MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 51477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015222	TGAT	2	8	84299	84306	25 %	50 %	25 %	0 %	325980951
1502	NC_015222	GCT	2	6	84340	84345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980951
1503	NC_015222	A	7	7	84373	84379	100 %	0 %	0 %	0 %	325980951
1504	NC_015222	TTG	2	6	84475	84480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980951
1505	NC_015222	GAA	2	6	84511	84516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980951
1506	NC_015222	GC	4	8	84527	84534	0 %	0 %	50 %	50 %	325980951
1507	NC_015222	CGA	2	6	84549	84554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980951
1508	NC_015222	GAT	2	6	84586	84591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980951
1509	NC_015222	TGT	2	6	84673	84678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980951
1510	NC_015222	TGGC	2	8	84693	84700	0 %	25 %	50 %	25 %	325980952
1511	NC_015222	GC	3	6	84743	84748	0 %	0 %	50 %	50 %	325980952
1512	NC_015222	TAT	2	6	84785	84790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980952
1513	NC_015222	TGA	2	6	84799	84804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980952
1514	NC_015222	TGA	2	6	84845	84850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980952
1515	NC_015222	TGGG	2	8	84892	84899	0 %	25 %	75 %	0 %	325980952
1516	NC_015222	CTG	2	6	84921	84926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980952
1517	NC_015222	ACT	2	6	84927	84932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980952
1518	NC_015222	TGGT	2	8	84966	84973	0 %	50 %	50 %	0 %	325980952
1519	NC_015222	TGA	2	6	85013	85018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980952
1520	NC_015222	AGT	2	6	85028	85033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980952
1521	NC_015222	T	7	7	85071	85077	0 %	100 %	0 %	0 %	325980952
1522	NC_015222	TTG	2	6	85096	85101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980952
1523	NC_015222	T	6	6	85161	85166	0 %	100 %	0 %	0 %	325980952
1524	NC_015222	TGT	2	6	85202	85207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980952
1525	NC_015222	CAT	2	6	85277	85282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980952
1526	NC_015222	TGA	2	6	85291	85296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980952
1527	NC_015222	T	6	6	85396	85401	0 %	100 %	0 %	0 %	325980952
1528	NC_015222	GGCTT	2	10	85422	85431	0 %	40 %	40 %	20 %	325980952
1529	NC_015222	CTG	2	6	85453	85458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980952
1530	NC_015222	GCC	2	6	85497	85502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980952
1531	NC_015222	GTT	2	6	85509	85514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980952
1532	NC_015222	CCT	2	6	85600	85605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325980952
1533	NC_015222	CAT	2	6	85647	85652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980952
1534	NC_015222	GAAA	2	8	85673	85680	75 %	0 %	25 %	0 %	325980952
1535	NC_015222	AGT	2	6	85685	85690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980952
1536	NC_015222	ATT	2	6	85704	85709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980952
1537	NC_015222	GTGTTG	2	12	85775	85786	0 %	50 %	50 %	0 %	325980953
1538	NC_015222	GCT	2	6	85822	85827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980953
1539	NC_015222	GCC	2	6	85870	85875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980953
1540	NC_015222	GAT	2	6	85960	85965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980953
1541	NC_015222	GCA	2	6	86005	86010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980953
1542	NC_015222	T	6	6	86052	86057	0 %	100 %	0 %	0 %	325980953
1543	NC_015222	TGGCGG	2	12	86178	86189	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325980953
1544	NC_015222	GTGA	2	8	86333	86340	25 %	25 %	50 %	0 %	325980953
1545	NC_015222	ATC	2	6	86343	86348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980953
1546	NC_015222	TGCA	2	8	86363	86370	25 %	25 %	25 %	25 %	325980953
1547	NC_015222	TGGG	2	8	86497	86504	0 %	25 %	75 %	0 %	325980953
1548	NC_015222	TGA	2	6	86548	86553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980953
1549	NC_015222	GCTA	2	8	86644	86651	25 %	25 %	25 %	25 %	325980953
1550	NC_015222	T	7	7	86758	86764	0 %	100 %	0 %	0 %	325980953
1551	NC_015222	GAT	2	6	86765	86770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980953
1552	NC_015222	GCA	2	6	86801	86806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980953
1553	NC_015222	AGG	2	6	86842	86847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980953
1554	NC_015222	GGT	2	6	86908	86913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980953
1555	NC_015222	ATT	2	6	86936	86941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980953
1556	NC_015222	GAA	2	6	86993	86998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980953
1557	NC_015222	T	6	6	87140	87145	0 %	100 %	0 %	0 %	325980953
1558	NC_015222	ATG	2	6	87173	87178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980954
1559	NC_015222	CAAT	2	8	87189	87196	50 %	25 %	0 %	25 %	325980954
1560	NC_015222	CTG	3	9	87251	87259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980954
1561	NC_015222	TAT	2	6	87335	87340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980954
1562	NC_015222	GGC	2	6	87345	87350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980954
1563	NC_015222	GATT	2	8	87384	87391	25 %	50 %	25 %	0 %	325980954
1564	NC_015222	AT	3	6	87553	87558	50 %	50 %	0 %	0 %	325980954
1565	NC_015222	TGC	2	6	87580	87585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980954
1566	NC_015222	TTC	2	6	87636	87641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980954
1567	NC_015222	TTG	2	6	87677	87682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980954
1568	NC_015222	T	6	6	87704	87709	0 %	100 %	0 %	0 %	325980954
1569	NC_015222	GT	3	6	87713	87718	0 %	50 %	50 %	0 %	325980954
1570	NC_015222	AATT	2	8	87807	87814	50 %	50 %	0 %	0 %	325980954
1571	NC_015222	CG	4	8	88072	88079	0 %	0 %	50 %	50 %	325980954
1572	NC_015222	GCA	2	6	88100	88105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980954
1573	NC_015222	TGG	2	6	88131	88136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980954
1574	NC_015222	GGC	2	6	88241	88246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980954
1575	NC_015222	AGT	2	6	88247	88252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980954
1576	NC_015222	ATTG	2	8	88292	88299	25 %	50 %	25 %	0 %	325980954
1577	NC_015222	GGCG	2	8	88359	88366	0 %	0 %	75 %	25 %	325980955
1578	NC_015222	AGG	2	6	88452	88457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980955
1579	NC_015222	GGCT	2	8	88532	88539	0 %	25 %	50 %	25 %	325980955
1580	NC_015222	ATG	2	6	88660	88665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980955
1581	NC_015222	GCAG	2	8	88871	88878	25 %	0 %	50 %	25 %	325980955
1582	NC_015222	TTG	2	6	88891	88896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980955
1583	NC_015222	TCCG	2	8	88973	88980	0 %	25 %	25 %	50 %	325980955
1584	NC_015222	ATTTG	2	10	89010	89019	20 %	60 %	20 %	0 %	325980955
1585	NC_015222	GATG	2	8	89046	89053	25 %	25 %	50 %	0 %	325980955
1586	NC_015222	TGA	2	6	89073	89078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980955
1587	NC_015222	GCG	2	6	89095	89100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980955
1588	NC_015222	GAT	2	6	89197	89202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980955
1589	NC_015222	GCT	2	6	89242	89247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980955
1590	NC_015222	TCA	2	6	89256	89261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980955
1591	NC_015222	GAA	2	6	89277	89282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980955
1592	NC_015222	GCAT	2	8	89386	89393	25 %	25 %	25 %	25 %	325980955
1593	NC_015222	CATT	2	8	89434	89441	25 %	50 %	0 %	25 %	325980956
1594	NC_015222	ACC	2	6	89762	89767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980956
1595	NC_015222	GCA	2	6	89843	89848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980956
1596	NC_015222	TTG	2	6	89883	89888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980956
1597	NC_015222	TAA	2	6	89992	89997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980956
1598	NC_015222	GCA	2	6	90025	90030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980956
1599	NC_015222	GAT	2	6	90065	90070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980956
1600	NC_015222	ATC	2	6	90171	90176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980956
1601	NC_015222	ATA	2	6	90255	90260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980956
1602	NC_015222	TGC	2	6	90313	90318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980956
1603	NC_015222	AGA	2	6	90396	90401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980956
1604	NC_015222	ATTG	2	8	90409	90416	25 %	50 %	25 %	0 %	325980956
1605	NC_015222	TCA	2	6	90427	90432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980956
1606	NC_015222	CGG	2	6	90435	90440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980956
1607	NC_015222	AGC	2	6	90460	90465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980956
1608	NC_015222	CTG	2	6	90578	90583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980956
1609	NC_015222	TTG	2	6	90618	90623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980956
1610	NC_015222	TGA	2	6	90697	90702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980956
1611	NC_015222	TGT	2	6	90724	90729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980956
1612	NC_015222	TAG	2	6	90816	90821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980956
1613	NC_015222	ATT	2	6	90834	90839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980956
1614	NC_015222	AATA	2	8	90881	90888	75 %	25 %	0 %	0 %	325980957
1615	NC_015222	TGA	2	6	90956	90961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980957
1616	NC_015222	CGG	2	6	90992	90997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980957
1617	NC_015222	TA	3	6	91014	91019	50 %	50 %	0 %	0 %	325980957
1618	NC_015222	TGCG	2	8	91047	91054	0 %	25 %	50 %	25 %	325980957
1619	NC_015222	GATTG	2	10	91082	91091	20 %	40 %	40 %	0 %	325980957
1620	NC_015222	GCA	2	6	91093	91098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980957
1621	NC_015222	TGG	2	6	91115	91120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980957
1622	NC_015222	ATTG	2	8	91169	91176	25 %	50 %	25 %	0 %	325980957
1623	NC_015222	CAAT	2	8	91181	91188	50 %	25 %	0 %	25 %	325980957
1624	NC_015222	CGG	2	6	91301	91306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980957
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1995	NC_015222	GGTT	2	8	113141	113148	0 %	50 %	50 %	0 %	325980970
1996	NC_015222	A	6	6	113272	113277	100 %	0 %	0 %	0 %	325980971
1997	NC_015222	AAGT	2	8	113361	113368	50 %	25 %	25 %	0 %	325980971
1998	NC_015222	AGAT	2	8	113421	113428	50 %	25 %	25 %	0 %	325980971
1999	NC_015222	TAA	2	6	113440	113445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980971
2000	NC_015222	TGC	2	6	113470	113475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980971

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