_015223	ATC	2	6	7460	7465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983718
76	NC_015223	GAA	2	6	7512	7517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325983718
77	NC_015223	GTT	2	6	7668	7673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325983718
78	NC_015223	TAT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983719
79	NC_015223	TTC	2	6	8138	8143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325983719
80	NC_015223	TTG	2	6	8179	8184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325983719
81	NC_015223	ATG	2	6	8358	8363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983719
82	NC_015223	CGT	2	6	8387	8392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983719
83	NC_015223	ATT	2	6	8466	8471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983719
84	NC_015223	ACG	2	6	8622	8627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983719
85	NC_015223	TGA	2	6	8672	8677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983719
86	NC_015223	TAA	2	6	8696	8701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325983719
87	NC_015223	CAG	2	6	8785	8790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983719
88	NC_015223	TTC	2	6	9105	9110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325983720
89	NC_015223	TAA	2	6	9725	9730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325983721
90	NC_015223	TAT	2	6	9731	9736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983721
91	NC_015223	TTA	2	6	9739	9744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983721
92	NC_015223	TGA	2	6	9777	9782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983721
93	NC_015223	ATT	2	6	9992	9997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983721
94	NC_015223	ATT	2	6	10012	10017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983721
95	NC_015223	CGG	2	6	10053	10058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983721
96	NC_015223	CTG	2	6	10093	10098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983721
97	NC_015223	TAC	2	6	10121	10126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983721
98	NC_015223	CAG	2	6	10153	10158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983721
99	NC_015223	CGA	2	6	10170	10175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983721
100	NC_015223	TGG	2	6	10244	10249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325983721
101	NC_015223	TGA	2	6	10522	10527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983722
102	NC_015223	CGG	2	6	10559	10564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983722
103	NC_015223	CAG	2	6	10583	10588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983722
104	NC_015223	GAA	2	6	10620	10625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325983722
105	NC_015223	TAA	2	6	10630	10635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325983722
106	NC_015223	TAA	2	6	10663	10668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325983722
107	NC_015223	CTG	2	6	10771	10776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983722
108	NC_015223	TGA	2	6	10778	10783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983722
109	NC_015223	TGC	2	6	10835	10840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983722
110	NC_015223	TGG	2	6	10983	10988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325983723
111	NC_015223	TAA	2	6	11155	11160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325983723
112	NC_015223	GCA	2	6	11189	11194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983723
113	NC_015223	AAT	2	6	11248	11253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325983723
114	NC_015223	TAA	2	6	11267	11272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325983723
115	NC_015223	GGC	2	6	11746	11751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983724
116	NC_015223	TAT	2	6	11773	11778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983724
117	NC_015223	TAG	2	6	11779	11784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983724
118	NC_015223	GAA	2	6	11804	11809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325983724
119	NC_015223	GCT	2	6	11990	11995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983724
120	NC_015223	TGA	2	6	12040	12045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983724
121	NC_015223	ATT	2	6	12253	12258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983724
122	NC_015223	GAA	2	6	12346	12351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325983724
123	NC_015223	CGG	2	6	12403	12408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983724
124	NC_015223	TGA	2	6	13046	13051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983725
125	NC_015223	TAT	2	6	13193	13198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983725
126	NC_015223	TCA	2	6	13295	13300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983725
127	NC_015223	CGC	2	6	13371	13376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325983725
128	NC_015223	ATC	2	6	13447	13452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983725
129	NC_015223	CTA	2	6	13466	13471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983725
130	NC_015223	ATT	2	6	13484	13489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983725
131	NC_015223	CGA	2	6	14866	14871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983726
132	NC_015223	CAC	2	6	14887	14892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325983726
133	NC_015223	CCA	2	6	14964	14969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325983726
134	NC_015223	CAT	2	6	15021	15026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983726
135	NC_015223	GAT	2	6	15032	15037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983726
136	NC_015223	CAT	2	6	15070	15075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983726
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142	NC_015223	CGG	2	6	15677	15682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983726
143	NC_015223	ACC	2	6	15712	15717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325983726
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150	NC_015223	GTC	2	6	16226	16231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983726
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152	NC_015223	CAA	2	6	16318	16323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325983726
153	NC_015223	ATT	2	6	16372	16377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983726
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161	NC_015223	ACA	2	6	16899	16904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325983726
162	NC_015223	CCA	2	6	16971	16976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325983726
163	NC_015223	TCC	2	6	17036	17041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325983726
164	NC_015223	GGC	2	6	17050	17055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983726
165	NC_015223	AGC	2	6	17134	17139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983726
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232	NC_015223	ATT	2	6	23112	23117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983731
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239	NC_015223	TTG	2	6	23854	23859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325983732
240	NC_015223	CCT	2	6	23911	23916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325983732
241	NC_015223	TCA	2	6	23951	23956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983732
242	NC_015223	TGA	2	6	23969	23974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983732
243	NC_015223	TAT	2	6	24069	24074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983733
244	NC_015223	AGC	2	6	24222	24227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983733
245	NC_015223	GCG	2	6	24234	24239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983733
246	NC_015223	GGC	3	9	24264	24272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983733
247	NC_015223	GTT	2	6	24277	24282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325983733
248	NC_015223	GGC	2	6	24355	24360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983734
249	NC_015223	ACA	2	6	24664	24669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325983734
250	NC_015223	GGC	2	6	24688	24693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983734
251	NC_015223	AAT	2	6	24709	24714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325983734
252	NC_015223	TGT	2	6	24755	24760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325983734
253	NC_015223	GTC	2	6	24817	24822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983734
254	NC_015223	TCA	2	6	24847	24852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983734
255	NC_015223	CGC	2	6	24868	24873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325983734
256	NC_015223	AGC	2	6	24909	24914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983734
257	NC_015223	GGT	2	6	25120	25125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325983734
258	NC_015223	TGG	2	6	25202	25207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325983734
259	NC_015223	TTA	2	6	25536	25541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325983734
260	NC_015223	CAA	2	6	25585	25590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325983734
261	NC_015223	ATG	2	6	25757	25762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983734
262	NC_015223	ATC	2	6	25793	25798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983734
263	NC_015223	TAC	2	6	25885	25890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983734
264	NC_015223	GCG	2	6	25963	25968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983734
265	NC_015223	ACT	2	6	25990	25995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983734
266	NC_015223	GGT	2	6	26008	26013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325983734
267	NC_015223	CCT	2	6	26071	26076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325983734
268	NC_015223	ATG	2	6	26164	26169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983734
269	NC_015223	TGG	2	6	26302	26307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325983734
270	NC_015223	GCC	2	6	26370	26375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325983734
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273	NC_015223	GAA	2	6	26689	26694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325983734
274	NC_015223	GTG	2	6	26786	26791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325983734
275	NC_015223	CAT	2	6	26913	26918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983734
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277	NC_015223	GTC	2	6	28803	28808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983735
278	NC_015223	TAA	2	6	28820	28825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325983735
279	NC_015223	CTG	2	6	28958	28963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983735
280	NC_015223	TGA	2	6	28983	28988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983735
281	NC_015223	TGT	2	6	28989	28994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325983735
282	NC_015223	TGT	2	6	29019	29024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325983735
283	NC_015223	TGG	2	6	29149	29154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325983735
284	NC_015223	AGC	2	6	29663	29668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325983736
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293	NC_015223	CCT	2	6	29965	29970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325983737
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344	NC_015223	ATG	2	6	33265	33270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325983740
345	NC_015223	CCG	2	6	33271	33276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325983740
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360	NC_015223	CTG	2	6	35216	35221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983743
361	NC_015223	ACT	2	6	35227	35232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983743
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363	NC_015223	CGC	2	6	35306	35311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325983743
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369	NC_015223	GCG	2	6	35632	35637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325983743
370	NC_015223	ACC	2	6	35638	35643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325983743
371	NC_015223	TCA	2	6	35730	35735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983743
372	NC_015223	TCA	2	6	36010	36015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983744
373	NC_015223	TGG	2	6	36044	36049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325983744
374	NC_015223	CAA	2	6	36059	36064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325983744
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