MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 51477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015222	GATT	2	8	142725	142732	25 %	50 %	25 %	0 %	325980994
2502	NC_015222	AAT	2	6	142753	142758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980994
2503	NC_015222	AGG	2	6	142768	142773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980994
2504	NC_015222	ACG	2	6	142783	142788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980994
2505	NC_015222	GAG	2	6	142793	142798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980994
2506	NC_015222	CG	3	6	142834	142839	0 %	0 %	50 %	50 %	325980994
2507	NC_015222	CGC	2	6	142886	142891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980994
2508	NC_015222	ATC	2	6	142894	142899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980994
2509	NC_015222	TGC	2	6	142932	142937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980994
2510	NC_015222	GAA	2	6	142946	142951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980994
2511	NC_015222	CG	3	6	142968	142973	0 %	0 %	50 %	50 %	325980994
2512	NC_015222	TAG	2	6	143191	143196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980994
2513	NC_015222	TGA	3	9	143218	143226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980994
2514	NC_015222	CGG	2	6	143263	143268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980994
2515	NC_015222	TG	3	6	143281	143286	0 %	50 %	50 %	0 %	325980994
2516	NC_015222	TCT	2	6	143336	143341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980994
2517	NC_015222	CA	3	6	143508	143513	50 %	0 %	0 %	50 %	325980994
2518	NC_015222	GTC	2	6	143564	143569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980994
2519	NC_015222	AG	3	6	143588	143593	50 %	0 %	50 %	0 %	325980994
2520	NC_015222	GCG	2	6	143711	143716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980994
2521	NC_015222	CGA	2	6	143791	143796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980994
2522	NC_015222	GCA	2	6	143800	143805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980994
2523	NC_015222	TGGC	2	8	143935	143942	0 %	25 %	50 %	25 %	325980994
2524	NC_015222	TATC	2	8	143944	143951	25 %	50 %	0 %	25 %	325980994
2525	NC_015222	TTC	2	6	144105	144110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980994
2526	NC_015222	GCA	2	6	144121	144126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980994
2527	NC_015222	TGG	2	6	144128	144133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980994
2528	NC_015222	TCC	2	6	144136	144141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325980994
2529	NC_015222	GCGT	2	8	144153	144160	0 %	25 %	50 %	25 %	325980994
2530	NC_015222	GAT	2	6	144173	144178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980994
2531	NC_015222	TGA	2	6	144241	144246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980994
2532	NC_015222	GAA	3	9	144284	144292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980994
2533	NC_015222	ACCA	2	8	144303	144310	50 %	0 %	0 %	50 %	325980994
2534	NC_015222	GTG	2	6	144408	144413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980994
2535	NC_015222	ATG	2	6	144420	144425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980994
2536	NC_015222	TGGC	2	8	144467	144474	0 %	25 %	50 %	25 %	325980994
2537	NC_015222	GTT	2	6	144499	144504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980994
2538	NC_015222	CGA	2	6	144617	144622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980994
2539	NC_015222	GATT	2	8	144676	144683	25 %	50 %	25 %	0 %	325980994
2540	NC_015222	GCT	2	6	144749	144754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980994
2541	NC_015222	TGC	2	6	144892	144897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980994
2542	NC_015222	TG	3	6	145032	145037	0 %	50 %	50 %	0 %	325980994
2543	NC_015222	AT	3	6	145041	145046	50 %	50 %	0 %	0 %	325980994
2544	NC_015222	GGC	2	6	145073	145078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980994
2545	NC_015222	GGAT	2	8	145103	145110	25 %	25 %	50 %	0 %	325980994
2546	NC_015222	ACT	2	6	145132	145137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980994
2547	NC_015222	TAT	2	6	145204	145209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980994
2548	NC_015222	ATCAC	2	10	145236	145245	40 %	20 %	0 %	40 %	325980994
2549	NC_015222	TAA	2	6	145309	145314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980994
2550	NC_015222	ACC	2	6	145380	145385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980994
2551	NC_015222	GCT	2	6	145401	145406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980994
2552	NC_015222	CTG	2	6	145573	145578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980995
2553	NC_015222	CTT	2	6	145593	145598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980995
2554	NC_015222	GCC	2	6	145663	145668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980995
2555	NC_015222	ATC	2	6	145693	145698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980995
2556	NC_015222	CCA	2	6	145719	145724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980995
2557	NC_015222	ACT	2	6	145787	145792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980995
2558	NC_015222	CCTT	2	8	145841	145848	0 %	50 %	0 %	50 %	325980995
2559	NC_015222	TGC	2	6	146040	146045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980995
2560	NC_015222	TGA	2	6	146067	146072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980995
2561	NC_015222	ATG	2	6	146125	146130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980995
2562	NC_015222	GCA	2	6	146141	146146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980995
2563	NC_015222	CAT	2	6	146167	146172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980995
2564	NC_015222	ATT	2	6	146203	146208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980995
2565	NC_015222	GGTG	2	8	146212	146219	0 %	25 %	75 %	0 %	325980995
2566	NC_015222	CAT	2	6	146359	146364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980995
2567	NC_015222	AT	4	8	146396	146403	50 %	50 %	0 %	0 %	325980995
2568	NC_015222	TCA	2	6	146454	146459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980995
2569	NC_015222	ATCA	2	8	146515	146522	50 %	25 %	0 %	25 %	325980995
2570	NC_015222	ATT	2	6	146596	146601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980995
2571	NC_015222	GTT	2	6	146602	146607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980995
2572	NC_015222	GTG	3	9	146663	146671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980995
2573	NC_015222	T	6	6	146694	146699	0 %	100 %	0 %	0 %	325980995
2574	NC_015222	AAT	2	6	146859	146864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980995
2575	NC_015222	GAA	2	6	146893	146898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980995
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2578	NC_015222	AATC	2	8	146961	146968	50 %	25 %	0 %	25 %	325980995
2579	NC_015222	CAT	2	6	147003	147008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980995
2580	NC_015222	GCA	2	6	147035	147040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980995
2581	NC_015222	ATAC	2	8	147069	147076	50 %	25 %	0 %	25 %	325980995
2582	NC_015222	CGC	3	9	147105	147113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980995
2583	NC_015222	TGC	2	6	147143	147148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980995
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2585	NC_015222	GCG	2	6	147284	147289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980995
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2587	NC_015222	GC	3	6	147322	147327	0 %	0 %	50 %	50 %	325980995
2588	NC_015222	CCA	2	6	147449	147454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980995
2589	NC_015222	CATG	2	8	147477	147484	25 %	25 %	25 %	25 %	325980995
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2591	NC_015222	ATCA	2	8	147601	147608	50 %	25 %	0 %	25 %	325980995
2592	NC_015222	CGAT	2	8	147669	147676	25 %	25 %	25 %	25 %	325980995
2593	NC_015222	AAT	2	6	147760	147765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980995
2594	NC_015222	ATCG	2	8	147868	147875	25 %	25 %	25 %	25 %	325980995
2595	NC_015222	CAA	2	6	147891	147896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980995
2596	NC_015222	CAA	2	6	147916	147921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980995
2597	NC_015222	TTG	2	6	148055	148060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980995
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2599	NC_015222	TGCC	2	8	148140	148147	0 %	25 %	25 %	50 %	325980995
2600	NC_015222	AATGT	2	10	148190	148199	40 %	40 %	20 %	0 %	325980995
2601	NC_015222	GTT	2	6	148205	148210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980995
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2603	NC_015222	TTCC	2	8	148358	148365	0 %	50 %	0 %	50 %	325980996
2604	NC_015222	ATT	2	6	148389	148394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980996
2605	NC_015222	T	6	6	148414	148419	0 %	100 %	0 %	0 %	325980996
2606	NC_015222	TTGA	2	8	148464	148471	25 %	50 %	25 %	0 %	325980996
2607	NC_015222	GATC	2	8	148490	148497	25 %	25 %	25 %	25 %	325980996
2608	NC_015222	T	6	6	148570	148575	0 %	100 %	0 %	0 %	325980996
2609	NC_015222	GATTG	2	10	148604	148613	20 %	40 %	40 %	0 %	325980996
2610	NC_015222	CAT	2	6	148652	148657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980996
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2612	NC_015222	GAT	2	6	148713	148718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980996
2613	NC_015222	TTC	2	6	148839	148844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980996
2614	NC_015222	GCGCCT	2	12	148852	148863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325980996
2615	NC_015222	TCA	2	6	148864	148869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980996
2616	NC_015222	ATTA	2	8	148878	148885	50 %	50 %	0 %	0 %	325980996
2617	NC_015222	TGCT	2	8	148945	148952	0 %	50 %	25 %	25 %	325980996
2618	NC_015222	TTG	2	6	148972	148977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980996
2619	NC_015222	TGG	2	6	149033	149038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980996
2620	NC_015222	TGG	2	6	149048	149053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980996
2621	NC_015222	ATCCA	2	10	149079	149088	40 %	20 %	0 %	40 %	325980996
2622	NC_015222	CAT	2	6	149138	149143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980996
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2740	NC_015222	CAT	2	6	156585	156590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981003
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2742	NC_015222	TGC	2	6	156610	156615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981003
2743	NC_015222	CAG	2	6	156756	156761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981003
2744	NC_015222	CGC	2	6	156767	156772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981003
2745	NC_015222	TGC	2	6	156886	156891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981004
2746	NC_015222	GC	3	6	156890	156895	0 %	0 %	50 %	50 %	325981004
2747	NC_015222	TTG	2	6	156923	156928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325981004
2748	NC_015222	ATG	2	6	156950	156955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981004
2749	NC_015222	TCT	2	6	156974	156979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325981004
2750	NC_015222	TGC	2	6	157085	157090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981004
2751	NC_015222	TCG	2	6	157109	157114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981004
2752	NC_015222	GCGG	2	8	157147	157154	0 %	0 %	75 %	25 %	325981004
2753	NC_015222	T	6	6	157210	157215	0 %	100 %	0 %	0 %	325981004
2754	NC_015222	GTT	2	6	157252	157257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325981004
2755	NC_015222	GCC	3	9	157345	157353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981004
2756	NC_015222	CTT	2	6	157425	157430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325981004
2757	NC_015222	TCA	2	6	157442	157447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981004
2758	NC_015222	T	6	6	157492	157497	0 %	100 %	0 %	0 %	325981004
2759	NC_015222	T	7	7	157507	157513	0 %	100 %	0 %	0 %	325981004
2760	NC_015222	TTC	2	6	157531	157536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325981004
2761	NC_015222	GCG	2	6	157570	157575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981004
2762	NC_015222	CG	3	6	157584	157589	0 %	0 %	50 %	50 %	325981004
2763	NC_015222	GCG	2	6	157602	157607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981004
2764	NC_015222	CAA	2	6	157666	157671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325981004
2765	NC_015222	CCAG	2	8	157752	157759	25 %	0 %	25 %	50 %	325981004
2766	NC_015222	TCA	2	6	157770	157775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981004
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2768	NC_015222	CTG	2	6	157854	157859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981004
2769	NC_015222	CCAG	2	8	157860	157867	25 %	0 %	25 %	50 %	325981004
2770	NC_015222	CCA	3	9	157869	157877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325981004
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2779	NC_015222	TCCA	2	8	158274	158281	25 %	25 %	0 %	50 %	325981005
2780	NC_015222	GGC	2	6	158284	158289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981005
2781	NC_015222	CTG	2	6	158371	158376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981005
2782	NC_015222	ATC	2	6	158401	158406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981005
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2785	NC_015222	ACCGGT	2	12	158503	158514	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325981005
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2799	NC_015222	ATG	2	6	159456	159461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981007
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2814	NC_015222	ACT	2	6	160416	160421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981009
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2819	NC_015222	T	6	6	160629	160634	0 %	100 %	0 %	0 %	325981009
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2822	NC_015222	TTG	2	6	160741	160746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325981009
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2827	NC_015222	GGC	2	6	160905	160910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981009
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2829	NC_015222	TCGCA	2	10	161008	161017	20 %	20 %	20 %	40 %	325981009
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2832	NC_015222	CTGG	2	8	161259	161266	0 %	25 %	50 %	25 %	325981009
2833	NC_015222	CG	3	6	161396	161401	0 %	0 %	50 %	50 %	325981009
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2844	NC_015222	AGC	2	6	162202	162207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981010
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2847	NC_015222	ATTT	2	8	162373	162380	25 %	75 %	0 %	0 %	325981011
2848	NC_015222	CAT	3	9	162509	162517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981011
2849	NC_015222	TCAA	2	8	162813	162820	50 %	25 %	0 %	25 %	325981012
2850	NC_015222	AAGA	2	8	162869	162876	75 %	0 %	25 %	0 %	325981012
2851	NC_015222	AAT	2	6	162914	162919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981012
2852	NC_015222	ATAG	2	8	162931	162938	50 %	25 %	25 %	0 %	325981012
2853	NC_015222	GCAAT	2	10	163003	163012	40 %	20 %	20 %	20 %	325981012
2854	NC_015222	GCT	2	6	163029	163034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981012
2855	NC_015222	ATA	2	6	163070	163075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981012
2856	NC_015222	ATG	2	6	163119	163124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981012
2857	NC_015222	AG	3	6	163236	163241	50 %	0 %	50 %	0 %	325981012
2858	NC_015222	CGC	2	6	163304	163309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981012
2859	NC_015222	TAA	2	6	163343	163348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981012
2860	NC_015222	GTG	2	6	163357	163362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981012
2861	NC_015222	A	6	6	163467	163472	100 %	0 %	0 %	0 %	325981012
2862	NC_015222	GAAA	2	8	163504	163511	75 %	0 %	25 %	0 %	325981012
2863	NC_015222	TAAA	2	8	163528	163535	75 %	25 %	0 %	0 %	325981012
2864	NC_015222	ATG	2	6	163563	163568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981012
2865	NC_015222	GAA	2	6	163574	163579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981012
2866	NC_015222	A	6	6	163598	163603	100 %	0 %	0 %	0 %	325981012
2867	NC_015222	AAAT	2	8	163668	163675	75 %	25 %	0 %	0 %	325981012
2868	NC_015222	A	6	6	163694	163699	100 %	0 %	0 %	0 %	325981012
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2991	NC_015222	TTG	2	6	170302	170307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325981017
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